((((((((((((((((((((((' Methanosarcina barkeri str. 227 DSM 1538' : 0.00119 , ' Methanosarcina barkeri str. MS DSM 800 (T)' : 0.00015 ) : 0.00053 , ' Methanosarcina vacuolata str. Z-761' : 0.00356 ) : 0.0081 , ' Methanosarcina thermophila str. TM-1 DSM 1825 (T)' : 0.00243 ) : 0.00414 , (' Methanosarcina siciliae str. TA/M DSM 3028 (T)' : 0.00254 , ' Methanosarcina acetivorans str. C2A DSM 2834 (T)' : 0.0039 ) : 0.00101 ) : 0.00685 , (' Methanosarcina mazei str. C16 ATCC 43340 (T)' : 0.00045 , (' Methanosarcina mazei str. C16 DSM 2053 (T)' : 0.00046 , (' Methanosarcina mazei str. Go1' : 0.00047 , ' Methanosarcina mazei str. S-6' : 0 ) : 0 ) : 0.00087 ) : 0.00872 ) : 0.0062 , ' Methanosarcina sp. str. WH1 DSM 4659' : 0.00158 ) : 0.03313 , ((' Methanococcoides methylutens str. TMA-10 DSM 2657 (T)' : 0.00748 , ' Methanococcoides burtonii DSM 6242 (T)' : 0.00924 ) : 0.01458 , (' Methanohalophilus sp. str. SF1 DSM 3243' : 0.0009 , ' Methanohalophilus mahii ATCC 35705 (T)' : 0.01322 ) : 0.02405 ) : 0.00604 ) : 0.01815 , (' Methanolobus oregonensis str. WAL1 DSM 5435 (T)' : 0.00533 , (' Methanolobus taylorii str. GS-16' : 0.00577 , (' symbiont of Plagiopyla frontata' : 0.00491 , (' Methanolobus vulcani str. PL-12/M DSM 3029 (T)' : 0.00412 , (' Methanolobus bombayensis str. B-1 OCM 438 (T)' : 0.00863 , ' Methanolobus tindarius str. Tindari 3 DSM 2278 (T)' : 0.00431 ) : 0.00263 ) : 0.00267 ) : 0.00456 ) : 0.00412 ) : 0.00463 ) : 0.04115 , ' Methanohalobium evestigatum str. Z-7303 DSM 3721 (T)' : 0.00762 ) : 0.0228 , ' Methanohalophilus zhilinae str. WeN5 DSM 4017 (T)' : 0.00881 )'METHANOSARCINA' : 0.04324 , (((' Methanosaeta thermoacetophila str. Z-517 DSM 4774 (T)' : 0 , ' Methanosaeta thermoacetophila str. PT DSM 6194 (T)' : 0 ) : 0.00517 , (' Methanosaeta thermoacetophila str. CALS-1 DSM 3870' : 0.00507 , ' Methanosaeta thermoacetophila str. CALS-1 DSM 3870' : 0.00254 ) : 0.0052 ) : 0.02543 , (((' Methanosaeta concilii str. Opfikon' : 0 , ' Methanosaeta concilii str. Opfikon DSM 2139' : 0 ) : 0.00059 , ' Methanosaeta concilii str. FE DSM 3013' : 0.00191 ) : 0.00048 , (' Methanosaeta concilii str. UA' : 0 , (' Methanosaeta concilii str. Opfikon DSM 2139' : 0 , (' Methanosaeta concilii str. GP6 DSM 3671 (T)' : 0 , ' Methanosaeta concilii str. PM' : 0 ) : 0.00124 ) : 0.00124 ) : 0.00472 ) : 0.02637 )'METHANOSAETA' : 0.04084 )'METHANOSARCINALES' : 0.0478 , (((((((' Methanoculleus olentangyi str. RC/ER ATCC 35293 (T)' : 0 , ' Methanoculleus bourgense str. MS2 (T) ATCC 43281 (T)' : 0.00161 ) : 0 , ' Methanoculleus olentangyi str. RC/ER OCM 52 (T)' : 0 ) : 0.01189 , ' Methanoculleus thermophilicus str. TCI DSM 3915' : 0.01591 ) : 0.0012 , ' Methanoculleus marisnigri str. JR1 (T) ATCC 35101 (T)' : 0.00822 ) : 0.00347 , ' Methanoculleus palmolei str. INSLUZ DSM 4273 (T)' : 0.00656 ) : 0.01793 , ((' Methanogenium organophilum str. CV DSM 3596 (T)' : 0.00535 , ' Methanogenium cariaci str. JR1 (T) ATCC 35093 (T)' : 0.00635 ) : 0.00715 , (' Methanoplanus petrolearius SEBR 4847 (T)' : 0.00498 , (' Methanomicrobium mobile str. BP DSM 1539 (T)' : 0.017 , (' Methanoplanus limicola str. M3 DSM 2279 (T)' : 0.00169 , ' Methanoplanus endosymbiosus str. MC1 (GDVogels) DSM 3599 (T)' : 0 ) : 0.03606 ) : 0.01557 ) : 0.00991 ) : 0.02115 )'MCU.BOURGENSE' : 0.00788 , ((((' symbiont of Plagiopyla nasuta' : 0.01697 , ' Methanospirillum sp. str. R10' : 0.01603 ) : 0 , ' clone CY 24' : 0.03998 ) : 0.02079 , (' Methanofollis liminatans str. GKZPZ DSM 4140 (T)' : 0 , (' Methanofollis tationis DSM 2702 (T)' : 0 , ' Methanofollis tationis DSM 2702 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.02882 )'MF.TATIONIS' : 0.00993 , (((' Methanospirillum hungatei str. JF1 DSM 864 (T)' : 0 , ' clone CY 104' : 0.02502 ) : 0.03654 , ' clone CY 49' : 0.04398 )'MSP.HUNGATEI' : 0.02185 , ((' symbiont of archaeobacterial symbiont of Trimyema sp.' : 0 , ' symbiont of Trimyema compressa' : 0 ) : 0.00092 , (' symbiont of archaeobacterial symbiont of Metopus contortus' : 0.00122 , (' clone CY 46' : 0.00118 , (' Methanocorpusculum labreanum str. Z DSM 4855 (T)' : 0 , (' Methanocorpusculum labreanum str. Z ATCC 43576 (T)' : 0 , (' Methanocorpusculum parvum str. XII ATCC 43721 (T)' : 0 , (' Methanocorpusculum sinense str. China Z DSM 4274 (T)' : 0 , (' Methanocorpusculum bavaricum str. SZSXXZ DSM 4179 (T)' : 0.00155 , ' Methanocorpusculum bavaricum str. SZSXXZ DSM 4179 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00104 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00339 ) : 0.00191 )'MCR.PARVUM' : 0.09568 ) : 0.01214 ) : 0.00223 )'METHANOMICROBIALES' : 0.08363 ) : 0.07438 , ' Methanosarcina sp. str. R17' : 0.0157 ) : 0.14164 , (' Halobaculum gomorrense str. DS2807 DSM 9297 (T)' : 0.0098 , (((((((((' Halorubrum saccharovorum NCIMB 2081 (T)' : 0 , ' Halorubrum saccharovorum NCIMB 2081 (T)' : 0.00403 ) : 0 , ' Halorubrum saccharovorum JCM 8865 (T)' : 0.00042 ) : 0.00326 , (' Halorubrum lacusprofundi ACAM 34 (T)' : 0 , ' Halorubrum lacusprofundi JCM 8891 (T)' : 0.00036 ) : 0.00522 ) : 0.02325 , ' Halorubrum vacuolatum str. M24 JCM 9060' : 0.00047 ) : 0.00091 , ' Halobacterium sp. str. Ch2 ACM 3911' : 0.00278 ) : 0.00061 , (' Halorubrum distributum str. I-M JCM 9100' : 0.00496 , ' Halorubrum trapanicum NRC 34021 (T)' : 0.00709 ) : 0.00187 ) : 0.00209 , (' Halorubrum sodomense str. RD-26 ATCC 33755 (T)' : 0 , ' Halorubrum sodomense str. RD-26 ATCC 33755 (T)' : 0.00239 ) : 0.00172 )'HR.SACCHAROVORUM' : 0.02115 , (' Halogeometricum borinquense str. PR 3 ATCC 700274 (T)' : 0.0217 , (' Haloferax mediterranei ATCC 33500 (T)' : 0.0078 , (' Haloferax denitrificans ATCC 35960 (T)' : 0.00056 , (' Haloferax volcanii str. DS-2 ATCC 29605 (T)' : 0.00137 , (' Haloferax gibbonsii ATCC 33959 (T)' : 0.00135 , ' Haloferax sp. str. Aa 2.2' : 0 ) : 0.00043 ) : 0.00114 ) : 0.00355 ) : 0.04624 )'HF.VOLCANII' : 0.0557 ) : 0.01405 , ((((((' Halobacterium halobium str. R1' : 0 , ' Halobacterium halobium str. R1' : 0.00048 ) : 0.00017 , ' Halobacterium halobium' : 0 ) : 0.00053 , (' Halobacterium sp. str. Y12' : 0.00109 , ' Halobacterium cutirubrum str. clone lambda-Hc4' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Halobacterium salinarium' : 0.00353 )'HB.HALOBIUM' : 0.00523 , ' Natronomonas pharaonis str. Gabara JCM 8858 (T)' : 0.05138 ) : 0.00076 , ((((((' Natrinema pallidum NCIMB 777 (T)' : 0.00031 , ' Natrinema pellirubrum NCIMB 786 (T)' : 0.00354 ) : 0.00302 , (' Halorubrum trapanicum NCIMB 767' : 0.00444 , ' str. L-11' : 0.00166 ) : 0.00306 ) : 0.00538 , (' Natronorubrum bangense str. A33 AS 1.1984 (T)' : 0.01806 , ' Natrialba magadii NCIMB 2190 (T)' : 0.02322 ) : 0.01488 ) : 0.00248 , (' Haloterrigena turkmenica str. 4 VKM B-1734 (T)' : 0.01625 , (' str. B1T' : 0.00593 , ' str. 172P1' : 0.00525 ) : 0.01509 ) : 0.00499 ) : 0.02396 , (' Natronococcus occultus ATCC 43101 (T)' : 0.01854 , ' Natronococcus amylolyticus str. Ah-36 JCM 9655 (T)' : 0.01278 ) : 0.00995 )'NTC.AMYLOLYTICUS' : 0.00945 , (((((' Halococcus salifodinae str. Blp DSM 8989 (T)' : 0 , ' Halococcus salifodinae str. Blp DSM 8989 (T)' : 0.00048 ) : 0 , ' Halococcus sp. str. Br3' : 0.00034 ) : 0.00465 , ' Halococcus saccharolyticus ATCC 49257 (T)' : 0.0009 ) : 0.00649 , (' Halococcus morrhuae str. LD.3.1 (C.B. van Niel) ATCC 17082 (T)' : 0.01093 , (' Halococcus morrhuae' : 0.00206 , ' Halococcus morrhuae NRC 16008' : 0 ) : 0.00275 ) : 0.02286 )'HC.MORRHUAE' : 0.01548 , (' Haloarcula mukohataei' : 0.01649 , (' Haloarcula marismortui str. clone HC8 [gene=rrnA operon]' : 0.00357 , (' Haloarcula japonica str. TR-1 JCM 7785 (T)' : 0.01301 , (' Haloarcula sinaiiensis ATCC 33800' : 0.00239 , (' Haloarcula hispanica str. Y27 ATCC 33960 (T)' : 0.00263 , (' Haloarcula sinaiiensis ATCC 33800' : 0.00293 , (' Haloarcula marismortui str. clone HH10 [gene=rrnB operon]' : 0.00156 , (' Haloarcula argentinensis' : 0.01673 , (' Haloarcula vallismortis ATCC 29715 (T)' : 0 , ' Haloarcula vallismortis' : 0 ) : 0 ) : 0.00294 ) : 0.00458 ) : 0.00482 ) : 0.00856 ) : 0.01755 ) : 0.00776 ) : 0.06994 )'HAR.VALLISMORTIS' : 0.06437 ) : 0.03017 ) : 0.04506 ) : 0.01498 ) : 0.03961 )'HALOPHILIC_ARCHAEA' : 0.02078 ) : 0.09112 , ((' Thermoplasma acidophilum str. 122-1B2' : 0.05137 , ' Picrophilus oshimae str. KAW2/2 DSM 9789 (T)' : 0.04992 )'TPL.ACIDOPHILUM' : 0.14311 , ((' coastal surface waters picoplankton DNA from Oregon clone OARB' : 0.02204 , ' Santa Barbara Channel bacterioplankton DNA clone SBAR16' : 0.01412 )'ENV.SBAR16' : 0.0445 , ((' Santa Barbara Channel bacterioplankton DNA clone SBAR1A' : 0.04842 , ' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-7' : 0.04028 ) : 0.01142 , (' Pele's Vents Archaea DNA clone PVA1' : 0.0203 , (' clone ANTARCTIC5' : 0.00668 , ' Woods Hole bacterioplankton DNA clone WHARN' : 0.01429 ) : 0.02265 ) : 0.01208 )'ENV.25-7' : 0.04865 ) : 0.16142 )'THERMOPLASMALES' : 0.04224 ) : 0.09937 , (((' Archaeoglobus fulgidus' : 0 , ' Archaeoglobus fulgidus str. VC-16 DSM 4304 (T)' : 0 ) : 0.00083 , ' Archaeoglobus fulgidus str. VC-16' : 0.00118 ) : 0.0015 , (' Archaeoglobus veneficus str. SNP6 DSM 11195 (T)' : 0.00408 , (' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP9' : 0.02132 , ' Ferroglobus placidus str. AEDII12DO DSM 10642 (T)' : 0.01315 ) : 0.00579 ) : 0.00755 )'ARCHAEOGLOBALES' : 0.04075 )'METHANOMICROBACTERIA' : 0.05544 , ((' Methanothermus fervidus str. V 24 S DSM 2088 (T)' : 0.01116 , ' Methanothermus fervidus' : 0.00155 )'MT.FERVIDUS' : 0.02912 , (((((((((' Methanobacterium thermoautotrophicum str. CSM3' : 0 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. Z-245 DSM 3720' : 0 ) : 0 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. FF1' : 0 ) : 0 , (' Methanobacterium thermoautotrophicum str. delta H' : 0 , (' Methanobacterium thermoautotrophicum str. FTF' : 0 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. FF3' : 0 ) : 0 ) : 0.00053 ) : 0 , (' Methanobacterium thermoautotrophicum str. delta H [gene=rrnA gene]' : 0.00322 , ' Methanothermobacter defluvii str. ADZ VKM B-1962' : 0 ) : 0 ) : 0 , ((' Methanothermobacter thermoflex str. IDZ VKM B-1963' : 0.00023 , ' Methanothermobacter thermophilus str. M VKM B-1786' : 0.00046 ) : 0 , (' Methanobacterium thermoautotrophicum str. delta H' : 0.00056 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. delta H' : 0 ) : 0.00023 ) : 0.00088 ) : 0.00211 , ((' Methanobacterium thermoautotrophicum str. Marburg' : 0.00017 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. ZH3 DSM 9446' : 0 ) : 0.00458 , ((' Methanobacterium wolfei' : 0.00086 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. CB12 ATCC 43574' : 0.0054 ) : 0 , (' Methanobacterium thermoautotrophicum str. HN4' : 0.00053 , (' Methanobacterium thermoautotrophicum str. CB12 OCM 36' : 0 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. SF-4' : 0 ) : 0 ) : 0.00086 ) : 0.005 ) : 0.00253 ) : 0 , ' Methanobacterium thermoautotrophicum str. THF' : 0.00064 ) : 0.00081 , ' Methanobacterium thermaggregans OCM 141 (T)' : 0.00182 )'MB.THERMOAUTOTROPHICUM' : 0.02565 , (((((((' Methanobacterium formicicum DSM 3636' : 0.00179 , ' Methanobacterium palustre str. F DSM 3108 (T)' : 0.00295 ) : 0.00172 , ' Methanobacterium formicicum DSM 1312' : 0.00267 ) : 0.00403 , ' Methanobacterium subterraneum str. A8p DSM 11074 (T)' : 0.00989 ) : 0.0123 , ' endosymbiont of Metopus palaeformis' : 0.02433 ) : 0.00552 , (' Methanobacterium ivanovii str. Ivanov OCM 140' : 0.00032 , (' Methanobacterium espanolae str. GP9 NRC 5912 (T)' : 0.00036 , ' Methanobacterium bryantii str. M.o.H. DSM 863 (T)' : 0.00115 ) : 0 ) : 0.01103 ) : 0.00743 , ' Methanosphaera stadtmanae str. MCB-3 DSM 3091 (T)' : 0.06443 ) : 0.00893 , ((' Methanobrevibacter ruminantium str. M-1 ATCC 35063 (T)' : 0.02122 , ' Methanobrevibacter smithii str. PS DSM 861 (T)' : 0.01713 ) : 0.00432 , (' Methanobrevibacter cuticularis str. RFM-1 DSM 11139 (T)' : 0.00167 , (' Methanobrevibacter curvatus str. RFM-2 DSM 11111 (T)' : 0.00248 , (' Methanobrevibacter filiformis str. RFM-3 DSM 11501 (T)' : 0.0029 , (' Methanobrevibacter arboriphilicus str. DH1 DSM 1536' : 0.00933 , ((' symbiont of methanogen symbiont in termite gut' : 0 , ' symbiont of methanogen symbiont in termite gut' : 0.00095 ) : 0 , (' symbiont of methanogen symbiont in termite gut' : 0 , (' symbiont of methanogen symbiont in termite gut' : 0 , (' symbiont of methanogen symbiont in termite gut' : 0 , (' symbiont of methanogen symbiont in termite gut' : 0 , ' symbiont of methanogen symbiont in termite gut' : 0.0035 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00016 ) : 0.03625 ) : 0.01273 ) : 0.01135 ) : 0.01132 ) : 0.00753 ) : 0.01649 )'MB.FORMICICUM' : 0.01505 )'METHANOBACTERIUM' : 0.0533 )'METHANOBACTERIALES' : 0.01978 ) : 0.06603 , (' Thermococcus fumicolans str. ST557' : 0.00333 , (' Thermococcus aggregans str. TY DSM 10597 (T)' : 0.00178 , (((((((' Pyrococcus abyssi' : 0.00138 , ' Pyrococcus sp.' : 0.00182 ) : 0.00295 , ' Pyrococcus shinkaii str. OT3' : 0.00033 ) : 0.02479 , ' Pyrococcus furiosus str. Vc1 DSM 3638 (T)' : 0.00037 ) : 0.002 , ' Pyrococcus horikoshii str. JA-1' : 0.00037 ) : 0.00148 , ' Thermococcus chitonophagus str. GC74 DSM 10152 (T)' : 0.00207 ) : 0.00321 , ' Pyrococcus furiosus' : 0.00076 )'PC.FURIOSUS' : 0.00832 , (' Thermococcus pacificus str. P-4 DSM 10394 (T)' : 0.00556 , (' Thermococcus barophilus str. MP' : 0.00976 , ((((' Thermococcus peptonophilus str. SM-2 JCM 9654' : 0 , ' Thermococcus peptonophilus str. SM-2' : 0.0083 ) : 0.00107 , ' Thermococcus peptonophilus str. OG-1 JCM 9653 (T)' : 0.00529 ) : 0.00196 , (' Thermococcus guaymasensis str. TYS JCM 10136 (T)' : 0.00271 , ' Pyrococcus sp. str. KOD1' : 0.00355 ) : 0.00302 ) : 0.00164 , (' Thermococcus stetteri' : 0.00376 , (' Thermococcus celer' : 0 , (' Thermococcus celer str. VU 13 DSM 2476 (T)' : 0 , (' Thermococcus hydrothermalis str. AL662' : 0.0029 , (' Thermococcus stetteri str. K-3 DSM 5262 (T)' : 0.00627 , (' Thermococcus profundus str. DT5432 (T)' : 0.00069 , (' Thermococcus profundus str. DT5432 DSM 9503 (T)' : 0 , ' Thermococcus profundus' : 0.00033 ) : 0.00033 ) : 0.00191 ) : 0.00124 ) : 0.00264 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00793 ) : 0.00524 ) : 0.0045 )'TC.CELER' : 0.00352 ) : 0.00551 ) : 0.00197 )'THERMOCOCCALES' : 0.00981 ) : 0.05532 , ((((((' Methanococcus jannaschii [gene=rrnA gene]' : 0 , ' Methanococcus jannaschii str. JAL-1 DSM 2661 (T)' : 0.00127 ) : 0 , ' Methanococcus jannaschii [gene=rrnB gene]' : 0.00039 ) : 0.00026 , ' Methanocaldococcus fervens str. AG86 DSM 4213 (T)' : 0.00348 ) : 0.00158 , ' Methanocaldococcus vulcanius str. M7' : 0.01462 ) : 0.00373 , ' Methanococcus infernus str. ME DSM 11812 (T)' : 0.01499 ) : 0.018 , (' Methanococcus igneus str. Kol 5 DSM 5666 (T)' : 0.00857 , (' Methanococcus thermolithotrophicus str. SN-1 DSM 2095 (T)' : 0.00835 , ((' Methanococcus "aeolicus" str. A' : 0 , ' Methanococcus "aeolicus"' : 0 ) : 0.01504 , ((((' Methanococcus voltae str. PS ATCC 33273 (T)' : 0 , ' Methanococcus voltae str. PS DSM 1537 (T)' : 0 ) : 0.00371 , ' Methanococcus voltae str. A3 OCM 197' : 0.00203 ) : 0.01712 , ' Methanococcus vannielii str. EY33' : 0.03064 ) : 0.00633 , (((' Methanococcus maripaludis str. C7 OCM 364' : 0.00096 , ' Methanococcus maripaludis str. C5 OCM 209' : 0.00034 ) : 0 , ' Methanococcus maripaludis str. C6 OCM 363' : 0.00062 ) : 0.0003 , (' Methanococcus maripaludis str. delta RC DSM 2771 (T)' : 0 , (' Methanococcus maripaludis str. D' : 0 , (' Methanococcus maripaludis str. JJ ATCC 43000 (T)' : 0 , ' Methanococcus maripaludis str. JJ DSM 2067 (T)' : 0 ) : 0.00104 ) : 0 ) : 0.00238 ) : 0.00761 )'MC.MARIPALUDIS' : 0.03266 ) : 0.01744 ) : 0.04425 ) : 0.03008 )'METHANOCOCCALES' : 0.00857 ) : 0.02807 , ' Methanopyrus kandleri str. av19 DSM 6324 (T)' : 0.09845 )'1.1 EURYARCHAEOTA' : 0.02703 , ((' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP78' : 0.03925 , ' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP27' : 0.06018 )'ENV.PJP27' : 0.00765 , ((((((((((((' deep-sea holothurian (sea cucumber) midgut archaeobacterium DNA clone JM8' : 0.00446 , ' deep-sea holothurian (sea cucumber) midgut archaeobacterium DNA clone JM7' : 0.00843 ) : 0.00407 , ' deep-sea holothurian (sea cucumber) midgut archaeobacterium DNA clone JM1' : 0.00411 ) : 0.00876 , ' deep-sea holothurian (sea cucumber) midgut archaeobacterium DNA clone JM2' : 0.02184 ) : 0 , ' deep-sea holothurian (sea cucumber) midgut archaeobacterium DNA clone JM6' : 0.00423 ) : 0.00185 , (' deep-sea holothurian (sea cucumber) midgut archaeobacterium DNA clone JM3' : 0.00763 , ' deep-sea holothurian (sea cucumber) midgut archaeobacterium DNA clone JM4' : 0.00126 ) : 0.0049 ) : 0.001 , ' clone ANTARCTIC12' : 0.00693 ) : 0.00103 , (' Santa Barbara Channel bacterioplankton DNA clone SBAR12' : 0.00234 , ' Santa Barbara Channel bacterioplankton DNA clone SBAR5' : 0.00612 ) : 0.00354 ) : 0.00123 , ' Woods Hole bacterioplankton DNA clone WHARQ' : 0.0019 )'ENV.SBAR12' : 0.02308 , ((' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD19' : 0.00721 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE16' : 0.04405 )'ENV.FIE16' : 0.00099 , ((((' Pele's Vents Archaea DNA clone PVA2' : 0.00112 , ' Pacific Ocean station 49 500m depth bacterioplankton DNA clone NH49-8' : 0 ) : 0.00013 , ' Pele's Vents Archaea DNA clone PVA3' : 0.00112 ) : 0 , ' Pacific Ocean station 49 500m depth bacterioplankton DNA clone NH49-14' : 0.00287 ) : 0.00394 , (' Pacific Ocean station 49 500m depth bacterioplankton DNA clone NH49-9' : 0.00121 , ((' Pele's Vents Archaea DNA clone PVA4' : 0.00297 , ' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-13' : 0.00251 ) : 0 , (' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-1' : 0 , ' Pacific Ocean station 49 500m depth bacterioplankton DNA clone NH49-4' : 0.00249 ) : 0.0006 ) : 0.01219 ) : 0.01123 )'ENV.PVA2' : 0.11744 ) : 0.0183 ) : 0.02738 , ' clone 4B7' : 0.00769 )'MARINE_CRENARCHAEOTA' : 0.06478 , ' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP89' : 0.28523 )'NON-THERMOPHILIC_CRENARCHAEOTA' : 0.01132 , (' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP41' : 0.00332 , (' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP33' : 0.00231 , (((' Thermofilum pendens str. Hvv3 DSM 2475 (T)' : 0.01039 , ' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP6' : 8e-05 ) : 0.01548 , ' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP81' : 0.05366 )'TMF.PENDENS' : 0.01817 , (((((' Thermoproteus neutrophilus JCM 9278 (T)' : 0.0052 , ' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP8' : 0.00162 ) : 0.00084 , (' Pyrobaculum islandicum str. geo3' : 0.0037 , ' Pyrobaculum aerophilum str. IM2 DSM 7523 (T)' : 0.00682 ) : 0.00308 ) : 0.01208 , ' Thermoproteus tenax' : 0.01287 ) : 0.06406 , ' Thermocladium modestius str. IC-125 JCM 10088 (T)' : 0.01501 )'PYB.ISLANDICUM' : 0.01315 , (((((((' Thermosphaera aggregans str. M11TL DSM 11486 (T)' : 0 , ' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP74' : 0.00878 ) : 0.04875 , ' Mud Volcano area of Yellowstone NP ("Black Pool") hot spring DNA clone pJP7' : 0.01093 ) : 0.01334 , (' Desulfurococcus mobilis' : 0 , ' Desulfurococcus mobilis DSM 2161' : 0 ) : 0.00589 ) : 0.025 , ' Sulfophobococcus zilligii str. K1 DSM 11193 (T)' : 0.00519 )'DCO.MOBILIS' : 0.00593 , (' Stetteria hydrogenophila str. 4ABC' : 0.0015 , ' Staphylothermus marinus str. F1 DSM 3639 (T)' : 0.00533 )'STH.MARINUS' : 0.01793 ) : 0.00846 , (((' Aeropyrum pernix str. K1' : 0.00971 , ' Aeropyrum pernix str. K1' : 0.00447 ) : 0.01089 , ' Stetteria hydrogenophila str. 4ABC' : 0.00255 )'AP.PERNIX' : 0.01019 , (' Pyrolobus fumari str. 1A DSM 11204' : 0.00541 , (' Pyrodictium occultum str. PL-19 DSM 2709 (T)' : 0.00042 , (' Hyperthermus butylicus DSM 5456 (T)' : 0.00044 , ' Pyrodictium abyssi DSM 6158 (T)' : 0.00161 ) : 0.00043 ) : 0.00687 )'PYR.OCCULTUM' : 0.02732 ) : 0.02017 )'PYRODICTIALES' : 0.01515 , ((((((' Sulfolobus solfataricus str. P1 IFO 15331 (T)' : 0 , ' Sulfolobus solfataricus str. P1 DSM 1616 (T)' : 0.00028 ) : 0 , (' Sulfolobus solfataricus str. 98/2' : 0 , ' Sulfolobus solfataricus str. P2 DSM 1617' : 0.00099 ) : 0.00099 ) : 0.00042 , (' Sulfolobus shibatae str. B12 DSM 5389 (T)' : 0 , ' Sulfolobus shibatae str. B12 DSM 5389 (T)' : 0 ) : 0.00184 ) : 0.0011 , ' Sulfolobus solfataricus str. Ron 12/III' : 0.00646 )'SUL.SOLFATARICUS' : 0.03139 , (' Sulfolobus sp. str. LM' : 0 , (' Sulfolobus metallicus DSM 6482 (T)' : 0.00159 , ' Sulfolobus metallicus DSM 6482 (T)' : 0.00085 ) : 0.00083 )'SUL.METALLICUS' : 0.07692 )'SULFOLOBUS_I' : 0.00589 , ((((((((' Sulfolobus acidocaldarius' : 0 , ' Sulfolobus solfataricus str. P1 DSM 1616 (T)' : 0 ) : 0 , ' Sulfolobus acidocaldarius str. 98-3 ATCC 33909 (T)' : 0.00015 ) : 0 , ' Sulfolobus "thuringiensis" str. Ron 12/I' : 0 ) : 0 , ' Sulfolobus acidocaldarius str. 98-3 DSM 639' : 0 ) : 0 , ' Sulfolobus acidocaldarius str. N8' : 0 )'SUL.ACIDOCALDARIUS' : 0.01725 , (' Sulfolobus sp. str. B6/2' : 0.00057 , (' Stygiolobus azoricus str. FC6 DSM 6296 (T)' : 1e-05 , ' Stygiolobus azoricus str. FC6 DSM 6296 (T)' : 0.00192 ) : 0.00943 )'SL.AZORICUS' : 0.01832 ) : 0.00411 , (' Sulfurisphaera ohwakuensis str. TA-1 IFO 15161 (T)' : 0.00175 , ' Acidianus sp. str. TA1' : 0 )'SFR.OHWAKUENSIS' : 0.02429 )'SULFOLOBUS_II' : 0.01628 , (((((' Acidianus ambivalens str. LEI 10 DSM 3772 (T)' : 0 , ' Acidianus ambivalens str. LEI 10 DSM 3772 (T)' : 0 ) : 0.00029 , ' Acidianus ambivalens str. LEI 10 DSM 3772 (T)' : 0.00083 ) : 0.00029 , (' Acidianus infernus str. So4a DSM 3191 (T)' : 0 , (' Acidianus infernus str. So4a DSM 3191 (T)' : 0 , ' Acidianus infernus str. So4a DSM 3191 (T)' : 0 ) : 0.00068 ) : 0.00094 ) : 0.00303 , ' str. ICHT' : 0.0002 )'ADI.INFERNUS' : 0.01466 , (((' Acidianus brierleyi IFO 15269' : 0 , ' Acidianus brierleyi DSM 1651 (T)' : 0.00145 ) : 0.00076 , ' Acidianus brierleyi' : 0.00785 )'ADI.BRIERLEYI' : 0.03399 , (' Sulfolobus hakonensis str. HO1-1; H' : 0.00397 , (' Metallosphaera sedula' : 0.00106 , (' Metallosphaera sedula IFO 15509 (T)' : 0 , (' Metallosphaera sedula DSM 5348 (T)' : 0 , (' Metallosphaera prunae str. Ron 12/II DSM 10039 (T)' : 0.00014 , ' Metallosphaera sp. str. TA2' : 0.00272 ) : 0.00014 ) : 0.00079 ) : 0.00632 ) : 0.00532 )'MTS.SEDULA' : 0.03872 ) : 0.0194 )'ACIDIANUS' : 0.02297 ) : 0.00765 ) : 0.05018 ) : 0.06313 ) : 0.02106 ) : 0.03591 ) : 0.04465 )'THERMOPHILIC_CRENARCHAEOTA' : 0.01217 ) : 0.20883 )'1.2 CRENARCHAEOTA' : 0.03789 )'ARCHAEA' : 0.31178 , ((((((' Hydrogenobacter thermophilus str. TK-6 (T)' : 0.00962 , ' Calderobacterium hydrogenophilum str. Z-829 (T)' : 0.00214 ) : 0.00358 , ' Hydrogenobacter thermophilus str. T3' : 0.00988 ) : 0.01338 , (' Thermocrinis ruber str. OC 1/4' : 0.00707 , ' str. EM 17' : 0.00328 ) : 0.02072 ) : 0.0225 , ' Aquifex pyrophilus str. Kol5a' : 0.03271 ) : 0.01258 , ' Hydrogenobacter acidophilus str. 3H-1' : 0.13147 )'THERMOPHILIC_OXYGEN_REDUCERS' : 0.05252 , ((((((((' Geotoga subterranea str. CC-1 ATCC 51225 (T)' : 0.01392 , ' Geotoga petraea str. T5 ATCC 51226 (T)' : 0.01725 )'GEOTOGA' : 0.07721 , (' Petrotoga mobilis str. SJ95 DSM 10674 (T)' : 0.00204 , ' Petrotoga miotherma str. 42-6 ATCC 51224 (T)' : 0.00965 )'PETROTOGA' : 0.09978 ) : 0.05077 , (' Fervidobacterium islandicum str. H-21 DSM 5733 (T)' : 0.01082 , (' Fervidobacterium gondwanense str. AB39 ACM 5017 (T)' : 0.02944 , ' Fervidobacterium nodosum str. Rt 17-B1 ATCC 35602 (T)' : 0.01791 ) : 0.00641 )'FERVIDOBACTERIUM' : 0.12623 ) : 0.01773 , (' Thermosipho melanesiensis str. BI429 CIP 104789 (T)' : 0.01032 , ' Thermosipho africanus str. OB7 DSM 5309 (T)' : 0.02392 )'THERMOSIPHO' : 0.03827 ) : 0.00922 , ((' Thermotoga elfii str. SERB 6459 DSM 9442' : 0.00267 , ' Thermotoga subterranea str. SL1 DSM 9912' : 0.00755 ) : 0.01323 , (' Thermotoga hypogea SEBR 7054 (T)' : 0.02343 , ' Thermotoga thermarum str. LA3' : 0.02096 ) : 0.02284 )'THERMOTOGA' : 0.02889 ) : 0.01001 , ' Thermotoga maritima str. MSB8 DSM 3109 (T)' : 0.03476 ) : 0.01541 , (' clone OPB7' : 0.03272 , ' str. EM 3' : 0.09098 )'ENV.OPB_7' : 0.21813 )'THERMOTOGALES' : 0.01249 , ((' Coprothermobacter proteolyticus str. BT ATCC 35245 (T)' : 0.00055 , ' Coprothermobacter platensis str. 3R DSM 11748 (T)' : 0.02104 )'CTM.PROTEOLYTICUS' : 0.00657 , (' str. EM 19' : 0.00998 , (((' Synechococcus lividus str. y-7c7b-S' : 0.036 , ' Thermodesulfobacterium commune str. YSRA-1 ATCC 33708 (T)' : 0 ) : 0.01818 , ' clone OPB45' : 0.04046 )'ENV.OPB45' : 0.05624 , (' str. SBR2095' : 0.31436 , (((((((((((((((' Thermus sp. str. YS38' : 0 , ' Thermus sp. str. ZHGI A.1' : 0 ) : 0.00028 , ' Thermus sp. str. ZHGIB A.4' : 0 ) : 0.00026 , ' Thermus sp. str. ac-1' : 0 ) : 0 , ' Thermus sp. str. OS-Ramaley-4' : 0.00102 ) : 0.01139 , ' Thermus sp. str. ZFI A.2' : 0.01272 ) : 0.005 , (' Thermus sp. str. ViI7' : 0.00351 , (' Thermus scotoductus str. SE-1 DSM 8553 (T)' : 0.00137 , ' Thermus sp. str. NMX2 A.1' : 0.00367 ) : 0.00434 ) : 0.01556 ) : 0.00395 , (' Thermus aquaticus str. X-1 ATCC 27978' : 0.0019 , ((' Thermus aquaticus str. YT-1' : 0 , ' Thermus aquaticus str. YT-1' : 0 ) : 0.00133 , (' Thermus sp. str. YSPID A.1' : 0.00404 , ' Thermus sp. str. ac-7' : 0.0023 ) : 0.00184 ) : 0.01176 ) : 0.00804 ) : 0.00531 , (' Thermus sp. str. SPS14' : 0.04906 , ((' Thermus sp. str. Fiji 3A.1' : 0.00186 , ' Thermus sp. str. HS A.1' : 0.00212 ) : 0.001 , ((' Thermus flavus str. AT-62' : 0 , ' Thermus thermophilus str. HB27' : 0 ) : 0.00032 , (' Thermus thermophilus str. HB-8 ATCC 27634 (T)' : 0.00271 , (' Thermus flavus str. AT-62 ATCC 33923' : 0.00117 , (' Thermus thermophilus str. HB-8' : 0 , ' Thermus thermophilus str. HB-8 ATCC 27634 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00731 ) : 0.00944 )'T.THERMOPHILUS' : 0.01372 , (((' Thermus filiformis str. WAI 33 A1 ATCC 43280 (T)' : 0.01515 , ' Thermus filiformis' : 0 ) : 0 , ' Thermus sp. str. W28 A.1' : 0.00091 ) : 0.00074 , (' Thermus sp. str. Tok8 A.1' : 0.00034 , ((' Thermus sp. str. Tok3 A.1' : 0.00028 , ' Thermus sp. str. Tok20 A.1' : 0.00033 ) : 0.00087 , (' Thermus sp. str. Rt4 1A' : 0.00061 , (' Thermus sp. str. OK6 A.1' : 0.0003 , ' Thermus sp. str. T351' : 0 ) : 0 ) : 0.00069 ) : 0.001 ) : 0.00016 )'T.FILIFORMIS' : 0.01896 ) : 0.03319 , (' Meiothermus silvanus str. V1-R2 DSM 9946 (T)' : 0.02739 , (' Meiothermus chliarophilus str. ALT-8 DSM 9957 (T)' : 0.04076 , (((' Meiothermus ruber str. Loginova 21 ATCC 35948 (T)' : 0 , ' Meiothermus ruber' : 0.00029 ) : 0 , ' Meiothermus ruber str. Loginova 21 ATCC 35948 (T)' : 0.00266 ) : 0.00165 , (' Thermus sp. str. ac-17' : 0.00037 , (' Meiothermus cerbereus str. GY-1 DSM 11376 (T)' : 0.00174 , ' Thermus sp. str. ac-2' : 0.00059 ) : 0.00175 ) : 0.00784 ) : 0.05219 ) : 0.05378 )'MEI.RUBER' : 0.04775 )'THERMUS' : 0.03724 , ((' Deinococcus radiophilus DSM 20551 (T)' : 0.01783 , ' Deinococcus proteolyticus DSM 20540 (T)' : 0.01474 ) : 0.01144 , ((' Deinococcus radiodurans ATCC 35073' : 0.01824 , ' Deinococcus radiodurans DSM 20539 (T)' : 0.00724 ) : 0.0139 , (' Deinococcus radiopugnans ATCC 19172 (T)' : 0.01046 , (' Deinococcus grandis DSM 3963 (T)' : 0.00122 , ' Deinococcus sp. str. S34' : 0.00518 ) : 0.03019 ) : 0.02175 ) : 0.01718 )'DEINOCOCCUS' : 0.14975 ) : 0.03767 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type M' : 0.13991 ) : 0.04005 , ' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G29' : 0.22923 )'DEINOCOCCUS-THERMUS_SUBDIVISION' : 0.00526 , (((((((' clone LGd1' : 0.01579 , ' clone LGd15' : 0.00764 ) : 0.1312 , ' clone LGd2' : 0.14886 ) : 0.02438 , (' clone LGd10' : 0.0125 , (' clone LGd5' : 0.04082 , ' clone LGd6' : 0.08706 ) : 0.04752 ) : 0.05143 ) : 0.0282 , ((' clone NTd42' : 0 , ' clone OPS128' : 0 ) : 0.07189 , (' clone O1Ad37' : 0.00293 , (' clone NTd43' : 0 , ' clone OPB92' : 0.00081 ) : 0.00711 ) : 0.10212 ) : 0.02878 ) : 0.3212 , ' clone LGd9' : 0.13042 )'ENV.OPB92' : 0.05946 , (' str. SBR1031' : 0.0469 , (' clone OPB65' : 0.10197 , ' clone T78' : 0.03891 ) : 0.1559 )'ENV.SLT78' : 0.46975 ) : 0.05188 , ((' Sphaerobacter thermophilus str. 6022 DSM 20745 (T)' : 0.09289 , ' Thermomicrobium roseum ATCC 27502 (T)' : 0.14387 ) : 0.05373 , ((' Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 (T)' : 0.00127 , ' Herpetosiphon geysericola ATCC 23076 (T)' : 0.01584 ) : 0.05475 , (((((' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone OSVI-L-4' : 0 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD2' : 0.12589 ) : 0 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type C' : 0 ) : 0.04806 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD5' : 0.14728 ) : 0.09956 , ' str. SBR2022' : 0.03336 ) : 0.01713 , ((' Heliothrix oregonensis str. F1' : 0.10614 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone OSV-L-20' : 0.11228 ) : 0.0225 , (' Chloroflexus aurantiacus str. J-10-fl ATCC 29366 (T)' : 0.0013 , (' Chloroflexus aurantiacus str. 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TMBS4 DSM 6591 (T)' : 0.01759 , ' "Geothrix fermentans"' : 0.0172 )'HP.FOETIDA' : 0.01359 ) : 0.08136 , ' clone 32-20' : 0.01812 ) : 0.00899 , (' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE12' : 0.00332 , (' clone iii1-8' : 0.00375 , (' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE13' : 0.00345 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD55' : 0.00018 ) : 0.043 ) : 0.01544 )'ENV.III1_8' : 0.01223 ) : 0.05606 , ' clone RB25' : 0.00798 ) : 0.00587 , (((' clone TG14' : 0.00441 , ' clone TG13' : 0.00174 ) : 0.01028 , ' clone WCHA1-89' : 0.02217 ) : 0.00209 , (' clone WFeA1-35' : 0.00738 , (' clone OPB5' : 0.00184 , (' clone OPB95' : 0.00298 , (' clone WCHA1-39' : 0.00164 , (' clone WCHA1-83' : 0.00394 , ' clone WFeA1-59' : 0.00456 ) : 0.00788 ) : 0.00472 ) : 0.00334 ) : 0.01273 ) : 0.01466 )'ENV.OPB_5' : 0.00878 ) : 0.02383 , (' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type K' : 0.03145 , (' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_36' : 0.00284 , (' clone A39' : 0.00091 , ' clone A40' : 0.00161 ) : 0.01776 ) : 0.34188 )'ENV.OS_K' : 0.0057 ) : 0.00455 , ((((' Nitrospina gracilis str. Nb-3' : 0.0127 , ' Nitrospina gracilis str. Nb-211' : 0.00255 ) : 0.03301 , ' str. s22' : 0.00581 ) : 0.00392 , ' str. SBR1093' : 0.0168 )'NITROSPINA' : 0.01393 , ((' clone JAP751' : 0.00042 , ' clone JAP750' : 0.00024 ) : 0.00032 , (' clone JAP504' : 0.00017 , ' clone JAP604' : 0 ) : 0.00039 )'ENV.JAP604' : 0.02042 ) : 0.02074 )'NITROSPINA' : 0.01393 , (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((' Mycobacterium avium subsp. avium str. chester DSM 43216' : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. avium str. chester DSM 43216' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis ATCC 19698 (T)' : 0.00027 ) : 0 , ' Mycobacterium avium str. Hiberry 1244' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. Linda' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. Y-37' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. peip' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium str. 11-11 (Brennan#38)' : 0 ) : 0 , (' Mycobacterium avium str. 8-2 (Brennan#35)' : 0 , (' Mycobacterium avium str. 9-60' : 0 , ' Mycobacterium avium str. IIIb (TMC-1462)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. 18' : 0 ) : 0 , (' Mycobacterium avium str. serovar 4' : 0.00031 , ' Mycobacterium avium str. serovar 1' : 0 ) : 0.00097 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. Dx8709991' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium str. Brennan#34' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. wein' : 0 ) : 0 , (' Mycobacterium avium str. SJB#2' : 0.00478 , ' Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. Dx8610316' : 0.00098 ) : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium intracellulare str. serovar 4 ATCC 35767' : 0.00027 ) : 0.00055 , ' Mycobacterium intracellulare str. serovar 7 ATCC 35847' : 0.00075 ) : 0.00059 , ((((' Mycobacterium intracellulare str. 1-18 (Brennan#30)' : 0 , ' Mycobacterium intracellulare CDC 1214' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium intracellulare str. serovar 18 ATCC 35770' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium intracellulare str. 1-19 (Brennan#31)' : 0 ) : 0.00041 , (' Mycobacterium intracellulare str. serovar 12 ATCC 35762' : 0 , (' Mycobacterium intracellulare str. SN 424 ATCC 15985' : 0 , (' Mycobacterium intracellulare str. 8-3 (Brennan#36)' : 0 , (' Mycobacterium intracellulare str. 1-13 (Brennan#29)' : 0 , ' Mycobacterium sp. str. 3937' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00054 ) : 0.00094 ) : 0.00042 , (' Mycobacterium scrofulaceum ATCC 19981 (T)' : 0.00154 , (' Mycobacterium kansasii' : 0 , (' Mycobacterium intermedium' : 0 , (' Mycobacterium kansasii str. SN 502 DSM 43224' : 0 , (' Mycobacterium gastri str. W-417 ATCC 15754 (T)' : 0 , ' Mycobacterium kansasii str. G133 (A. Pollak) ATCC 12478 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.04462 ) : 0.02986 ) : 0.00374 ) : 0.00221 ) : 0.00125 , ((' Mycobacterium malmoense str. Mo 816 ATCC 29571 (T)' : 0 , ' Mycobacterium malmoense str. Mo 816 ATCC 29571 (T)' : 0.00025 ) : 0 , (' Mycobacterium haemophilum' : 0.0016 , (' Mycobacterium haemophilum' : 0.00025 , ((((((' Mycobacterium leprae str. cosmid L471' : 1e-05 , ' Mycobacterium leprae str. armadillo grown' : 0.00138 ) : 0 , ' Mycobacterium leprae' : 0.00156 ) : 0 , (' Mycobacterium leprae' : 0 , ' Mycobacterium leprae' : 0 ) : 0.00059 ) : 0 , ' Mycobacterium leprae' : 0 ) : 0 , ' Mycobacterium leprae str. LTB' : 0.00026 ) : 0.00221 , ((((' Mycobacterium ulcerans' : 0.00248 , ' Mycobacterium marinum' : 0.0009 ) : 0 , ' Mycobacterium ulcerans' : 0.00238 ) : 0 , ' Mycobacterium marinum' : 0.00036 ) : 0.00148 , ((' Mycobacterium bovis str. vallee' : 0 , ' Mycobacterium tuberculosis str. H37/Rv' : 0.0003 ) : 0 , (' Mycobacterium bovis str. BCG' : 7e-05 , (' Mycobacterium microti str. OV 254' : 0.00012 , (' Mycobacterium tuberculosis str. H37/Rv' : 0 , (' Mycobacterium tuberculosis' : 0 , ' Mycobacterium tuberculosis str. H37/Rv' : 0 ) : 0.0045 ) : 0 ) : 0.00021 ) : 0.00017 ) : 0.00212 ) : 0.00604 ) : 0.00051 ) : 0.0054 ) : 0.00127 ) : 0.00144 ) : 0.00045 , (' Mycobacterium szulgai ATCC 35799 (T)' : 0 , ' Mycobacterium szulgai ATCC 35799 (T)' : 0.00113 ) : 0.00049 ) : 0.00281 , (' Mycobacterium conspicuum DSM 44146' : 0 , ' Mycobacterium conspicuum str. 3895/92' : 0 ) : 0.0035 ) : 0.00054 , (((' Mycobacterium gordonae str. P-15 ATCC 14470 (T)' : 0 , ' Mycobacterium gordonae str. P-15 ATCC 14470 (T)' : 0 ) : 0.00078 , ' Mycobacterium sp. str. 333' : 0.00217 ) : 0.00364 , (' Mycobacterium interjectum str. 4185/92 DSM 44064 (T)' : 0.00295 , (' Mycobacterium heidelbergense str. 2554/91 ATCC 51253 (T)' : 0.00089 , (' Mycobacterium simiae ATCC 25275 (T)' : 0.00047 , ((' Mycobacterium sp. str. 8/18' : 0 , ' Mycobacterium tilburgii' : 0.02781 ) : 0 , (((' Mycobacterium lentiflavum str. 439/93 ATCC 51986' : 0 , ' Mycobacterium lentiflavum str. 2186/92 ATCC 51985 (T)' : 0.00067 ) : 0.00033 , ' Mycobacterium lentiflavum str. 89-446 ATCC 51988' : 0.00283 ) : 0.00201 , (' Mycobacterium sp. str. 94-92' : 0.00026 , (' Mycobacterium sp.' : 0 , ' Mycobacterium genavense str. 2289 ATCC 51233 (T)' : 0.00468 ) : 0.00077 ) : 0.00205 ) : 0.00106 ) : 0.00098 ) : 0.00228 ) : 0.00513 ) : 0.0055 ) : 0.00239 ) : 0.00038 , ' Mycobacterium asiaticum str. N6IH ATCC 25276 (T)' : 0.00146 ) : 0 , ' Mycobacterium asiaticum str. N6IH ATCC 25276 (T)' : 0.00038 ) : 0.00274 , (' Mycobacterium cookii str. NZ2 ATCC 49103 (T)' : 0.00374 , ((' Mycobacterium sp.' : 0.00088 , ' Mycobacterium branderi str. H 52157 ATCC 51789 (T)' : 0 ) : 0.01275 , (' Mycobacterium celatum ATCC 51130' : 0.00256 , (' Mycobacterium celatum str. type 3 NCTC 12882' : 0.00177 , ' Mycobacterium celatum ATCC 51131 (T)' : 0 ) : 0.00138 ) : 0.00249 ) : 0.01072 ) : 0.00426 ) : 0.00335 , ((' Mycobacterium shimoidei ATCC 27962 (T)' : 0.00078 , ' Mycobacterium shimoidei' : 0.00144 ) : 0.00427 , (' Mycobacterium xenopi ATCC 19250 (T)' : 0 , (' Mycobacterium xenopi ATCC 19250 (T)' : 0 , ' Mycobacterium xenopi ATCC 19250 (T)' : 0 ) : 0.00036 ) : 0.01765 ) : 0.00807 ) : 0.00172 , ((' Mycobacterium terrae str. W-45 ATCC 15755 (T)' : 0 , ' Mycobacterium terrae str. W-45 ATCC 15755 (T)' : 0 ) : 0.00132 , (' Mycobacterium hiberniae str. Hi 11 ATCC 49874 (T)' : 0.0006 , (' Mycobacterium nonchromogenicum ATCC 19530 (T)' : 0 , ' Mycobacterium nonchromogenicum ATCC 19530 (T)' : 0 ) : 0.00462 ) : 0.00518 ) : 0.00289 ) : 0.00083 , (' Mycobacterium peregrinum str. Schering 20 ATCC 14467 (T)' : 0.004 , (' Mycobacterium gadium ATCC 27726 (T)' : 0.00039 , ' Mycobacterium gadium ATCC 27726 (T)' : 0.00211 ) : 0.00477 ) : 0.00461 ) : 0.00107 , (' Mycobacterium fallax ATCC 35219 (T)' : 0.00199 , ((' Mycobacterium triviale ATCC 23292 (T)' : 0 , ' Mycobacterium triviale ATCC 23292 (T)' : 0 ) : 0.00466 , (' Mycobacterium chitae ATCC 19627 (T)' : 0.00197 , (' Mycobacterium chitae ATCC 19630' : 0.00223 , ' Mycobacterium chitae ATCC 19627 (T)' : 0.00258 ) : 0 ) : 0.0137 ) : 0.00266 ) : 0.00252 ) : 0.00127 , (((((((' Mycobacterium thermoresistibile ATCC 19527 (T)' : 0 , ' Mycobacterium thermoresistibile ATCC 19527 (T)' : 0.0022 ) : 0.00107 , ' Mycobacterium hassiacum' : 0.02128 ) : 0.00372 , ' Mycobacterium sp. str. chromogen' : 0.00554 ) : 0.00213 , (' Mycobacterium smegmatis ATCC 19420 (T)' : 1e-05 , (' Mycobacterium smegmatis str. W-113 ATCC 14468' : 0 , (' Mycobacterium confluentis' : 0.0063 , ' Mycobacterium madagascariense ATCC 49865 (T)' : 0.00522 ) : 0.00511 ) : 0.00058 ) : 0.0055 ) : 0.00066 , (' Mycobacterium duvalii str. C-63 ATCC 43910 (T)' : 0.00147 , (' Mycobacterium flavescens ATCC 14474 (T)' : 0 , ' Mycobacterium flavescens ATCC 14474 (T)' : 0.00049 ) : 0.00489 ) : 0.00195 ) : 0.00144 , (' Mycobacterium phlei ATCC 11758 (T)' : 0.00078 , (' Mycobacterium novocastrense str. 73 DSM 44203 (T)' : 0.00383 , ' Mycobacterium sp.' : 0.00716 ) : 0.01628 ) : 0.00191 ) : 0 , ((((((((((' Mycobacterium sp. str. PYR-1' : 0 , ' Mycobacterium austroafricanum str. E9789-SA124 ATCC 33464 (T)' : 0.00117 ) : 0 , (' Mycobacterium vaccae ATCC 15483 (T)' : 0 , ' Mycobacterium sp. str. PYR-I (Fast Growing PAH Degrader)' : 0.00589 ) : 0.00034 ) : 0.00392 , (' Mycobacterium aurum ATCC 23366 (T)' : 0 , ' Mycobacterium aurum ATCC 23366 (T)' : 0.0016 ) : 0.00419 ) : 0.00214 , (' Mycobacterium chubuense ATCC 27278 (T)' : 0.00097 , (' Mycobacterium chlorophenolicum str. PCP-I DSM 43826 (T)' : 0 , (' Mycobacterium chlorophenolicum str. PCP-I DSM 43826 (T)' : 0.00147 , ' Mycobacterium chlorophenolicum str. PCP-I NCIMB 12325 (T)' : 0 ) : 0.00119 ) : 0.00221 ) : 0.00399 ) : 0.00283 , ' Mycobacterium obuense ATCC 27023 (T)' : 0.00542 ) : 0.00243 , (' Mycobacterium gilvum ATCC 43909 (T)' : 0 , ' Mycobacterium gilvum ATCC 43909 (T)' : 0.00058 ) : 0.00262 ) : 0.0011 , ' Mycobacterium parafortuitum str. 311 DSM 43528 (T)' : 0.00394 ) : 0.00114 , ' Mycobacterium aichiense ATCC 27280 (T)' : 0.00228 ) : 0.00082 , (' Mycobacterium sp. str. PAH135' : 0 , ' Mycobacterium sp. str. RJGll.135 (Fast Growing Pyrene Degrader)' : 0 ) : 0.00116 ) : 0.00111 , (' Mycobacterium fortuitum subsp. fortuitum ATCC 6841 (T)' : 0.00024 , (' Mycobacterium fortuitum' : 0.0005 , ((((((' clone SMKN23' : 0 , ' clone SMKN22' : 0 ) : 0.00249 , ' Mycobacterium farcinogenes DSM 43294' : 0.00535 ) : 0.00033 , ' Mycobacterium farcinogenes ATCC 35753 (T)' : 0.00388 ) : 0 , ' Mycobacterium senegalense ATCC 35796 (T)' : 0.00162 ) : 0.00042 , ' Mycobacterium fortuitum' : 0.0022 ) : 0.00041 , ((' Mycobacterium chelonae ATCC 14472' : 0.00029 , ' Mycobacterium alvei str. CR-21 CIP 103464 (T)' : 0.00102 ) : 0.00202 , (((' Mycobacterium chelonae ATCC 49651' : 0 , ' Mycobacterium mucogenicum ATCC 49650 (T)' : 0 ) : 0 , (' Mycobacterium sp. str. 51' : 0 , ' Mycobacterium chelonae ATCC 49649' : 0.00217 ) : 0.00403 ) : 0.00137 , (((' Mycobacterium hodleri str. EMI2 DSM 44183 (T)' : 0.00666 , ' Mycobacterium diernhoferi str. SN 1418 ATCC 19340 (T)' : 0.0097 ) : 0.00046 , ' Mycobacterium neoaurum ATCC 25795 (T)' : 0.00268 ) : 0.00302 , (' Mycobacterium abscessus str. L948 ATCC 19977 (T)' : 0 , (' Mycobacterium chelonae subsp. chelonae ATCC 35752 (T)' : 0 , ' Mycobacterium abscessus str. L948 ATCC 19977 (T)' : 0.00237 ) : 0 ) : 0.01452 ) : 0.00297 ) : 0.0032 ) : 0.00136 ) : 0.00095 ) : 0.00158 ) : 0.00306 ) : 0.0056 ) : 0.00306 ) : 0.00098 , ' Mycobacterium sphagni str. Sph29 ATCC 33026' : 0.00342 ) : 0 , ' Mycobacterium komossense str. Ko2 ATCC 33013 (T)' : 0.00961 )'MYB.TUBERCULOSIS' : 0.01317 , (((' Tsukamurella paurometabola DSM 20162 (T)' : 0.00112 , ' Tsukamurella paurometabola DSM 20162 (T)' : 0.00027 ) : 0 , (' Tsukamurella pulmonis IMMIB D-1321 (T)' : 0.00036 , ' Tsukamurella paurometabola' : 0.00182 ) : 0.00089 ) : 0.00042 , ((' Tsukamurella paurometabola str. N663 NCTC 10741' : 0.00081 , ' Tsukamurella inchonensis str. IMMIB D-771 DSM 44067 (T)' : 0.0015 ) : 0.00158 , (' Tsukamurella paurometabola str. N663 NCTC 10741' : 0.00041 , (' Tsukamurella paurometabola DSM 20162 (T)' : 0 , ' Tsukamurella paurometabola DSM 20162 (T)' : 0.00045 ) : 0.00062 ) : 0.00902 ) : 0.00056 )'TSU.PAUROMETABOLA' : 0.01445 )'MYCOBACTERIA' : 0.00606 , (((((((((((((' clone SMKN12' : 0 , ' clone SMKN17' : 0 ) : 0 , ' clone SMKN29' : 0.00177 ) : 0 , ' clone SMKN14' : 0.02295 ) : 0.00136 , ' clone SMKN4' : 0.02148 ) : 0.00136 , ((' clone SMKN27' : 0.00568 , ' clone SMKN15' : 0.0034 ) : 0.00171 , (' Gordonia amarae' : 0.00763 , (' Gordonia amarae str. N667 ATCC 27808 (T)' : 0.00113 , ' Gordonia amarae str. N667 ATCC 27808 (T)' : 0 ) : 0.00029 ) : 0.00632 ) : 0.0014 ) : 0.00187 , (' clone SMKN35' : 0.01426 , ' Gordonia hirsuta str. K718a DSM 44140 (T)' : 0.04284 ) : 0.00936 ) : 0.00376 , ' Gordonia hydrophobica str. 1610/1b DSM 44015 (T)' : 0.00783 ) : 0.00191 , ((' Gordonia rubropertincta' : 0 , ' Gordonia rubropertincta ATCC 25593' : 0 ) : 0.00246 , (' Gordonia terrae DSM 43249 (T)' : 0 , (' Gordonia terrae' : 0.00043 , ' Gordonia terrae ATCC 25594 (T)' : 0 ) : 0.00152 ) : 0.05555 ) : 0.00566 )'GRD.AMARAE' : 0.00175 , ((' Gordonia aichiensis' : 0 , ' Gordonia aichiensis ATCC 33611 (T)' : 0 ) : 0 , (' Gordonia sputi CIP 1835.89' : 0.00084 , (' Gordonia sputi DSM 44019 (T)' : 0 , (' Gordonia sputi' : 0 , (' Gordonia sputi CIP 1781.88' : 0 , ' Gordonia sputi CIP 1833.89 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00068 ) : 0.00174 ) : 0.00093 )'GRD.SPUTI' : 0.01409 ) : 0.00077 , (' Gordonia bronchialis' : 0.00014 , (' Gordonia bronchialis CIP 1780.88 (T)' : 0.00442 , (' Gordonia bronchialis DSM 43247 (T)' : 0.00145 , ' Gordonia bronchialis' : 0.00057 ) : 0 ) : 0.00132 )'GRD.BRONCHIALIS' : 0.00117 ) : 0.01075 , ' Skermania piniformis str. UQM3063 IFO 15059 (T)' : 0.01951 ) : 0.00407 , ' Williamsia muralis str. MA140/96' : 0.01786 ) : 0.00286 , (((((' Dietzia maris DSM 46102' : 0 , ' Dietzia maris str. IMV 195; AUCNM-A-593; VKM Ac-593 DSM 43672 (T)' : 0 ) : 5e-05 , ' clone JN10c' : 0.02464 ) : 5e-05 , ' Dietzia maris str. IMV 195; AUCNM-A-593; VKM Ac-593 ATCC 35013 (T)' : 0.00011 ) : 0.00025 , ' Rhodococcus sp.' : 0.0954 )'DZ.MARIS' : 0.01661 , (((((' Corynebacterium xerosis DSM 20743 (T)' : 0.00023 , ' Corynebacterium xerosis ATCC 373 (T)' : 0.00015 ) : 0 , ' Corynebacterium xerosis ATCC 373 (T)' : 0 ) : 0 , ' Corynebacterium xerosis ATCC 373 (T)' : 0.00038 ) : 0.0052 , (' Corynebacterium asperum CIP 52.13' : 0.00435 , (' Corynebacterium amycolatum NCFB 2768 (T)' : 0 , ' Corynebacterium amycolatum CIP 103452 (T)' : 0.00055 ) : 0 ) : 0.01218 )'COR.XEROSIS' : 0.00502 , ((((((' Corynebacterium glutamicum DSM 20300 (T)' : 0 , ' Rhodococcus globerulus DSM 43953' : 0 ) : 0.00044 , ' Corynebacterium glutamicum NCIMB 10025 (T)' : 0.00225 ) : 0.0049 , ' Corynebacterium "acetoacidophilum" CIP 103776' : 0.00043 ) : 0 , (' Corynebacterium glutamicum NCIMB 10025 (T)' : 0.00042 , ' Corynebacterium glutamicum IAM 12435 (T)' : 0.00096 ) : 0.00041 ) : 0.01061 , (' Corynebacterium callunae NCIMB 10338 (T)' : 0 , ' Corynebacterium callunae CCUG 28793' : 0 ) : 0.01411 )'COR.GLUTAMICUM' : 0.00428 , (((((((' Corynebacterium jeikeium NCTC 11913 (T)' : 0 , ' Corynebacterium jeikeium CIP 103337 (T)' : 0 ) : 0.00098 , ' Corynebacterium jeikeium ATCC 43734 (T)' : 0.00414 ) : 0.00757 , (' Corynebacterium urealyticum DSM 7109 (T)' : 0.00067 , ' Corynebacterium urealyticum ATCC 43042 (T)' : 0.0006 ) : 0.01335 ) : 0.00237 , ' Corynebacterium falsenii str. CCUG 33651 DSM 44353 (T)' : 0.0041 ) : 0.00486 , (' Corynebacterium bovis NCTC 3224 (T)' : 0 , (' Corynebacterium bovis ATCC 7715 (T)' : 0.0034 , ' Corynebacterium bovis NCTC 3224 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.01793 ) : 0.00427 , (' Corynebacterium kroppenstedtii CCUG 35717 (T)' : 0.00646 , (' Corynebacterium variabilis str. AC 256 NCDO 2097 (T)' : 0 , ' Corynebacterium variabilis str. AC 256 NCIMB 9455 (T)' : 0 ) : 0.03722 ) : 0.00566 )'COR.UREALYTICUM' : 0.00533 , ((((((((((((' Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 102968 (T)' : 0 , ' Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97' : 0.00064 ) : 0 , ' Corynebacterium pseudotuberculosis str. S1' : 0.00072 ) : 0.0007 , (' Corynebacterium pseudotuberculosis str. OR1' : 0 , (' Corynebacterium pseudotuberculosis str. OT1' : 0 , ' Corynebacterium pseudotuberculosis' : 0 ) : 0 ) : 0.00089 ) : 0 , ' Corynebacterium pseudotuberculosis NCTC 3450 (T)' : 0 ) : 0.0012 , ' Corynebacterium ulcerans CIP 54.53' : 0 ) : 0 , ' Corynebacterium ulcerans NCTC 7910 (T)' : 0.00058 ) : 0.0003 , ' Corynebacterium ulcerans CCUG 2708 (T)' : 0.00086 ) : 0.00472 , ((' Corynebacterium argentoratense str. IBS B10697 CIP 104296 (T)' : 0.0158 , ' Corynebacterium vitarumen NCTC 20294 (T)' : 0.00491 ) : 0.0035 , (' Corynebacterium kutscheri ATCC 15677 (T)' : 0.0022 , (' Corynebacterium kutscheri CIP 103423' : 0.00064 , ' Corynebacterium kutscheri CIP 103423' : 0 ) : 0.00568 ) : 0.01642 ) : 0.00641 ) : 0.00195 , (' Corynebacterium diphtheriae NCTC 11397 (T)' : 0.00088 , ' Corynebacterium diphtheriae CIP 100721 (T)' : 0.00033 ) : 0.00639 ) : 0.00775 , (((' Corynebacterium renale str. Charita-a CIP 103421' : 0 , ' Corynebacterium renale str. Charita-a ATCC 19412 (T)' : 0 ) : 0 , ' Corynebacterium renale str. Charita-a CIP 103421' : 0.00059 ) : 0.00031 , ((' Corynebacterium renale str. HR57' : 0.00039 , ' Corynebacterium renale str. HR56' : 0 ) : 0.00335 , (' Corynebacterium renale str. HR58' : 0 , ' Corynebacterium renale str. HR59' : 0 ) : 0.00012 ) : 0.00173 ) : 0.0149 ) : 0.00196 , (' Corynebacterium durum str. IBS G15036 IBS G15036 (T)' : 0.02461 , (' Corynebacterium matruchotii DSM 20635 (T)' : 0.00369 , ' Corynebacterium matruchotii CIP 81.82 (T)' : 0.00213 ) : 0.03383 ) : 0.01165 )'COR.PSEUDOTUBERCULOSIS' : 0.00188 , (((((((((' Corynebacterium afermentans subsp. liphophilum CIP 103500 (T)' : 0 , ' Corynebacterium mucifaciens DMMZ 2278 (T)' : 0.00953 ) : 0 , ' Corynebacterium afermentans subsp. afermentans CIP 103499 (T)' : 0.00251 ) : 0.00061 , (' Corynebacterium coyleiae DMMZ 214 (T)' : 0.00588 , ' Corynebacterium afermentans str. DMMZ 545 (DMMZ 525?)' : 0.00649 ) : 0.00496 ) : 0.0019 , ((' Corynebacterium sundsvallense' : 0.0179 , ' Corynebacterium riegelii' : 0.00777 ) : 0.00791 , (' Corynebacterium pseudogenitalium NCTC 11860' : 0.00039 , (' Corynebacterium sp. str. taxon 1 CDC G4330' : 0 , ' Corynebacterium sp. str. taxon 2 CDC G5911' : 0.00312 ) : 0.00108 ) : 0.01005 ) : 0.00238 ) : 0.00329 , (' Corynebacterium "genitalium" NCTC 11859' : 0.00761 , (' Corynebacterium mycetoides NCTC 9864 (T)' : 0.0005 , ' Corynebacterium mycetoides' : 0.00059 ) : 0.02941 ) : 0.00561 ) : 0.00195 , (' Corynebacterium auris str. DZZM 328 DSM 44122 (T)' : 0.00103 , ' Corynebacterium auris str. DZZM 328 DSM 44122 (T)' : 0 ) : 0.01766 ) : 0.00335 , (((' Corynebacterium seminale CIP 104297 (T)' : 0.00394 , ' Corynebacterium glucuronolyticum str. GF 838 DSM 44120 (T)' : 0.00034 ) : 0.02526 , ' Turicella otitidis str. 234/92 DSM 8821 (T)' : 0.05423 ) : 0.00824 , (' Corynebacterium cystitidis ATCC 29593 (T)' : 0.00105 , (' Corynebacterium cystitidis CIP 103424 (T)' : 0.0004 , ' Corynebacterium cystitidis NCTC 11863 (T)' : 0 ) : 0.00139 ) : 0.02472 ) : 0.0058 ) : 0.00118 , ' Corynebacterium camporealensis str. CRS-51 CECT 4897 (T)' : 0.01291 )'COR.AFERMENTANS' : 0.00218 , ((((' Corynebacterium flavescens NCDO 1320 (T)' : 0.00065 , ' Corynebacterium flavescens CIP 69.5 (T)' : 0.00064 ) : 0.01331 , (' Corynebacterium ammoniagenes CIP 101283 (T)' : 0.00281 , ' Corynebacterium ammoniagenes CIP 101283 (T)' : 0.00291 ) : 0.01637 ) : 0.00406 , (' Corynebacterium pilosum str. 46 Hara NCTC 11862 (T)' : 0.00073 , (' Corynebacterium pilosum str. 46 Hara ATCC 29592 (T)' : 0.00332 , ' Corynebacterium pilosum str. 46 Hara ATCC 29592 (T)' : 0.00057 ) : 0.00232 ) : 0.01559 )'COR.FLAVESCENS' : 0.00353 , (((((' Corynebacterium minutissimum str. clone 1 NCTC 10288 (T)' : 0.00071 , ' Corynebacterium minutissimum str. clone 1 NCTC 10288 (T)' : 0.00102 ) : 0 , ' Corynebacterium minutissimum str. clone 1 NCTC 10288 (T)' : 0.00142 ) : 0.00099 , ' Corynebacterium singulare str. B52218 IBS B52218 (T)' : 0.00199 ) : 0.00936 , (' Corynebacterium xerosis IAM 12431' : 0.00059 , (' Corynebacterium striatum NCTC 764 (T)' : 0.00101 , ' Corynebacterium striatum CIP 81.15 (T)' : 0 ) : 0.00082 ) : 0.01256 )'COR.MINUTISSIMUM' : 0.00313 , (((' Corynebacterium "fastidiosum" CIP 103808' : 0.00156 , ' Corynebacterium "segmentosum" NCTC 934' : 0.00158 ) : 0.00167 , (' Corynebacterium accolens CCUG 28779 (T)' : 0 , ' Corynebacterium macginleyi str. JCL-2 CIP 104099 (T)' : 0.00817 ) : 0.00301 )'COR.MACGINLEYI' : 0.00278 , ((' Corynebacterium sp. CDC G5840' : 0.00108 , ' Corynebacterium "tuberculostearicum" ATCC 35692' : 0.00192 )'COR.TUBERCULOSTEARICUM' : 0.00785 , (' Corynebacterium confusum DMMZ 2439 (T)' : 0.01422 , (' Corynebacterium propinquum CIP 103792 (T)' : 0.00095 , (' Corynebacterium propinquum CIP 103792 (T)' : 0.00261 , (' Corynebacterium pseudodiphtheriticum NCTC 11136 (T)' : 0.00036 , ' Corynebacterium pseudodiphtheriticum CIP 103420 (T)' : 0.00065 ) : 0 ) : 0.00122 ) : 0.0202 )'COR.PSEUDODIPHTHERITICUM' : 0.0117 ) : 0.00322 ) : 0.00583 ) : 0.00453 ) : 0.00824 ) : 0.00764 ) : 0.00562 ) : 0.01624 ) : 0.01094 ) : 0.01925 ) : 0.00832 )'CORYNEBACTERIUM' : 0.00881 ) : 0.00176 , (' Rhodococcus zopfii ATCC 51349 (T)' : 0.00188 , ((' Rhodococcus ruber DSM 43338 (T)' : 0 , ' Mycobacterium leprae' : 0.08856 ) : 0.00289 , (((' Rhodococcus coprophilus DSM 43347 (T)' : 0.00056 , ' Rhodococcus coprophilus ATCC 29080 (T)' : 0 ) : 0.00101 , ' Rhodococcus coprophilus JCM 3200 (T)' : 0.00176 ) : 0.00377 , ((' Rhodococcus rhodochrous DSM 43274 (T)' : 0 , ' Rhodococcus rhodochrous ATCC 271 (T)' : 0 ) : 0.00108 , (' Rhodococcus rhodochrous str. 372 CIP 1759.88 (T)' : 0.00032 , (' Rhodococcus rhodochrous str. 372 DSM 43241 (T)' : 0.00063 , ' Rhodococcus rhodochrous' : 0.02182 ) : 0 ) : 0.0039 ) : 0.00719 ) : 0.00666 ) : 0.00429 )'RCO.RHODOCHROUS' : 0.00967 ) : 0.00062 , (' Rhodococcus rhodnii ATCC 35071 (T)' : 0.00026 , (' Rhodococcus rhodnii str. N 443 DSM 43337' : 0.00036 , (' Rhodococcus rhodnii str. N 445 DSM 43336 (T)' : 0 , ' Rhodococcus rhodnii str. N 444 DSM 43959' : 0 ) : 0 ) : 0.00034 )'RCO.RHODNII' : 0.0089 ) : 0.00094 , ' Nocardia corynebacteroides DSM 20151 (T)' : 0.00843 ) : 0.00083 , (((((((((((((' Rhodococcus sp. str. RHA2' : 0 , ' Rhodococcus sp. str. RHA3' : 0 ) : 0 , ' Rhodococcus sp. str. RHA3' : 0.00091 ) : 0 , ' Rhodococcus sp. str. RHA4' : 0 ) : 0.0008 , ' Rhodococcus sp. str. RHA6' : 0 ) : 0 , ' Tsukamurella wratislaviensis' : 0 ) : 0.00052 , ' Rhodococcus opacus DSM 43206 (T)' : 0.00289 ) : 0.00015 , (' Rhodococcus opacus DSM 43205 (T)' : 0 , ' Rhodococcus opacus' : 0 ) : 0.00094 ) : 0.00094 , ' Rhodococcus percolatus str. BMS1; LMAU.R292 HAMBI 1752 (T)' : 0.00341 ) : 0.00352 , (' Rhodococcus marinonascens' : 0.0003 , ' Rhodococcus marinonascens ATCC 35653 (T)' : 0 ) : 0.00459 ) : 0 , (' Rhodococcus sp.' : 0 , (' Rhodococcus sp. str. RHA1' : 0 , ' Rhodococcus sp. str. RHA7' : 0 ) : 0 ) : 0.00244 ) : 0.00211 , (((((' Rhodococcus sp. str. P6' : 0.00255 , ' Rhodococcus globerulus str. PWD1 NCIMB 12315 (T)' : 0.00068 ) : 0.00037 , ' Rhodococcus globerulus str. PWD1 NCIMB 12315 (T)' : 0.00066 ) : 0 , ' Rhodococcus globerulus str. PWD1 NCIMB 12315 (T)' : 0 ) : 0 , (' Rhodococcus globerulus DSM 43954 (T)' : 0.0003 , ' Rhodococcus sp.' : 0 ) : 0 ) : 0.00226 , ((' Rhodococcus erythropolis DSM 43188 (T)' : 0.00344 , ' Rhodococcus erythropolis DSM 43188 (T)' : 0 ) : 0 , (' Rhodococcus erythropolis' : 0 , (' str. S13A' : 0.00042 , (' Rhodococcus sp.' : 0.00247 , (' Rhodococcus erythropolis DSM 43066 (T)' : 0 , ' Rhodococcus erythropolis ATCC 4277 (T)' : 0 ) : 0.00799 ) : 0.00131 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00546 ) : 0.00292 )'RCO.OPACUS' : 0.00144 , (' Rhodococcus fascians' : 0.00014 , (' Rhodococcus fascians ATCC 35014' : 0 , (' Rhodococcus fascians str. CF19 DSM 20131' : 0 , (' Rhodococcus fascians' : 0 , ' Rhodococcus fascians ATCC 12974 (T)' : 0 ) : 0.01112 ) : 0 ) : 0.00127 )'RCO.FASCIANS' : 0.01369 ) : 0.00611 , (((((((' Rhodococcus equi str. equine lung isolate U of Illinois Vet Med Diagnostic Medicine' : 0.00048 , ' Corynebacterium hoagii ATCC 7005 (T)' : 0 ) : 0 , ' Rhodococcus equi ATCC 33701' : 0 ) : 0 , (' Rhodococcus equi ATCC 33707' : 0 , ' Rhodococcus equi ATCC 6939 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Rhodococcus equi DSM 20307 (T)' : 0 ) : 0 , ' Rhodococcus equi str. 545 DSM 43199 (T)' : 0.00079 ) : 0.00387 , (' clone SMKN6' : 0.00228 , (' clone SMKN41' : 0.0136 , (' clone 53a' : 0.00369 , (' clone 41a' : 0 , ' clone 21a' : 0.00235 ) : 0.07699 ) : 0.15356 ) : 0.11321 ) : 0.01983 )'RCO.EQUI' : 0.00485 , ((((((' Nocardia farcinica CIP 3029.92' : 0 , ' Nocardia farcinica CIP 3030.92' : 0 ) : 0 , ' Nocardia farcinica str. M. Goodfellow N898 ATCC 3318 (T)' : 0 ) : 0 , ' Nocardia farcinica str. M. Goodfellow N898 ATCC 3318 (T)' : 0.00301 ) : 0 , ' Nocardia otitidiscaviarum' : 0 ) : 0 , ' Nocardia farcinica' : 0.0003 ) : 0.0016 , ((((' Nocardia transvalensis str. N1202 DSM 43405 (T)' : 0 , ' Nocardia transvalensis str. N1202 DSM 43405 (T)' : 0.00029 ) : 0 , ' Nocardia transvalensis ATCC 6865 (T)' : 0 ) : 0 , ' Nocardia otitidiscaviarum' : 0.00712 ) : 0.00076 , (((' Nocardia brasiliensis str. M. Goodfellow N318 ATCC 19296 (T)' : 0 , ' Nocardia brasiliensis str. M. Goodfellow N318 ATCC 19296 (T)' : 0 ) : 0 , ' Nocardia brasiliensis' : 0.00031 ) : 0.00259 , (((((' Nocardia asteroides str. M. Goodfellow N317 ATCC 19247 (T)' : 0.00074 , ' Nocardia asteroides DSM 43757 (T)' : 0 ) : 0 , ' Nocardia asteroides str. M. Goodfellow N317 ATCC 19247 (T)' : 0 ) : 0.00253 , ' Nocardia salmonicida JCM 4826 (T)' : 0.01582 ) : 0.00329 , ' Nocardia asteroides ATCC 23824' : 0.00157 ) : 0.00146 , ((' Nocardia asteroides str. N 19 DSM 43005' : 0.00879 , ' Nocardia asteroides' : 0 ) : 0.0008 , (((' Nocardia carnea str. N1200 DSM 43397 (T)' : 0 , ' Nocardia carnea' : 0 ) : 0 , ' Nocardia carnea ATCC 6847 (T)' : 0.0013 ) : 0.00124 , ((' Nocardia brevicatena ATCC 15333 (T)' : 0 , ' Nocardia brevicatena str. N1201 DSM 43024 (T)' : 0.00333 ) : 0.0031 , (' Nocardia pseudobrasiliensis ATCC 51512 (T)' : 0.00602 , (((' Nocardia nova ATCC 33726 (T)' : 0 , ' Nocardia nova str. N1112 JCM 6044 (T)' : 0 ) : 0.00337 , (' Nocardia vaccinii ATCC 11092 (T)' : 0.00087 , ' Nocardia vaccinii str. N1199 DSM 43285 (T)' : 0 ) : 0.00755 ) : 0.00127 , ((' Nocardia otitidiscaviarum ATCC 14629 (T)' : 0 , ' Nocardia otitidiscaviarum ATCC 14629 (T)' : 0 ) : 0.00772 , (' Nocardia crassostreae str. NB4H C.S. Friedman ATCC 700418 (T)' : 0.00247 , (' Nocardia seriolae str. N1116 JCM 3360 (T)' : 0 , ' Nocardia seriolae ATCC 43993 (T)' : 0 ) : 0.00916 ) : 0.00047 ) : 0.00138 ) : 0.00457 ) : 0.00258 ) : 0.00926 ) : 0.00596 ) : 0.00148 ) : 0.00772 ) : 0.00533 ) : 0.00325 )'NOC.ASTEROIDES' : 0.00504 ) : 0.00665 )'RHODOCOCCUS' : 0.00419 )'MYCOBACTERIA_SUBDIVISION' : 0.01716 , ((((((((((((((' Actinobispora aurantiaca str. Y-14860 CCTCC AA97002 (T)' : 0.00904 , ' Actinobispora yunnanensis str. Y-11981 CCTCC M90959 (T)' : 0.00783 ) : 0.00316 , ' Actinobispora alaniniphila str. Y-16303 CCTCC AA97001 (T)' : 0.00863 ) : 0.00349 , ' Actinobispora xinjiangensis str. XJ-45 CCTCC AA97020 (T)' : 0.0109 ) : 0.00951 , ' Actinobispora yunnanensis IFO 15681' : 0.00221 ) : 0.00227 , (' Pseudonocardia asaccharolytica str. 580 DSM 44247 (T)' : 0.00901 , ' Pseudonocardia saturnea DSM 43195 (T)' : 0.02685 ) : 0.00428 ) : 0.00386 , (' clone K12' : 0.00682 , (' Pseudonocardia petroleophila ATCC 15777 (T)' : 0.00137 , (' Pseudonocardia hydrocarbonoxydans DSM 43281 (T)' : 0.00683 , ' Amycolata petrophilea' : 0.00244 ) : 0.00223 ) : 0.03355 ) : 0.00283 ) : 0.00475 , ' Pseudonocardia alni str. 3LS VKM AC901 (T)' : 0.00283 ) : 0.00347 , (' Pseudonocardia sulfidoxydans str. 592 DSM 44248 (T)' : 0.00555 , (' Pseudonocardia halophobica DSM 43089 (T)' : 0.00203 , ' Pseudonocardia halophobica DSM 43089 (T)' : 0.00234 ) : 0.00608 ) : 0.00509 ) : 0.00645 , ' Pseudonocardia compacta DSM 43592 (T)' : 0.00451 ) : 0.00161 , ' Pseudonocardia alni str. 3LS DSM 44104 (T)' : 0.00227 ) : 0.01296 , ' Amycolata nitrificans' : 0.00197 ) : 0.01991 , ' Pseudonocardia autotrophica' : 0.00658 ) : 0.03686 , (' Pseudonocardia thermophila str. A18 ATCC 19285 (T)' : 0.00493 , ' Pseudonocardia thermophila str. A18 ATCC 19285 (T)' : 0 ) : 0.00663 )'PSC.HALOPHOBICA' : 0.0067 , ((' Kibdelosporangium aridum subsp. aridum' : 0 , ' Kibdelosporangium aridum subsp. aridum' : 0.00116 )'KIB.ARIDUM' : 0.00288 , (((((((' Saccharopolyspora hirsuta subsp. hirsuta ATCC 27875 (T)' : 0 , ' Saccharopolyspora hirsuta subsp. hirsuta ATCC 27875 (T)' : 0.00205 ) : 0.00573 , ' Saccharopolyspora hirsuta subsp. hirsuta ATCC 27875 (T)' : 0.00226 ) : 0.00854 , ' Saccharopolyspora hordei str. A54 ATCC 49856 (T)' : 0.01411 ) : 0.00915 , (' Saccharopolyspora taberi str. LL-WRAT-210 DSM 43856 (T)' : 0.00452 , (' Saccharopolyspora spinosporotrichia str. AS4.198 DSM 44350 (T)' : 0.01704 , ' Saccharopolyspora erythraea str. M5-12259 NRRL 2338 (T)' : 0.00276 ) : 0.00993 ) : 0.00953 ) : 0.00237 , (' Saccharopolyspora gregorii str. A85 NCIMB 12823 (T)' : 0.00257 , (' Saccharopolyspora spinosa str. A83543.1 DSM 44228 (T)' : 0.01368 , ' Saccharopolyspora sp. str. A215' : 0.00641 ) : 0.0206 ) : 0.00317 ) : 0.00397 , ((' Saccharopolyspora rectivirgula ATCC 33515 (T)' : 0 , ' Saccharopolyspora rectivirgula' : 0.00099 ) : 0.02235 , (' Actinopolyspora halophila ATCC 27976 (T)' : 0.01068 , (' Actinopolyspora mortivallis JCM 7550 (T)' : 0.02195 , ' Actinopolyspora halophila' : 0.00103 ) : 0.01133 ) : 0.08231 ) : 0.00817 )'SCP.HIRSUTA' : 0.0035 , ((((((((' Saccharothrix mutabilis subsp. capreolus DSM 40225 (T)' : 0.00098 , ' Saccharothrix mutabilis subsp. mutabilis DSM 43853 (T)' : 0.00041 ) : 0.00375 , (' Saccharothrix australiensis str. LL-BM782Ce8 ATCC 31497 (T)' : 0.00066 , ' Saccharothrix australiensis str. LL-BM782Ce8 ATCC 31497 (T)' : 0.02528 ) : 0.01138 ) : 0.00197 , ' Saccharothrix coeruleofusca DSM 43679 (T)' : 0.00281 ) : 0.00524 , ' Saccharothrix longispora DSM 43749 (T)' : 0.00574 ) : 0.00195 , (' Lentzea albidocapillata str. IMMIB D-958 DSM 44073 (T)' : 0.00501 , (' Actinosynnema mirum DSM 43827 (T)' : 0.00106 , ' Actinosynnema mirum IFO 14064 (T)' : 0.00714 ) : 0.02045 ) : 0.00581 ) : 0.00436 , (' Kutzneria viridogrisea JCM 3282 (T)' : 0.00271 , ' Kutzneria viridogrisea DSM 43850 (T)' : 0.00333 ) : 0.01512 ) : 0.00608 , ' Actinokineospora riparia IFO 14541 (T)' : 0.01094 )'SCT.AUSTRALIENSIS' : 0.00339 , (((((((' Amycolatopsis sp. str. MG 417' : 0.00598 , ' Amycolatopsis orientalis subsp. orientalis DSM 40040 (T)' : 0.00794 ) : 0.00068 , ' Amycolatopsis orientalis subsp. orientalis IFO 12806 (T)' : 0.00043 ) : 0.00318 , ' Amycolatopsis azurea NRRL 11412 (T)' : 0.01004 ) : 0.004 , (' Amycolatopsis mediterranei str. ME 83/973 ATCC 13685 (T)' : 0.00068 , (' Amycolatopsis coloradensis NRRL 3218 (T)' : 0.00127 , ' Amycolatopsis alba str. A83850 DSM 44262 (T)' : 0.00191 ) : 0.01299 ) : 0.00549 ) : 0.00211 , ' Amycolatopsis sulphurea DSM 46092 (T)' : 0.00977 ) : 0.00338 , (' Amycolatopsis methanolica NCIMB 11946 (T)' : 0.02416 , ' Amycolatopsis fastidiosa ATCC 31181 (T)' : 0.01955 ) : 0.01267 )'AMY.ORIENTALIS' : 0.00604 , (' Prauserella rugosa DSM 43194 (T)' : 0.02272 , ((((' Saccharomonospora viridis str. K73 NCIMB 9602 (T)' : 0 , ' Saccharomonospora viridis str. K191; Greiner-Mai R25' : 0 ) : 0 , ' Saccharomonospora viridis str. SB-33' : 0 ) : 0.00138 , ' Saccharomonospora viridis ATCC 15386 (T)' : 0.01632 ) : 0.00282 , ((((' Saccharomonospora glauca str. K202; J-S.Ruan 350' : 0 , ' Saccharomonospora glauca str. SB-37' : 0 ) : 0 , ' Saccharomonospora glauca str. K169 DSM 43769 (T)' : 0.00031 ) : 0.00124 , ' Saccharomonospora sp. str. A1206' : 0.00134 ) : 0.00337 , (((' Saccharomonospora sp. str. K180; 30Urbakt' : 0 , ' Saccharomonospora xinjiangensis str. XJ-54 CCTCC AA97021 (T)' : 0.05421 ) : 0.00282 , ' Saccharomonospora cyanea str. K168; NA134 (T)' : 0.00494 ) : 0.00183 , (' Saccharomonospora caesia INMI 19125 (T)' : 0 , ((' Saccharomonospora caesia str. K163 DSM 43068' : 0 , ' Saccharomonospora caesia str. SB-01' : 0 ) : 0 , (' Saccharomonospora caesia str. SB-58' : 0 , (' Saccharomonospora caesia str. SB-22' : 0 , ' Saccharomonospora azurea str. K161; NA128 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00152 ) : 0.00167 ) : 0.00326 ) : 0.01348 ) : 0.00961 )'SCM.VIRIDIS' : 0.01336 ) : 0.01155 ) : 0.01895 ) : 0.0267 ) : 0.00931 )'SACCHAROPOLYSPORA' : 0.00621 ) : 0.00742 , ((((((((((((((((' Propionibacterium acnes DSM 1897 (T)' : 0.00093 , ' Propionibacterium acnes DSM 1897 (T)' : 0 ) : 0.00035 , ' Propionibacterium acnes ATCC 6919 (T)' : 0 ) : 0.00104 , ' Actinomyces israelii DSM 43020' : 0.00299 ) : 0.00031 , ' str. s13' : 0.00169 ) : 0.00818 , (' Propionibacterium avidum DSM 4901 (T)' : 0.00221 , (' Propionibacterium avidum ATCC 25577' : 0.001 , ' Propionibacterium propionicus DSM 43307 (T)' : 0 ) : 0.00415 ) : 0.00647 )'PRP.ACNES' : 0.0039 , ((' Propionibacterium granulosum DSM 20700 (T)' : 0 , ' Propionibacterium granulosum ATCC 25564' : 0.00285 ) : 0.00737 , ((' Eubacterium combesii ATCC 25545 (T)' : 0.00336 , ' Propionibacterium acidipropionici DSM 20272' : 0.00729 ) : 0.00382 , (' Propionibacterium jensenii DSM 20535 (T)' : 0.00581 , (' Propionibacterium thoenii DSM 20276 (T)' : 0 , ' Propionibacterium thoenii DSM 20276 (T)' : 0.00645 ) : 0.0068 ) : 0.03117 ) : 0.02011 )'PRP.THOENII' : 0.00913 ) : 0 , (' Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii str. E11.1 DSM 4902 (T)' : 0.00106 , (' Propionibacterium freudenreichii subsp. freudenreichii DSM 20271 (T)' : 0 , (' Propionibacterium freudenreichii subsp. freudenreichii DSM 20271 (T)' : 0.00175 , ' Propionibacterium freudenreichii subsp. freudenreichii DSM 20271 (T)' : 0.00147 ) : 0.00139 ) : 0.00104 )'PRP.FREUDENREICHII' : 0.07236 ) : 0.00932 , ' Propionibacterium propionicus DSM 43307 (T)' : 0.01276 ) : 0.00424 , ' Tessaracoccus bendigoensis str. Ben106 ACM 5119 (T)' : 0.02136 ) : 0.00227 , (' Propionibacterium lymphophilum ATCC 27520' : 0.00217 , ' Propionibacterium lymphophilum DSM 4903 (T)' : 0.00394 )'PRP.LYMPHOPHILUM' : 0.03819 ) : 0.01422 , (' Luteococcus japonicus IFO 12422 (T)' : 0.00258 , (' Luteococcus japonicus DSM 10546 (T)' : 0.00279 , ' Luteococcus japonicus IFO 12422 (T)' : 0.00406 ) : 0.02672 )'LUT.JAPONICUS' : 0.02308 ) : 0.00388 , ' Propioniferax innocua NCTC 11082 (T)' : 0.03692 ) : 0.00884 , ((' Friedmanniella antarctica str. AA-1042 DSM 11053 (T)' : 0.00336 , ' Tropheryma whippelii' : 0 ) : 0.01164 , (' Microlunatus sp. str. Y-73' : 0.01191 , (' Microlunatus phosphovorus DSM 10555 (T)' : 0 , (' Microlunatus phosphovorus str. NM-1' : 0 , ' Microlunatus phosphovorus str. NM-2' : 0 ) : 0 ) : 0.01281 ) : 0.01444 )'MCL.PHOSPHOVORUS' : 0.01288 ) : 0.00284 , (((((' Aeromicrobium fastidiosum NCIMB 12713 (T)' : 0.00435 , ' Aeromicrobium fastidiosum NCIMB 12713 (T)' : 0 ) : 0.00072 , ' Aeromicrobium fastidiosum DSM 10552 (T)' : 0.00022 ) : 0.00213 , (' Nocardioides sp. NCFB 3007' : 0 , ' Nocardioides sp. NCFB 3005' : 0 ) : 0.0024 ) : 0.00461 , (' Aeromicrobium erythreum NRRL B-3381 (T)' : 0.00049 , ' Aeromicrobium erythreum NRRL B-3381 (T)' : 0 ) : 0.00646 )'ARMB.FASTIDIOSUM' : 0.00954 , (((' Nocardioides simplex NCIMB 8929 (T)' : 0 , ' Nocardioides jensenii DSM 20641 (T)' : 0 ) : 0.00564 , ' Nocardioides jensenii DSM 20641 (T)' : 0.00044 ) : 0.01179 , (((' Nocardioides luteus NCIMB 11455 (T)' : 0.00658 , ' Nocardioides albus DSM 43109 (T)' : 0.00435 ) : 0.00399 , ' Nocardioides albus KCTC 9186 (T)' : 0.00043 ) : 0.01266 , ((((' Nocardioides plantarum DSM 11054 (T)' : 0 , ' Nocardioides plantarum str. Grainger J70 NCIMB 12834 (T)' : 0.00101 ) : 0.00034 , ' Nocardioides plantarum str. Grainger J70 NCIMB 12834 (T)' : 0.00103 ) : 0.01203 , ' clone Nb' : 0.03025 ) : 0.01179 , (' clone FJ21A' : 0.00415 , ((' Nocardioides nitrophenolicus str. NSP41' : 0.00524 , ' Nocardioides simplex KCTC 9106 (T)' : 0 ) : 1e-05 , (' clone JAP416' : 0.00373 , (' Nocardioides simplex ATCC 6946 (T)' : 0.00027 , ' Nocardioides simplex DSM 20130 (T)' : 0 ) : 0.00202 ) : 0.00217 ) : 0.00541 ) : 0.0092 ) : 0.02178 ) : 0.0144 ) : 0.03704 ) : 0.01602 ) : 0.00496 , (' Kribbella sandramycini ATCC 39419 (T)' : 0.00225 , ' Kribbella flavida IFO 14399 (T)' : 0.00209 )'KRIBBELLA' : 0.01829 )'PROPIONIBACTERIUM' : 0.01183 , (' clone SMK3' : 0.04932 , (((' Pilimelia terevasa DSM 43040 (T)' : 0.00414 , ' Pilimelia anulata DSM 43039 (T)' : 0.00549 ) : 0.00162 , ' Pilimelia terevasa IFO 15964' : 0.00181 )'PLM.TEREVASA' : 0.00527 , (((((' Actinoplanes philippinensis IFO 13878 (T)' : 0.00117 , ' Actinoplanes philippinensis DSM 43019 (T)' : 0 ) : 0 , ' Actinoplanes philippinensis' : 0.00952 ) : 0.00023 , ' Actinoplanes philippinensis ATCC 12427 (T)' : 0.00071 ) : 0.00153 , ' Actinoplanes auranticolor IFO 12245 (T)' : 0.00974 )'APL.PHILIPPINENSIS' : 0.0054 , (((' Actinoplanes regularis DSM 43151 (T)' : 0.00285 , ' Actinoplanes cyaneus DSM 46137 (T)' : 0.00998 ) : 0.00147 , ' Actinoplanes utahensis str. Bayer AG SE50/110 ATCC 31044' : 0.00651 )'APL.UTAHENSIS' : 0.00345 , (((((' Catenuloplanes japonicus DSM 44102 (T)' : 5e-05 , ' Catenuloplanes japonicus IFO 14176 (T)' : 0.0012 ) : 0.11993 , (' Glycomyces harbinensis str. LL-DO5139 IFO 14487 (T)' : 0.01399 , ' Glycomyces tenuis IFO 15904' : 0.04097 ) : 0.12949 )'GM.TENUIS' : 0.00242 , (' Catenuloplanes japonicus str. N381-14; N406-14 IFO 14177' : 0.00698 , (' Catenuloplanes japonicus IFO 14176 (T)' : 0.00539 , ' Catenuloplanes japonicus str. RA330' : 0.00366 ) : 0.00113 )'CAT.JAPONICUS' : 0.04618 ) : 0.00097 , (' Actinoplanes brasiliensis DSM 43805 (T)' : 0.00276 , ((' Catenuloplanes caeruleus subsp. azureus DSM 44103 (T)' : 1e-05 , ' Couchioplanes caeruleus subsp. azureus IFO 13993 (T)' : 0.00482 ) : 0.00011 , (' Couchioplanes caeruleus subsp. caeruleus IFO 13939 (T)' : 0.00062 , ' Couchioplanes caeruleus subsp. caeruleus IFO 13939 (T)' : 0.00288 ) : 0.00786 ) : 0.00817 )'CCP.CAERULEUS' : 0.0671 )'CATENULOPLANES' : 0.00241 , (' Spirilliplanes yamanashiensis str. YU127-1 IFO 15828 (T)' : 0.00119 , (' Verrucosispora gifhornensis str. HR1-2 DSM 44337 (T)' : 0.01433 , (' Micromonospora olivasterospora str. MK70 DSM 43868 (T)' : 0.00172 , ((((((((((((' Micromonospora rhodorangea DSM 43822 (T)' : 0 , ' Micromonospora echinospora subsp. ferruginea DSM 43141 (T)' : 0 ) : 0.00172 , ' Micromonospora echinospora subsp. echinospora DSM 43816 (T)' : 0 ) : 0.00339 , ' Micromonospora echinospora subsp. pallida DSM 43817 (T)' : 0.00085 ) : 0.00268 , ' Micromonospora inositola DSM 43819 (T)' : 0.00126 ) : 0.00298 , (' Micromonospora rosaria DSM 803 (T)' : 0.00278 , ' Micromonospora chersinia DSM 44151 (T)' : 0.00078 ) : 0.0005 ) : 0.00401 , (' Micromonospora purpurea DSM 43036 (T)' : 0.00056 , (' Micromonospora chalcea ATCC 12452 (T)' : 0.00219 , ' Micromonospora chalcea DSM 43026 (T)' : 0.00203 ) : 0.00513 ) : 0.00162 ) : 0.00441 , (' Micromonospora aurantiaca DSM 43813 (T)' : 0 , (' Micromonospora halophytica subsp. halophytica' : 0.00202 , (' Micromonospora brunnea DSM 43814 (T)' : 0.00582 , ' Micromonospora purpureochromogenes DSM 43821 (T)' : 0.00105 ) : 0.00313 ) : 0.00229 ) : 0.00155 ) : 0.0063 , ' Micromonospora halophytica subsp. nigra DSM 43818 (T)' : 0.0004 ) : 0.00579 , ' Micromonospora coerulea DSM 43143 (T)' : 0.00018 ) : 0.0046 , ' Frankia sp. str. G48' : 0.00037 ) : 0.00073 , (' Micromonospora echinospora subsp. echinospora ATCC 15837 (T)' : 0.00068 , ' Frankia sp. str. L27' : 0.00243 ) : 0.00103 )'MMS.ECHINOSPORA' : 0.00087 , ((' Micromonospora carbonacea subsp. carbonacea DSM 43168 (T)' : 0 , ' Micromonospora carbonacea subsp. aurantiaca' : 0.00068 )'MMS.CARBONACEA' : 0.00176 , (' Catellatospora ferruginea DSM 44099 (T)' : 0.00178 , ((((' Catellatospora citrea subsp. citrea IFO 14495 (T)' : 0.00249 , ' Catellatospora citrea DSM 44098 (T)' : 0.00386 ) : 0.00084 , ' Catellatospora citrea subsp. citrea DSM 44097 (T)' : 0.0026 ) : 0.008 , ' Catellatospora tsunoense DSM 44101 (T)' : 0.01649 )'CTL.CITREA' : 0.009 , ((((((' Dactylosporangium roseum IFO 14352 (T)' : 0.00022 , ' Dactylosporangium roseum IFO 14352 (T)' : 0.00264 ) : 0.00049 , ' Dactylosporangium fulvum IFO 14381 (T)' : 0.00109 ) : 0.00038 , (' Dactylosporangium fulvum DSM 43917 (T)' : 0.00076 , ' Dactylosporangium roseum DSM 43916 (T)' : 0.00165 ) : 0.00067 ) : 0 , (' Dactylosporangium thailandense IFO 12593 (T)' : 0.01985 , ' Dactylosporangium aurantiacum str. D-748 DSM 43157 (T)' : 0.00038 ) : 0.00293 ) : 0.00017 , ' Dactylosporangium thailandense DSM 43158 (T)' : 0.00391 ) : 0.00288 , (((' Dactylosporangium aurantiacum str. D-748 ATCC 23491 (T)' : 0.00079 , ' Dactylosporangium aurantiacum str. D-748 IFO 12592 (T)' : 0.00125 ) : 0.0002 , ' Dactylosporangium aurantiacum str. D-748 DSM 43157 (T)' : 0.00059 ) : 0.00137 , (' Dactylosporangium "salmoneum" DSM 43910' : 0.00213 , (' Dactylosporangium matsuzakiense DSM 43810 (T)' : 0.0004 , (' Dactylosporangium vinaceum DSM 43823 (T)' : 0.00049 , (' Dactylosporangium matsuzakiense IFO 14259 (T)' : 0 , ' Dactylosporangium vinaceum IFO 14181 (T)' : 0.00102 ) : 0.0017 ) : 0.00095 ) : 0.00452 ) : 0.00298 ) : 0.00318 )'DCT.AURANTIACUM' : 0.01126 ) : 0.00931 ) : 0.00759 ) : 0.00823 ) : 0.00503 ) : 0.00294 ) : 0.0059 ) : 0.0031 ) : 0.00517 ) : 0.00669 ) : 0.01056 ) : 0.01446 )'MICROMONOSPORA' : 0.01358 ) : 0.00488 ) : 0.00911 , (((' Thermocrispum municipale str. MKD 35 DSM 44069 (T)' : 0 , ' Thermocrispum municipale str. MKD 19' : 0.00281 ) : 0.0173 , ' Thermocrispum agreste str. CHB77 DSM 44070 (T)' : 0.01306 )'THERMOCRISPUM' : 0.0279 , (((((((' Kineosporia aurantiaca JCM 3230 (T)' : 0.0068 , ' Kineosporia aurantiaca IFO 14067 (T)' : 0.00099 ) : 0.00067 , ' Kineosporia aurantiaca ATCC 29727 (T)' : 0.0008 ) : 0.00309 , ' Kineosporia succinea str. I-273 JCM 9957 (T)' : 0.00828 ) : 0.00233 , ' Kineosporia rhizophila str. I-449 JCM 9960 (T)' : 0.01254 ) : 0.00341 , ' Kineosporia rhamnosa str. I-132 JCM 9954 (T)' : 0.00682 ) : 0.01629 , (' Kineococcus aurantiacus IFO 15268 (T)' : 0.00307 , ' Kineococcus aurantiacus IFO 15268 (T)' : 0.02302 ) : 0.02799 )'KINEOSPORIA' : 0.06614 , ((((((((((((((((' Actinomyces viscosus DSM 43027' : 0.00317 , ' Actinomyces viscosus DSM 43027' : 0 ) : 0.00166 , ' Actinomyces viscosus NCTC 10951 (T)' : 0.00065 ) : 0.00371 , (' Actinomyces naeslundii NCTC 10301 (T)' : 0.00173 , (' Actinomyces naeslundii DSM 43013 (T)' : 0.00636 , ' Actinomyces naeslundii DSM 43013 (T)' : 0.00046 ) : 0.00153 ) : 0.00405 ) : 0.00364 , ' Actinomyces slackii NCTC 11923 (T)' : 0.01471 ) : 0.00196 , ' Actinomyces denticolens NCTC 11490 (T)' : 0.02273 ) : 0.00544 , (' Actinomyces bovis DSM 43014 (T)' : 0.00463 , ' Actinomyces bovis NCTC 11535 (T)' : 0.0008 ) : 0.02031 ) : 0.00339 , (' Actinomyces howellii NCTC 11636 (T)' : 0.00604 , ((' Actinomyces israelii' : 0.00647 , ' Actinomyces israelii CIP 103259 (T)' : 0.00245 ) : 0.01402 , (' Actinomyces gerencseriae DSM 6844 (T)' : 0.00333 , (' Actinomyces gerencseriae str. WVU 307 DSM 43322' : 0 , ' Actinomyces gerencseriae str. WVU 307 DSM 43322' : 0.00098 ) : 0.00397 ) : 0.01429 ) : 0.01394 ) : 0.0063 ) : 0.04395 , ' Actinomyces graevenitzii CCUG 27294 (T)' : 0.00487 ) : 0.05475 , ' Actinomyces europaeus CCUG 32789A (T)' : 0.00453 )'ACT.VISCOSUS' : 0.03988 , (((' Actinomyces neuii subsp. neuii str. 97/90' : 0.0036 , ' Actinomyces neuii subsp. anitratus str. 50/90' : 0.00145 ) : 0.03136 , ' Mobiluncus sp. str. 0960' : 0.04929 ) : 0.02117 , (((' Actinomyces radingae str. APL1 DSM 9169 (T)' : 0.03868 , ' Actinomyces hyovaginalis NCFB 2983 (T)' : 0.00641 ) : 0.00783 , (' Actinomyces turicensis str. APL10 DSM 9168 (T)' : 0.0003 , ' unnamed organism' : 0.00021 ) : 0.00958 ) : 0.00487 , (((' Actinomyces meyeri CIP 103148 (T)' : 0.00096 , ' Actinomyces georgiae DSM 6843 (T)' : 0.01773 ) : 0.0011 , ' Actinomyces sp.' : 0.00318 ) : 0.00324 , (' Actinomyces sp. str. APL11' : 0.00303 , (' Actinomyces odontolyticus' : 0.00035 , (' Actinomyces odontolyticus DSM 43331' : 0.00111 , ' Actinomyces odontolyticus DSM 43331' : 0.00317 ) : 0.01217 ) : 0.00314 ) : 0.00574 ) : 0.00506 ) : 0.02297 )'ACT.NEUII' : 0.00507 ) : 0.03481 , (' Mobiluncus mulieris str. SV 17J ATCC 35243 (T)' : 0.00911 , (' Mobiluncus mulieris str. SV 17J ATCC 35243 (T)' : 0 , (' Mobiluncus curtisii subsp. holmesii ATCC 35242 (T)' : 0 , ((' Mobiluncus curtisii subsp. curtisii str. BV 345-16 ATCC 35241 (T)' : 1e-05 , ' Mobiluncus curtisii subsp. curtisii str. BV 345-16 ATCC 35241 (T)' : 0 ) : 0 , (' Mobiluncus mulieris str. SV 17J ATCC 35243 (T)' : 0 , ((' Mobiluncus curtisii subsp. curtisii str. BV 345-16 ATCC 35241 (T)' : 0 , ' Mobiluncus curtisii subsp. holmesii ATCC 35242 (T)' : 0 ) : 0 , (' Mobiluncus sp. str. A294' : 0 , (' Mobiluncus sp. str. A345' : 0 , ' Mobiluncus sp. str. A543' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00225 ) : 0.00754 ) : 0 ) : 0.00432 ) : 0.01598 )'MOB.CURTISII' : 0.00995 ) : 0.03425 , ' Actinomyces hordeovulneris CIP 103149 (T)' : 0.00774 ) : 0.01889 , ((' Arcanobacterium haemolyticum str. 53/W/1 NCTC 9697' : 0.01517 , ' Arcanobacterium phocae str. M2546/94/1 DSM 10004' : 0.00588 ) : 0.00925 , (((' Arcanobacterium pyogenes NCTC 5224 (T)' : 0.00013 , ' Arcanobacterium pyogenes ATCC 19411 (T)' : 0 ) : 0.00571 , ' Arcanobacterium bernardiae str. LCDC 89-0504 DSM 9152 (T)' : 0.00746 ) : 0.00423 , (' Actinobaculum suis DSM 20639 (T)' : 0.00326 , (' Actinobaculum schaalii CCUG 27420 (T)' : 0 , ' Actinobaculum schaalii CCUG 27420 (T)' : 0 ) : 0.02978 ) : 0.05788 ) : 0.01823 )'ABC.PYOGENES' : 0.00873 ) : 0.00576 , (' clone pCON4' : 0.01355 , (' Jonesia denitrificans NCTC 10816 (T)' : 0.00124 , ' Jonesia denitrificans' : 0.00153 ) : 0.15554 )'JNS.DENITRIFICANS' : 0.01014 )'ACTINOMYCES' : 0.10806 , (((((' Bifidobacterium thermophilum ATCC 25525 (T)' : 0.02515 , ' Bifidobacterium asteroides ATCC 25910 (T)' : 0.00658 ) : 0.00174 , ' Bifidobacterium coryneforme ATCC 25911 (T)' : 0.00371 ) : 0.01628 , ' Bifidobacterium minimum ATCC 27538 (T)' : 0.01107 ) : 0.03603 , ' Gardnerella vaginalis ATCC 14018 (T)' : 0.00595 )'BIF.MINIMUM' : 0.00331 , (((((' Bifidobacterium catenulatum str. B669 ATCC 27539 (T)' : 0.00343 , ' Bifidobacterium catenulatum str. B669 ATCC 27539 (T)' : 0 ) : 0.00319 , ' Bifidobacterium pseudocatenulatum ATCC 27919 (T)' : 0.00414 ) : 0.00484 , (' Bifidobacterium dentium ATCC 15423' : 0.00768 , ' Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703 (T)' : 0.01743 ) : 0.00488 ) : 0.00283 , ' Bifidobacterium angulatum ATCC 27535 (T)' : 0.01841 )'BIF.CATENULATUM' : 0.00366 , ((((' Bifidobacterium bifidum KCTC 3202' : 0 , ' Bifidobacterium bifidum KCTC 3202' : 0 ) : 0 , ' Bifidobacterium bifidum ATCC 29521 (T)' : 0.00083 ) : 0 , (' Bifidobacterium bifidum' : 0.00089 , ' Bifidobacterium bifidum DSM 20456 (T)' : 0.00104 ) : 0 )'BIF.BIFIDUM' : 0.00558 , ((((((' Bifidobacterium sp.' : 0.00087 , ' Bifidobacterium lactis str. UR1' : 0.00325 ) : 0.00193 , ' Bifidobacterium animalis ATCC 25527 (T)' : 0.00645 ) : 0.01433 , ' Bifidobacterium pseudolongum subsp. globosum ATCC 25865 (T)' : 0.00576 ) : 0.0086 , ' Bifidobacterium cuniculi ATCC 27916 (T)' : 0.01516 ) : 0.00519 , ' Bifidobacterium magnum ATCC 27540 (T)' : 0.02449 )'BIF.LACTIS' : 0.01112 , (((' Bifidobacterium breve ATCC 15698' : 0.00662 , ' Bifidobacterium infantis CIP 6469 (T)' : 0.00292 ) : 0 , (' Bifidobacterium breve' : 0 , ' Bifidobacterium infantis ATCC 15700' : 0 ) : 0.0052 ) : 0.00684 , ((((((' Bifidobacterium longum ATCC 15707 (T)' : 0 , ' Bifidobacterium longum ATCC 15707 (T)' : 0.00025 ) : 0.00043 , ' Bifidobacterium pseudolongum subsp. pseudolongum str. PNC-2-9G ATCC 25526 (T)' : 0.00043 ) : 0 , ' Bifidobacterium longum ATCC 15708' : 0.0012 ) : 0.0005 , ' Bifidobacterium suis ATCC 27533 (T)' : 0.00168 ) : 0 , ' Bifidobacterium infantis ATCC 15697 (T)' : 0 ) : 0 , (' Bifidobacterium infantis ATCC 25962' : 0 , (' Bifidobacterium infantis ATCC 15697 (T)' : 0.00192 , (' Bifidobacterium indicum ATCC 25912 (T)' : 0.00031 , (' Bifidobacterium infantis ATCC 15697 (T)' : 0 , (' Bifidobacterium infantis ATCC 15697 (T)' : 0 , ' Bifidobacterium infantis CIP 6469 (T)' : 0.00139 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00831 )'BIF.INFANTIS' : 0.01414 ) : 0.0125 ) : 0.0044 ) : 0.00511 )'BIFIDOBACTERIUM' : 0.00892 )'ACTINOMYCES' : 0.16338 , (' Bogoriella caseilytica HKI 0088 (T)' : 0.04179 , (((((((' Brachybacterium faecium DSM 4810 (T)' : 0 , ' Brachybacterium faecium' : 0.00071 ) : 0.00257 , ' Brachybacterium conglomeratum NCIMB 9859' : 0.00783 ) : 0.00343 , (' Brachybacterium tyrofermentans CNRZ 926 (T)' : 0.005 , ' Brachybacterium alimentarium CNRZ 925 (T)' : 0.0023 ) : 0.00416 ) : 0.00354 , ' Brachybacterium nesterenkovii DSM 9573 (T)' : 0.00751 )'BCB.FAECIUM' : 0.00881 , (' Dermabacter hominis DSM 7083 (T)' : 0.001 , (' Dermabacter hominis NCFB 2769 (T)' : 0.00146 , (' Dermabacter sp. str. CDC group 5, 8' : 0 , ' Dermabacter sp. str. CDC group 3, 427' : 0 ) : 0.00197 ) : 0.00255 )'DRB.HOMINIS' : 0.01939 ) : 0.00468 , ((' Dermatophilus congolensis ATCC 14637 (T)' : 0.0012 , ' Dermatophilus congolensis ATCC 14637 (T)' : 0.00018 ) : 0.00614 , (' Dermacoccus nishinomiyaensis DSM 20448 (T)' : 0.00485 , (' Demetria terragena str. HKI 0089 DSM 11295 (T)' : 0.01359 , ' Kytococcus sedentarius DSM 20547 (T)' : 0.03242 ) : 0.02316 ) : 0.01391 )'DER.CONGOLENSIS' : 0.01311 )'DERMATOPHILUS' : 0.0062 , (((((((((((((((' str. B0686' : 0.00463 , ' Arthrobacter polychromogenes str. 2568 DSM 20136 (T)' : 0 ) : 0.00022 , ' Arthrobacter oxydans DSM 20119 (T)' : 0 ) : 0.00162 , ' str. RS4' : 0.00755 ) : 0.00143 , ' str. B0672' : 0.00553 ) : 0.00022 , ' str. H61' : 0.02789 ) : 0.00165 , (' str. B0620' : 0.00091 , (' str. B0603' : 0.0009 , ' str. B0612' : 0.00277 ) : 0 ) : 0.00289 ) : 0.00616 , (' Renibacterium salmoninarum str. K272/88 (Icelandic isolate)' : 0.00075 , ' Renibacterium salmoninarum str. Les-1-74 ATCC 33209 (T)' : 0.00554 ) : 0.02113 ) : 0.00125 , (' str. B0723' : 0.02976 , ((' Arthrobacter globiformis str. 168 DSM 20124 (T)' : 0 , ' Arthrobacter globiformis str. 168 DSM 20124 (T)' : 0 ) : 0.00067 , (' Arthrobacter pascens str. B89 DSM 20545 (T)' : 0 , (' str. S7' : 0 , ' Arthrobacter ramosus str. I Gm 25 DSM 20546 (T)' : 0.01591 ) : 0 ) : 0.02882 ) : 0.01205 ) : 0.00316 )'ARB.GLOBIFORMIS' : 0.00275 , ((' Arthrobacter citreus str. C7 DSM 20133 (T)' : 0.01267 , ' Arthrobacter agilis str. W.O. 219 DSM 20550 (T)' : 0.01617 ) : 0.00647 , (' Arthrobacter ureafaciens str. NC DSM 20126 (T)' : 0.00243 , (' Rhizobium sp. str. 3466.Rhizobium isolate' : 0.01081 , (' Arthrobacter nicotinovorans DSM 420 (T)' : 0 , (' Arthrobacter histidinolovorans DSM 20115 (T)' : 0.0004 , (' Arthrobacter ilicis DSM 20138 (T)' : 0.00345 , ' Arthrobacter aurescens DSM 20116 (T)' : 0.00273 ) : 0.01832 ) : 0.00031 ) : 0 ) : 0.00386 ) : 0.00676 )'ARB.AGILIS' : 0.00705 ) : 0.00272 , ((((' Micrococcus luteus str. Hucker S66 ATCC 381' : 0.00152 , ' str. S25' : 0.03047 ) : 0 , ' Arthrobacter sp. str. H1' : 0.02786 ) : 0.00204 , ' Micrococcus lylae str. JL 178 DSM 20315 (T)' : 0.00822 ) : 0.00351 , ((' str. B755' : 0.00636 , ' str. B686' : 0.00868 ) : 0.04759 , ((' str. S36' : 0.00189 , ' str. S23' : 0.00117 ) : 0.00107 , (' Arthrobacter sulfureus DSM 20167 (T)' : 0.00611 , ((' Arthrobacter creatinolyticus str. GIFU 12498 GIFU 12498 (T)' : 0.01166 , ' Arthrobacter sp. str. S2' : 0.01775 ) : 0.00174 , ((' Arthrobacter nicotianae str. 94 DSM 20123 (T)' : 0.00063 , ' Arthrobacter uratoxydans DSM 20647 (T)' : 0.01334 ) : 0.00231 , (' Arthrobacter protophormiae str. M-570 DSM 20168 (T)' : 0 , (' clone pX1' : 0 , (' clone pCON17' : 0.00217 , ' clone pCON14' : 0.00352 ) : 0.00918 ) : 0.00158 ) : 0.00739 ) : 0.00495 ) : 0.00677 ) : 0.01516 ) : 0 ) : 0.00749 )'ARB.SULFUREUS' : 0.00316 ) : 0.00279 , (' Nesterenkonia halobia str. 28-3 DSM 20541 (T)' : 0.0316 , (' Arthrobacter atrocyaneus DSM 20127 (T)' : 0 , ' str. B0629' : 0.00281 ) : 0.02302 )'NK.HALOBIA' : 0.00455 ) : 0.00172 , ' Arthrobacter crystallopoietes DSM 20117 (T)' : 0.00576 ) : 0.00219 , ((' Rothia dentocariosa ATCC 17931 (T)' : 0.00842 , ' Stomatococcus mucilaginosus DSM 20746 (T)' : 0.00646 )'ROTHIA_AND_STOMATOCOCCUS' : 0.00286 , ((' Kocuria kristinae str. PM 129 DSM 20032 (T)' : 0.00983 , ' Kocuria varians DSM 20033 (T)' : 0.0184 ) : 0.00451 , (' Kocuria rosea str. KSE ATCC 187 (T)' : 0.00019 , ' Kocuria rosea DSM 20447 (T)' : 0.00143 ) : 0.00599 )'KOCURIA' : 0.01834 ) : 0.00235 ) : 0.00485 , ((' Brevibacterium mcbrellneri str. E2cr ATCC 49030 (T)' : 0.02132 , ' Brevibacterium otitidis str. A37/73 NCFB 3053 (T)' : 0.01562 ) : 0.00864 , (' str. GH443' : 0.00285 , (' Brevibacterium linens NCDO 739 (T)' : 0.00366 , (' Brevibacterium casei NCDO 2048 (T)' : 0.00287 , (' Brevibacterium epidermidis NCDO 2286 (T)' : 0.00132 , (' Brevibacterium iodinum NCDO 613 (T)' : 0.00105 , (' Brevibacterium linens' : 0.00792 , ' Brevibacterium iodinum' : 0 ) : 0.00196 ) : 0.0014 ) : 0.00574 ) : 0.00893 ) : 0.0158 ) : 0.01501 )'BRB.LINENS' : 0.02439 )'ARTHROBACTER' : 0.0049 , ((((((((((((' Cellulomonas turbata' : 0 , ' Cellulomonas turbata NCIMB 10587 (T)' : 0 ) : 0.00058 , ' Promicromonospora enterophila' : 0.00111 ) : 0.00689 , (' Promicromonospora citrea' : 0.00901 , (' Cellulomonas cellulans DSM 43879' : 0.00095 , ' Cellulomonas cellulans' : 0.00121 ) : 0.01376 ) : 0.00961 ) : 0.00204 , ' Cellulomonas hominis str. DMMZ CE40 (CDC group A-3) DSM 9581 (T)' : 0.00602 ) : 0.00186 , ((' Cellulomonas uda' : 0.0002 , ' Cellulomonas uda NCIMB 8200 (T)' : 0.00189 ) : 0.0018 , ((' Cellulomonas gelida' : 0.00437 , ' Cellulomonas gelida NCIMB 8076 (T)' : 0.00077 ) : 0.00118 , (' Cellulomonas flavigena NCIMB 8073 (T)' : 9e-05 , ' Cellulomonas flavigena' : 0.00362 ) : 0.01444 ) : 0.00256 ) : 0.01353 ) : 0.00443 , ((' Cellulomonas fimi' : 0 , ' Cellulomonas fimi DSM 20113 (T)' : 0 ) : 0.00029 , (' Cellulomonas biazotea DSM 20112 (T)' : 0 , ' Cellulomonas biazotea' : 0 ) : 0.00088 ) : 0.00444 ) : 0.00156 , (' Cellulomonas cellasea DSM 20118 (T)' : 0 , ' Cellulomonas cellasea' : 0 ) : 0.00546 ) : 0.00185 , (' Cellulomonas fermentans DSM 3133 (T)' : 0.00029 , ' Cellulomonas fermentans' : 0 ) : 0.01582 )'CLLM.FLAVIGENA' : 0.00092 , (' clone CY 44' : 0 , ' unnamed organism' : 0.03414 )'STR.MEDIEVAL' : 0.04992 ) : 0.00641 , ((' clone SMK143' : 0 , ' clone SMK5' : 0.00039 ) : 0.00359 , (' Sanguibacter suarezii str. ST-26' : 0.00197 , (' Sanguibacter inulinus str. ST-50 NCFB 3024 (T)' : 0.00344 , ' Sanguibacter keddieii str. ST-74 ATCC 51767 (T)' : 0.00016 ) : 0.00443 ) : 0.01955 )'SGB.INULINUS' : 0.00705 ) : 0.00436 , (' str. SBR1075' : 0.00343 , (' Intrasporangium calvum str. No.7 KIP IFO 12989 (T)' : 0.00459 , (' Terracoccus luteus DSM 44267 (T)' : 0.00199 , (' Janibacter limosus str. 2003-10 DSM 11140 (T)' : 0.00421 , (' Terrabacter tumescens NCIMB 8914 (T)' : 0.00421 , ' Terrabacter tumescens' : 0.00036 ) : 0.01498 ) : 0.01097 ) : 0.00608 ) : 0.05315 )'TRB.TUMESCENS' : 0.01006 )'CELLULOMONAS' : 0.00655 , (((((((((' Clavibacter michiganense' : 0 , ' Clavibacter michiganense' : 0 ) : 0 , ' Clavibacter michiganense subsp. tessellarius ATCC 33566 (T)' : 0 ) : 0.00022 , (' Clavibacter michiganense subsp. sepedonicum LMG 2889 (T)' : 0.00024 , ' Clavibacter michiganense subsp. nebraskense DSM 7483 (T)' : 0.00119 ) : 0.00049 ) : 0.00024 , (' Clavibacter michiganense subsp. insidiosum JCM 1369 (T)' : 0.00018 , (' Clavibacter michiganense subsp. michiganense LMG 7333 (T)' : 0.00161 , (' Clavibacter michiganense subsp. sepedonicum' : 0 , ' Clavibacter michiganense subsp. nebraskense LMG 5627 (T)' : 0.00461 ) : 0.00467 ) : 0.00214 ) : 0.00024 ) : 0.00024 , ' Clavibacter michiganense subsp. michiganense JCM 3345' : 0.00338 ) : 3e-05 , (' Clavibacter michiganense subsp. michiganense DSM 46364 (T)' : 0.00024 , ' Clavibacter michiganense subsp. insidiosum LMG 3663 (T)' : 0 ) : 0.00024 )'CLV.MICHIGANENSE' : 0.00349 , ((' Cryobacterium psychrophilum str. 27-O-b JCM 1463 (T)' : 0.01899 , ' str. RS28' : 0.00448 ) : 0.0103 , (' Rathayibacter toxicus str. CS14 JCM 9669 (T)' : 0.00471 , (' Rathayibacter tritici DSM 7486 (T)' : 0.00113 , (' Rathayibacter rathayi JCM 9307 (T)' : 0.00369 , ' Rathayibacter rathayi DSM 7485 (T)' : 0 ) : 0.00112 ) : 0.01476 ) : 0.0132 )'RTB.RATHAYI' : 0.01202 ) : 0.00338 , (' Brevibacterium "helvolum" DSM 20419' : 0.02212 , (' Curtobacterium luteum DSM 20542 (T)' : 0.00042 , ' Curtobacterium citreum DSM 20528 (T)' : 0.00136 ) : 0.00942 )'CUB.CITREUM' : 0.00463 )'CLAVIBACTER' : 0.00353 , ((((((((' Agrococcus jenensis DSM 9580 (T)' : 1e-05 , ' clone 5111' : 0.01529 ) : 0.02815 , ' clone 16a' : 0.02669 ) : 0.00121 , ' str. S10' : 0.00532 ) : 0.00689 , (' Leucobacter komagatae' : 0.00543 , ' Leucobacter komagatae' : 0.01113 ) : 0.04317 ) : 0.00609 , ((' Clavibacter xyli subsp. cynodontis str. Cxc' : 0 , ' Clavibacter xyli subsp. cynodontis str. TB1A JCM 9733' : 0 ) : 0.00242 , (' Corynebacterium "aquaticum" DSM 20146' : 0.00249 , ' Corynebacterium "aquaticum" JCM 1368' : 0.00063 ) : 0.00251 ) : 0.00669 ) : 0.00178 , (' clone 5011' : 0.00065 , (' Tropheryma whippelii str. patient 1' : 0 , ' unnamed organism' : 0.00157 ) : 0.01303 ) : 0.05665 )'LEUCOBACTER' : 0.00826 , (((((' Agromyces mediolanus str. CNF 183; K. Aoki AN-9 JCM 9631' : 0.0021 , ' Agromyces mediolanus str. CNF 208 JCM 9633' : 0.01702 ) : 0.00149 , ' Agromyces mediolanus str. CNF 186; K. Aoki AN-15 JCM 9632' : 0.00152 ) : 0.00339 , ' Agromyces mediolanus JCM 1376' : 0.00047 ) : 0 , ' Agromyces mediolanus DSM 20152 (T)' : 0.00131 ) : 0.00655 , ((' Agromyces cerinus subsp. cerinus JCM 9083 (T)' : 0 , ' Agromyces cerinus subsp. cerinus DSM 8595 (T)' : 0.00697 ) : 0.00099 , (' Agromyces ramosus DSM 43045 (T)' : 0.00133 , (' Agromyces succinolyticus str. CNF 201' : 0.00731 , ' Agromyces fucosus subsp. hippuratus JCM 9086 (T)' : 0.0042 ) : 0.00466 ) : 0.00056 ) : 0.01724 )'AGROMYCES' : 0.00989 ) : 0.00429 , (' Microbacterium barkeri DSM 20145 (T)' : 0.00397 , ((' Microbacterium esteraromaticum ATCC 8091 (T)' : 1e-05 , ' clone 5411' : 0.03897 )'MBM.ESTERAROMATICUM' : 0.00045 , ((' Microbacterium arabinogalactanolyticum str. M-2 IFO 14344 (T)' : 0.0013 , ' clone py3' : 0.00125 )'MBM.ARABINOGALACTANOLYTICUM' : 0.00071 , (((((((' Microbacterium maritypicum ATCC 19260 (T)' : 0.00103 , ' Microbacterium liquefaciens DSM 20638 (T)' : 0 ) : 0.00493 , ' str. UW 103/A31' : 0.00035 ) : 0.01128 , (' Microbacterium keratanolyticum DSM 8606 (T)' : 0.00033 , ' Microbacterium keratanolyticum IFO 13309 (T)' : 0.00025 ) : 0.00048 ) : 0.00159 , ' Microbacterium saperdae str. 48-1-4 IFO 15038 (T)' : 0.00019 ) : 0.00052 , ' Microbacterium luteolum str. 69 IFO 15074 (T)' : 0.0002 ) : 0.00276 , ' Microbacterium sp. str. Mainz' : 0.00166 )'MBM.KERATANOLYTICUM' : 0 , (((((' Microbacterium trichothecenolyticum str. 114-2 IFO 15077 (T)' : 0.00498 , ' Microbacterium ketosireducens IFO 14548 (T)' : 0.00507 ) : 0.00214 , (' Microbacterium halophilum str. N 76 IFO 16062 (T)' : 0.00242 , ' Microbacterium thalassium IFO 16060 (T)' : 0.02087 ) : 0.00313 ) : 0.00183 , ' Aureobacterium resistens DMMZ 1710 (T)' : 0.00395 ) : 0.00066 , ' Microbacterium testaceum DSM 20166 (T)' : 0.00535 )'MBM.THALASSIUM' : 0.00169 , ((((' Microbacterium arborescens DSM 20754 (T)' : 0.00101 , ' Microbacterium imperiale DSM 20530 (T)' : 0.00049 ) : 0.00796 , (' Microbacterium arborescens IFO 3750 (T)' : 0.00113 , ' Microbacterium imperiale IFO 12610 (T)' : 0.00181 ) : 0.00032 ) : 0.01138 , ' Microbacterium hominis IFO 15708 (T)' : 0.00706 ) : 0.00144 , ((((' Microbacterium lacticum DSM 20427 (T)' : 0.0084 , ' Microbacterium lacticum IFO 14135 (T)' : 0.0029 ) : 0.00077 , ' Microbacterium terregens str. 88 IFO 12961 (T)' : 0.00478 ) : 0.00023 , ' Microbacterium schleiferi str. S 110 IFO 15075 (T)' : 0.00545 ) : 0.00097 , (' Microbacterium aurum IFO 15204 (T)' : 0.00338 , ((' Microbacterium aurantiacum IFO 15234 (T)' : 0.00248 , ' Microbacterium chocolatum IFO 3758 (T)' : 0.00409 ) : 0.00037 , (' str. e428122' : 0.00029 , (' Microbacterium flavescens IFO 15039 (T)' : 0.0036 , (' Microbacterium dextranolyticum str. M-73 IFO 14592 (T)' : 0.00471 , ' Microbacterium laevaniformans IFO 14471 (T)' : 0.00776 ) : 0.00539 ) : 0.00355 ) : 0.00337 ) : 0.01147 ) : 0.00114 ) : 0.00405 )'MBM.IMPERIALE' : 0.00324 ) : 0.00138 ) : 0.00142 ) : 0.01427 ) : 0.01604 )'MBM.LACTICUM' : 0.01106 ) : 0.00812 ) : 0.00978 ) : 0.00636 ) : 0.0071 ) : 0.06199 )'ARTHROBACTER' : 0.00559 ) : 0.00905 ) : 0.00604 )'ARTHROBACTER_SUBDIVISION' : 0.00575 ) : 0.00807 , ((((((((((((((((((((' Kitasatospora cheerisanensis str. YC75' : 0.0085 , ' Kitasatospora phosalacinea str. KA-338 JCM 3340 (T)' : 0.00022 ) : 0.00197 , ' Kitasatospora phosalacinea str. KA-338 DSM 43860 (T)' : 0.00237 ) : 0.00155 , ' Kitasatospora griseola str. AM-9660 DSM 43859 (T)' : 0.00309 ) : 0.00353 , ' Kitasatospora setae DSM 43861 (T)' : 0.00365 ) : 8e-05 , ' Kitasatospora setae JCM 3304 (T)' : 0.00063 ) : 0.00023 , ' Kitasatospora paracochleata str. 14769' : 0.00352 ) : 3e-05 , ' Kitasatospora cystarginea str. RK-419 JCM 7356 (T)' : 0.00507 ) : 0.00026 , ' Streptomyces aureofaciens str. A-377 NRRL 2209 (T)' : 0.00728 ) : 0.0001 , ' Kitasatospora azatica IFO 13803 (T)' : 0.00471 ) : 0.00125 , (' Streptomyces lavendulae subsp. lavendulae DSM 2014 (T)' : 0.00061 , ((' Streptomyces subrutilus DSM 40445 (T)' : 0.00075 , ' Streptomyces lavendulae subsp. lavendulae IFO 12789 (T)' : 0.00045 ) : 0.00048 , (' Streptomyces virginiae IFO 3729 (T)' : 0 , ' Streptomyces virginiae IFO 12827 (T)' : 0.00056 ) : 0.00056 ) : 0.00187 ) : 0.02219 ) : 0.00128 , (((' Streptomyces sp. str. GP 770; isolate E. Atalan A46R51' : 0.00033 , ' Streptomyces sp. str. GP 772; isolate E. Atalan A46R47' : 0.00069 ) : 0.00035 , ' Streptomyces sp. str. GP 773; isolate E. Atalan A81319' : 0.00165 ) : 0.00114 , (' Streptomyces setonii ATCC 25497 (T)' : 0.00076 , (' Streptomyces griseus subsp. griseus ATCC 23345 (T)' : 0 , (' Streptomyces ornatus DSM 40307' : 0.00064 , ' Streptomyces griseus subsp. griseus KCTC 9080 [gene=rrnE gene]' : 0 ) : 0.00762 ) : 0.00116 ) : 0.00333 ) : 0.00402 )'KTS.SETAE' : 0.00182 , (' Streptomyces purpureus DSM 43460 (T)' : 0.00101 , (' Streptomyces mobaraensis DSM 40587 (T)' : 0.0019 , ((' Streptomyces luteoverticillatus DPDU 0081' : 0.00242 , ' Streptomyces seoulensis str. IMSNU-1 IMSNU 21266' : 0.0049 ) : 0.00206 , ((((' Streptomyces galbus' : 0.00065 , ' Streptomyces hygroscopicus' : 0.00219 ) : 0.00318 , ' Streptomyces lincolnensis' : 0.00568 ) : 0.00172 , ' Streptomyces galbus DSM 40480' : 0.00365 ) : 0.00363 , (' Streptomyces bottropensis ATCC 25435 (T)' : 0.00212 , (((' Streptomyces scabiei ATCC 33282' : 0 , ' Streptomyces scabiei str. SNS-26' : 0 ) : 0 , ' Streptomyces scabiei ATCC 49173 (T)' : 0.00028 ) : 0 , (' Streptomyces diastatochromogenes ATCC 12309 (T)' : 0.00327 , (' Streptomyces neyagawaensis ATCC 27449 (T)' : 0.00152 , (' Streptomyces acidiscabies ATCC 49003 (T)' : 0.00794 , ' Streptomyces sp. str. 91-Sy-13' : 0.01153 ) : 0.00374 ) : 0.00331 ) : 0.0011 ) : 0.00304 ) : 0.00482 ) : 0.00499 ) : 0.01393 ) : 0.00613 )'STM.SCABIEI' : 0.00241 ) : 0.00633 , ' Streptomyces bikiniensis DSM 40581 (T)' : 0.00701 ) : 0.00437 , ((' Streptomyces cinnamoneus subsp. cinnamoneus DPDU 0093 (T)' : 0 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE10' : 0.13079 ) : 0.00058 , (' Streptomyces olivoreticuli subsp. cellulophilus DPDU 0278 (T)' : 0 , (' Streptomyces cinnamoneus subsp. azacolutus DPDU 0074 (T)' : 0.00279 , ' Streptomyces roseoverticillatus DPDU 0819 (T)' : 0.00017 ) : 0.00273 ) : 0.00248 )'STM.CINNAMONEUS' : 0.00736 ) : 0.00237 , ' Streptomyces salmonis DPDU 00098 (T)' : 0.00257 ) : 0.00122 , ' Streptomyces abikoensis DSM 40831 (T)' : 0.00265 ) : 0.00364 , ((' Amycolatopsis orientalis subsp. lurida DSM 43187' : 0.00498 , ' Streptomyces lydicus str. D-45 ATCC 25470 (T)' : 0.00585 ) : 0.00052 , (' Streptomyces rimosus [gene=rrnF gene]' : 0.00159 , (' clone K1' : 0.0031 , (' Streptomyces armeniacus JCM 3070 (T)' : 0.00148 , (' Streptomyces armeniacus JCM 3070 (T)' : 0.00022 , ' Streptomyces armeniacus JCM 3070 (T)' : 0.00025 ) : 0.00244 ) : 0.01202 ) : 0.00727 ) : 0.00392 )'STM.ARMENIACUS' : 0.00672 ) : 0.00171 , ((((' Streptomyces megasporus DSM 41476 (T)' : 0.01356 , ' Streptomyces macrosporus DSM 41449 (T)' : 0.00421 ) : 0.0079 , ' Streptomyces thermolineatus DSM 41451 (T)' : 0.01126 ) : 0.00333 , ' Streptomyces mashuensis DSM 40221 (T)' : 0.01069 )'STM.MASHUENSIS' : 0.00311 , (((((' Streptomyces thermodiastaticus DSM 40573 (T)' : 0.00164 , ' Streptomyces thermodiastaticus JCM 4840 (T)' : 0.00284 ) : 0.00129 , ' Streptomyces thermoviolaceus subsp. thermoviolaceus str. ISP 5443 DSM 40443 (T)' : 0.00254 ) : 0.0014 , (' Streptomyces thermodiastaticus JCM 4840 (T)' : 0.00171 , ' Streptomyces thermoviolaceus subsp. apingens DSM 41392 (T)' : 0.00024 ) : 0.00171 ) : 0.0036 , (' Streptomyces thermoalcalitolerans str. TA56 DSM 41741 (T)' : 0.00262 , (' Streptomyces thermogriseus str. Y-14046 CCTCC AA97014 (T)' : 0.00082 , (' Streptomyces thermovulgaris str. ISP 5444 DSM 40444 (T)' : 0 , ' Streptomyces thermovulgaris str. ISP 5579 DSM 40579 (T)' : 0.00024 ) : 0.00818 ) : 0.00085 ) : 0.006 )'THERMOPHILIC_STREPTOMYCES' : 0.00163 , ((((((((' Streptomyces canescens DSM 40001 (T)' : 0 , ' Streptomyces albidoflavus DSM 40455 (T)' : 0 ) : 0 , ' Streptomyces odorifer DSM 40347 (T)' : 0 ) : 0 , (' Streptomyces sampsonii DSM 40394 (T)' : 0 , ' Streptomyces limosus DSM 40131 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Streptomyces felleus DSM 40130 (T)' : 0 ) : 0 , ' Streptomyces coelicolor DSM 40233 (T)' : 0 ) : 0 , ' Streptomyces sampsonii ATCC 25495 (T)' : 0 ) : 0.00079 , (' Streptomyces diastaticus subsp. diastaticus DSM 40496 (T)' : 0 , (' Streptomyces rutgersensis subsp. rutgersensis DSM 40077 (T)' : 0 , (' Streptomyces gougerotii DSM 40324 (T)' : 0 , ' Streptomyces intermedius DSM 40372 (T)' : 0.00089 ) : 0.00027 ) : 0.00264 ) : 0.00854 )'STM.ALBIDOFLAVUS' : 0.00071 , (' Streptomyces eurythermus ATCC 14975 (T)' : 0.00207 , ((' Streptomyces brasiliensis str. CCIB 71 DSM 43159 (T)' : 0.00315 , ' Streptomyces bluensis' : 0.00885 ) : 0.00287 , ((((' Streptomyces espinosus NRRL 5729' : 0.0027 , ' Streptomyces sp. NRRL 3890' : 0.00157 ) : 0.00864 , ' Streptomyces glaucescens' : 0.0045 ) : 0.0006 , ' Streptomyces thermocarboxydus str. AT37 DSM 44293 (T)' : 0.00398 ) : 0.00185 , (' Streptomyces pseudogriseolus NRRL 3985' : 0.00122 , ((' Streptomyces caelestis NRRL 2418 (T)' : 0.00423 , ' Streptomyces ambofaciens' : 0.00142 ) : 0.00084 , (' Streptomyces tendae ATCC 19812 (T)' : 0 , ((' Streptomyces lividans str. TK21 [gene=rrnB gene]' : 0.00038 , ' Streptomyces coelicolor str. A3(2)' : 0.00154 ) : 0 , (' Streptomyces lividans str. TK64' : 0.00944 , (' Streptomyces coelicolor' : 0 , ' Streptomyces coelicolor str. M145; A3(2)' : 0.00232 ) : 0.01014 ) : 0.00241 ) : 0.00129 ) : 0.00283 ) : 0.00379 ) : 0.00248 ) : 0.00644 ) : 0.00323 )'STM.COELICOLOR' : 0.00402 ) : 0.00354 ) : 0.00315 ) : 0.00213 ) : 0.00937 , ' Streptomyces albus subsp. albus DSM 40313 (T)' : 0.00545 )'STREPTOMYCES' : 0.01595 , (((((((((((((' Actinomadura verrucosospora JCM 3147 (T)' : 0.00015 , ' Actinomadura formosensis str. C-36820 JCM 7474 (T)' : 0.006 ) : 0.00072 , ' Actinomadura coerulea IFO 14679 (T)' : 0.002 ) : 0 , ' Actinomadura citrea IFO 14678 (T)' : 0.00214 ) : 0.0006 , (' Actinomadura macra IFO 14102 (T)' : 0.0006 , (' Actinomadura luteofluorescens IFO 13057 (T)' : 0.00165 , ' Actinomadura verrucosospora IFO 14100 (T)' : 0.00127 ) : 0.00842 ) : 0.00084 ) : 0.00251 , ((' Actinomadura rugatobispora IFO 14382 (T)' : 0.00174 , ' Actinomadura viridis str. Mt-1 IFO 15238' : 0.00958 ) : 0.00658 , (' Actinomadura fulvescens str. IFO 14347 (T)' : 0.00423 , ' Actinomadura atramentaria IFO 14695 (T)' : 0.01675 ) : 0.00071 ) : 0.00173 ) : 0.00285 , (' Actinomadura madurae IFO 14623 (T)' : 0.00049 , (' Actinomadura madurae JCM 7436 (T)' : 0.00415 , (' Actinomadura madurae DSM 43067 (T)' : 0.00038 , ' Actinomadura madurae JCM 7436 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00493 ) : 0.00291 ) : 0.00391 , (' Excellospora viridilutea IFO 14480' : 0.01731 , (' Actinomadura kijaniata DSM 43764 (T)' : 0.00157 , ' Actinomadura kijaniata IFO 14229 (T)' : 0.00073 ) : 0.00296 ) : 0.00201 ) : 0.00193 , ' Actinomadura cremea subsp. rifamycini IFO 14183 (T)' : 0.01598 ) : 0.00059 , ' Spirillospora albida IFO 12248 (T)' : 0.01065 )'AMD.MADURAE' : 0.00229 , (' Actinomadura glomerata str. I-226 JCM 9376 (T)' : 0.00421 , (' Actinocorallia herbida str. AL-50780 IFO 15485 (T)' : 0.00213 , (' Actinomadura libanotica IFO 14095 (T)' : 0.00265 , ' Actinomadura aurantiaca JCM 8201 (T)' : 0.00135 ) : 0.00462 ) : 0.00457 )'AMD.HERBIDA' : 0.00743 ) : 0.00295 , ((((' Thermomonospora curvata IFO 15933' : 0.0007 , ' Thermomonospora curvata JCM 3096 (T)' : 0.00207 ) : 0 , ' Thermomonospora curvata DSM 43183 (T)' : 0.00037 ) : 0.00419 , ' Actinomadura echinospora IFO 14042 (T)' : 0.01539 )'TMMS.CURVATA' : 0.01419 , ((' Thermobispora bispora str. R51 ATCC 19993 (T) [gene=rrnA]' : 0.00043 , ' Thermobispora bispora str. R51 ATCC 19993 (T) [gene=rrnC]' : 0.00216 ) : 0.02105 , (' Thermobispora bispora str. R51 ATCC 19993 (T) [gene=rrnB]' : 0.00088 , (' Thermobispora bispora str. R51 ATCC 19993 (T)' : 0 , ' Thermobispora bispora str. R51 ATCC 19993 (T) [gene=rrnD]' : 0.00311 ) : 0.00269 ) : 0.03165 )'THS.BISPORA' : 0.03969 ) : 0.00327 ) : 0.00904 , (((' Thermobifida alba str. T-3 ATCC 27644 (T)' : 0.00089 , ' Thermobifida alba JCM 3077 (T)' : 0.00206 ) : 0.00429 , (' Thermobifida fusca str. 190Th ATCC 27730 (T)' : 0.00189 , ' Thermobifida fusca str. 190Th ATCC 27730 (T)' : 0.0008 ) : 0.00613 )'TBF.FUSCA' : 0.00835 , ((((' Nocardiopsis prasina DSM 43845 (T)' : 0.00312 , ' Nocardiopsis listeri DSM 40297 (T)' : 0.00234 ) : 0.00145 , ' Nocardiopsis alba DSM 43377 (T)' : 0.00192 ) : 0.00161 , ' Nocardiopsis lucentensis DSM 44048 (T)' : 0.00381 ) : 0.00149 , ((' Nocardiopsis dassonvillei DSM 43111 (T)' : 0 , ' Nocardiopsis dassonvillei IFO 14626 (T)' : 0.00364 ) : 0.0007 , (' Nocardiopsis dassonvillei DSM 40465 (T)' : 0.00044 , (' Nocardiopsis synnemataformans str. D-1215 JCM 10456 (T)' : 0 , ' Nocardiopsis dassonvillei DSM 43884 (T)' : 0.00151 ) : 0.0008 ) : 0.00105 ) : 0.002 )'NRP.DASSONVILLEI' : 0.01737 )'NOCARDIOPSIS' : 0.02376 )'ACTINOMADURA' : 0.00447 , (((' Streptosporangium roseum DSM 43021 (T)' : 0 , ' Streptosporangium roseum JCM 3005 (T)' : 0.00324 ) : 0.00759 , ' Streptosporangium nondiastaticum DSM 43348 (T)' : 0.01138 )'STS.NONDIASTATICUM' : 0.00098 , (((((' Streptosporangium viridialbum DSM 46131' : 0 , ' Streptosporangium pseudovulgare DSM 43181 (T)' : 0 ) : 0.00073 , (' Streptosporangium nondiastaticum DSM 43848 (T)' : 0.0053 , ' Streptosporangium pseudovulgare' : 0.00335 ) : 0.00916 ) : 0.00115 , (' Streptosporangium pseudovulgare IFO 13991 (T)' : 0.00182 , ' Streptosporangium nondiastaticum IFO 13990 (T)' : 0.00271 ) : 0.00213 ) : 0.00262 , (' Streptosporangium fragile DSM 43847 (T)' : 0.00047 , ' Streptosporangium fragile IFO 14311 (T)' : 0.00154 ) : 0.00346 )'STS.PSEUDOVULGARE' : 0.0002 , (((((((' Streptosporangium "brasiliense" DSM 44109' : 0.00177 , ' Streptosporangium sp. DSM 43137' : 0 ) : 0.00067 , ' Streptosporangium "rubrum" DSM 44095' : 0.00124 ) : 0 , ' Streptosporangium album DSM 43023 (T)' : 0 ) : 0 , (' Streptosporangium "koreanum" DSM 44110' : 0 , (' Streptosporangium roseum subsp. "incarnatum" DSM 44111' : 0 , ' Streptosporangium roseum DSM 43871' : 0 ) : 0 ) : 0.00092 ) : 0 , (' Streptosporangium vulgare DSM 43802 (T)' : 0 , ' Streptosporangium roseum DSM 43021 (T)' : 0 ) : 0.0003 ) : 0.00194 , (' Streptosporangium vulgare subsp. "antibioticum" DSM 44112' : 0 , (' Streptosporangium vulgare IFO 13985 (T)' : 0 , ((' Streptosporangium amethystogenes subsp. amethystogenes DSM 43179 (T)' : 0.00023 , ' Streptosporangium amethystogenes DSM 46128' : 0 ) : 0.0007 , (' Streptosporangium vulgare DSM 46133' : 0 , (' Streptosporangium longisporum DSM 43180 (T)' : 0 , ' Streptosporangium longisporum IFO 13141 (T)' : 0.00057 ) : 0.00483 ) : 0.00074 ) : 0.00104 ) : 0.0005 ) : 0.00254 )'STS.ROSEUM' : 0.00149 , (((' Streptosporangium violaceochromogenes DSM 43849 (T)' : 0.00104 , ' Streptosporangium violaceochromogenes DSM 43872' : 0.0027 ) : 0.01248 , ' Streptosporangium violaceochromogenes JCM 3281 (T)' : 0.002 )'STS.VIOLACEOCHROMOGENES' : 0.00163 , (' Streptosporangium carneum DSM 44125 (T)' : 0.00295 , (' Planomonospora parontospora subsp. parontospora IFO 13880 (T)' : 0.00316 , ((' Streptosporangium viridialbum DSM 43801 (T)' : 0.00147 , ' Streptosporangium viridialbum JCM 3027 (T)' : 0.00544 )'STS.VIRIDIALBUM' : 0.0013 , ((' Planobispora longispora IFO 13918' : 0.00984 , ' Streptosporangium "cinnabarium" DSM 44094' : 0.00841 )'PBS.LONGISPORA' : 0.00363 , (((((((' Nonomuria pusilla IFO 14684 (T)' : 0 , ' Nonomuria pusilla IFO 14684 (T)' : 0.00766 ) : 0.00239 , ' Nonomuria angiospora IFO 13155 (T)' : 0.013 ) : 0.001 , (' Nonomuria helvata IFO 14681 (T)' : 0.00363 , ' Nonomuria spiralis IFO 14097 (T)' : 0.0054 ) : 0.00211 ) : 0.0005 , (' Nonomuria ferruginea str. 487-2 IFO 14094 (T)' : 0.00184 , (' Nonomuria salmonea DSM 43678 (T)' : 0.00465 , ' Nonomuria salmonea IFO 14687 (T)' : 0.00169 ) : 0.01152 ) : 0.00102 ) : 0.00223 , (' Nonomuria polychroma IFO 14345 (T)' : 0.00725 , ' Nonomuria fastidiosa IFO 14680 (T)' : 0.01101 ) : 0.00361 ) : 0.00363 , (' Nonomuria africana IFO 14745 (T)' : 0.00111 , (' Nonomuria roseola IFO 14685 (T)' : 0.00268 , ' Nonomuria recticatena IFO 14525 (T)' : 0.00117 ) : 0.0029 ) : 0.00746 )'NM.SALMONEA' : 0.00521 , ((' Thermomonospora chromogena ATCC 43196 (T)' : 0.00643 , ' Thermomonospora chromogena str. Agre 577 JCM 6244 (T)' : 0.00237 )'TMMS.CHROMOGENA' : 0.04534 , ((((' Streptosporangium corrugatum IFO 13972 (T)' : 0.0044 , ' Streptosporangium corrugatum' : 0.00223 ) : 0.00043 , ' Streptosporangium corrugatum DSM 43316 (T)' : 0.00438 ) : 0.00225 , (' Herbidospora cretacea str. K-319 IFO 15474' : 0.00422 , ' Streptosporangium claviforme DSM 44127 (T)' : 0.0015 ) : 0.00368 )'STS.CORRUGATUM' : 0.00331 , (((((' Microtetraspora niveoalba IFO 15239 (T)' : 0.00482 , ' Microtetraspora fusca IFO 13915 (T)' : 0.00026 ) : 0.00055 , ' Microtetraspora glauca IFO 14761 (T)' : 0.00181 ) : 0.00076 , ' Microtetraspora glauca DSM 43311 (T)' : 0.00119 ) : 0 , ' Microtetraspora glauca IFO 14761 (T)' : 0.0022 )'MTT.GLAUCA' : 0.00828 , (' Planotetraspora mira IFO 15435 (T)' : 0.00601 , (' Microbispora rosea subsp. rosea IFO 14044 (T)' : 0.00257 , ((' Microbispora rosea subsp. rosea ATCC 27098 (T)' : 0.00273 , ' Microbispora rosea subsp. rosea ATCC 33326 (T)' : 0.00459 ) : 0.00257 , (' Microbispora rosea subsp. aerata ATCC 15448 (T)' : 0.00031 , ((' Microbispora rosea subsp. rosea ATCC 27099 (T)' : 0.00128 , ' Microbispora mesophila str. T-1 JCM 3151 (T)' : 0.02049 ) : 0.00159 , (' Microbispora rosea subsp. rosea JCM 3021 (T)' : 0.00205 , (' Microbispora rosea subsp. rosea IFO 14876 (T)' : 0.00175 , ' Microbispora rosea subsp. rosea IFO 14041 (T)' : 0.00119 ) : 0.00247 ) : 0.00429 ) : 0.0037 ) : 0.00772 ) : 0.00409 ) : 0.00799 )'MBSP.ROSEA' : 0.00349 ) : 0.00398 ) : 0.00345 ) : 0.00192 ) : 0.00665 ) : 0.00361 ) : 0.0053 ) : 0.0057 ) : 0.01118 ) : 0.0018 ) : 0.00359 ) : 0.00262 )'STREPTOSPORANGIUM' : 0.01547 ) : 0.01771 )'STREPTOMYCES_SUBDIVISION' : 0.00748 ) : 0.00947 , ((((((' Microsphaera multipartita str. Y-104 JCM 9543 (T)' : 0.00043 , ' Microsphaera multipartita str. Y-104 JCM 9543 (T)' : 0.00374 ) : 0.02108 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD6' : 0.01991 ) : 0.01387 , (' Cryptosporangium japonicum str. YU 636-3 IFO 15966 (T)' : 0.00498 , ' Cryptosporangium arvum str. YU 629-21 IFO 15965 (T)' : 0.0083 ) : 0.0222 ) : 0.00494 , ((' Blastococcus aggregatus ATCC 25902 (T)' : 0.00225 , ' Frankia sp. str. AnpUS4' : 0.00637 ) : 0.00762 , (' Geodermatophilus obscurus subsp. dictyosporus str. G97' : 0.00612 , (' Geodermatophilus obscurus subsp. obscurus DSM 43160 (T)' : 0.0004 , ' Geodermatophilus obscurus subsp. obscurus ATCC 25078 (T)' : 0.00993 ) : 0.01614 ) : 0.01389 ) : 0.0171 )'GDP.OBSCURUS' : 0.00164 , ' Sporichthya polymorpha DSM 46113' : 0.016 ) : 0.00616 , (' Acidothermus cellulolyticus str. 11B ATCC 43068 (T)' : 0.01007 , ((' Frankia sp. str. AgKG'4/84' : 0.0027 , ' Frankia sp. str. Ag45/Mut15' : 0.02677 ) : 0.00127 , (((((((((' Frankia sp. str. Col ORS 060501' : 0.00237 , ' Frankia sp. str. D11 ORS 020602' : 0 ) : 0 , ' Frankia sp. str. EUN1f ULQ 132500106' : 0.00127 ) : 0 , ' Frankia sp. str. HRN18a ULF 140101801' : 0.00611 ) : 0 , ' Frankia sp. str. CH ORS 140102' : 0 ) : 0 , ' Frankia sp. str. SCN10a' : 0.00066 ) : 0.00118 , (' Frankia sp. str. Ea1-12 ULF 130100112' : 0 , (' Frankia sp. str. Ea1-28' : 0.00038 , ' Frankia sp. str. HR27-14' : 0 ) : 0 ) : 0.00159 ) : 0.00169 , (' Frankia sp. str. AgB1-9' : 0.01906 , (' Frankia sp. str. Dc2 atypical' : 0.00916 , ' Frankia sp. str. Cn7 atypical' : 0.00246 ) : 0.00211 ) : 0.00904 ) : 0.00111 , (' Frankia sp. str. PtI1 DDB 17020110' : 0 , ' Frankia sp. str. Cn3 atypical' : 0.00612 ) : 0.01593 ) : 0.00265 , (((' Frankia sp. str. ARgP5' : 0 , ' Frankia sp. str. ARgP5(AG) ULQ 0132105009' : 0.00171 ) : 0.0009 , (' Frankia sp. str. AVN17o ULF 014101715' : 0.00333 , ' Frankia sp. str. AVN17s' : 0 ) : 0.00333 ) : 0.00157 , (' Frankia sp.' : 0 , (((' Frankia sp. str. CeD ORS 020606' : 0 , ' Frankia sp. str. CeD' : 0 ) : 0 , ' Frankia sp. str. M2 ORS 020609' : 0.002 ) : 0.00091 , (' Frankia sp. str. AcN14a' : 0.00051 , (' Frankia sp. str. ArI4' : 0.00028 , (' Frankia sp. str. ACoN24d' : 0 , (' Frankia alni str. ArI3 HFP 013003' : 0 , (' Frankia "myricanod"' : 0.0018 , (' Frankia sp.' : 0 , (' Frankia sp.' : 0.00401 , (' Frankia sp. str. Dryas' : 0 , ' Frankia sp.' : 0.00105 ) : 0 ) : 0.0022 ) : 0.00637 ) : 0.00219 ) : 0 ) : 0.01035 ) : 0.00066 ) : 0.0046 ) : 0.00054 ) : 0.00159 ) : 0.0043 ) : 0.00323 )'FRANKIA' : 0.03581 ) : 0.00675 )'FRANKIA' : 0.00476 ) : 0.01969 , (((((' Microthrix parvicella' : 0.07726 , ' clone SMK140' : 0.04769 ) : 2e-05 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD57' : 0.01918 ) : 0.03507 , ' unnamed organism' : 0.05544 ) : 0.0057 , (' Acidimicrobium ferrooxidans str. ICP DSM 10331 (T)' : 6e-05 , ' str. TH3' : 0.00649 ) : 0.02516 )'A.FERROOXIDANS' : 0.04341 , (((' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-5' : 0 , ' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-16' : 0.00758 ) : 0.00284 , ' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-9' : 0.01321 ) : 0.01556 , (' clone A21' : 0.02532 , (' clone 4211' : 0 , ' clone A55' : 0.03115 ) : 0.02814 ) : 0.13528 )'ENV.BDA1-5' : 0.04428 )'ACIDIMICROBIUM' : 0.02628 ) : 0.01315 , (((' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE7' : 0.00112 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE2' : 0 ) : 0.012 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD13' : 0.02077 )'ENV.PAD13' : 0.02021 , ((((' Slackia heliotrinireducens str. RHS 1 NCTC 11029 (T)' : 0.01606 , ' Slackia exigua str. S-7 ATCC 700122 (T)' : 0.0192 ) : 0.01699 , ' Coriobacterium glomerans DSM 20642 (T)' : 0.05033 ) : 0.01433 , (' str. nitropropanol-degrading bacterium NPOH1' : 0.02245 , ' Eggerthella lenta DSM 2243 (T)' : 0.04486 ) : 0.02152 ) : 0.03676 , (((' Atopobium minutum ATCC 33267 (T)' : 0.00087 , ' Eubacterium fossor ATCC 43386 (T)' : 0.01781 ) : 0.00128 , ' Atopobium minutum NCFB 2751 (T)' : 0.00188 ) : 0.00942 , ((' Atopobium parvulum str. 1246 ATCC 33793 (T)' : 0 , ' Atopobium parvulum str. 1246 ATCC 33793 (T)' : 0 ) : 0.00562 , (' Atopobium rimae str. VPI D140H-11A NCFB 2896 (T)' : 0 , ' Atopobium rimae str. VPI D140H-11A NCFB 2896 (T)' : 0 ) : 0.01971 ) : 0.03736 ) : 0.0379 )'ATP.MINUTUM' : 0.04893 )'ATOPOBIUM' : 0.01628 ) : 0.08428 , (' Rubrobacter xylanophilus str. PRD-1 DSM 9941 (T)' : 0.03617 , (' Rubrobacter radiotolerans DSM 5868' : 0.00048 , (' Rubrobacter radiotolerans DSM 46359 (T)' : 0 , ' Rubrobacter radiotolerans JCM 2153 (T)' : 0 ) : 0.00098 ) : 0.07021 )'RBB.RADIOTOLERANS' : 0.00158 ) : 0.04624 , (((((' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 66' : 0.0044 , ' str. SBR1053' : 0.05719 ) : 0.00441 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 4' : 0.0049 ) : 0.00036 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 65' : 0.01487 ) : 0.02507 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 64' : 0.02887 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 47' : 0.01728 ) : 0.03391 ) : 0.03747 , ((' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 19' : 0.00237 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 87' : 0.00019 ) : 0.00314 , ((' str. SBR1087' : 0 , ' str. SBR1076' : 0.00061 ) : 0.00278 , (' clone SMKN1' : 0.00957 , (' str. SBR1115' : 0.01064 , ' str. SBR2107' : 0.01963 ) : 0.04458 ) : 0.06043 ) : 0.06654 ) : 0.04573 )'ENV.MC4' : 0.00614 ) : 0.13852 , (' str. 3' : 0.03133 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 58' : 0.01194 )'ENV.MC58' : 0.0085 ) : 0.00874 , ((' clone A58L' : 0.01791 , ' clone A53n' : 0.02096 ) : 0.007 , (' clone G43' : 0.00148 , (' clone WCHA1-78' : 0.00679 , (' clone S-36' : 0.00144 , ' clone WCHA1-48' : 0.07543 ) : 0.00906 ) : 0.01003 ) : 0.03018 )'ENV.WCHA48' : 0.00965 )'HIGH_G+C' : 0.01274 , (((((' Streptobacillus moniliformis str. ANL 370-1' : 9e-05 , ' Streptobacillus moniliformis ATCC 14647 (T)' : 0.00692 ) : 0.03088 , ' Leptotrichia microbii' : 0.05364 ) : 0.02471 , ' Sebaldella termitidis ATCC 33386 (T)' : 0.04775 ) : 0.01038 , (' Leptotrichia buccalis NCTC 10249 (T)' : 0.00089 , (' Leptotrichia buccalis ATCC 14201 (T)' : 0.00102 , ' Leptotrichia bucallis' : 0.00038 ) : 0.00094 ) : 0.06386 )'LPT.BUCCALIS' : 0.018 , ((' Propionigenium modestum' : 0.00923 , ' Propionigenium maris str. 10succ1 DSM 9537 (T)' : 0.01888 )'PRG.MODESTUM' : 0.02087 , (' Cetobacterium ceti str. M-3333 NCFB 3026 (T)' : 0.0209 , (' Fusobacterium perfoetens ATCC 29250 (T)' : 0.01709 , ((((' Clostridium rectum NCIMB 10651 (T)' : 0.00167 , ' Fusobacterium mortiferum ATCC 25557 (T)' : 0 ) : 0.00063 , ' Fusobacterium mortiferum ATCC 25557 (T)' : 0.00092 ) : 0.00035 , ' Fusobacterium necrogenes ATCC 25556 (T)' : 0.00104 ) : 0.00206 , ((((' Fusobacterium mortiferum ATCC 25557 (T)' : 0 , ' Fusobacterium ulcerans NCTC 12111 (T)' : 0.0017 ) : 0 , ' Fusobacterium varium NCTC 10560 (T)' : 0.00042 ) : 0.00105 , ' Fusobacterium varium ATCC 8501 (T)' : 0.00062 ) : 0.007 , ((((' Fusobacterium necrophorum str. FnS-1; biotype AB' : 0.00513 , ' Fusobacterium necrophorum str. FnS40; biotype B' : 0.01036 ) : 0.00173 , ' Fusobacterium necrophorum subsp. necrophorum ATCC 25286 (T)' : 0.00047 ) : 0.00455 , (' Fusobacterium gonidiaformans ATCC 25563 (T)' : 0 , ' Fusobacterium gonidiaformans ATCC 25563 (T)' : 0.00107 ) : 0.00689 ) : 0.00599 , ((' Fusobacterium russii ATCC 25533 (T)' : 0 , ' Fusobacterium russii ATCC 25533 (T)' : 0.00229 ) : 0.01809 , ((' Fusobacterium periodonticum str. EK1-15 ATCC 33693 (T)' : 0 , ' Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 (T)' : 0 ) : 0.00075 , (' Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 (T)' : 0.00199 , ((' Fusobacterium nucleatum subsp. fusiforme NCTC 11326 (T)' : 0.00031 , ' Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii ATCC 49256 (T)' : 0.00238 ) : 0.00089 , ((' Fusobacterium nucleatum subsp. animalis NCTC 12276 (T)' : 0.00397 , ' Fusobacterium alocis ATCC 35896 (T)' : 0.00368 ) : 0.00149 , (' Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 (T)' : 0.0028 , (' Fusobacterium simiae ATCC 33568 (T)' : 0.0014 , ' Fusobacterium simiae ATCC 33568 (T)' : 0 ) : 0.00357 ) : 0.00059 ) : 0.00232 ) : 0 ) : 0.00237 ) : 0.01377 ) : 0.01556 ) : 0.01035 ) : 0.01031 )'FUSOBACTERIA' : 0.02986 ) : 0.00845 ) : 0.01542 ) : 0.0605 )'FUSOBACTERIA' : 0.1414 ) : 0.00907 , (((((((' Desulfotomaculum thermosapovorans str. MLF DSM 6562 (T)' : 0.0018 , ' Desulfotomaculum thermosapovorans str. MLF DSM 6562 (T)' : 0.0001 ) : 0.00826 , ' Sporotomaculum hydroxybenzoicum str. BT DSM 5475 (T)' : 0.00426 ) : 0.01816 , (' Desulfotomaculum geothermicum str. BSD DSM 3669 (T)' : 0.01488 , ' Desulfotomaculum geothermicum str. BSD DSM 3669 (T)' : 0.00493 ) : 0.0191 ) : 0.02493 , (' str. sporeB' : 0.00979 , ' str. sporeA' : 0.015 ) : 0.04059 ) : 0.00671 , (((' Desulfotomaculum thermobenzoicum str. TSB DSM 6193 (T)' : 0.00109 , ' Desulfotomaculum thermoacetoxidans str. CAMZ DSM 5813 (T)' : 0.00079 ) : 0.00056 , ' Desulfotomaculum thermobenzoicum' : 0.02167 ) : 0.00742 , ((' Desulfotomaculum australicum str. AB33 ACM 3917 (T)' : 0.00726 , ' Desulfotomaculum thermocisternum str. ST90 DSM 10259 (T)' : 0.00192 ) : 0.00498 , (' Desulfotomaculum kuznetsovii str. 17 DSM 6115 (T)' : 0.00954 , ' Desulfotomaculum luciae str. SLT SMCC W644 (T)' : 0.00169 ) : 0.0136 ) : 0.01273 ) : 0.03132 ) : 0.00161 , (' Desulfotomaculum halophilum SEBR 3139 (T)' : 0.00925 , ' Desulfotomaculum acetoxidans str. 5575 DSM 771 (T)' : 0.00807 ) : 0.00232 )'DFM.GEOTHERMICUM' : 0.00378 , ((((' Syntrophomonas wolfei DSM 2245 (T)' : 0.0261 , ' Syntrophospora bryantii DSM 3014B (T)' : 0.02457 ) : 0.01571 , ' Thermosyntropha lipolytica str. JW/VS-265' : 0.03808 ) : 0.04557 , ' Anaerobranca horikoshii str. JW/YL-138 DSM 9786 (T)' : 0.09525 )'SYNTROPHOMONAS' : 0.006 , ((((((' Moorella thermoautotrophica str. JW 701/3 DSM 1974 (T)' : 0.00191 , ' Moorella thermoautotrophica str. JW 701/5' : 0.0019 ) : 0.00293 , ' Moorella thermoautotrophica str. JW 701/3 DSM 1974 (T)' : 0.00976 ) : 0 , (' Moorella thermoautotrophica str. JW 701/3 DSM 1974 (T)' : 0 , ' Moorella thermoautotrophica' : 0 ) : 0.00057 ) : 0.00125 , (' Moorella thermoacetica str. LJD (T)' : 0.01012 , ' Moorella thermoacetica ATCC 39073' : 0 ) : 0.00418 ) : 0.00359 , ' Moorella glycerini str. JW/AS-Y6 DSM 11254 (T)' : 0.00308 )'MOORELLA' : 0.00797 , (' Thermaerobacter marianensis str. 7p75a' : 0.01001 , (((((((((((' Dehalococcoides ethenogenes str. 195' : 0.00632 , ' clone t0.8.f' : 0.00417 ) : 0.00092 , ' str. s16' : 0.00112 ) : 0.00124 , ' clone H1.4.f' : 0.00242 ) : 0.00031 , (' clone H3.93' : 0.00202 , ' clone t0.6.f' : 0.00295 ) : 0.00126 ) : 0.00275 , ' clone RB21' : 0.00735 )'DH.ETHENOGENES' : 0.00192 , (' clone H1.2.f' : 0.15733 , (' Sargasso Sea, Bermuda Atlantic Time-Series Study clone SAR 307' : 0.02914 , ' Sargasso Sea, Bermuda Atlantic Time-Series Study clone SAR 202' : 0.02812 ) : 0.00283 )'ENV.SAR202' : 0.11402 ) : 0.01211 , ' clone OPB9' : 0.10426 ) : 0.07268 , (' clone OPS145' : 0.00229 , (' Dictyoglomus thermophilum str. Rt46B.1' : 0 , (' Dictyoglomus thermophilum str. H-6-12 DSM 3960 (T)' : 0.01494 , ' Dictyoglomus sp. str. Rt46-B1' : 0 ) : 0.00018 ) : 0.00237 )'DGL.THERMOPHILUM' : 0.15438 ) : 0.08173 , ' Ammonifex degensii str. KC4 DSM 10501 (T)' : 0.02798 ) : 0.10976 , ' Thermoterrabacterium ferrireducens' : 0.01311 )'DICTYOGLOMUS' : 0.01679 , ((((((' Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes str. 4B (T)' : 0.03286 , ' Thermoanaerobacterium xylanolyticum str. LX-II DSM 7097 (T)' : 0.00833 ) : 0.00064 , ' Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes str. 4B ATCC 33743 (T)' : 0 ) : 0.00313 , ' Thermoanaerobium "lactoethylicum" str. ZE-1 DSM 9003' : 0.00365 ) : 0.00649 , ' Thermoanaerobacterium saccharolyticum str. B6A-RI; B6A DSM 7060 (T)' : 0.00283 ) : 0.00344 , (' Clostridium thermoamylolyticum DSM 2335' : 0.00227 , (' Thermoanaerobacterium aotearoense str. JW/SL-NZ613 (T)' : 0.00556 , ' Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum ATCC 7956 (T)' : 0.00599 ) : 0.00525 ) : 0.00415 )'TBM.THERMOSULFURIGENES' : 0.03395 , (' Thermoanaerobacter kivui DSM 2030 (T)' : 0.00413 , ((((((' Thermoanaerobacter acetoethylicus str. HTB2/W ATCC 33265 (T)' : 0 , ' Thermoanaerobacter acetoethylicus str. HTB2/W ATCC 33265 (T)' : 0 ) : 0.00152 , ' Thermoanaerobacter ethanolicus str. JW200 (T)' : 0.00045 ) : 0 , ' Thermoanaerobacter ethanolicus str. JW200 (T) ATCC 31550' : 0.00148 ) : 0.00047 , (' Clostridium sp. str. AZ3 B.1' : 0.00121 , (' Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus str. E100-69 ATCC 35045 (T)' : 0.00449 , ' Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus str. E100-69 DSM 567 (T)' : 0.00034 ) : 0.00203 ) : 0.02151 ) : 0.00177 , (' Thermoanaerobacter sulfurophilus str. L-64 DSM 11584 (T)' : 0.00432 , ' Thermoanaerobacter wiegelii str. Rt8.B1' : 0.00018 ) : 0.00303 )'TAB.ETHANOLICUS' : 0.00079 , (((' Thermoanaerobacter thermocopriae str. JT-3 IAM 13577 (T)' : 0 , ' Thermoanaerobacter thermocopriae str. JT-3 IAM 13577 (T)' : 0 ) : 0.00092 , ' Thermoanaerobacter mathranii str. A3 DSM 11426 (T)' : 0.00023 )'TAB.THERMOCOPRIAE' : 0.00317 , (((' Thermoanaerobacter brockii str. HTD4 DSM 1457 (T)' : 0.00234 , ' Thermoanaerobacter ethanolicus str. 39E ATCC 33223' : 0.00142 ) : 0.00026 , (' str. from Siljan ring drill (~3 km down)' : 0.00021 , ' Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii str. AKo-1 DSM 3389 (T)' : 0.00449 ) : 0.00131 ) : 0 , (' Thermoanaerobacter brockii subsp. lactiethylicus DSM 9801 (T)' : 0.00311 , (' Thermoanaerobacter ethanolicus str. 39E ATCC 33223' : 0.00543 , (' Thermoanaerobacter brockii str. HTD4 (T)' : 0.00429 , ' Thermoanaerobacter acetoethylicus str. HTB2/W (T)' : 0.01334 ) : 0.01683 ) : 0.0105 ) : 6e-05 )'TAB.BROCKII' : 0.02875 ) : 0.0172 ) : 0.01546 ) : 0.07885 )'THERMOANAEROBACTER' : 0.02392 ) : 0.02974 ) : 0.01077 ) : 0.01254 ) : 0.04248 )'THERMOANAEROBACTER' : 0.01458 ) : 0.00276 , (((((((((((((' Selenomonas ruminantium subsp. ruminantium str. GA192 (T)' : 0.00242 , ' Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica JCM 6582 (T)' : 0.00104 ) : 0.0012 , ' Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica str. HD4' : 0.00121 ) : 0.00187 , ' Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica DSM 2872 (T)' : 0.00315 ) : 0.00637 , ' Mitsuokella multacida str. A 405-1 NCTC 10934 (T)' : 0.01067 ) : 0.00689 , ' Selenomonas lacticifex str. VB4b DSM 20757 (T)' : 0.02129 ) : 0.00383 , (' Schwartzia succinivorans str. S1-1 DSM 10502 (T)' : 0.00641 , (' Quinella ovalis' : 0.12762 , ' Selenomonas sputigena ATCC 35185 (T)' : 0.04042 ) : 0.0423 ) : 0.01181 ) : 0.00485 , (' Zymophilus paucivorans str. SH2 DSM 20756 (T)' : 0.05031 , (' Pectinatus cerevisiiphilus ATCC 29359 (T)' : 0.01295 , ' Pectinatus frisingensis ATCC 33332 (T)' : 0.01476 ) : 0.0326 ) : 0.00541 )'SLN.RUMINA' : 0.01776 , (((' Veillonella parvula DSM 2008 (T)' : 0.00095 , ' Veillonella dispar DSM 20735 (T)' : 0.0013 ) : 0.00398 , ' Veillonella atypica DSM 20739 (T)' : 0.00114 ) : 0.01701 , ((' Megasphaera elsdenii str. B159 ATCC 17752' : 0.02335 , ' Megasphaera cerevisiae str. VTT-E-85230' : 0.02607 ) : 0 , (' Dialister pneumosintes ATCC 33048 (T)' : 0.00093 , (' Eubacterium sp. str. SC -5' : 0 , ' Eubacterium sp. str. SC 3D' : 0 ) : 0 ) : 0.23531 ) : 0.04018 )'VLN.PARVULA' : 0.03218 ) : 0.00822 , (((' Acetonema longum str. APO-1 DSM 6540 (T)' : 0.08455 , ' clone CY 69' : 0.04953 ) : 0.00448 , ' Clostridium quercicolum ATCC 25974 (T)' : 0.00512 ) : 0.00989 , (' Sporomusa paucivorans str. X DSM 3697 (T)' : 0.00468 , (' Sporomusa silvacetica str. DG-1 DSM 10669 (T)' : 0.03409 , ' Sporomusa termitida str. JSN-2' : 0.0132 ) : 0.01537 ) : 0.03405 )'SPM.PAUCIVORANS' : 0.01536 ) : 0.01916 , (((' Acidaminococcus fermentans str. AO' : 0 , ' Acidaminococcus fermentans str. VR4 DSM 20731 (T)' : 0 ) : 0.00046 , ' Acidaminococcus fermentans str. VR4 ATCC 25085 (T)' : 0.00474 ) : 0.0044 , (' Succiniclasticum ruminis str. SE10 DSM 9236 (T)' : 0.04351 , (' Phascolarctobacterium faecium ACM 3679 (T)' : 0 , (' Phascolarctobacterium faecium ACM 3681' : 0.001 , ' Phascolarctobacterium faecium ACM 3680' : 0 ) : 0.00051 ) : 0.01825 ) : 0.04052 )'PHA.FAECIUM' : 0.01993 )'SPOROMUSA' : 0.02917 , ((((((' Desulfitobacterium dehalogenans str. JW/IU-DC1 DSM 9161 (T)' : 0 , ' Desulfitobacterium sp. str. PCE1' : 0.00329 ) : 0.00341 , (' Desulfitobacterium frappieri str. PCP-1' : 0.00763 , ' Desulfitobacterium hafniense str. DCB-2' : 0.00534 ) : 0.01065 ) : 0.0509 , ' Syntrophobotulus glycolicus str. FlGlyR' : 0.00969 ) : 0.01369 , (' clone A49u' : 0.0046 , (' Desulfosporosinus orientis str. Singapore I DSM 765 (T)' : 0.02409 , ' Desulfosporosinus orientis str. Singapore I NCIMB 8382 (T)' : 0.00023 ) : 0.00325 ) : 0.0102 ) : 0.00809 , (' clone A50u' : 0.05651 , ' Peptococcus niger' : 0.01525 ) : 0.01399 )'DFI.DEHALOGENANS' : 0.01783 , (((((' Desulfotomaculum ruminis str. DL NCIMB 8452 (T)' : 0 , ' Desulfotomaculum ruminis str. DL NCIMB 8452 (T)' : 0.0005 ) : 0.00545 , ' Desulfotomaculum ruminis str. DL DSM 2154 (T)' : 0.00033 ) : 0.00556 , (' Desulfotomaculum aeronauticum str. 9 DSM 10349 (T)' : 0.02626 , ' Desulfotomaculum nigrificans NCIMB 8395 (T)' : 0.01329 ) : 0.03752 ) : 0.00326 , ' Desulfotomaculum putei str. TH-11 SMCC W459 (T)' : 0.0115 )'DFM.RUMINIS' : 0.03717 , ((' Heliophilum fasciatum str. Tanzania ATCC 51790 (T)' : 0 , ' Heliophilum fasciatum str. Tanzania ATCC 51790 (T)' : 0 ) : 0.02012 , (((' Heliobacillus mobilis ATCC 43427 (T)' : 0 , ' Heliobacillus mobilis ATCC 43427 (T)' : 0 ) : 0.00534 , ' Heliobacterium chlorum ATCC 35205 (T)' : 0.00565 ) : 0.00823 , ((' Heliobacterium gestii str. Chainat ATCC 43375 (T)' : 0 , ' Heliobacterium gestii str. Chainat ATCC 43375 (T)' : 0 ) : 0.00761 , (' Heliobacterium modesticaldum str. Ice1' : 0 , ' Heliobacterium modesticaldum str. Ice1' : 0 ) : 0.01211 ) : 0.01424 ) : 0.0176 )'HEL.CHLORUM' : 0.05551 ) : 0.01903 )'HELIOBACTERIUM' : 0.03445 ) : 0.00376 , ' Clostridium sp. str. DMC' : 0.06269 )'SPOROMUSA' : 0.00594 , (((((((((((((((((((((' Butyrivibrio fibrisolvens NCDO 2221 (T)' : 0.00032 , ' Butyrivibrio fibrisolvens str. D1' : 0.00061 ) : 0.02738 , ' Clostridium proteoclasticum str. B316 ATCC 51982 (T)' : 0.03589 ) : 0.02362 , ' Clostridium aminophilum str. F VPI 14602 (T)' : 0.03194 ) : 0.01675 , (' Clostridium symbiosum ATCC 14940 (T)' : 0.00045 , ' Clostridium symbiosum' : 0.00192 ) : 0.0229 ) : 0.01368 , (((' Clostridium xylanolyticum ATCC 49623 (T)' : 0 , ' Clostridium xylanolyticum DSM 6555 (T)' : 0.00172 ) : 0.00035 , ' Clostridium aerotolerans DSM 5434 (T)' : 0.00052 ) : 0.00347 , (' Clostridium celerecrescens DSM 5628 (T)' : 0.0015 , (' Desulfotomaculum guttoideum str. 50 DSM 4024 (T)' : 0.00214 , ' Clostridium sphenoides ATCC 19403 (T)' : 0.00336 ) : 0.0026 ) : 0.00839 ) : 0.0187 ) : 0.00239 , (' Clostridium sp. str. FS 41 DSM 6877' : 0.01128 , ' Clostridium clostridiiforme ATCC 25537 (T)' : 0.00721 ) : 0.01624 )'C.XYLANOLYTICUM' : 0.0049 , ((' Eubacterium cellulosolvens ATCC 43171 (T)' : 0.0027 , ' Eubacterium cellulosolvens ATCC 43171 (T)' : 0.00028 ) : 0.01111 , ((((' Ruminococcus obeum' : 4e-05 , ' Ruminococcus obeum ATCC 29174 (T)' : 0.00049 ) : 0.00329 , ' Ruminococcus schinkii str. B DSM 10518 (T)' : 0.01358 ) : 0.00139 , ' Ruminococcus hydrogenotrophicus str. S5a33 DSM 10507 (T)' : 0.02877 ) : 0.00122 , ((' Ruminococcus hansenii ATCC 27752 (T)' : 0.02668 , ' Ruminococcus hansenii ATCC 27752 (T)' : 0 ) : 0.02605 , (' str. 8' : 0.01591 , (' Ruminococcus productus ATCC 27340 (T)' : 0.0002 , (' Ruminococcus productus ATCC 27340 (T)' : 0.00041 , (' Ruminococcus productus ATCC 27340 (T)' : 0.0313 , ' Clostridium coccoides ATCC 29236 (T)' : 0.00015 ) : 0.0016 ) : 0.00045 ) : 0.0082 ) : 0.00262 ) : 0.02991 ) : 0.04389 )'RUC.HANSENII' : 0.00835 ) : 0.00342 , (' Butyrivibrio crossotus str. Bu 46 NCDO 2416 (T)' : 0.01457 , (' Eubacterium saburreum DSM 3986 (T)' : 0.03028 , ' Johnsonella ignava ATCC 51276 (T)' : 0.08423 ) : 0.05056 )'EUB.SABURREUM' : 0.01966 ) : 0.00275 , (' Clostridium nexile DSM 1787 (T)' : 0.01696 , (((' Ruminococcus gnavus ATCC 29149 (T)' : 0.05311 , ' Ruminococcus gnavus ATCC 29149 (T)' : 0 ) : 0 , ' Ruminococcus gnavus ATCC 29149 (T)' : 0.00017 ) : 0.01294 , (' Eubacterium formicigenerans ATCC 27755 (T)' : 0.01216 , (' Eubacterium contortum ATCC 25540 (T)' : 0 , (' Eubacterium fissicatena DSM 3598 (T)' : 0.00369 , (' Clostridium oroticum ATCC 13619 (T)' : 0.03186 , (' Ruminococcus lactaris ATCC 29176 (T)' : 0.01787 , (' Ruminococcus torques ATCC 27756 (T)' : 0.00103 , ' Ruminococcus torques ATCC 27756 (T)' : 0.00022 ) : 0.00204 ) : 0.00399 ) : 0.00282 ) : 0.00331 ) : 0.0279 ) : 0.00288 ) : 0.00452 )'RUC.GNAVUS' : 0.00805 ) : 0.00644 , (((' Eubacterium rectale ATCC 33656 (T)' : 0.01928 , ' Roseburia cecicola ATCC 33874 (T)' : 0.01417 ) : 0.03003 , ' Eubacterium ramulus ATCC 29099 (T)' : 0.00777 ) : 0.00432 , (' Butyrivibrio fibrisolvens str. 49' : 0.00293 , ((' Pseudobutyrivibrio ruminis str. A12-1 DSM 9787 (T)' : 0.00067 , ' Butyrivibrio fibrisolvens str. Bu 21 NCDO 2399' : 0.00337 ) : 0.00204 , (' Butyrivibrio fibrisolvens str. OB189' : 0.00517 , (' Butyrivibrio fibrisolvens str. OB156' : 0.00026 , (' Butyrivibrio fibrisolvens str. OB192' : 0.00042 , ' Butyrivibrio fibrisolvens str. OB157' : 0 ) : 0.0014 ) : 0.01334 ) : 0.01149 ) : 0.01137 ) : 0.03121 )'BTV.FIBRISOLVENS' : 0.00909 ) : 0.00591 , (' Eubacterium hadrum ATCC 29173 (T)' : 0.0117 , (' Eubacterium uniforme ATCC 35992 (T)' : 0.02928 , (' Eubacterium ventriosum ATCC 27560 (T)' : 0 , ' Eubacterium ventriosum DSM 3988 (T)' : 0.00103 ) : 0.02033 ) : 0.0355 )'EUB.VENTRIOSUM' : 0.00619 ) : 0.00555 , (' Eubacterium "pectinii" str. P-1 DSM 6788' : 0.02569 , ((' Lachnospira multipara str. D32 ATCC 19207 (T)' : 0 , ' Lachnospira multipara str. 40' : 0 ) : 0.01955 , (' Lachnospira pectinoschiza str. 150-1' : 0.01906 , ' Eubacterium eligens ATCC 27750 (T)' : 0.01713 ) : 0.00535 ) : 0.01377 )'LCN.MULTIPARA' : 0.0099 ) : 0.01064 , (((' Eubacterium hallii ATCC 27751 (T)' : 0.03534 , ' Eubacterium ruminantium str. GA 195 ATCC 17233 (T)' : 0.04284 ) : 0.00597 , ' Coprococcus eutactus ATCC 27759 (T)' : 0.05129 ) : 0.00817 , (' Clostridium herbivorans str. 54408 ATCC 49925 (T)' : 0.00539 , ((' Clostridium polysaccharolyticum ATCC 33142 (T)' : 0.00331 , ' Clostridium polysaccharolyticum DSM 1801 (T)' : 0.00329 ) : 0.02055 , (' Catonella morbi ATCC 51271 (T)' : 0.04406 , ' Acetitomaculum ruminis str. 139B ATCC 43876 (T)' : 0.08869 ) : 0.02186 ) : 0.00625 ) : 0.00893 )'C.POLYSACCHAROLYTICUM' : 0.01083 ) : 0.00462 , ((' Eubacterium xylanophilum ATCC 35991 (T)' : 0.01921 , ' Clostridium populeti ATCC 35295 (T)' : 0.04174 ) : 0.01385 , (' Clostridium aminovalericum DSM 1283 (T)' : 0.00109 , ' Clostridium aminovalericum ATCC 13725 (T)' : 0.00802 ) : 0.02067 )'C.AMINOVALERICUM' : 0.00502 )'C.COCCOIDES' : 0.0235 , ((' Clostridium neopropionicum DSM 3847 (T)' : 0.00702 , ' Clostridium propionicum DSM 1682 (T)' : 0.01282 )'C.PROPIONICUM' : 0.02418 , ((((' Clostridium piliforme' : 0.00259 , ' str. RJ' : 0.00107 ) : 0.00257 , (' Clostridium piliforme' : 0 , ' str. RT' : 0 ) : 0.00434 ) : 0.01307 , ' Clostridium colinum DSM 6011 (T)' : 0.01571 )'C.COLINUM' : 0.02348 , (' clone UN117' : 0 , (' clone UN11' : 0 , (' clone UN15' : 0 , (' clone UN16' : 0 , ' clone UN68' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 )'ENV.UN117' : 0.03766 ) : 0.03018 )'C.PROPIONICUM' : 0.0306 ) : 0.01793 , (' Epulopiscium sp. str. morphotype A1' : 0.02779 , ((' Clostridium lentocellum DSM 5427 (T)' : 0.00058 , ' Clostridium lentocellum DSM 5427 (T)' : 0.00383 ) : 0.05162 , (' Epulopiscium sp. str. morphotype A2' : 0.01201 , ' Epulopiscium sp. str. morphotype B' : 0.01703 ) : 0.01235 ) : 0.01676 )'C.LENTOCELLUM' : 0.05628 ) : 0.01917 , (' Clostridium halophilum DSM 5387 (T)' : 0.03717 , (' Acidaminobacter hydrogenoformans str. glu 65 DSM 2784 (T)' : 0.04798 , ((((((' clone UN43' : 0 , ' clone UN24' : 0 ) : 0 , (' clone UN48' : 0 , ' clone UN82' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' clone UN38' : 0 ) : 0 , ' clone UN17' : 0 ) : 0 , ' clone UN105' : 0 )'ENV.UN_CLONES' : 0.00815 , (' Clostridium aminobutyricum DSM 2634' : 0.00691 , (' Eubacterium saphenum ATCC 49989 (T)' : 0.04372 , (((((' Eubacterium tardum str. SC 87K' : 0 , ' Eubacterium tardum str. SC 87K' : 0 ) : 0.00561 , ' Eubacterium minutum ATCC 700079 (T)' : 0.0026 ) : 0.00036 , ' Eubacterium minutum ATCC 700079 (T)' : 0 ) : 0.01244 , (' Eubacterium nodatum str. AK-5 ATCC 33099 (T)' : 0 , ' Eubacterium nodatum str. AK-5 ATCC 33099 (T)' : 0 ) : 0.02754 )'EUB.NODATUM' : 0.05538 , ((' Eubacterium brachy str. BR-179 ATCC 33089 (T)' : 0 , ' Eubacterium brachy str. BR-179 ATCC 33089 (T)' : 0 ) : 0.01941 , ((' Eubacterium timidum' : 0 , ' Eubacterium timidum' : 0 ) : 0.02226 , (' Fusobacterium sulci ATCC 35585 (T)' : 0.02174 , (' Eubacterium infirmum str. W 1471; clone 1471-3' : 0 , ' Eubacterium infirmum str. W 1471; clone 1471-3' : 0 ) : 0.01444 ) : 0.02587 ) : 0.04185 )'EUB.BRACHY' : 0.01582 ) : 0.00455 ) : 0.02325 ) : 0.01127 ) : 0.03009 ) : 0.0075 )'EUBACTERIUM' : 0.03381 ) : 0.00943 , ((' Clostridium felsineum DSM 794 (T)' : 0.00733 , ' Clostridium formicoaceticum DSM 92 (T)' : 0.01245 )'C.FORMICOACETICUM' : 0.01638 , (((((' Filifactor villosus ATCC 33388 (T)' : 0.02952 , ' Fusobacterium alocis ATCC 35896 (T)' : 0.03023 ) : 0.03269 , ' Eubacterium yurii subsp. yurii ATCC 43713' : 0.1119 ) : 0.04069 , (' Clostridium sticklandii str. SR VPI 14603' : 0.00028 , ' Clostridium sticklandii str. HF ATCC 12662 (T)' : 0.00146 ) : 0.06373 ) : 0.01323 , (' Eubacterium acidaminophilum str. a1-2 DSM 3953 (T)' : 0.00689 , ' Clostridium litorale DSM 5388 (T)' : 0.0227 ) : 0.0351 )'C.STICKLANDII' : 0.00337 , (((' Clostridium paradoxum str. JW-YL-7' : 0 , ' Clostridium paradoxum str. JW-YL-7 DSM 7308 (T)' : 0.00023 ) : 0.0051 , ' Clostridium thermoalcaliphilum str. JW/YL-23-2 DSM 7309 (T)' : 0.00797 )'C.PARADOXUM' : 0.02474 , (((' Clostridium ghoni NCIMB 10636 (T)' : 0.00417 , ' Eubacterium tenue ATCC 25553 (T)' : 0.0089 ) : 0.00117 , ' Clostridium sordellii ATCC 9714 (T)' : 0.00295 )'EUB.TENUE' : 0.00296 , (((' Clostridium bifermentans NCIMB 10716 (T)' : 0.00148 , ' clone PAN031' : 0.0042 ) : 0.0019 , ' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone AAN036' : 0.31337 )'C.BIFERMENTANS' : 0.00472 , (' Clostridium lituseburense ATCC 25759 (T)' : 0.00843 , (((' Clostridium glycolicum DSM 1288 (T)' : 0.00598 , ' Clostridium mayombei str. SFC-5 DSM 6539 (T)' : 0.01248 ) : 0.00819 , ' Clostridium irregularis ATCC 25756 (T)' : 0.01448 )'C.GLYCOLICUM' : 0.0063 , (' Clostridium difficile str. N6; Clark 90556-M6S; Mc Clung 1780 NCTC 11209 (T)' : 0.01184 , ((((' clone UN84' : 0.00181 , ' clone UN36' : 0 ) : 0 , ' clone UN109' : 0.00438 ) : 0.01794 , ' Clostridium mangenotii str. A33N ATCC 25761 (T)' : 0.01957 )'C.MANGENOTII' : 0.00707 , (' Peptostreptococcus anaerobius str. LK16 ATCC 27227' : 0 , (' Peptostreptococcus sp. str. C' : 0 , (' Peptostreptococcus anaerobius str. LK54 ATCC 27337 (T)' : 0.00096 , (' Peptostreptococcus anaerobius str. LK54 ATCC 27337 (T)' : 0 , (' Peptostreptococcus anaerobius str. LK54 ATCC 27337 (T)' : 0.00948 , ' Peptostreptococcus anaerobius str. LK54 ATCC 27337 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00208 ) : 0.00096 ) : 0.00138 )'PPS.ANAEROBIUS' : 0.05933 ) : 0.0139 ) : 0.00925 ) : 0.01187 ) : 0.01253 ) : 0.00412 ) : 0.03255 ) : 0.01532 ) : 0.06482 )'C.LITUSEBURENSE' : 0.01049 )'EUBACTERIUM' : 0.01785 , (((((((((((' Acetobacterium paludosum DSM 8237 (T)' : 0.00602 , ' Acetobacterium bakii DSM 8239 (T)' : 0.00617 ) : 0.0027 , ' Acetobacterium fimetarium DSM 8238 (T)' : 0.00723 ) : 0.00098 , ' Acetobacterium carbinolicum str. WoProp 1 DSM 2925 (T)' : 0.00335 ) : 0.00055 , ' clone Aspo4' : 0.00062 ) : 0 , (' Acetobacterium malicum str. MuME1 DSM 4132 (T)' : 0 , (' str. s7' : 0 , ' clone A1ghqi' : 0 ) : 0 ) : 0.00049 ) : 0.00141 , (' Acetobacterium wieringae str. C DSM 1911 (T)' : 0.00587 , ' Acetobacterium woodii str. WB1 DSM 1030 (T)' : 0.00217 ) : 0.00065 ) : 0.01082 , (' Eubacterium limosum DSM 20543 (T)' : 0 , (' Eubacterium callanderi str. FD DSM 3662 (T)' : 5e-05 , ' Eubacterium limosum ATCC 8486 (T)' : 0.00149 ) : 0.00461 ) : 0.04066 ) : 0.00729 , (' Eubacterium barkeri' : 0 , ' Eubacterium barkeri ATCC 25849 (T)' : 0 ) : 0.01871 ) : 0.014 , ' Pseudoramibacter alactolyticus DSM 3980 (T)' : 0.04044 ) : 0.00856 , (' Eubacterium thermomarinus' : 0.00852 , (' Clostridium acidiurici ATCC 7906 (T)' : 0.02312 , (' Clostridium purinolyticum ATCC 33906 (T)' : 0.01509 , ' Eubacterium angustum ATCC 43737 (T)' : 0.0418 ) : 0.0072 ) : 0.05299 ) : 0.06771 )'C.PURINOLYTICUM' : 0.01104 , (' Clostridium hydroxybenzoicum str. JW/Z-1 ATCC 51151 (T)' : 0.02136 , (((((((' Tissierella praeacuta NCTC 11158' : 0 , ' Tissierella praeacuta ATCC 25539 (T)' : 0.00074 ) : 0.00073 , ' Clostridium hastiforme DSM 5675 (T)' : 0 ) : 0 , ' Clostridium hastiforme DSM 5675 (T)' : 0.00071 ) : 0.01005 , ' Tissierella creatinophila str. KRE 4 DSM 6911 (T)' : 0.02214 ) : 0.00949 , ' Clostridium sp. str. BN II' : 0.01608 ) : 0.00712 , (' Clostridium filamentosum DSM 6645' : 0.06144 , ' Clostridium ultunense str. BS' : 0.04062 ) : 0.00763 )'TSS.PRAEACUTA' : 0.01708 , (' Helcococcus kunzii NCFB 2900 (T)' : 0.00968 , (((' Peptostreptococcus micros GIFU 7701' : 0.00822 , ' str. PUS8.29' : 0.0085 ) : 0.04464 , ' Peptostreptococcus magnus ATCC 15794 (T)' : 0.06917 )'PPS.MICROS' : 0.01455 , ((' Peptostreptococcus prevotii GIFU 8124' : 0.00818 , ' Peptostreptococcus ivorii str. SBH093 DSM 10022 (T)' : 0.03794 )'PPS.IVORII' : 0.00165 , ((((((' Peptostreptococcus indolicus ATCC 29427 (T)' : 0.01403 , ' Peptostreptococcus harei str. SBH432 DSM 10020 (T)' : 0.00458 ) : 0.01387 , ' Peptostreptococcus asaccharolyticus GIFU 7717' : 0.03332 ) : 0.01302 , ' Peptostreptococcus lacrimalis GIFU 7667 (T)' : 0.03618 ) : 0.01241 , ' Peptostreptococcus sp. str. 9succ1' : 0.03446 ) : 0.00832 , ' Peptostreptococcus asaccharolyticus ATCC 14963 (T)' : 0.04173 )'PPS.INDOLICUS' : 0.0163 , (' Peptostreptococcus tetradius GIFU 7672 (T)' : 0.00566 , ((' Peptostreptococcus lactolyticus GIFU 8586 (T)' : 0.01398 , ' Peptostreptococcus octavius str. Davey 1 NCTC 9810 (T)' : 0.03219 ) : 0.00477 , (' Peptostreptococcus prevotii ATCC 9321 (T)' : 0.02169 , (' Peptostreptococcus hydrogenalis GIFU 7662 (T)' : 0.00839 , (' Peptostreptococcus asaccharolyticus GIFU 7946' : 0.00106 , ' Peptostreptococcus vaginalis GIFU 12669 (T)' : 0.01162 ) : 0.00757 ) : 0.01766 ) : 0.00287 ) : 0.03719 )'PPS.TETRADIUS' : 0.0509 ) : 0.03704 ) : 0.01509 ) : 0.08769 ) : 0.02241 ) : 0.05557 ) : 0.01677 )'C.PURINOLYTICUM' : 0.0222 ) : 0.03207 , ((((((((' Haloanaerobacter chitinovorans str. W5C8 OCM 229 (T)' : 0.00846 , ' Haloanaerobacter chitinovorans str. W5C8 OGC 229 (T)' : 0.00042 ) : 0 , ' Haloanaerobacter salinarius str. SG3903' : 0.00384 ) : 0.00392 , (' Haloanaerobacter lacunaris str. Z-7888 DSM 6640 (T)' : 0.01661 , ' Halobacteroides halobius str. Z-7287 DSM 6639' : 0.00197 ) : 0.00748 ) : 0.00702 , (' Haloanaerobacter lacunaris str. Z-7888 DSM 6640 (T)' : 0.00274 , ' Haloanaerobacter lacunaris str. Z-7888 DSM 6640 (T)' : 0.00955 ) : 0.01318 ) : 0.02063 , (' Halobacteroides halobius str. MD-1 DSM 5150 (T)' : 0.00656 , ' Halobacteroides halobius str. MD-1 ATCC 35273 (T)' : 0.0025 ) : 0.04465 ) : 0.01186 , ' Orenia marismortui str. DY-1 DSM 5156 (T)' : 0.02821 )'HLA.CHITINOVORANS' : 0.01792 , (' Sporohalobacter lortetii str. MD-2 ATCC 35059 (T)' : 0.00786 , (' Acetohalobium arabaticum str. Z-7288 DSM 5501 (T)' : 0.00032 , (' Acetohalobium arabaticum str. Z-7288' : 0 , ' Acetohalobium arabaticum str. Z-7288 DSM 5501 (T)' : 0.00825 ) : 0.00824 ) : 0.04567 )'ACH.ARABATICUM' : 0.04458 ) : 0.04177 , (' Halothermothrix orenii str. H168 OCM 544 (T)' : 0.06393 , (' Halocella cellulolytica str. Z-10151 DSM 7362' : 0.02315 , (' Haloanaerobium salsugo str. VS-752 (T) ATCC 51327' : 0.00722 , (' Haloanaerobium lacuroseus str. H200 DSM 10165 (T)' : 0.00327 , ((' Haloanaerobium acetoethylicum str. EIGI DSM 3532 (T)' : 0.00169 , ' Haloanaerobium acetoethylicum str. EIGI DSM 3532 (T)' : 0 ) : 0.00066 , (' Haloanaerobium congolense SEBR 4224 (T)' : 0.0011 , (((' Haloanaerobium praevalens ATCC 33744 (T)' : 0.00062 , ' Haloanaerobium praevalens DSM 2228 (T)' : 0.00012 ) : 0.00037 , ' Haloanaerobium alcaliphilum str. GSLS DSM 8275 (T)' : 0.00952 ) : 0.00056 , ((' Haloanaerobium saccharolyticum subsp. senegalense str. H150' : 0.00086 , ' Haloanaerobium saccharolyticum subsp. senegalense DSM 7379 (T)' : 0 ) : 0.00014 , (' Haloanaerobium saccharolyticum subsp. saccharolyticum str. Z-7787' : 3e-05 , (' Haloanaerobium saccharolyticum subsp. saccharolyticum str. Z-7787 DSM 6643 (T)' : 0.00078 , ' Haloanaerobium saccharolyticum subsp. saccharolyticum str. Z-7787 DSM 6643 (T)' : 0 ) : 0.00699 ) : 0.00115 ) : 0.00141 ) : 0.00333 ) : 0.00156 ) : 0.00835 ) : 0.00818 )'HAN.PRAEVALENS' : 0.04065 ) : 0.02343 )'HALOANAEROBIUM' : 0.04611 )'ANAEROBIC_HALOPHILES' : 0.07078 ) : 0.02 , ((((((((' Alicyclobacillus acidoterrestris DSM 3923' : 0.00292 , ' Alicyclobacillus acidocaldarius str. 104-1A DSM 446 (T)' : 0.00054 ) : 0.00992 , ' Alicyclobacillus acidocaldarius str. 104-1A NCIMB 11725 (T)' : 0.00101 ) : 0 , ' Alicyclobacillus acidocaldarius str. TDBrock 115-8 ATCC 43034' : 0.00187 ) : 0.00382 , (' Alicyclobacillus cycloheptanicus' : 0.01288 , (' Sulfobacillus thermosulfidooxidans' : 0.02782 , ' Sulfobacillus disulfidooxidans str. SD-11' : 0.03963 ) : 0.02031 ) : 0.02806 ) : 0.02312 , ' Bacillus tusciae DSM 2912 (T)' : 0.07318 ) : 0.01435 , (' symbiont of Daphnia sp.' : 0.14746 , ((' str. ALV' : 0.00718 , ' Sulfobacillus acidophilus str. NAL DSM 10332 (T)' : 0.01501 ) : 0.02134 , ((' gram neg, iron oxidizing, related to isolates BC and ALV clone A70' : 0.00065 , ' clone cOS77' : 0.00328 ) : 0.00199 , (' Sulfobacillus thermosulfidooxidans' : 0.00792 , (' str. BC' : 0.01027 , ' Sulfobacillus sp. str. C-MT1' : 0.00261 ) : 0.00155 ) : 0.01989 ) : 0.05553 ) : 0.11072 ) : 0.02693 )'ALICYCLOBACILLUS' : 0.01272 , ' Bacillus schlegelii DSM 2000 (T)' : 0.10132 ) : 0.01388 , (((' Paenibacillus validus NCIMB 12782 (T)' : 0.0022 , ' Thermoactinomyces vulgaris DSM 43016 (T)' : 0.00227 ) : 0.01217 , ' Thermoactinomyces dichotomicus str. N1595 NCIMB 10211 (T)' : 0.0334 )'TA.VULGARIS' : 0.00182 , (((((((((((((' Paenibacillus gordonae str. Q1 ATCC 29948 (T)' : 0.003 , ' Paenibacillus validus DSM 3037 (T)' : 0.00018 ) : 0.00029 , ' Paenibacillus validus DSM 3037 (T)' : 0.00054 ) : 0.00853 , (' Bacillus mucilaginosus str. 1480D VKPM B-7519 (T)' : 0.02051 , ' Bacillus edaphicus str. T7 VKPM B-7517 (T)' : 0.03038 ) : 0.01478 ) : 0.01515 , ' Bacillus viscosus ATCC 51155' : 0.00479 ) : 0.00486 , (' Paenibacillus chondroitinus str. 12 DSM 5051 (T)' : 0.00975 , ' Paenibacillus alginolyticus str. 3 DSM 5050 (T)' : 0.00881 ) : 0.03357 ) : 0.00325 , (' Paenibacillus larvae subsp. pulvifaciens NCDO 1141' : 0.00188 , ' Paenibacillus larvae subsp. larvae ATCC 9545 (T)' : 0.00045 ) : 0.01858 ) : 0.00537 , (' Paenibacillus thiaminolyticus str. AHU 1392 JCM 8360 (T)' : 0.00221 , (' Paenibacillus popilliae ATCC 14706 (T)' : 0.00406 , ' Paenibacillus lentimorbus ATCC 14707 (T)' : 0.00159 ) : 0.00319 ) : 0.02745 )'PAE.VALIDUS' : 0.0052 , (' Paenibacillus campinasensis str. 324 KCTC 0364BP (T)' : 0 , (((' Paenibacillus chibensis NRRL B-142 (T)' : 0.00225 , ' Paenibacillus amylolyticus NCIMB 8144' : 0.00145 ) : 0.00904 , (' Paenibacillus glucanolyticus str. S93 DSM 5162 (T)' : 0.0046 , ' Paenibacillus lautus NRRL NRS-666 (T)' : 0.00285 ) : 0.01147 ) : 0.00754 , ((' Paenibacillus macquariensis str. 673 NCTC 10419 (T)' : 0.00263 , ' Paenibacillus macquariensis str. 673 DSM 2 (T)' : 0.00063 ) : 0.0093 , (' Paenibacillus amylolyticus NRRL NRS-290 (T)' : 0.00312 , (' Paenibacillus illinoisensis str. 14 NRRL NRS-1356 (T)' : 0.00401 , ' Paenibacillus pabuli NCIMB 12781' : 0.01081 ) : 0.00655 ) : 0.00969 ) : 0.00847 ) : 0.01664 )'PAE.MACQUARIENSIS' : 0.00788 ) : 0.00189 , ((' Paenibacillus kobensis str. YK205 IFO 15729 (T)' : 0.02016 , ' Paenibacillus curdlanolyticus str. YK9 IFO 15724 (T)' : 0.01472 ) : 0.0076 , (' Paenibacillus apiarius NRRL NRS-1438 (T)' : 0.0074 , (' Paenibacillus alvei ATCC 6344 (T)' : 0.00169 , (' Paenibacillus alvei NCDO 1153' : 0 , ' Paenibacillus alvei IFO 3343' : 0 ) : 0.00277 ) : 0.02121 ) : 0.02069 )'PAE.ALVEI' : 0.00916 ) : 0.00111 , (' Paenibacillus macerans NCDO 1764' : 0.00047 , (' Paenibacillus macerans ATCC 8244 (T)' : 0.0042 , ' Paenibacillus macerans JCM 2500' : 0.00283 ) : 0 )'PAE.MACERANS' : 0.03002 ) : 0.00441 , (' Paenibacillus azotofixans DSM 1735 (T)' : 0.00886 , ' Paenibacillus azotofixans str. P3L-5 ATCC 35681 (T)' : 0.00753 )'PAE.AZOTOFIXANS' : 0.03601 ) : 0.0032 , ((' Paenibacillus peoriae str. 11.B.9 IFO 15541 (T)' : 0.00395 , ' Paenibacillus azotofixans NRRL B-14372' : 0.00177 ) : 0.00063 , (' Paenibacillus polymyxa IAM 13419 (T)' : 0.00068 , (' Paenibacillus polymyxa NCDO 1774' : 0 , ' Paenibacillus polymyxa DSM 36 (T)' : 0.01188 ) : 0.00138 ) : 0.00079 )'PAE.POLYMYXA' : 0.01277 )'PAE.POLYMYXA' : 0.00766 , ((((((((((' Brevibacillus formosus NRRL NRS-863 (T)' : 0.00043 , ' Brevibacillus brevis JCM 2503 (T)' : 0.00313 ) : 0 , ' Brevibacillus brevis NCIMB 9372 (T)' : 0.00112 ) : 0.00032 , ' Brevibacillus agri NRRL NRS-1219 (T)' : 0.0055 ) : 0.0003 , (' Brevibacillus reuszeri NRRL NRS-1206 (T)' : 0.00242 , (' Brevibacillus parabrevis IFO 12334 (T)' : 0.00113 , ' Brevibacillus brevis ATCC 8185' : 0.00277 ) : 0.00397 ) : 0.00103 ) : 0.00043 , (' Brevibacillus choshinensis str. HPD52' : 0 , (' Rhizobium sp. str. TM1.Rhizobium isolate' : 0 , ' Rhizobium sp. str. H4.Rhizobium isolate' : 0.00133 ) : 0.02022 ) : 0.00189 ) : 0.0025 , ' Brevibacillus centrosporus NRRL NRS-664 (T)' : 0.0037 ) : 0.00694 , (' Brevibacillus laterosporus IAM 12455 (T)' : 0 , (' Brevibacillus laterosporus ATCC 64 (T)' : 0 , (' Brevibacillus laterosporus JCM 2496 (T)' : 0.00295 , ' Brevibacillus laterosporus NCDO 1763 (T)' : 0.00034 ) : 0.00223 ) : 0.00071 ) : 0.01689 ) : 0.00382 , ' Brevibacillus borstelensis NRRL NRS-818 (T)' : 0.0055 ) : 0.01021 , ' Brevibacillus thermoruber str. BT2 DSM 7064 (T)' : 0.01732 )'BB.BREVIS' : 0.01019 , ((((((' Aneurinibacillus aneurinilyticus DSM 5562 (T)' : 0 , ' Aneurinibacillus aneurinilyticus NCIMB 10056' : 0 ) : 0 , ' Aneurinibacillus aneurinilyticus ATCC 12856 (T)' : 0.00353 ) : 0.00061 , (' Aneurinibacillus migulanus DSM 2895 (T)' : 0.00017 , (' Bacillus acidovorans ATCC 51159' : 0.0007 , ' Aneurinibacillus migulanus ATCC 9999 (T)' : 0.0007 ) : 0 ) : 0.00073 ) : 0.0093 , ' Aneurinibacillus thermoaerophilus str. L420-91 DSM 10154 (T)' : 0.01788 ) : 0.01481 , ((' Ammoniphilus oxalivorans str. RAOx-FS DSM 11537 (T)' : 0 , ' clone UN116' : 1.36831 ) : 0.00883 , (' Oxalophagus oxalicus str. Alt Ox1 DSM 5503 (T)' : 0.00193 , ' Oxalophagus oxalicus str. Alt Ox1 DSM 5503 (T)' : 0 ) : 0.0171 ) : 0.04055 )'AB.ANEURINILYTICUS' : 0.0048 , (' Bacillus horti str. K13 JCM 9943 (T)' : 0.03044 , ((' Marinococcus halophilus NCIMB 2178 (T)' : 0.00046 , ' Marinococcus halophilus DSM 20408 (T)' : 0.00811 )'MRC.HALOPHILUS' : 0.00612 , (((((((((((' Sporolactobacillus laevis str. M-103 IAM 12387' : 0.00052 , ' Sporolactobacillus laevis str. M-114 IAM 12388' : 0 ) : 0 , ' Sporolactobacillus racemicus str. M-17 IAM 12396' : 0.00025 ) : 0.00292 , (' Sporolactobacillus racemicus str. M-16 IAM 12395' : 0.00052 , ' Sporolactobacillus racemicus str. M-116 IAM 14264' : 0 ) : 0.00382 ) : 3e-05 , (' Bacillus laevolacticus str. M-8 IAM 12321 (T)' : 3e-05 , ' Bacillus laevolacticus str. M-14 IAM 12318' : 0 ) : 0.00322 ) : 0.00013 , (' Bacillus laevolacticus str. M-1 IAM 12322' : 0.00026 , ' Bacillus laevolacticus str. M-14 NCIMB 10274' : 0.00086 ) : 0.00022 ) : 0.0001 , ' Bacillus myxolacticus str. M-105 IAM 12326' : 0.00071 ) : 0.00034 , ' Sporolactobacillus laevis str. M-18 IAM 14263' : 0.00293 ) : 0.00341 , (' Sporolactobacillus inulinus ATCC 15538 (T)' : 0.00017 , (' Sporolactobacillus inulinus NRIC 1134' : 0 , (' Sporolactobacillus inulinus JCM 6014 (T)' : 0 , ' Sporolactobacillus racemicus str. M-86 IAM 12384' : 0 ) : 0.0003 ) : 0.00101 ) : 0.00663 )'SPL.INULINUS' : 0.01655 , ' Bacillus racemilacticus str. M-5 IAM 12319' : 0.02071 ) : 0.00512 , (' Bacillus sp. DSM 8718' : 0.01307 , (' Bacillus sp. DSM 8715' : 0.00564 , (((' Bacillus sp. DSM 8721' : 0.01146 , ' Bacillus sp. DSM 8720' : 0.00994 ) : 0.01337 , ' Bacillus vedderi str. JaH' : 0.00592 ) : 0.01978 , ((((' Bacillus alcalophilus DSM 485 (T)' : 0 , ' Bacillus sp. DSM 8724' : 0.00036 ) : 0 , ' Bacillus alcalophilus DSM 485 (T)' : 0.00134 ) : 0.00788 , ' Bacillus sp. DSM 8725' : 0.00301 ) : 0.009 , ((' Bacillus sp. DSM 8719' : 0 , ' Bacillus sp. DSM 8722' : 0 ) : 0.005 , (' Bacillus sp. DSM 8716' : 0.0125 , (' Bacillus sp. DSM 8717' : 0.00867 , ' Bacillus sp. DSM 8714' : 0.01012 ) : 0.00295 ) : 0.01611 ) : 0.00897 ) : 0.00425 ) : 0.00275 ) : 0.00258 )'B.ALCALOPHILUS' : 0.01276 )'SPOROLACTOBACILLUS' : 0.00631 , (((((((((((((((((((((((((' Bacillus kaustophilus NCIMB 8547 (T)' : 0.00015 , ' Bacillus thermoleovorans ATCC 43513 (T)' : 0.0009 ) : 0 , ' Bacillus caldolyticus DSM 405' : 0.00015 ) : 0 , ' Bacillus thermoleovorans DSM 5366 (T)' : 0.00021 ) : 0.00028 , ' Bacillus caldotenax DSM 406' : 0.00056 ) : 0.00049 , ' Bacillus caldotenax DSM 406' : 0.00358 ) : 0.00045 , ' Bacillus caldovelox DSM 411' : 0.00057 ) : 0.00085 , ' Bacillus thermocatenulatus DSM 730 (T)' : 0.00254 ) : 0.00046 , ' Bacillus stearothermophilus str. T10' : 0.00362 ) : 0 , ' Bacillus stearothermophilus NCDO 1768 (T)' : 0.00329 ) : 0.00175 , (' Bacillus thermodenitrificans DSM 465' : 0.00061 , ' Bacillus denitrificans DSM 466' : 0 ) : 0.00359 ) : 0.00707 , (' Bacillus sp. str. Ak1' : 0.0024 , ' Bacillus thermoglucosidasius str. KP 1006 ATCC 43742 (T)' : 0.00305 ) : 0.00822 ) : 0.00148 , (' Saccharococcus thermophilus str. 657 ATCC 43125 (T)' : 0 , ' Saccharococcus thermophilus str. 657 ATCC 43125 (T)' : 0 ) : 0.00676 ) : 0.0043 , (' Bacillus flavothermus DSM 2641' : 0.01466 , (' Bacillus sp. DSM 2349' : 0.00025 , (' Bacillus thermoalkalophilus DSM 6866' : 0.00266 , ' Bacillus pallidus DSM 3670 (T)' : 0.00024 ) : 0 ) : 0.01733 ) : 0.01076 )'B.STEAROTHERMOPHILUS' : 0.01207 , (' Bacillus smithii JCM 9076 (T)' : 0 , (' Bacillus smithii DSM 4216 (T)' : 0.00023 , ' Bacillus smithii DSM 4216 (T)' : 0 ) : 0.00275 )'B.SMITHII' : 0.01764 ) : 0.00189 , ((' Bacillus infernus str. TH-22 (=SMCC/W 478)' : 0 , ' Bacillus infernus str. TH-23 (=SMCC/W 479)' : 0 ) : 0.02502 , (' Bacillus methanolicus str. C1 NCIMB 13114' : 0 , ' Bacillus methanolicus str. C1 NCIMB 13114' : 0.0003 ) : 0.00678 )'B.METHANOLICUS' : 0.00604 ) : 0.00332 , (' Alicyclobacillus acidoterrestris DSM 3922 (T)' : 0.00304 , (((((' Bacillus sporothermodurans str. M215 DSM 10599 (T)' : 0.00133 , ' Bacillus sporothermodurans str. M215 DSM 10599 (T)' : 0.00193 ) : 0.00074 , ' Bacillus sporothermodurans str. M215 DSM 10599 (T)' : 0.00052 ) : 0.00136 , ' Bacillus sp.' : 0.01413 ) : 0.00044 , ' Bacillus oleronius str. Rt 10 DSM 9356 (T)' : 0.00735 ) : 0.00409 , (' Bacillus thermoamylovorans str. DKP CNCM I-1378 (T)' : 0.01179 , (' str. unidentified bacterium D' : 0.00181 , ((' Bacillus coagulans NCDO 1761 (T)' : 0 , ' Bacillus coagulans IAM 12463 (T)' : 0 ) : 0 , (' Bacillus coagulans JCM 2257' : 0.00553 , ' Bacillus badius ATCC 14574 (T)' : 0.00814 ) : 0.00124 ) : 0.00186 ) : 0.03584 ) : 0.00498 ) : 0.011 )'B.SPOROTHERMODURANS' : 0.00363 ) : 0.00108 , (' Bacillus sp. str. WN13 DSM 5271' : 0.00438 , (((' Gracilibacillus dipsosauri str. DD1' : 0.00258 , ' Gracilibacillus halotolerans str. NN' : 0.01154 ) : 0.00068 , ' Amphibacillus xylanus str. Ep01 JCM 7361 (T)' : 0.03891 ) : 0.00126 , (((' Virgibacillus pantothenticus IAM 11061 (T)' : 0.00402 , ' Virgibacillus pantothenticus NCDO 1765' : 0.00167 ) : 0.00915 , ' Salibacillus salexigens str. C-20Mo CCM 4646 (T)' : 0.02727 ) : 0.00459 , (' Halobacillus litoralis str. SL-4 DSM 10405 (T)' : 0.0012 , (' Marinococcus albus DSM 20748 (T)' : 0.00328 , (' Sporosarcina ureae' : 0.00091 , ' Halobacillus halophilus NCIMB 2269 (T)' : 0 ) : 0.01915 ) : 0.00367 ) : 0.01381 ) : 0.04685 ) : 0.02685 )'VR.PANTOTHENTICUS' : 0.0154 ) : 0.00613 , (' Bacillus aminovorans NCIMB 8292 (T)' : 0.02285 , (' Bacillus badius ATCC 14574 (T)' : 0.00024 , ' Bacillus badius NCDO 1760 (T)' : 0.00032 ) : 0.01108 )'B.BADIUS' : 0.01232 ) : 0.00066 , (' Bacillus lentus NCDO 1127 (T)' : 0.0004 , (' Bacillus lentus IAM 12466 (T)' : 0.00028 , ' Bacillus lentus JCM 2511 (T)' : 0.00132 ) : 0.00071 )'B.LENTUS' : 0.00874 ) : 0.0019 , ' Bacillus pseudomegaterium ATCC 49866' : 0.01241 ) : 0.00166 , (((' Bacillus firmus IAM 12464' : 0.00066 , ' Bacillus firmus JCM 2512 (T)' : 0.00274 ) : 0.00045 , ' Bacillus firmus NCIMB 9366 (T)' : 0.00057 )'B.FIRMUS' : 0.00501 , ((' Bacillus benzoevorans NCIMB 12555 (T)' : 0.0013 , ' Bacillus benzoevorans DSM 5391 (T)' : 0 ) : 0.00597 , (' Bacillus circulans IAM 12462 (T)' : 0.00024 , (' Bacillus circulans ATCC 4513 (T)' : 1e-05 , ' Bacillus circulans NCDO 1775 (T)' : 0.00147 ) : 0.00504 ) : 0.00925 )'B.CIRCULANS' : 0.00901 ) : 0.00218 ) : 0.00334 , (' Bacillus psychrosaccharolyticus ATCC 23296 (T)' : 0.00435 , ((' Bacillus maroccanus NCIMB 10500' : 0.00037 , ' Bacillus macroides NCDO 1661' : 0 ) : 0 , (' Bacillus simplex str. ZAN-044' : 0.00103 , ' Bacillus simplex DSM 1321 (T)' : 0.0042 ) : 0.00066 ) : 0.01175 )'B.SIMPLEX' : 0.01183 ) : 0.00207 , (' Bacillus simplex DSM 1321 (T)' : 0.00278 , (' Bacillus megaterium DSM 32 (T)' : 0.00023 , (' clone A5g' : 0 , ' Bacillus megaterium IAM 13418 (T)' : 0.00143 ) : 0.00235 ) : 0.00096 )'B.MEGATERIUM' : 0.01224 )'B.MEGATERIUM' : 0.00179 , (((' Bacillus sp. DSM 8723' : 0.00651 , ' Bacillus cohnii DSM 6307 (T)' : 0.0292 ) : 0.00503 , ' Bacillus fastidiosus DSM 91 (T)' : 0.02206 )'B.COHNII' : 0.00285 , (((((' Exiguobacterium acetylicum NCIMB 9889 (T)' : 0.00065 , ' Exiguobacterium acetylicum' : 0.00176 ) : 0.00379 , ' Exiguobacterium sp.' : 0.00334 ) : 0.01166 , ' Exiguobacterium aurantiacum NCDO 2321 (T)' : 0.02362 ) : 0.00961 , (' Bacillus azotoformans ATCC 29788 (T)' : 0.00025 , ' Bacillus azotoformans DSM 1046 (T)' : 0.01062 ) : 0.0483 )'EXG.ACETYLICUM' : 0.00212 , ((' Bacillus sp.' : 0.0125 , ' Bacillus sp.' : 0.00313 )'BACILLUS_AMBER' : 0.00653 , (((' Bacillus pumilus NCDO 1766 (T)' : 0.00101 , ' Bacillus sp. IFO 12605' : 0.00302 ) : 0.00081 , ' Bacillus pumilus ATCC 72' : 0.00097 )'B.PUMILUS' : 0.00364 , (' Bacillus sp.' : 0.01339 , ((' Paenibacillus popilliae ATCC 14706 (T)' : 0.00152 , ' Bacillus atrophaeus NCIMB 12899 (T)' : 0.0004 ) : 0.00056 , ((((' Bacillus licheniformis str. B-6-4J' : 0.00024 , ' Bacillus licheniformis DSM 13 (T)' : 0 ) : 0 , ' Bacillus licheniformis NCDO 1772 (T)' : 0.00037 ) : 0.00201 , ' Paenibacillus lautus NCIMB 12780' : 0.00086 ) : 0.00135 , ((' Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350 (T)' : 0 , ' Paenibacillus lentimorbus ATCC 14707 (T)' : 0.00074 ) : 0.00057 , (' Bacillus subtilis str. 168 [gene=rrnO gene]' : 0 , (' Bacillus subtilis [gene=rrnO gene]' : 0 , (((' Bacillus subtilis [gene=rrnE gene]' : 0.0008 , ' Bacillus subtilis [gene=rrnI gene]' : 0.00053 ) : 0 , (' Bacillus subtilis str. 168 [gene=rrnJ gene]' : 0 , ' Bacillus subtilis [gene=rrnJ gene]' : 0 ) : 0.00016 ) : 0.00029 , ((' Bacillus subtilis str. 168 [gene=rrnA gene]' : 0.00012 , ' Bacillus subtilis [gene=rrnA gene]' : 0 ) : 0 , (' Bacillus subtilis NCDO 1769 (T)' : 0 , (' Bacillus subtilis str. 168 [gene=rrnW gene]' : 0 , (((' Bacillus subtilis [gene=rrnB gene]' : 0 , ' Bacillus subtilis' : 0 ) : 0 , ' Bacillus subtilis str. 168' : 0.00139 ) : 0 , (' Bacillus subtilis [gene=rrnH gene]' : 0 , (' Bacillus subtilis [gene=rrnG gene]' : 0 , (' Bacillus subtilis [gene=rrnD gene]' : 0.00139 , ' Bacillus subtilis [gene=rrnW gene]' : 0 ) : 0.00026 ) : 0.0003 ) : 0.00033 ) : 0 ) : 0.00073 ) : 0.00012 ) : 0.00032 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00163 ) : 0.0058 ) : 0.00068 ) : 0.00637 )'B.SUBTILIS' : 0.01425 ) : 0.01785 ) : 0.00475 ) : 0.00368 )'B.SUBTILIS' : 0.00202 ) : 0.0034 , (((((((((((((((((' Staphylococcus capitis subsp. capitis ATCC 27840 (T)' : 0 , ' Staphylococcus capitis' : 0 ) : 0 , ' Staphylococcus capitis subsp. capitis ATCC 27840 (T)' : 0 ) : 0.00063 , ' Staphylococcus caprae ATCC 35538 (T)' : 0 ) : 0 , (' Staphylococcus aureus ATCC 25923' : 0.00053 , (' Staphylococcus caprae DSM 20608 (T)' : 0 , ' Staphylococcus capitis subsp. ureolyticus ATCC 49326 (T)' : 0.00137 ) : 0 ) : 0.00044 ) : 0 , ' Staphylococcus arlettae' : 0 ) : 0.0012 , (' Staphylococcus saccharolyticus ATCC 14953 (T)' : 0.00059 , ' Staphylococcus saccharolyticus ATCC 14953 (T)' : 0 ) : 0.00202 ) : 0.00017 , (((' Staphylococcus epidermidis' : 0.00046 , ' Staphylococcus epidermidis' : 0.00025 ) : 0.00158 , ' Staphylococcus epidermidis' : 0.00046 ) : 0 , (' Staphylococcus epidermidis ATCC 14990 (T)' : 0 , (' Staphylococcus epidermidis ATCC 14990 (T)' : 9e-05 , (' Staphylococcus epidermidis ATCC 14990 (T)' : 0 , (' Staphylococcus epidermidis ATCC 14990 (T)' : 0 , ' Staphylococcus epidermidis ATCC 14990 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 6e-05 ) : 0 ) : 0.00267 ) : 0 , (' Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 12600 (T)' : 0.00032 , (' Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 12600 (T)' : 0 , (' str. L-81' : 0 , (' Staphylococcus haemolyticus' : 0 , (' Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 12600 (T)' : 0 , (' Staphylococcus aureus subsp. anaerobius str. MVF-7 ATCC 35844 (T)' : 0 , (' Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 12600 (T)' : 0 , ' Staphylococcus aureus subsp. aureus NCDO 949 (T)' : 0.00077 ) : 0.00026 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00877 ) : 0.00055 ) : 0.00044 ) : 0.00374 ) : 0.00027 , ((' Staphylococcus pasteuri ATCC 51129 (T)' : 0 , ' Staphylococcus pasteuri ATCC 51129 (T)' : 0.00053 ) : 0.00112 , (' Spirochaeta sp. str. HIS Oman, N26' : 0 , (' Staphylococcus warneri ATCC 27836 (T)' : 0 , ' Staphylococcus warneri' : 0 ) : 0.03465 ) : 0.00174 ) : 0.00205 ) : 0.00035 , (((((' Staphylococcus vitulinus str. DD 756 ATCC 51145 (T)' : 0.00033 , ' Staphylococcus pulvereri ATCC 51698 (T)' : 0.00023 ) : 0.00039 , ' Staphylococcus pulvereri str. NT 215 PCM 2443 (T)' : 0.00049 ) : 0.00035 , ' Staphylococcus lentus str. K21 MAFF 911385' : 0.00094 ) : 0.00061 , (' Staphylococcus sciuri' : 0 , ' Staphylococcus sciuri ATCC 20345 (T)' : 0 ) : 0.00401 ) : 0.00166 , ((((((' Staphylococcus carnosus' : 0.00058 , ' Staphylococcus condimenti str. F-2 DSM 11674 (T)' : 0 ) : 0.00046 , ' Staphylococcus piscifermentans str. SK 03' : 0.00046 ) : 0.00103 , ' Staphylococcus carnosus subsp. carnosus ATCC 51365 (T)' : 0 ) : 0.00034 , (' Staphylococcus simulans str. MK 148 MAFF 910161' : 0 , ' Staphylococcus piscifermentans ATCC 51136 (T)' : 0.01109 ) : 0.00041 ) : 0.0034 , (' Staphylococcus auricularis' : 0 , (' Staphylococcus auricularis str. WK811M ATCC 33753 (T)' : 0.00012 , (' Staphylococcus auricularis str. WK811M ATCC 33753 (T)' : 0.0001 , ' Staphylococcus auricularis str. WK811M MAFF 911484' : 0 ) : 0.00043 ) : 0 ) : 0.00439 ) : 0.00169 , (' Staphylococcus muscae str. MB4 CCM 4175 (T)' : 0.002 , ((' Staphylococcus lutrae' : 0.00478 , ' Staphylococcus felis str. GD521 ATCC 49168 (T)' : 0.00336 ) : 0.00038 , ((' Staphylococcus hyicus str. 1 ATCC 11249 (T)' : 0.00169 , ' Staphylococcus chromogenes str. 1462 MAFF 911474' : 0.00274 ) : 0.00082 , (((' Staphylococcus delphini str. Heidy ATCC 49171 (T)' : 0.00049 , ' Staphylococcus intermedius str. H11 MAFF 911388' : 0.00053 ) : 0 , ' Staphylococcus intermedius' : 0 ) : 0.00086 , (' Staphylococcus schleiferi subsp. coagulans str. GA211 ATCC 49545 (T)' : 0 , (' Staphylococcus schleiferi subsp. schleiferi ATCC 43808 (T)' : 0 , (' Staphylococcus schleiferi subsp. schleiferi DSM 4807 (T)' : 0 , ' Staphylococcus schleiferi subsp. schleiferi DSM 4807 (T)' : 0 ) : 0.00068 ) : 0.00081 ) : 0.00113 ) : 0.00088 ) : 0.00072 ) : 0.00213 ) : 0.00317 ) : 0.00962 ) : 0.00088 ) : 0.00198 , (' Staphylococcus lugdunensis str. N860297 ATCC 43809 (T)' : 0 , ' Staphylococcus lugdunensis' : 0 ) : 0.00207 ) : 0 , (((' Staphylococcus haemolyticus ATCC 29970 (T)' : 0.00221 , ' Staphylococcus haemolyticus MAFF 911476' : 0.00051 ) : 0 , ' Staphylococcus haemolyticus ATCC 29970 (T)' : 0.00028 ) : 0.00094 , ((' Staphylococcus hominis subsp. hominis ATCC 27844 (T)' : 0 , ' Staphylococcus hominis' : 0 ) : 0.00032 , (' Staphylococcus hominis subsp. hominis ATCC 27844 (T)' : 0.00035 , ' Staphylococcus xylosus' : 0.0006 ) : 0 ) : 0.00168 ) : 0.0007 ) : 0.00218 , ((((' Staphylococcus saprophyticus' : 0 , ' Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus str. NT75 DSM 20229 (T)' : 0.00083 ) : 0.00056 , ' Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 (T)' : 0 ) : 0.0005 , ' Staphylococcus xylosus MAFF 911482' : 0 ) : 0.0004 , ((((' Staphylococcus equorum' : 0 , ' Staphylococcus "aerophilus"' : 0 ) : 6e-05 , ' Staphylococcus equorum ATCC 43958 (T)' : 0 ) : 0 , ' Staphylococcus equorum ATCC 43958 (T)' : 0.00073 ) : 0.00069 , (((' Staphylococcus kloosii' : 0 , ' Staphylococcus kloosii str. SC210 ATCC 43959 (T)' : 0 ) : 0.00047 , ' Staphylococcus succinus str. AMG-D1 ATCC 700337 (T)' : 0.00083 ) : 0.00019 , (((' Staphylococcus caprae' : 0 , ' Staphylococcus arlettae str. BP47 ATCC 43957 (T)' : 0 ) : 0.0003 , ' Staphylococcus gallinarum str. VIII1 ATCC 35539 (T)' : 0.00139 ) : 0.00026 , (' Staphylococcus cohnii subsp. urealyticum str. CK27 ATCC 49330 (T)' : 0 , (' Staphylococcus cohnii' : 0 , (' Staphylococcus cohnii subsp. cohnii MAFF 911487' : 0 , ' Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus MAFF 911473 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00085 ) : 0.00113 ) : 0.00512 ) : 0.00308 ) : 0.00125 ) : 0.00307 )'STAPHYLOCOCCUS' : 0.0115 , (' Macrococcus caseolyticus str. DD 4508 MAFF 911387' : 0.00084 , (' Macrococcus caseolyticus str. DD 4508 ATCC 13548 (T)' : 0.00114 , ' Macrococcus caseolyticus' : 0 ) : 0 )'MAC.CASEOLYTICUS' : 0.02427 ) : 0.00632 , (' Salinicoccus roseus DSM 5351 (T)' : 0.06658 , ((' Gemella morbillorum ATCC 27824 (T)' : 0.00608 , ' Gemella sanguinis str. 2045-94 CCUG 37820 (T)' : 0.00307 ) : 0 , (' Gemella haemolysans ATCC 10379 (T)' : 0 , ' Gemella haemolysans ATCC 10379 (T)' : 0.00031 ) : 0.00173 ) : 0.03182 )'GEM.HAEMOLYSANS' : 0.00882 ) : 0.00723 , (' Sporolactobacillus dextrus str. M-15 IAM 12380' : 0.00738 , ((' Bacillus cereus str. F4810/72 NCTC 11143' : 0 , ' Bacillus anthracis str. Sterne' : 0 ) : 0 , (' Bacillus cereus NCDO 1771 (T)' : 0 , (' Bacillus cereus IAM 12605 (T)' : 0 , (' str. S12' : 0.00019 , (((' Bacillus medusa NCIMB 10437' : 0.00035 , ' Bacillus thuringiensis NCIMB 9134 (T)' : 0 ) : 0 , ' Bacillus thuringiensis IAM 12077 (T)' : 0 ) : 0.00098 , (' Bacillus mycoides str. 273 DSM 2048 (T)' : 0.00065 , (' Bacillus cereus str. FDA PCI 213 ATCC 11778' : 0 , (' str. B773' : 0 , ' Bacillus sp.' : 0.01412 ) : 0.01679 ) : 0.00557 ) : 0.0013 ) : 0.01065 ) : 0.00012 ) : 0 ) : 0.00032 ) : 0.02916 )'B.CEREUS' : 0.00775 )'STAPHYLOCOCCUS' : 0.00317 , ((((((((((((((' Bacillus sphaericus NRS 592' : 0.00362 , ' Bacillus fusiformis ATCC 7055 (T)' : 0.00266 ) : 0.0012 , ' Bacillus sphaericus str. 2362' : 0 ) : 0.0009 , ' Bacillus sphaericus NRS 400' : 0.00028 ) : 0.00041 , (' Bacillus sphaericus NRS 1198' : 0.00577 , ' Bacillus sphaericus str. 2297' : 0.00087 ) : 0 ) : 0.0045 , ' Bacillus sphaericus str. 1013 (T. Gibson) ATCC 14577 (T)' : 0.00064 ) : 0.00476 , ' Bacillus fusiformis ATCC 7055 (T)' : 0.00125 ) : 0.00112 , (' Bacillus sphaericus str. IAM 13420' : 0.00019 , (' Bacillus sphaericus str. 1013 (T. Gibson) NCDO 1767 (T)' : 0.00017 , (' Bacillus sp.' : 0.00252 , ' Bacillus sphaericus str. BCA16' : 0 ) : 0.00908 ) : 0.00209 ) : 0.00144 )'B.SPHAERICUS' : 0.00496 , (' Bacillus silvestris str. HR3-23' : 0.01987 , ((' Caryophanon latum NCDO 2034' : 0.0017 , ' Caryophanon latum NCDO 1745' : 0 ) : 0.0008 , (' Caryophanon latum NCIMB 9533 (T)' : 0.0067 , ' Caryophanon tenue NCDO 2324 (T)' : 0.00316 ) : 0.00226 ) : 0.00917 )'CRP.LATUM' : 0.00792 ) : 0.00524 , (' Filibacter limicola' : 0.0056 , (' Kurthia gibsonii NCIMB 9758 (T)' : 0.00662 , (' Kurthia zopfii str. F64/100; K5 NCIMB 9878 (T)' : 0 , ' Kurthia zopfii str. F64/100; K5 ATCC 33403 (T)' : 0.00017 ) : 0.0069 ) : 0.02319 )'KUR.ZOPFII' : 0.01334 ) : 0.00315 , ' Bacillus thermosphaericus str. P-11 DSM 10633 (T)' : 0.04106 ) : 0.00404 , (' str. B775' : 0.01589 , ' Bacillus insolitus DSM 5 (T)' : 0 )'B.INSOLITUS' : 0.01028 ) : 0.00311 , (' Bacillus pasteurii NCIMB 8841 (T)' : 0.00176 , ((' Sporosarcina ureae NCIMB 9251 (T)' : 0.00038 , ' Sporosarcina ureae' : 0 ) : 0.01077 , (' Bacillus globisporus str. W25 NCIMB 11434 (T)' : 0.00057 , (' Bacillus globisporus str. W25 DSM 4 (T)' : 0.00075 , (' Bacillus globisporus str. W25 ATCC 23301 (T)' : 0 , (' Bacillus psychrophilus str. W16A ATCC 23304 (T)' : 0.00031 , (' Bacillus psychrophilus str. W5 ATCC 23306' : 0 , (' Bacillus psychrophilus str. W16A IAM 12468 (T)' : 0.00188 , ' Bacillus psychrophilus str. W16A ATCC 23304 (T)' : 0.00037 ) : 0 ) : 0.00055 ) : 0.00061 ) : 0 ) : 0.00033 ) : 0.00947 ) : 0.0331 )'B.PSYCHROPHILUS' : 0.00682 ) : 0.00285 , ((' Planococcus citreus NCIMB 1493 (T)' : 0.0077 , ' Planococcus kocurii NCIMB 629 (T)' : 0.00577 ) : 0.00297 , (' Planococcus mcmeekinii str. S23F2 ATCC 700539 (T)' : 0.0008 , ' Planococcus okeanokoites' : 0.00641 ) : 0.00441 )'PLC.MCMEEKINII' : 0.00802 )'B.SPHAERICUS' : 0.00199 , (' Bacillus thermocloacae DSM 5250 (T)' : 0.00837 , ((((((((((' Listeria monocytogenes str. 53 XXIII NCTC 10357 (T)' : 0.00114 , ' Listeria monocytogenes str. 5867' : 0 ) : 0 , ' Listeria monocytogenes ATCC 35152' : 0.00032 ) : 0 , (' Listeria innocua' : 0.00153 , ' Listeria monocytogenes' : 0.00053 ) : 0.00231 ) : 0.00059 , (' Listeria innocua str. SLCC 3379 ATCC 33090 (T)' : 0.00089 , ' Listeria innocua str. SLCC 3379 NCTC 11288 (T)' : 0 ) : 0.00077 ) : 0.00057 , (' Listeria welshimeri str. Welshimer V8 ATCC 35897 (T)' : 0 , ' Listeria welshimeri str. Welshimer V8 NCTC 11857 (T)' : 0.00026 ) : 0.00119 ) : 0.00041 , ' Listeria seeligeri NCTC 11856 (T)' : 0.00125 ) : 0.00077 , (' Listeria ivanovii subsp. londoniensis CLIP 12229 (T)' : 0.00032 , (' Listeria ivanovii subsp. ivanovii str. SLCC 2379 CLIP 12510 (T)' : 0.00037 , ' Listeria ivanovii subsp. ivanovii str. SLCC 2379 NCTC 11846 (T)' : 0 ) : 0.00054 ) : 0.00106 ) : 0.00739 , (' Listeria grayi CIP 6818' : 0 , (' Listeria grayi ATCC 19120 (T)' : 0 , ' Listeria grayi str. F-9 NCTC 10812 (T)' : 0.00107 ) : 0.0018 ) : 0.0085 )'LIS.MONOCYTOGENES' : 0.00319 , (' Brochothrix campestris ATCC 43754 (T)' : 0.00076 , (' Brochothrix thermosphacta ATCC 11509 (T)' : 0 , ' Brochothrix thermosphacta NCDO 1676 (T)' : 0.00412 ) : 0.00479 )'BRO.THERMOSPHACTA' : 0.02558 )'LISTERIA-BROCHOTHRIX' : 0.00523 , (((((((' Facklamia sourekii' : 0.02283 , ' Ignavigranum ruoffiae str. 1607-97 CCUG 37658 (T)' : 0.0329 ) : 0.01267 , ' Globicatella sanguinis' : 0.02281 ) : 0.00154 , ' Facklamia hominis' : 0.03197 ) : 0.01231 , ' Abiotrophia defectiva str. SC10 ATCC 49176 (T)' : 0.03669 ) : 0.00684 , (' Abiotrophia balaenopterae CCUG 37380 (T)' : 0.0028 , (' Abiotrophia elegans str. B1333 DSM 11693 (T)' : 0.00967 , ' Abiotrophia adiacens str. GaD ATCC 49175 (T)' : 0.02084 ) : 0.01236 ) : 0.01667 ) : 0.00934 , (' Aerococcus viridans ATCC 11563 (T)' : 0.0181 , ' Aerococcus urinae NCFB 2893 (T)' : 0.02332 ) : 0.01854 )'ABIOTROPHIA' : 0.00551 , ((((((((((((((((((' Weissella viridescens str. S38A NCDO 1655 (T)' : 0.00193 , ' Weissella viridescens str. S38A ATCC 12706 (T)' : 0.00024 ) : 0 , ' Weissella viridescens str. S38A JCM 1174 (T)' : 0 ) : 0.00069 , (' Weissella minor NCDO 1973' : 0.00218 , ' Weissella minor ATCC 35412 (T)' : 0 ) : 0.00336 ) : 0.00365 , (' Weissella halotolerans str. R61 ATCC 35410 (T)' : 0.0175 , (' Weissella kandleri NCDO 2753 (T)' : 0.00037 , ' Weissella kandleri DSM 20593 (T)' : 0.00054 ) : 0.01592 ) : 0.00568 ) : 0.00592 , ((' Weissella hellenica NCFB 2973 (T)' : 0 , ' Weissella hellenica NCFB 2973 (T)' : 0.0003 ) : 0.00115 , (' Weissella paramesenteroides NCDO 803 (T)' : 0 , ' Weissella paramesenteroides DSM 20288 (T)' : 0.00314 ) : 0.00181 ) : 0.00739 ) : 0.00317 , (' Weissella confusus NCDO 1586 (T)' : 0.00012 , (' Weissella confusus JCM 1093 (T)' : 2e-05 , ' Weissella confusus ATCC 10881 (T)' : 0.00232 ) : 0.00512 ) : 0.00036 )'WEI.VIRIDESCENS' : 0.04052 , (((' Oenococcus oeni NCDO 1674 (T)' : 0.0034 , ' Oenococcus oeni NCDO 1674 (T)' : 0.00137 ) : 0 , ' Oenococcus oeni ATCC 23279 (T)' : 0.00016 ) : 0.01464 , (' Leuconostoc fallax DSM 20189' : 0.01304 , (' Lactobacillus fructosus NCDO 2345 (T)' : 0.01636 , ((((' Leuconostoc citreum NCFB 2787' : 0.0003 , ' Leuconostoc citreum NCDO 2787' : 0.00095 ) : 0.00229 , ' Leuconostoc lactis ATCC 19256' : 0.00368 ) : 0.00793 , ' Leuconostoc carnosum str. SML40 NCFB 2776 (T)' : 0.00349 ) : 0.00188 , ((' Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides NCDO 523 (T)' : 0 , ' Leuconostoc pseudomesenteroides str. 39 NCDO 768 (T)' : 0.00192 ) : 0.00064 , (' Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris ATCC 19254 (T)' : 0 , ' Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 (T)' : 0.00066 ) : 0.00064 ) : 0.0036 ) : 0.04629 ) : 0.01949 ) : 0.12481 )'LC.MESENTEROIDES' : 0.00639 ) : 0.0454 , (' Lactobacillus amylophilus DSM 20533 (T)' : 0.01834 , (((' Lactobacillus acidophilus subsp. johnsonii str. BMF 6Lb6 LAB 82' : 0 , ' Lactobacillus johnsonii ATCC 33200 (T)' : 0.00043 ) : 0.00016 , (' Lactobacillus gasseri NCDO 2233 (T)' : 0.00058 , ' Lactobacillus gasseri ATCC 33323 (T)' : 0.00255 ) : 0.00171 ) : 0.01922 , (' Lactobacillus acetotolerans DSM 20749 (T)' : 0.01647 , ((((' Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii str. Calvert NCDO 213 (T)' : 0.00154 , ' Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii str. Calvert ATCC 9649 (T)' : 0.0003 ) : 0.0007 , ' Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis ATCC 12315 (T)' : 0.00081 ) : 0.00022 , ' Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus str. Lb.14 JCM 1002 (T)' : 0.00491 ) : 0.0085 , (' Lactobacillus helveticus str. Lh12 NCDO 2712 (T)' : 0.00283 , ((' Lactobacillus acidophilus NCDO 1748 (T)' : 0.00041 , ' Lactobacillus acidophilus ATCC 4356 (T)' : 0.00073 ) : 0.0013 , (' Lactobacillus crispatus DSM 20584 (T)' : 0.00203 , (' Lactobacillus amylolyticus str. LA 5 DSM 11664 (T)' : 0.00144 , ' Lactobacillus amylovorus ATCC 33620 (T)' : 0.01434 ) : 0.00289 ) : 0.00346 ) : 0.00376 ) : 0.03784 ) : 0.00641 ) : 0.01838 ) : 0.02747 )'L.DELBRUECKII' : 0.01891 ) : 0.01138 , ((' Lactobacillus fermentum ATCC 14931 (T)' : 0.00064 , ' Lactobacillus fermentum NCDO 1750 (T)' : 0.00796 ) : 0.0111 , (' Lactobacillus pontis str. LTH 2587' : 0.00204 , ((' Lactobacillus reuteri str. F275 DSM 20016 (T)' : 0.00186 , ' Lactobacillus reuteri str. F275 DSM 20016 (T)' : 0.01897 ) : 0.00762 , (' Lactobacillus vaginalis NCTC 12197 (T)' : 0.00486 , (' Lactobacillus panis DSM 6035 (T)' : 0.00409 , (' Lactobacillus oris NCDO 2160 (T)' : 0.00246 , ' Lactobacillus oris DSM 4864 (T)' : 0.0005 ) : 0.00308 ) : 0.01213 ) : 0.00951 ) : 0.00891 ) : 0.02176 )'L.REUTERI' : 0.00739 ) : 0.00668 , ((' Pediococcus acidilactici str. B213c DSM 20284 (T)' : 0.00557 , ' Pediococcus pentosaceus ATCC 33316 (T)' : 0.00159 ) : 0.00722 , (' Pediococcus parvulus str. S182 JCM 5889 (T)' : 0.00325 , ' Pediococcus damnosus str. Be.1 JCM 5886 (T)' : 0.00142 ) : 0.00975 )'PED.PENTOSACEUS' : 0.01183 ) : 0.00231 , (((((((' Lactobacillus sp. ATCC 10776' : 0.00047 , ' Lactobacillus pentosus JCM 1588' : 0 ) : 0 , ' Lactobacillus plantarum JCM 1149 (T)' : 0.00015 ) : 0.00045 , (' Lactobacillus plantarum str. 17-5 ATCC 8014' : 0 , ' Lactobacillus plantarum str. Lp 39 NCDO 1752 (T)' : 0.00314 ) : 0.00072 ) : 0.00925 , (' Lactobacillus alimentarius ATCC 29643 (T)' : 0.00316 , ' Lactobacillus farciminis ATCC 29644 (T)' : 0.00887 ) : 0.02947 ) : 0.00501 , (' Lactobacillus reuteri str. F275 JCM 1112 (T)' : 0.00846 , ' Lactobacillus collinoides JCM 1123 (T)' : 0.00999 ) : 0.01245 ) : 0.00861 , (' Lactobacillus brevis NCDO 1749 (T)' : 0.00013 , (' Lactobacillus brevis ATCC 14869 (T)' : 0.00024 , ' Lactobacillus brevis ATCC 14869 (T)' : 0 ) : 0.00025 ) : 0.01787 )'L.PLANTARUM' : 0.0052 , ((((' Lactobacillus kefiri ATCC 35411 (T)' : 0 , ' Lactobacillus kefiri JCM 5818 (T)' : 0 ) : 0.00221 , (' Lactobacillus buchneri ATCC 4005 (T)' : 0.00048 , ' Lactobacillus buchneri NCDO 110 (T)' : 0.00434 ) : 0.00256 ) : 0.00474 , (' Lactobacillus hilgardii ATCC 8290 (T)' : 0.00012 , (' Lactobacillus hilgardii JCM 1155 (T)' : 0.00012 , ' Lactobacillus sp. str. L 343 ATCC 13133' : 0 ) : 0.00026 ) : 0.00619 ) : 0.0092 , (((' Lactobacillus fructivorans DSM 20203 (T)' : 0.00052 , ' Lactobacillus homohiochii JCM 1199 (T)' : 0 ) : 0.00034 , ' Lactobacillus fructivorans ATCC 8288 (T)' : 0.00057 ) : 0.00464 , (' Lactobacillus lindneri str. KPA DSM 20690 (T)' : 0.00354 , ((' Lactobacillus sanfranciscensis JCM 5668 (T)' : 0.00021 , ' Lactobacillus sanfranciscensis str. Kline L-2 ATCC 27651 (T)' : 0.00022 ) : 0.00035 , (' Lactobacillus sanfranciscensis DSM 20663' : 0.00019 , ' Lactobacillus sanfranciscensis str. Kline L-2 ATCC 27651 (T)' : 0.00041 ) : 0.00037 ) : 0.00551 ) : 0.02278 ) : 0.01223 )'L.SANFRANCISCENSIS' : 0.00567 ) : 0.00228 ) : 0.00381 , (' Lactobacillus mali ATCC 27053 (T)' : 0.00619 , (((' Lactobacillus animalis ATCC 35046 (T)' : 0.00032 , ' Lactobacillus animalis NCDO 2425' : 0.00044 ) : 0.00047 , ' Lactobacillus murinus ATCC 35020' : 0.00102 ) : 0.00423 , (' Lactobacillus ruminis str. RF1 ATCC 27780 (T)' : 0.00419 , (' Lactobacillus agilis DSM 20509 (T)' : 0.0068 , (' Lactobacillus aviarius subsp. aviarius ATCC 43234 (T)' : 0.01033 , (' Lactobacillus salivarius subsp. salivarius str. H066 ATCC 11741 (T)' : 0.00068 , ' Lactobacillus salivarius subsp. salicinius str. H0268 ATCC 11742 (T)' : 0.00138 ) : 0.01672 ) : 0.01227 ) : 0.01738 ) : 0.01401 ) : 0.00775 )'L.MALI' : 0.01525 ) : 0.00668 , ((' Lactobacillus sharpeae DSM 20505 (T)' : 0.01409 , ' Lactobacillus manihotivorans str. OND 32 LMG 18010 (T)' : 0.01701 ) : 0.00275 , ((' Lactobacillus rhamnosus JCM 1136 (T)' : 0 , ' Lactobacillus rhamnosus DSM 20021 (T)' : 0 ) : 0.00106 , ((((' Lactobacillus casei subsp. casei NCDO 161 (T)' : 0.00393 , ' Lactobacillus casei subsp. casei JCM 1134 (T)' : 0 ) : 0.00022 , ' Lactobacillus casei subsp. casei ATCC 393 (T)' : 0.00043 ) : 0.00102 , ' Lactobacillus zeae ATCC 15820 (T)' : 0 ) : 0.0006 , (' Lactobacillus casei subsp. casei ATCC 334' : 0 , (' Lactobacillus paracasei subsp. paracasei JCM 8130 (T)' : 0 , (' Lactobacillus paracasei subsp. paracasei JCM 1133' : 0 , (' Lactobacillus paracasei subsp. paracasei JCM 1181' : 0 , ' Lactobacillus paracasei subsp. tolerans JCM 1171 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00173 ) : 0.00179 ) : 0.0351 )'L.CASEI' : 0.00915 ) : 0.00467 , (' Lactobacillus coryniformis subsp. coryniformis ATCC 25602 (T)' : 0.00837 , (' Lactobacillus bifermentans JCM 1094' : 0 , ' Lactobacillus bifermentans ATCC 35409 (T)' : 0 ) : 0.01499 )'L.BIFERMENTANS' : 0.01806 ) : 0.00159 , ' Pediococcus dextrinicus str. L95 JCM 5887 (T)' : 0.02966 ) : 0.005 , ' Lactobacillus sakei subsp. sakei ATCC 15521 (T)' : 0.01996 )'LACTOBACILLI' : 0.00292 , (((' str. SBR2013' : 0.00094 , ' str. SBR2001' : 0 ) : 0 , ' Desemzia incerta DSM 20581 (T)' : 0.46914 )'DSZ.INCERTA' : 0.00706 , (((' Dolosigranulum pigrum str. R91/1468 NCFB 2975 (T)' : 0.03972 , ' Alloiococcus otitis NCFB 2890 (T)' : 0.0249 ) : 0.00991 , ' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G32' : 0.0076 )'AIC.OTITIS' : 0.01425 , (((((' Carnococcus allantoicus str. NDP' : 0 , ' Lactosphaera pasteurii str. KoTa2 ATCC 35945' : 0.00219 ) : 0 , ' Lactosphaera pasteurii str. KoTa2 DSM 2381 (T)' : 0.00043 ) : 0.00702 , ' Carnobacterium alterfunditum ACAM 311' : 0.02945 ) : 0.00447 , (' Carnobacterium funditum str. pf3 DSM 5970 (T)' : 0.00646 , ' Carnobacterium mobile NCFB 2765 (T)' : 0.00797 ) : 0.01066 ) : 0.00447 , ((' Carnobacterium divergens ATCC 35677 (T)' : 0.00044 , ' Carnobacterium divergens NCDO 2763 (T)' : 0.00105 ) : 0.00668 , (' Carnobacterium gallinarum NCFB 2766 (T)' : 0.00175 , ((' Carnobacterium piscicola NCDO 2762 (T)' : 0.00991 , ' Lactobacillus maltaromicus str. MX5 JCM 1154 (T)' : 0 ) : 0.00029 , (' Lactobacillus maltaromicus str. MX5 ATCC 27865 (T)' : 0.0002 , ' Carnobacterium piscicola' : 0.00094 ) : 0.00018 ) : 0.00466 ) : 0.00751 ) : 0.00754 )'CRN.DIVERGENS' : 0.02779 ) : 0.01582 )'CARNOBACTERIUM' : 0.01554 ) : 0.0032 , ((' Vagococcus fluvialis NCDO 2497 (T)' : 0.01606 , ' Vagococcus salmoninarum str. OSI-68 NCFB 27777 (T)' : 0.01779 ) : 0.00066 , ((((((((' Tetragenococcus halophilus JCM 5888 (T)' : 0.00032 , ' Tetragenococcus halophilus IAM 1676 (T)' : 0.00068 ) : 0.01058 , ' Enterococcus sulfureus str. MUTK 31 NCDO 2379 (T)' : 0.03864 ) : 0.00228 , ' Enterococcus saccharolyticus NCDO 2594 (T)' : 0.00599 ) : 0.00396 , (' str. BAW1' : 0.00602 , (' Enterococcus cecorum' : 0.01007 , ' Enterococcus columbae str. STR 345 NCIMB 13013 (T)' : 0.00526 ) : 0.01637 ) : 0.0007 ) : 0.00179 , ' Enterococcus asini str. AS2 DSM 11492 (T)' : 0.01065 ) : 0.00196 , (' Enterococcus sp. LMG 12316' : 0.0038 , (' Enterococcus faecium JCM 5804 (T)' : 0.01163 , (' Enterococcus hirae ATCC 9790' : 0 , ' Enterococcus hirae ATCC 9790' : 0 ) : 0.03533 ) : 0 ) : 0.00396 ) : 0.00322 , ((' Enterococcus faecalis JCM 5803 (T)' : 0.00137 , ' Enterococcus faecalis' : 0.02572 ) : 0.01619 , (' Melissococcus pluton str. M40P NCDO 2440' : 0.00071 , ' Melissococcus pluton str. M43P NCDO 2443 (T)' : 0.00034 ) : 0.11855 ) : 0.00215 )'ENTEROCOCCUS' : 0.00316 , ((((((((((((((((' Streptococcus suis' : 0 , ' Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae ATCC 43078 (T)' : 0.00102 ) : 0.0028 , ' Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis NCFB 1356 (T)' : 0.00088 ) : 0.00368 , (' Streptococcus agalactiae ATCC 13813 (T)' : 0 , (' Streptococcus agalactiae' : 0 , ' Streptococcus agalactiae NCDO 1348 (T)' : 0 ) : 0.00301 ) : 0.00753 ) : 0.00452 , ' Streptococcus criae NCDO 2772 (T)' : 0.01006 ) : 0.00137 , (' Streptococcus porcinus ATCC 43138 (T)' : 0.00283 , ' Streptococcus porcinus NCDO 600 (T)' : 0.0034 ) : 0.00869 ) : 0.00054 , (' Streptococcus agalactiae ATCC 13813 (T)' : 0.00198 , (' Streptococcus uberis ATCC 19436 (T)' : 0.00211 , (' Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae ATCC 43078 (T)' : 0 , ' Streptococcus uberis' : 0 ) : 0.00488 ) : 0 ) : 0.00511 ) : 0.00272 , ((' Streptococcus canis' : 0 , ' Streptococcus canis str. STR-T1 ATCC 43496 (T)' : 0.00539 ) : 0.00347 , (' Streptococcus sp. str. 4286' : 0 , (' Streptococcus pyogenes ATCC 19615' : 0 , (' Streptococcus pyogenes str. T1 ATCC 12344 (T)' : 0.00178 , ' Streptococcus pyogenes' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00526 ) : 0.00596 )'STC.PYOGENES' : 0.00286 , (((' Streptococcus equi subsp. equi NCDO 2493 (T)' : 0.00137 , ' Streptococcus equi subsp. equi ATCC 33398 (T)' : 0.01115 ) : 0.00258 , ' Streptococcus equi subsp. zooepidemicus str. S 34 ATCC 43079 (T)' : 0.00793 )'STC.EQUI' : 0.00452 , (((' Lactococcus piscium str. fish isolate HR1A-68' : 0.01531 , ' Lactococcus raffinolactis NCDO 617 (T)' : 0.00479 ) : 0.00653 , ' Lactococcus plantarum NCDO 1869 (T)' : 0.00289 ) : 0.01026 , ((' Lactococcus garvieae NCDO 2156' : 0.0001 , ' Lactococcus garvieae str. YT-3 ATCC 49156 (T)' : 0.00176 ) : 0.02241 , ((' Lactococcus lactis subsp. cremoris ATCC 19257 (T)' : 0 , ' Lactococcus lactis subsp. cremoris str. 205' : 0.0004 ) : 0.00101 , ((' Lactococcus lactis str. IL 1403' : 0 , ' Lactococcus lactis subsp. lactis ATCC 19435 (T)' : 0 ) : 0 , (' Lactococcus lactis subsp. lactis str. DRC-1' : 0 , (' Lactococcus lactis subsp. lactis str. 7962' : 0 , (' Lactococcus lactis subsp. lactis str. f2d2' : 0.00027 , ' Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118' : 0.00042 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00179 ) : 0.02986 ) : 0.0294 )'LCC.LACTIS' : 0.0303 ) : 0.00849 ) : 0.00768 , (' Streptococcus hyointestinalis ATCC 49169 (T)' : 0.00078 , ' Streptococcus hyointestinalis DSM 20770 (T)' : 0.00088 )'STC.HYOINTESTINALIS' : 0.00741 ) : 0.00308 , (' Streptococcus hyovaginalis str. SHV515 DSM 12219 (T)' : 0.00942 , ' Streptococcus thoraltensis str. S69 DSM 12221 (T)' : 0.01017 )'STC.THORALTENSIS' : 0.01179 ) : 0.00163 , (((((((' Streptococcus sp. str. 69130' : 0 , ' Streptococcus milleri str. 4221' : 0 ) : 0 , ' Streptococcus milleri str. SJMC' : 0.00083 ) : 0 , ' Streptococcus sp. str. MGH' : 0.00039 ) : 0 , ' Streptococcus anginosus ATCC 33397 (T)' : 0.00079 ) : 0.00196 , (' Streptococcus anginosus ATCC 12395 (T)' : 0 , ' Streptococcus anginosus NCTC 10713 (T)' : 0 ) : 0.00654 ) : 0.00085 , ' Streptococcus equi subsp. equi NCTC 9682 (T)' : 0 ) : 0.00118 , (((((' Streptococcus mutans NCTC 10449 (T)' : 0 , ' Streptococcus mutans ATCC 25175 (T)' : 0 ) : 0.02119 , ' Streptococcus macacae NCTC 11558 (T)' : 0.03754 ) : 0.00908 , (' Streptococcus sobrinus DSM 20742 (T)' : 0.00785 , ' Streptococcus downei NCTC 11391 (T)' : 0.00964 ) : 0.00935 ) : 0.00278 , (' Streptococcus criceti NCDO 2720 (T)' : 0.01971 , ' Streptococcus ratti NCDO 2723 (T)' : 0.01487 ) : 0.0042 ) : 0.00274 , ((' Streptococcus alactolyticus NCDO 1091 (T)' : 0.00101 , ' Streptococcus alactolyticus str. 76-84-1 ATCC 43492 (T)' : 0.00536 ) : 0.00388 , ((((((' Streptococcus thermophilus NCDO 573 (T)' : 0.00287 , ' Streptococcus thermophilus DSM 20617 (T)' : 0.00184 ) : 0 , ' Streptococcus salivarius str. C699 ATCC 13419' : 0.00063 ) : 0 , ' Streptococcus salivarius NCDO 1779 (T)' : 0.00085 ) : 0 , ' Streptococcus salivarius ATCC 7073 (T)' : 0 ) : 0.00092 , ' Streptococcus vestibularis NCTC 12166 (T)' : 0.00438 ) : 0.00225 , ((' Streptococcus macedonicus str. LAB617 ACA-DC 206 (T)' : 0.00201 , ' Streptococcus gallolyticus ACM 3969 (T)' : 0.00184 ) : 0.00109 , (' Streptococcus equinus NCDO 1037 (T)' : 0.00092 , (' Streptococcus bovis NCDO 597 (T)' : 0.00045 , (' Streptococcus bovis ATCC 33317 (T)' : 0.00113 , ' Streptococcus bovis ATCC 33317 (T)' : 0.00579 ) : 0.00129 ) : 0.00056 ) : 0.00271 ) : 0.01436 ) : 0.0093 ) : 0.00338 ) : 0.01078 )'STC.SALIVARIUS' : 0.01039 ) : 0.00621 , (' Streptococcus sanguinis ATCC 10556 (T)' : 0 , ((' Streptococcus anginosus str. SK54 NCTC 11324' : 0.00114 , ' Streptococcus anginosus str. SK54 ATCC 27335 (T)' : 0.00018 ) : 0.0018 , (' Streptococcus milleri str. 372' : 0.00089 , (' Streptococcus anginosus str. SK54 ATCC 27335 (T)' : 0 , (' Streptococcus constellatus' : 0 , (' Streptococcus constellatus ATCC 27823 (T)' : 1e-05 , ' Streptococcus constellatus ATCC 27823 (T)' : 0 ) : 0.00086 ) : 0 ) : 0.00102 ) : 0.00692 ) : 0.00113 )'STC.CONSTELLATUS' : 0.00587 ) : 0.00892 , (' Streptococcus acidominimus' : 0.01118 , (' Streptococcus dysgalactiae' : 0.00059 , (' Streptococcus suis str. S735 ATCC 43765 (T)' : 0 , ' Streptococcus suis str. S735 NCTC 10234 (T)' : 0.00019 ) : 0.00361 ) : 0.01529 )'STC.SUIS' : 0.00203 ) : 0.00348 , (' Streptococcus parasanguinis str. 85-81' : 0.00635 , (((((' Streptococcus gordonii str. SK 3 NCTC 7865 (T)' : 0.00026 , ' Streptococcus gordonii str. SK 3 ATCC 10558 (T)' : 0.00036 ) : 0 , ' Streptococcus mitis str. SK 51 NCTC 3165' : 0 ) : 0.00032 , ' Streptococcus mitis str. SK 51 NCTC 3165' : 0.00107 ) : 0.00058 , ' Streptococcus cristatus str. CR311 NCTC 12479 (T)' : 0.00627 ) : 0.00063 , (' Streptococcus oralis str. PB 182 NCTC 11427 (T)' : 0 , (' Streptococcus oralis str. PB 182 ATCC 35037 (T)' : 0.0013 , ((' Streptococcus peroris str. O-66 JCM 10158 (T)' : 0.00826 , ' Streptococcus infantis str. O-122 JCM 10157 (T)' : 0.0028 ) : 0.00045 , ((' Streptococcus mitis NCTC 12261 (T)' : 0.00092 , ' Streptococcus mitis ATCC 49456 (T)' : 0.00077 ) : 0.00067 , (' Streptococcus pneumoniae NCTC 7465 (T)' : 0.00082 , (' Streptococcus pneumoniae ATCC 33400 (T)' : 0.00098 , (' Streptococcus pneumoniae ATCC 6303' : 0 , ' Streptococcus pneumoniae' : 0 ) : 0.00177 ) : 0 ) : 0.00159 ) : 0.00046 ) : 0.00065 ) : 0.00019 ) : 0.01173 ) : 0.00939 )'STC.PNEUMONIAE' : 0.00132 ) : 0.0051 , ' Streptococcus sanguinis NCTC 7863' : 0.00056 )'STREPTOCOCCI' : 0.03959 , (' str. SBR2004' : 0.3665 , (((((((((((((((((' unnamed organism' : 0 , ' unnamed organism' : 0.00046 ) : 0.00292 , ' unnamed organism' : 0.00318 ) : 0.00057 , ' unnamed organism' : 0.00091 ) : 0.00544 , (' unnamed organism' : 0.00085 , ' str. ASHY' : 0.00119 ) : 0.01036 ) : 0.00428 , (' str. FD' : 0 , (' str. ULW' : 0.00035 , (' unnamed organism' : 0 , (' str. EY' : 6e-05 , ' unnamed organism' : 0.00098 ) : 0.01206 ) : 0.00152 ) : 0.0019 ) : 0.01063 ) : 0.0037 , ' unnamed organism' : 0.02175 ) : 0.00328 , ((' unnamed organism' : 0.00425 , ' unnamed organism' : 0 ) : 0.00205 , (' unnamed organism' : 0.00671 , (' unnamed organism' : 0.00071 , (' unnamed organism' : 0 , ' unnamed organism' : 0 ) : 0.01134 ) : 0.00839 ) : 0.03006 ) : 0.0165 ) : 0.00569 , (' str. SCWL' : 0.00827 , (' str. rice yellow dwarf' : 0.00675 , (' unnamed organism' : 0.01745 , ' Mycoplasma sp. str. BVK' : 0.00336 ) : 0.00184 ) : 0.00333 ) : 0.00942 ) : 0.00532 , ((((' unnamed organism' : 0.00304 , ' Mycoplasma sp. str. SUNHP' : 0.00439 ) : 0 , ' unnamed organism' : 0 ) : 0.00405 , (' unnamed organism' : 0.00214 , ' unnamed organism' : 0.00129 ) : 0.00387 ) : 0.01257 , (' unnamed organism' : 0 , (((' Mycoplasma sp. str. VAC' : 0.00133 , ' str. tsuwabuki witches' broom' : 0.00884 ) : 0.0039 , ' unnamed organism' : 0.00124 ) : 0.00105 , (' unnamed organism' : 0 , (' unnamed organism' : 0 , (' unnamed organism' : 0.00041 , ' unnamed organism' : 0.00044 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00122 ) : 0.0016 ) : 0.05751 ) : 0.00858 )'MLO_I' : 0.01614 , (' Mycoplasma sp. str. BAWB' : 0.0056 , (' Phytoplasma sp.' : 0.00263 , (((' unnamed organism' : 0.00127 , ' str. ACLR' : 0.00085 ) : 0.00035 , ' str. PPER' : 0.00042 ) : 0.0015 , ((' Mycoplasma sp. str. PD' : 0 , ' Mycoplasma sp.' : 0 ) : 0.00409 , (' str. Italian' : 0 , (' str. Apple proliferation' : 0 , ' str. AT' : 0.00196 ) : 0 ) : 0.00628 ) : 0.00332 ) : 0.01189 ) : 0.01434 )'MLO_II' : 0.01977 ) : 0.00975 , (' unnamed organism' : 0.00149 , (' str. ACLR' : 0.00077 , (((' str. AAY' : 0 , ' str. SAY' : 0.00544 ) : 0.00073 , ' unnamed organism' : 0.00044 ) : 0.00074 , (' unnamed organism' : 0.00207 , (' unnamed organism' : 0 , ((' str. onion yellows; tomato yellows, mulberry dwarf; Paulownia witches' broom' : 0 , ' unnamed organism' : 0.00091 ) : 0 , (' unnamed organism' : 0.00319 , ((' Phytoplasma sp. [gene=rrnB operon]' : 0.00086 , ' Phytoplasma sp. [gene=rrnA operon]' : 0.00025 ) : 0.00452 , (' Mycoplasma sp. str. STOL' : 0.0003 , ' str. VK' : 0 ) : 0.00533 ) : 0.01398 ) : 0.00034 ) : 0.00135 ) : 0 ) : 0.00829 ) : 0.0036 ) : 0.00356 )'MLO_III' : 0.02901 ) : 0.02466 , ' Acholeplasma sp. str. J-233' : 0.03122 ) : 0.0082 , ((' Acholeplasma oculi ISM 1499' : 0.02145 , ' Acholeplasma oculi str. 19L ATCC 27350 (T)' : 0.0164 ) : 0.01854 , (' Acholeplasma laidlawii str. JA1' : 0.00436 , ' Acholeplasma laidlawii str. PG8 ATCC 23206 (T)' : 0.00126 ) : 0.01631 )'ACP.LAIDLAWII' : 0.04424 ) : 0.00832 , (' Mycoplasma feliminutum ATCC 25749 (T)' : 0.01551 , (' Acholeplasma axanthum str. S-743' : 0.0669 , ' Acholeplasma modicum str. PG 49 ATCC 29102 (T)' : 0.01379 ) : 0.02927 )'ACP.MODICUM' : 0.00941 ) : 0.02126 , (' Anaeroplasma abactoclasticum str. 6-1 ATCC 27879 (T)' : 0.0214 , (' Anaeroplasma intermedium str. 5LA' : 0.00582 , (' Anaeroplasma bactoclasticum str. JR ATCC 27112 (T)' : 0.00345 , ' Anaeroplasma varium str. A-2 ATCC 43167 (T)' : 0.00499 ) : 0.00823 ) : 0.02555 )'ANP.VARIUM' : 0.04767 ) : 0.0164 , (((((' Clostridium spiroforme ATCC 29900 (T)' : 0.00148 , ' Clostridium spiroforme DSM 1552 (T)' : 0.00034 ) : 0.01836 , (' Clostridium ramosum str. 113-I ATCC 25582 (T)' : 0.00086 , ' Clostridium ramosum str. 113-I ATCC 25582 (T)' : 0.00088 ) : 0.01024 ) : 0.0224 , (' Lactobacillus catenaformis str. 1871 ATCC 25536 (T)' : 0.07736 , ' Lactobacillus vitulinus str. 185 ATCC 27783 (T)' : 0.01848 ) : 0.07498 ) : 0.21421 , ' Asteroleplasma anaerobium str. 161 ATCC 27880 (T)' : 0.04877 )'C.RAMOSUM' : 0.01352 , (((((' Eubacterium cylindroides ATCC 27528' : 0.02612 , ' Clostridium innocuum str. B-3 ATCC 14501 (T)' : 0.01055 ) : 0.02026 , ' Eubacterium tortuosum ATCC 25548 (T)' : 0.00758 ) : 0.02241 , ' Eubacterium dolichum ATCC 29143 (T)' : 0.00617 ) : 0.02542 , (' Eubacterium biforme ATCC 27806 (T)' : 0.03617 , (' Eubacterium cylindroides ATCC 27803 (T)' : 0.01796 , ' Streptococcus pleomorphus str. EFB 61/60B ATCC 29734 (T)' : 0.02254 ) : 0.01036 ) : 0.01466 ) : 0.01452 , (' Holdemania filiformis str. J1-31B-1 ATCC 51649 (T)' : 0.00556 , ((' Eubacterium sp. str. W 1365' : 0 , ' Eubacterium sp. str. W 1365' : 0 ) : 0.0376 , ((' Erysipelothrix tonsillarum str. T-305 ATCC 43339 (T)' : 0.00221 , ' Erysipelothrix rhusiopathiae str. alpha-P15 ATCC 19414 (T)' : 0.01104 ) : 0.00025 , (' Erysipelothrix sp. str. Vadkasca' : 0.00178 , (' Erysipelothrix tonsillarum CCUG 31352 (T)' : 0 , ' Erysipelothrix rhusiopathiae str. alpha-P15 ATCC 19414 (T)' : 0.00304 ) : 0 ) : 0.00357 ) : 0.10055 ) : 0.041 ) : 0.05576 )'EUB.CYLINDROIDES' : 0.02471 ) : 0.04649 )'ACHOLEPLASMA-ANAEROPLASMA' : 0.00736 , (((((((((((((((((' Mycoplasma capricolum subsp. capricolum str. E570/iii [gene=rrnB]' : 0 , ' Mycoplasma capricolum subsp. capricolum str. California kid [gene=rrnB]' : 0 ) : 0 , ' Mycoplasma capricolum ATCC 27343 (T) [gene=rrnB]' : 0.00158 ) : 0.00022 , (' Mycoplasma sp. str. F38 [gene=rrnA operon]' : 0 , (' Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae str. 4/2LC [gene=rrnA]' : 0.00068 , ' Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae str. F38 [gene=rrnA]' : 0 ) : 0 ) : 0.00175 ) : 0 , (' Mycoplasma capricolum subsp. capricolum str. E570/iii [gene=rrnA]' : 0 , ' Mycoplasma capricolum subsp. capricolum str. California kid [gene=rrnA]' : 0 ) : 0.00021 ) : 0 , (' Mycoplasma capricolum subsp. capricolum str. G5 [gene=rrnA]' : 0.0031 , (' Mycoplasma sp. str. F38 [gene=rrnB operon]' : 0 , ' Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae str. 4/2LC [gene=rrnB]' : 0 ) : 0.00033 ) : 0 ) : 0 , (' Mycoplasma sp. str. PG50 [gene=rrnB]' : 0.00032 , (' Mycoplasma sp. str. PG50 [gene=rrnA]' : 0.00066 , ' Mycoplasma sp. str. PG50 [gene=rrnA]' : 0 ) : 0.00032 ) : 0 ) : 0 , ' Mycoplasma capricolum subsp. capricolum str. G5 [gene=rrnB]' : 0.00065 ) : 0.00029 , ' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. PG1 [gene=rrnB]' : 0.00065 ) : 0.00028 , (' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. PG1 [gene=rrnA]' : 5e-05 , (' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. PG1 (SC type)' : 0.00056 , (' Mycoplasma mycoides subsp. capri str. PG3' : 0.00067 , (' Mycoplasma mycoides subsp. capri str. PG3 [gene=rrnB]' : 0 , (' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. UM30847 [gene=rrnB]' : 0 , ((' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. Y-goat [gene=rrnA]' : 0.00032 , ' Mycoplasma mycoides subsp. capri str. PG3 [gene=rrnA]' : 0 ) : 0 , (' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. UM30847 ATCC 33557' : 0 , (' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. Y-goat [gene=rrnB]' : 0 , ' Mycoplasma mycoides subsp. mycoides str. UM30847 [gene=rrnA]' : 0 ) : 0.00042 ) : 0.00021 ) : 0 ) : 0.00032 ) : 0 ) : 0 ) : 0.0001 ) : 0.0003 )'M.MYCOIDES' : 0.00518 , ((' Mycoplasma putrefaciens str. KS-1 [gene=rrnA + rrnB]' : 0.00034 , ' Mycoplasma putrefaciens str. C30 KS-1 ATCC 15718 (T)' : 0 ) : 0.00265 , (' Mycoplasma cottewii str. VIS ATCC 51347 (T)' : 0 , ' Mycoplasma yeatsii str. GIH ATCC 51346 (T)' : 0.00085 ) : 0.00283 )'M.PUTREFACIENS' : 0.00488 ) : 0.009 , ' Mesoplasma seiffertii' : 0.00935 ) : 0.00423 , (' Entomoplasma ellychniae str. ELCN-1 ATCC 43707 (T)' : 0.00527 , (' Mesoplasma entomophilum str. TAC ATCC 43706 (T)' : 0.00357 , ' Entomoplasma melaleucae str. M1 ATCC 49191 (T)' : 0.00165 ) : 0.00885 )'ENP.MELALEUCAE' : 0.00697 ) : 0.00742 , ' Mesoplasma lactucae str. 831-C4 ATCC 49193 (T)' : 0.03615 ) : 0.01838 , ((' Spiroplasma apis str. B-31 ATCC 33834 (T)' : 0.00684 , ' Spiroplasma clarkii str. CN-5 ATCC 33827 (T)' : 0.00938 ) : 0.00111 , (' Spiroplasma gladiatoris str. TG-1 ATCC 43525 (T)' : 0.00106 , (' Spiroplasma taiwanense str. CT-1 ATCC 43302 (T)' : 0.00213 , (' Spiroplasma diabroticae str. DU-1 ATCC 43210 (T)' : 0.00196 , ' Spiroplasma monobiae str. MQ-1 ATCC 33825 (T)' : 0.00306 ) : 0.00272 ) : 0.01448 ) : 0.00314 )'SPP.GLADIATORIS' : 0.01892 ) : 0.0214 , (' Spiroplasma mirum str. SMCA ATCC 29335 (T)' : 0.01248 , (' Spiroplasma poulsonii str. DW-1 ATCC 43153 (T)' : 0.00406 , (' Spiroplasma citri str. Maroc-R8-A2 ATCC 27556 (T)' : 0.00231 , ' Spiroplasma citri str. R8A2HP' : 0.00489 ) : 0.00435 ) : 0.0116 )'SPP.CITRI' : 0.03254 ) : 0.0281 , ' Spiroplasma ixodetis str. Y-32 ATCC 33835 (T)' : 0.07067 )'SPIROPLASMA' : 0.00851 , ((((((((((' Ureaplasma urealyticum str. 7 (serovar 1) ATCC 27813' : 0.00033 , ' Ureaplasma urealyticum str. Pi (serovar 6) ATCC 27818' : 0.00034 ) : 0.00102 , ' Ureaplasma urealyticum str. U26 (serovar 14) ATCC 33697' : 0.00033 ) : 0 , ' Ureaplasma urealyticum str. 27' : 0.0004 ) : 0.00056 , (' Ureaplasma urealyticum str. 960 ATCC 27618 (T)' : 0 , (' Ureaplasma urealyticum str. 23 (serovar 2) ATCC 27814' : 0.00103 , ' Ureaplasma urealyticum str. 354 (serovar 5) ATCC 27817' : 0.00039 ) : 0 ) : 0.0035 ) : 0.0048 , (' Ureaplasma diversum str. A417' : 0.00639 , (' Ureaplasma canigenitalium str. D6P-C' : 0.0108 , (' Ureaplasma cati str. F2' : 0.0074 , ' Ureaplasma felinum str. FT2-B' : 0.00375 ) : 0.01314 ) : 0.01353 ) : 0.00986 ) : 0.00319 , ' Ureaplasma gallorale ATCC 43346 (T)' : 0.01997 )'UPL.UREALYTICUM' : 0.01735 , (' Mycoplasma volis str. IL-372' : 0.00422 , (' Mycoplasma penetrans str. GTU-54-6A1' : 0.01195 , (' Mycoplasma muris str. RIII4 ATCC 33757 (T)' : 0.00787 , (' Mycoplasma iowae str. 695 ATCC 33552 (T)' : 0.0003 , (' Mycoplasma iowae str. PPAV' : 0 , ' Mycoplasma iowae' : 0 ) : 0.00116 ) : 0.01481 ) : 0.03369 ) : 0.01564 )'M.IOWAE' : 0.06529 ) : 0.01852 , ((((' Mycoplasma pneumoniae str. FH ATCC 15531 (T)' : 0.00053 , ' Mycoplasma pneumoniae str. M129' : 0 ) : 0 , ' Mycoplasma pneumoniae str. FH ATCC 15531 (T)' : 0 ) : 0.00479 , (' Mycoplasma genitalium str. G37 [gene=rrnA gene]' : 0 , (' Mycoplasma genitalium str. G37' : 0 , ' Mycoplasma genitalium str. G37 (J.G. Tully) ATCC 33530 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00952 )'M.GENITALIUM' : 0.00654 , (((' Mycoplasma pirum str. HRC/70-159 ATCC 25960 (T)' : 0.00464 , ' Mycoplasma alvi str. Isley (T)' : 0.00691 ) : 0.00465 , ' Mycoplasma testudinis str. 010 ATCC 43263 (T)' : 0.02431 ) : 0.00519 , (' Mycoplasma imitans str. 4229' : 0 , (' Mycoplasma gallisepticum str. A5969' : 0 , (' Mycoplasma gallisepticum str. S6 [gene=rrn16 operon]' : 0 , ' Mycoplasma gallisepticum str. S6; A5969 [gene=rrnA operon]' : 0.00176 ) : 0 ) : 0.00027 ) : 0.02378 )'M.GALLISEPTICUM' : 0.04822 ) : 0.03097 ) : 0.02558 , (' Haemobartonella felis str. California' : 0.05489 , (' Haemobartonella felis' : 0.07672 , (' Haemobartonella felis str. Florida-Ohio' : 0 , ' Haemobartonella muris str. Shizuoka' : 0 ) : 0.10595 ) : 0.23621 )'HBN.FELIS' : 0.24128 )'M.PNEUMONIAE' : 0.06205 , (' Mycoplasma mobile str. 163K ATCC 43663 (T)' : 0.00912 , ((((((((((' Mycoplasma flocculare str. Ms42' : 0 , ' Mycoplasma flocculare str. Ms42 ATCC 27399 (T)' : 0 ) : 0 , ' Mycoplasma flocculare str. Ms42 (T)' : 0 ) : 0 , ' Mycoplasma flocculare str. Ms42' : 0 ) : 0.01079 , (' Mycoplasma ovipneumoniae str. Y98' : 0 , ' Mycoplasma ovipneumoniae str. Y-98 (T)' : 0 ) : 0.01113 ) : 0.00271 , (' Mycoplasma hyopneumoniae str. J' : 0 , (' Mycoplasma hyopneumoniae' : 0 , ' Mycoplasma hyopneumoniae str. Weybridge ATCC 27719' : 0.00134 ) : 0 ) : 0.01353 ) : 0.00499 , (' Mycoplasma conjunctivae str. HRC/583 (T)' : 0.00965 , ' Mycoplasma bovoculi str. M165/69 (T)' : 0.01874 ) : 0.02532 ) : 0.01161 , ' Mycoplasma hyorhinis str. PG42 ATCC 17981 (T)' : 0.03103 ) : 0.02122 , (' Mycoplasma collis str. MO36' : 0.01066 , ' Mycoplasma neurolyticum str. Sabin type A ATCC 19988 (T)' : 0.01575 ) : 0.04472 ) : 0.01195 , (' Mycoplasma sualvi str. Mayfield B' : 0 , ' Mycoplasma sualvi str. Mayfield B ATCC 33004 (T)' : 0 ) : 0.04098 )'M.HYOPNEUMONIAE' : 0.00769 , ((((((((' Mycoplasma arginini ATCC 25528' : 0.0016 , ' Mycoplasma arginini str. G230 ATCC 23838 (T)' : 0.00053 ) : 0.00182 , ' Mycoplasma gateae ATCC 23392 (T)' : 0.00112 ) : 0.00101 , (' Mycoplasma canadense str. 275C' : 0 , ' Mycoplasma canadense str. 275c (T)' : 0 ) : 0.00268 ) : 0.00098 , (' Mycoplasma auris str. UIA ATCC 51348 (T)' : 0.00228 , ' Mycoplasma alkalescens str. PG51 (T)' : 0.00312 ) : 0.00205 ) : 0.00582 , ' Mycoplasma arthritidis str. PG6 ATCC 19611 (T)' : 0.01116 ) : 0.00273 , (' Mycoplasma salivarium str. PG20 ATCC 23064 (T)' : 0.00281 , (' Mycoplasma orale str. CH19299 ATCC 23714 (T)' : 0.00714 , (' Mycoplasma hyosynoviae str. S16' : 0.00106 , ' Mycoplasma hyosynoviae' : 0 ) : 0.01446 ) : 0.00964 ) : 0.00435 ) : 0.00954 , (' Mycoplasma hominis str. PG21 ATCC 23114 (T)' : 0.00102 , ' Mycoplasma hominis str. 183' : 0.00118 ) : 0.01324 )'M.HOMINIS' : 0.01 , (((' Mycoplasma sp. str. H3110' : 0.03957 , ' Mycoplasma agassizii str. PS6' : 0.02106 ) : 0.03048 , ' Mycoplasma pulmonis str. PG34 ATCC 19612 (T)' : 0.03252 )'M.AGASSIZII' : 0.01956 , ((((((' Mycoplasma bovirhinis str. PG43 (T)' : 0 , ' Mycoplasma bovirhinis str. PG43' : 0.0009 ) : 0.00235 , (' Mycoplasma sp. str. M209/78' : 0.00465 , ' Mycoplasma canis str. PG14' : 0.0156 ) : 0.00247 ) : 0.00614 , (' Mycoplasma leonicaptivi ATCC 49890 (T)' : 0.02451 , ' Mycoplasma felis ATCC 23391 (T)' : 0.01215 ) : 0.01169 ) : 0.0037 , (' Mycoplasma corogypsi str. BV1 ATCC 51148 (T)' : 0.00182 , (' Mycoplasma sturni str. UCMF; p170/171 ATCC 51945 (T)' : 0.00443 , (' Mycoplasma gallinaceum str. DD' : 0.01004 , ' Mycoplasma pullorum str. CKK' : 0.02033 ) : 0.03072 ) : 0.02256 ) : 0.00652 ) : 0.00652 , (' Mycoplasma synoviae str. WVU 1853' : 0.00546 , (' Mycoplasma synoviae str. WVU 1853' : 0 , ' Mycoplasma synoviae str. WVU 1853' : 0 ) : 0 ) : 0.02798 )'M.BOVIRHINIS' : 0.01006 , (((' Mycoplasma hyopharyngis str. H3-6B F (T)' : 0.00419 , ' Mycoplasma hyopharyngis str. 538N' : 0 ) : 0.00755 , ' Mycoplasma lipophilum str. MaBy ATCC 27104 (T)' : 0.01127 )'M.HYOPHARYNGIS' : 0.01375 , (((((' Mycoplasma californicum str. ST-6 ATCC 33461 (T)' : 0.01763 , ' Mycoplasma simbae ATCC 49888 (T)' : 0.00396 ) : 0.00546 , ' Mycoplasma bovigenitalium str. PG11 ATCC 19852 (T)' : 0.00478 ) : 0.01238 , ' Mycoplasma fermentans str. PG18 ATCC 19989 (T)' : 0.01927 ) : 0.00739 , (' Mycoplasma gallinarum str. PG16' : 0.01514 , (' Mycoplasma meleagridis str. 17529' : 0.00158 , ' Mycoplasma meleagridis str. 17529' : 0 ) : 0.01686 ) : 0.00904 )'M.MELEAGRIDIS' : 0.00394 , (((' Mycoplasma felifaucium ATCC 43428 (T)' : 0.00598 , ' Mycoplasma adleri str. G145 ATCC 27948 (T)' : 0.00518 ) : 0.00796 , ' Mycoplasma leopharyngis ATCC 49889 (T)' : 0.01419 ) : 0.00743 , ((' Mycoplasma agalactiae str. PG2 (T)' : 0.00044 , ' Mycoplasma agalactiae str. PG2 NCTC 10123 (T)' : 0 ) : 0.00075 , (' Mycoplasma bovis str. Donetta (T)' : 0.00025 , ' Mycoplasma bovis str. Donetta (T)' : 0.00066 ) : 0.00135 ) : 0.00878 )'M.AGALACTIAE' : 0.00504 ) : 0.01692 ) : 0.01028 ) : 0.02301 ) : 0.04031 ) : 0.00864 ) : 0.04364 )'M.HOMINIS' : 0.11779 ) : 0.02031 ) : 0.27993 ) : 0.02226 )'MYCOPLASMA' : 0.02847 ) : 0.0306 ) : 0.01074 ) : 0.00778 ) : 0.00779 ) : 0.01639 ) : 0.05305 ) : 0.00998 ) : 0.00686 ) : 0.0075 ) : 0.0067 ) : 0.08605 ) : 0.00632 ) : 0.00946 ) : 0.03002 ) : 0.01932 ) : 0.0796 ) : 0.02693 )'BACILLUS-LACTOBACILLUS-STREPTOCOCCUS' : 0.02341 ) : 0.01024 ) : 0.01738 ) : 0.00511 , ((((((((((' Ruminococcus flavefaciens str. C94 NCFB 2213 (T)' : 0.00012 , ' Ruminococcus flavefaciens str. C94 ATCC 19208 (T)' : 0.00037 ) : 0.00012 , ' Ruminococcus flavefaciens str. C94 ATCC 19208 (T)' : 0.00021 ) : 0.02317 , (' Ruminococcus callidus ATCC 27760 (T)' : 0 , ' Ruminococcus callidus' : 0 ) : 0.02771 ) : 0.01194 , (' Ruminococcus albus str. 7 ATCC 27210 (T)' : 0 , ' Ruminococcus albus' : 0.00058 ) : 0.03702 ) : 0.01037 , (' Eubacterium siraeum ATCC 29066 (T)' : 0.02314 , (' Fusobacterium prausnitzii ATCC 27766' : 0.02677 , (' Anaerofilum pentosovorans str. Fae DSM 7168 (T)' : 0.00308 , ' Anaerofilum agile str. F DSM 4272 (T)' : 0.00069 ) : 0.04665 ) : 0.05475 ) : 0.01329 ) : 0.01235 , (' Clostridium cellulosi str. (T)' : 0.02528 , ((' Ruminococcus bromii' : 0.00078 , ' Ruminococcus bromii ATCC 27255 (T)' : 0.00057 ) : 0.01811 , (' Clostridium leptum ATCC 29065 (T)' : 0.02157 , (' Clostridium sporosphaeroides' : 0.00126 , ' Clostridium sporosphaeroides ATCC 25781 (T)' : 0.00964 ) : 0.02593 ) : 0.03111 ) : 0.05577 ) : 0.02354 ) : 0.01482 , (' Eubacterium desmolans ATCC 43058 (T)' : 0.01241 , (' Sporobacter termitidis str. SYR DSM 10068 (T)' : 0.02009 , (' Clostridium viride str. T2-7 DSM 6836 (T)' : 0.01941 , ' Eubacterium plautii DSM 4000 (T)' : 0.02423 ) : 0.05382 ) : 0.05227 ) : 0.02334 )'C.LEPTUM' : 0.01649 , (((((' Clostridium thermolacticum str. TC 21 DSM 2911' : 0 , ' Clostridium thermolacticum str. TX41' : 0 ) : 0.00063 , ' Clostridium thermolacticum str. TC 21 DSM 2911' : 0.00159 ) : 0.00063 , (' Clostridium stercorarium NCIMB 11754 (T)' : 0.00159 , ' str. Rt51.B1' : 0.00426 ) : 0.00064 ) : 0 , ' Clostridium stercorarium' : 0.00128 )'C.THERMOLACTICUM' : 0.0155 , ((' Clostridium thermocellum DSM 1237 (T)' : 0.00187 , ' Clostridium thermocellum' : 0.00011 ) : 0.01042 , (' clone SMK197' : 0.11614 , (((' Acetivibrio cellulolyticus str. BAS ATCC 35928 (T)' : 0 , ' Acetivibrio cellulolyticus str. CD2 ATCC 33288 (T)' : 0 ) : 0.00692 , ' Clostridium aldrichii DSM 6159 (T)' : 0.00373 ) : 0.01291 , (' Bacteroides cellulosolvens ATCC 35603 (T)' : 0.025 , ((' Clostridium termitidis DSM 5396 (T)' : 0 , ' Clostridium cellobioparum DSM 1351 (T)' : 0.00639 ) : 0.00485 , (' Clostridium papyrosolvens ATCC 35413 (T)' : 0.0028 , (' Clostridium cellulolyticum ATCC 35319 (T)' : 0.00108 , (' clone A18p' : 0.00099 , ' Clostridium josui str. III FERM P-9684 (T)' : 0.20428 ) : 0.00601 ) : 0.01937 ) : 0.00721 ) : 0.02747 ) : 0.01848 ) : 0.00281 ) : 0.01364 )'C.THERMOCELLUM' : 0.05738 ) : 0.01927 ) : 0.02104 , (' str. 16SX-2' : 0.00113 , ' str. 16SX-1' : 0 )'STR.16SX' : 0.09196 )'C.LEPTUM' : 0.01594 , (((((((' Caldicellulosiruptor owensensis str. OL ATCC 700167 (T)' : 0.01136 , ' Caldicellulosiruptor lactoaceticus str. 6A DSM 9545 (T)' : 0.00063 ) : 0.00108 , (' "Anaerocellum thermophilum" str. Z-1203 ?' : 0 , ' "Anaerocellum thermophilum" str. Z-1203 ?' : 0.00017 ) : 0.00998 ) : 0.00308 , (' str. RI2.B1' : 0 , ' str. Wai35 B1' : 0.00072 ) : 0.00781 ) : 0.00668 , (' Caldicellulosiruptor saccharolyticus str. Tp8T.6.3.3.1 ATCC 43494 (T)' : 0.00271 , (' str. SP83' : 0.01035 , ' str. COMP.B1' : 0.00742 ) : 0.00053 ) : 0.00963 ) : 0.00652 , (' Thermoanaerobacter "cellulolyticus" str. NA 10 IFO 14436' : 0 , ' Thermoanaerobacter "cellulolyticus" str. NA 10 IFO 14436' : 0.00017 ) : 0.00948 ) : 0.00431 , (' str. Rt8.B7' : 0 , (' str. Ok9.B1' : 0.00222 , (' str. Rt8B.4' : 0.00342 , ' str. Rt8. B15' : 0.00037 ) : 0.00037 ) : 0.00024 ) : 0.01272 )'CCS.OWENSENSIS' : 0.01038 , (' Oxobacter pfennigii DSM 3222 (T)' : 0.00849 , (((' Thermobrachium celer str. JW/YL-NZ35 (T)' : 0.00247 , ' Caloramator indicus str. IndiB4 ACM 3982 (T)' : 0 ) : 0.01906 , ' Caloramator fervidus str. RT4. B1 ATCC 43204 (T)' : 0.02084 )'CLR.FERVIDUS' : 0.02574 , (((' Clostridium proteolyticum ATCC 49002 (T)' : 0.01699 , ' Clostridium histolyticum ATCC 19401 (T)' : 0.01267 ) : 0.00136 , ' Clostridium limosum ATCC 25620 (T)' : 0.00329 )'C.HISTOLYTICUM' : 0.0074 , ((((((' Clostridium thermobutyricum str. Wiegel (T)' : 0.00994 , ' Clostridium thermobutyricum' : 0 ) : 0.00648 , (' Clostridium thermopalmarium DSM 5974 (T)' : 0.01125 , ' Clostridium thermopalmarium DSM 5974 (T)' : 0 ) : 0.00449 ) : 0.01095 , (' Clostridium homopropionicum DSM 5847 (T)' : 0.00353 , ' Ilyobacter delafieldii str. 10cr1 DSM 5704 (T)' : 0.00648 ) : 0.01418 ) : 0.0058 , ((' Clostridium novyi str. 151 (L.S. McClung) ATCC 17861 (T)' : 0 , ' Clostridium novyi str. type A NCTC 538' : 0 ) : 0.00364 , (' Clostridium botulinum str. 468 toxin type C' : 0.00047 , (' Clostridium botulinum str. 2220 ATCC 17782' : 0.00022 , (' Clostridium botulinum str. 2023 ATCC 17851' : 0.00039 , ' Clostridium botulinum str. D 6f NCTC 8265' : 0.00082 ) : 0 ) : 0.00427 ) : 0.00234 ) : 0.01269 ) : 0.00773 , ' Clostridium grantii str. A-1' : 0.03506 )'C.THERMOBUTYRICUM' : 0.0071 , (((((((((((((' Clostridium botulinum str. A2 VPI 14856' : 0.00024 , ' Clostridium botulinum ATCC 25763 (T)' : 0 ) : 0.00025 , ' Clostridium botulinum str. NCA 213 B ATCC 7949' : 0.00048 ) : 0 , ' Clostridium botulinum str. 8G ATCC 25764' : 0 ) : 0 , (' Clostridium botulinum str. Langeland NCTC 10281' : 0.00303 , (' Clostridium botulinum NCTC 7272' : 0 , ' Clostridium botulinum str. KYTO-F' : 0.0003 ) : 0.00471 ) : 0 ) : 0.00041 , ' Clostridium botulinum NCTC 7273' : 0.00024 ) : 0 , (' Clostridium sporogenes str. 388 ATCC 3584 (T)' : 0 , ((' Clostridium putrificum str. 2318 ATCC 25784 (T)' : 0.00288 , ' Clostridium sporogenes str. 388 ATCC 3584 (T)' : 0 ) : 0 , (' Clostridium botulinum str. B3 VPI 15021' : 0.00048 , (' Clostridium botulinum str. BP2 VPI 14844' : 0.00286 , ' Clostridium novyi str. 151 (L.S. McClung) ATCC 17861 (T)' : 0.0006 ) : 0.00066 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00084 ) : 0.01158 , ' Clostridium oceanicum ATCC 25647 (T)' : 0.01275 ) : 0.02153 , (' Clostridium pasteurianum ATCC 6013 (T)' : 0.02714 , (' Clostridium magnum DSM 2767 (T)' : 0.02224 , ((' Clostridium tyrobutyricum NIZO 51' : 0 , ' Clostridium tyrobutyricum ATCC 25755 (T)' : 0.00033 ) : 0.00666 , (' Clostridium kluyveri' : 0.0129 , (' Clostridium ljungdahlii str. ERI-2' : 0.00035 , ' Clostridium ljungdahlii str. PETC ATCC 49587 (T)' : 0.00116 ) : 0.04304 ) : 0.01243 ) : 0.02167 ) : 0.00428 ) : 0.00464 )'C.BOTULINUM' : 0.00733 , ' Clostridium scatologenes ATCC 25775 (T)' : 0.01879 ) : 0.00465 , (((' Clostridium tetanomorphum str. H1 NCIMB 11547' : 0 , ' Clostridium tetanomorphum str. H1 NCIMB 11547' : 0 ) : 0.00307 , ' Clostridium tetanomorphum DSM 528' : 0.00038 ) : 0.00193 , ((' Clostridium pascui str. cm19 DSM 10365 (T)' : 0.00042 , ' Clostridium sp.' : 0.00279 ) : 0.01163 , (' Clostridium malenominatum ATCC 25776 (T)' : 0.00571 , (' Clostridium acetireducens str. 30A DSM 7310 (T)' : 0.01154 , (' Clostridium tetani NCTC 279 (T)' : 0.0101 , ' Clostridium cochlearium ATCC 17787 (T)' : 0.00339 ) : 0.0251 ) : 0.02373 ) : 0.01628 ) : 0.01092 )'C.COCHLEARIUM' : 0.00771 ) : 0.00368 , (' Clostridium subterminale ATCC 25774 (T)' : 0.01844 , ((' Clostridium estertheticum NCIMB 12511 (T)' : 0 , ' Clostridium estertheticum NCIMB 12511 (T)' : 0 ) : 0.01532 , (' Clostridium argentinense ATCC 27322 (T)' : 0.00041 , (' Clostridium argentinense str. 113/30 toxin type G' : 0.00081 , (' Clostridium argentinense ATCC 27322 (T)' : 0.00064 , (' Clostridium subterminale NCIMB 10746' : 0.00048 , (' Clostridium sp. DSM 1975' : 0.00087 , ' Clostridium subterminale ATCC 25774 (T)' : 5e-05 ) : 0.00368 ) : 0 ) : 0.00055 ) : 0.00041 ) : 0.02756 ) : 0.00461 )'C.SUBTERMINALE' : 0.00741 ) : 0.00726 , (' Clostridium collagenovorans DSM 3089 (T)' : 0.0069 , (' Clostridium sardiniensis ATCC 33455 (T)' : 0.01492 , (' Clostridium acetobutylicum ATCC 824 (T)' : 0 , ((' Clostridium acetobutylicum ATCC 824 (T)' : 0 , ' Clostridium acetobutylicum DSM 792 (T)' : 0 ) : 0.00062 , (' Clostridium acetobutylicum DSM 1731' : 0.00545 , ' Clostridium acetobutylicum NCDO 1712' : 0.00098 ) : 0.0009 ) : 0.00013 ) : 0.01987 ) : 0.03023 )'C.ACETOBUTYLICUM' : 0.01397 ) : 0.00567 , (((((' unnamed organism' : 0.00041 , ' unnamed organism' : 0 ) : 0.00503 , ' unnamed organism' : 0.00172 ) : 0.00625 , ' unnamed organism' : 0.00817 ) : 0.02621 , ' Clostridium cadaveris ATCC 25783 (T)' : 0.12464 )'C.CADAVERIS' : 0.00452 , (((' Clostridium intestinalis DSM 6191 (T)' : 0.02529 , ' Clostridium fallax ATCC 19400 (T)' : 0.01667 ) : 0.00285 , ' Clostridium algidicarnis NCFB 2931 (T)' : 0.0388 )'C.ALGIDICARNIS' : 0.00171 , (((((' Sarcina ventriculi str. VPI-s-7-31 GIFU 7886' : 0.01473 , ' Sarcina ventriculi DSM 286' : 0.0029 ) : 0.00168 , ' Sarcina maxima str. K66 DSM 316 (T)' : 0.00284 ) : 0.01331 , ' Eubacterium tarantellus ATCC 29255 (T)' : 0.00746 ) : 0.02541 , (' Clostridium perfringens str. CPN50 [gene=rrnB operon H3 fragment]' : 0.00034 , ' Clostridium perfringens ATCC 13124 (T)' : 0.00068 ) : 0.00759 )'C.PERFRINGENS' : 0.0064 , (((((((((' Eubacterium nitritogenes DSM 3985 (T)' : 0 , ' Eubacterium budayi ATCC 25541 (T)' : 0.00626 ) : 0.00027 , ' Clostridium barati str. 2227 ATCC 27638 (T)' : 0.00042 ) : 1e-05 , ' Clostridium barati ATCC 43756' : 0.00053 ) : 0.00571 , ' Clostridium absonum DSM 599 (T)' : 0.00297 ) : 0.00257 , (' Eubacterium multiforme DSM 20694 (T)' : 0.0006 , ' Eubacterium moniliforme ATCC 25546 (T)' : 0.00213 ) : 0.00337 ) : 0.00893 , ((' Clostridium celatum DSM 1785 (T)' : 0.01061 , ' Clostridium quinii DSM 6736 (T)' : 0.01275 ) : 0.00448 , (' Clostridium carnis ATCC 25777 (T)' : 0.00083 , (' Clostridium septicum ATCC 12464 (T)' : 0.0025 , ' Clostridium chauvoei ATCC 10092 (T)' : 0.0023 ) : 0.00803 ) : 0.01042 ) : 0.01384 ) : 0.00387 , ((' Clostridium paraputrificum ATCC 25780 (T)' : 0.0011 , ' Clostridium paraputrificum ATCC 25780 (T)' : 0.00783 ) : 0.00207 , (' Clostridium barati VPI 1586' : 0.03424 , (' Clostridium cellulovorans DSM 3052 (T)' : 0.00515 , ' Clostridium cellulovorans DSM 3052 (T)' : 0.00044 ) : 8e-05 ) : 0.00486 ) : 0.00687 ) : 0.00392 , ((' Clostridium chartatabidum DSM 5482 (T)' : 0 , ' Clostridium longisporum DSM 8431' : 0.00026 ) : 0.00672 , (' Clostridium aurantibutyricum str. 2038 NCIMB 10659 (T)' : 0.00146 , ' Clostridium aurantibutyricum str. 2038 NCIMB 10659 (T)' : 0.02517 ) : 0.00805 ) : 0.0077 )'C.AURANTIBUTYRICUM' : 0.00409 , (((((' Clostridium botulinum str. 36208 ATCC 9564' : 0.00049 , ' Clostridium botulinum str. Iwanai' : 0.00015 ) : 0 , ' Clostridium botulinum str. Eklund 202F ATCC 23387' : 0.00015 ) : 0 , ' Clostridium botulinum str. Eklund 17B ATCC 25765' : 0.00092 ) : 0.00165 , ' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A34o' : 2.71576 ) : 0.00099 , (((' Clostridium favososporum str. BKM B-1360 DSM 5907' : 0 , ' Clostridium corinoforum DSM 5906' : 0.00357 ) : 0.00145 , (' Clostridium puniceum DSM 2619 (T)' : 0.00041 , ' Clostridium puniceum DSM 2619 (T)' : 0.004 ) : 0.00117 ) : 0.0036 , (((((' Clostridium butyricum str. MMP3 DSM 2478' : 0 , ' Clostridium butyricum str. E.VI.3.6.1 NCIMB 8082' : 0 ) : 0.00049 , ' Clostridium kainantoi DSM 523' : 0 ) : 0 , ' Clostridium butyricum str. Rowett ATCC 19398 (T)' : 0.00277 ) : 0.00035 , ' Clostridium butyricum ATCC 43755' : 0.00034 ) : 0.00116 , ((' Clostridium saccharoperbutylacetonicum str. N1-4 ATCC 13564' : 0 , ' Clostridium saccharoperbutylacetonicum str. N1-504 ATCC 27022' : 0 ) : 0 , ((' Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 (T)' : 0 , ' Clostridium beijerinckii NCIMB 9362 (T)' : 0.00054 ) : 0.0001 , (((' Clostridium acetobutylicum NCP 262' : 0.00256 , ' Clostridium acetobutylicum NCP 262' : 0.00052 ) : 0.00353 , ' Clostridium caliptrosporum DSM 5905' : 0.00907 ) : 0 , (' Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 (T)' : 0 , (' Clostridium beijerinckii DSM 791 (T)' : 0 , ((' Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 (T)' : 0 , ' Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 (T)' : 0.00027 ) : 0 , (' Clostridium acetobutylicum ATCC 39058' : 0 , (' Clostridium acetobutylicum str. NCP 193' : 0 , (' Clostridium acetobutylicum NCIMB 8653' : 0 , (' Clostridium beijerinckii NRRL B-592' : 0 , ' Clostridium beijerinckii NRRL B-593' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00359 ) : 0.00069 ) : 0.00282 ) : 0.00862 ) : 0.00383 ) : 0.01514 )'C.BUTYRICUM' : 0.00412 ) : 0.01096 ) : 0.00522 ) : 0.02659 )'C.BARATI' : 0.0084 ) : 0.02796 ) : 0.02615 ) : 0.10474 ) : 0.07389 ) : 0.13089 )'C.BOTULINUM' : 0.0166 )'CLOSTRIDIUM' : 0.02432 )'GRAM_POSITIVES/FUSOBACTERIA' : 0.01262 , ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((' clone 37a' : 0 , ' clone 34a' : 0 ) : 0.0027 , ' clone 3911' : 0.00477 ) : 0.01594 , ' Cytophaga marinoflava ATCC 19326 (T)' : 0.01977 ) : 0.00365 , ' clone 33a' : 0.0377 ) : 0.00505 , (' Psychroserpens burtonensis ACAM 188 (T)' : 0.00634 , ' marine snow associated clone agg13' : 0.01731 ) : 0.01097 ) : 0.00375 , (' clone 26a' : 0.00884 , ((' clone 8511' : 0 , ' clone 811' : 0 ) : 0.00431 , (' clone 42a' : 0 , (' clone 19a' : 0.00165 , ' clone 12a' : 0.00292 ) : 0.00252 ) : 0.01224 ) : 0.01855 ) : 0.01667 )'PSH.BURTONENSIS' : 0.00774 , ((' Cytophaga latercula str. Lewin SIO-1 ATCC 23177 (T)' : 0.0045 , ' Cytophaga latercula str. Lewin SIO-1 ATCC 23177 (T)' : 0 ) : 0.00325 , (((' Psychroflexus gondwanensis DSM 5423 (T)' : 0.0031 , ' Psychroflexus torquis str. 651 ACAM 623 (T)' : 0.00957 ) : 0.01435 , (' clone 1411' : 0.03609 , ' clone 3711' : 0 ) : 0.04735 ) : 0.01651 , (' clone 54a' : 0.00603 , (' Flavobacterium salegens DSM 5424 (T)' : 0.01609 , (' clone 35a' : 0.01488 , ' clone 1111' : 0.00997 ) : 0.02869 ) : 0.02902 ) : 0.01785 ) : 0.03617 )'PSF.TORQUIS' : 0.00809 ) : 0.00477 , (' str. E-38' : 0.00495 , (((' Cytophaga lytica str. LIM-21 ATCC 23178 (T)' : 0.01041 , ' Cytophaga marinoflava NCIMB 397 (T)' : 0.00297 ) : 0.00212 , ' Cytophaga lytica str. LIM-21 ATCC 23178 (T)' : 0 ) : 0.02674 , (' str. E-45' : 0.00717 , (' Cytophaga uliginosa str. Zobell 553 ATCC 14397 (T)' : 0.00246 , ' Cytophaga uliginosa NCIMB 1863 (T)' : 0 ) : 0.06366 ) : 0.03875 ) : 0.00795 )'CY.ULIGINOSA' : 0.00141 ) : 0.07807 , (' Coenonia anatina LMG 14382 (T)' : 0.03874 , (((' Capnocytophaga cynodegmi ATCC 49044 (T)' : 0 , ' Capnocytophaga cynodegmi ATCC 49044 (T)' : 0.00099 ) : 0.00279 , (' Capnocytophaga canimorsus str. CalHlthDept 2340-2-61 ATCC 35979 (T)' : 0 , ' Capnocytophaga canimorsus str. CalHlthDept 2340-2-61 ATCC 35979 (T)' : 0.00125 ) : 0.00394 ) : 0.0052 , ((' Capnocytophaga haemolytica LMG 16021 (T)' : 0.00011 , ' Capnocytophaga haemolytica ATCC 51501 (T)' : 0.00427 ) : 0.00688 , ((' clone 4711' : 0.11484 , ' clone 311' : 0.18507 ) : 0.04162 , (((((((' Capnocytophaga granulosa LMG 16022 (T)' : 0 , ' Capnocytophaga granulosa ATCC 51502 (T)' : 0.0008 ) : 0.00035 , ' Capnocytophaga granulosa LMG 12119' : 0.00152 ) : 0.00255 , ' Capnocytophaga sp. LMG 12116' : 0.02296 ) : 0.00213 , (' Capnocytophaga sp. str. S3' : 0.00106 , ' Capnocytophaga gingivalis LMG 12118' : 0.00173 ) : 0.0022 ) : 0.00035 , ' Capnocytophaga gingivalis ATCC 33624 (T)' : 0.00166 ) : 0.00189 , ' Capnocytophaga gingivalis ATCC 33624 (T)' : 0.02038 ) : 0.01047 , ((' Capnocytophaga ochracea str. 25 ATCC 33596 (T)' : 0 , ' Capnocytophaga ochracea str. 25 ATCC 33596 (T)' : 0.00053 ) : 0.00356 , (((' Capnocytophaga sputigena ATCC 33612 (T)' : 0 , ' Capnocytophaga sputigena ATCC 33612 (T)' : 0.00098 ) : 0.00068 , ' Capnocytophaga sputigena ATCC 33612 (T)' : 0.00072 ) : 0.00373 , ((' Capnocytophaga ochracea ATCC 27872 (T)' : 0.00539 , ' Capnocytophaga ochracea LMG 12117' : 0.00433 ) : 0.00174 , (' Capnocytophaga ochracea LMG 12115' : 0 , (' Capnocytophaga ochracea FDC 7b' : 0 , (' Capnocytophaga sp. str. S1' : 0 , ' Capnocytophaga sp. str. S1B' : 0.00145 ) : 0.00136 ) : 0.00187 ) : 0.00176 ) : 0.01386 ) : 0.0036 ) : 0.02279 ) : 0.02021 ) : 0.02573 ) : 0.02228 ) : 0.05179 )'CAP.OCHRACEA' : 0.00552 ) : 0.00345 , (' clone 14a' : 0.00135 , ' clone FL7' : 0.02992 ) : 0.05455 ) : 0.06912 , (((' Flexibacter maritimus str. 449 (T)' : 0.00055 , ' Flexibacter maritimus JCM 8137' : 0.00424 ) : 0 , ' Flexibacter maritimus str. R2 ATCC 43398 (T)' : 0.00073 ) : 0.018 , (' Polaribacter franzmannii str. 301' : 0.00216 , (' marine snow associated clone agg50' : 0.00139 , (' Polaribacter irgensii str. 23-P ATCC 49675' : 0.0038 , ' Polaribacter glomeratus ATCC 43844' : 0.00986 ) : 0.01669 ) : 0.00416 ) : 0.06922 )'FLX.MARITIMUS' : 0 ) : 0.0255 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD36' : 0.01269 , ((' Flavobacterium aquatile ATCC 11947 (T)' : 0 , ' str. SBR2106' : 0.04148 ) : 0.00264 , (((' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD38' : 0.09543 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD64' : 0.00902 ) : 0.01283 , ' Flavobacterium columnare NCIMB 2248 (T)' : 0.0244 ) : 0.0112 , ((' Flavobacterium succinicans DSM 4002 (T)' : 0 , ' Flavobacterium succinicans IFO 14905 (T)' : 0.00342 ) : 0.0028 , (((' Flavobacterium hydatis IAM 12365' : 0.00103 , ' Flavobacterium psychrophilum NCIMB 1947 (T)' : 0.02236 ) : 0 , ' Flavobacterium hydatis ATCC 29551 (T)' : 0.00139 ) : 0.00133 , (((((' Flavobacterium johnsoniae str. MYX.1.1.1 ATCC 17061 (T)' : 0.00033 , ' Flexibacter aurantiacus str. Lewin DWO ATCC 23107 (T)' : 0.00082 ) : 0.00035 , ' Flavobacterium johnsoniae IFO 14942' : 0.00334 ) : 0.01308 , (' Flavobacterium flevense IFO 14960 (T)' : 0 , ' Flavobacterium flevense ATCC 27944 (T)' : 0.00165 ) : 0.01706 ) : 0.0036 , (' Flavobacterium pectinovorum str. Dorey 81 NCIMB 9059 (T)' : 0.00678 , ' Cytophaga sp. str. L-43-1-N' : 0.01029 ) : 0.00737 ) : 0.00031 , ((' Flavobacterium saccharophilum str. VL31 NCIMB 2072 (T)' : 0 , ' Flavobacterium saccharophilum str. VL31 NCIMB 2072 (T)' : 0.00106 ) : 0.00098 , (' Flavobacterium columnare str. RR-1a ATCC 43622' : 0.00222 , (' Flavobacterium johnsoniae DSM 425' : 0.00299 , (' Sporocytophaga cauliformis DSM 3657' : 0.00307 , (' Flavobacterium branchiophilum str. 270 IFO 15030' : 0.00317 , ' Flavobacterium hibernum ATCC 51468 (T)' : 0.0211 ) : 0.00612 ) : 0.00425 ) : 0.0049 ) : 0.00315 ) : 0.00119 ) : 0.00355 ) : 0.00697 ) : 0.01229 ) : 0.0106 ) : 0.00703 )'F.FLEVENSE' : 0.00661 ) : 0.03771 , (' Myroides odoratus ATCC 4651 (T)' : 0 , ' Myroides odoratus JCM 7458 (T)' : 0.00178 )'MY.ODORATUS' : 0.01359 ) : 0.03667 , (' clone 22a' : 0.01617 , (' clone 6711' : 0.01508 , ' clone 5911' : 0.00934 ) : 0.01168 )'ENV.5911' : 0.00495 ) : 0.02951 , ' clone 1911' : 0.0014 ) : 0.06402 , ((((((((' Blattabacterium sp.' : 0.01421 , ' endosymbiont of Mastotermes darwiniensis' : 0.0215 ) : 0.00352 , (' Blattabacterium sp.' : 0.0042 , ' Blattabacterium sp.' : 0.00182 ) : 0.0107 ) : 0.00373 , ' Blattabacterium sp.' : 0.00982 ) : 0.00632 , ' Blattabacterium sp.' : 0.00086 ) : 0.00271 , ' Blattabacterium sp.' : 0.00115 ) : 0.00065 , ' Blattabacterium sp.' : 0.00377 ) : 0.04811 , ' clone 6911' : 0.04098 )'BLT.SP' : 0.02376 , ((((' Empedobacter brevis ATCC 14234' : 0.00631 , ' Empedobacter brevis IAM 14197 (T)' : 0.02664 ) : 0.01522 , ' Weeksella virosa ATCC 43766 (T)' : 0.0278 ) : 0.01951 , ' Ornithobacterium rhinotracheale LMG 9086 (T)' : 0.04678 )'EMB.BREVIS' : 0.01605 , (((' Chryseobacterium meningosepticum ATCC 13253 (T)' : 0 , ' Chryseobacterium meningosepticum IFO 12535 (T)' : 0.00391 ) : 0.00527 , ' Chryseobacterium meningosepticum ATCC 13253 (T)' : 0 )'CSB.MENINGOSEPTICUM' : 0.00403 , (((' Chryseobacterium balustinum ATCC 33487 (T)' : 0 , ' Chryseobacterium balustinum IFO 15053 (T)' : 0 ) : 0.00971 , ' Chryseobacterium indoltheticum ATCC 27950 (T)' : 0.00975 ) : 0.00752 , ((((((' Flavobacterium ogurii' : 0.17895 , ' Flavobacterium paraogurii' : 0.0054 ) : 0.02277 , ' Chryseobacterium indologenes' : 0.00511 ) : 0.00201 , ' Chryseobacterium gleum' : 0.02786 ) : 0.00208 , ' Chryseobacterium gleum str. F93 ATCC 35910 (T)' : 0.11855 ) : 0 , ' Chryseobacterium indologenes ATCC 29897 (T)' : 0.00172 ) : 0.00273 , (' Bergeyella zoohelcum ATCC 43767 (T)' : 0.0075 , ((' Riemerella anatipestifer ATCC 11845 (T)' : 0 , ' Riemerella anatipestifer' : 0.00763 ) : 0.01043 , ((' str. SBR2024' : 0 , ' str. SBR1044' : 0.00417 ) : 0.00077 , (' str. SBR2072' : 0.00104 , ' str. SBR2091' : 0.00689 ) : 0.00128 ) : 0.01472 ) : 0.0418 ) : 0.00958 ) : 0.00936 )'CSB.BALUSTINUM' : 0.02259 ) : 0.03511 ) : 0.02254 ) : 0.00219 ) : 0.03955 , (' clone 5811' : 0.04656 , (' str. SBR2026' : 0.07048 , ' Microscilla aggregans subsp. catalatica str. HI-3 ATCC 23190' : 0.1309 ) : 0.03973 )'MSC.AGGREGANS' : 0.01652 ) : 0.03076 , ' clone 3811' : 0.00605 )'CYTOPHAGA' : 0.00564 , ((' Rikenella microfusus ATCC 29728 (T)' : 0.05861 , ' Bacteroides putredinis str. 1 Ando ATCC 29800 (T)' : 0.06078 )'RIK.MICROFUSUS' : 0.00729 , ((((' str. SBR2008' : 0 , ' str. SBR1035' : 0 ) : 0.05544 , ' "Anaeroflexus maritimus" str. PL12FS DSM 2831' : 0.07376 ) : 0.01046 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD30' : 0.04586 )'ANF.MARITIMUS' : 0.02442 , (' Cytophaga xylanolytica str. XM3' : 0.00657 , ((' Cytophaga fermentans NCIMB 2218 (T)' : 0.00144 , ' Cytophaga fermentans ATCC 19072 (T)' : 0 )'CY.FERMENTANS' : 0.01559 , (((' Marinilabilia salmonicolor NCIMB 2216 (T)' : 0.00147 , ' Marinilabilia agarovorans NCIMB 2217 (T)' : 0.01148 ) : 5e-05 , ' Marinilabilia agarovorans ATCC 19043 (T)' : 0.00212 )'ML.AGAROVORANS' : 0.03186 , (' Bacteroides splanchnicus NCTC 10825 (T)' : 0.031 , (((((((((' Porphyromonas gingivalis DSM 20709' : 0.00099 , ' Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 (T)' : 0.00023 ) : 0.04253 , ' Porphyromonas cansulci VPB 4875 (T)' : 0.03555 ) : 0.01653 , (' Porphyromonas macacae NCTC 11632 (T)' : 0.00051 , ' Porphyromonas macacae ATCC 33141 (T)' : 0.00223 ) : 0.04873 ) : 0.01012 , (' Porphyromonas asaccharolytica ATCC 25260 (T)' : 0.02008 , (' Porphyromonas circumdentaria NCTC 12469 (T)' : 0.01283 , (' Porphyromonas endodontalis ATCC 35406 (T)' : 0.00315 , ' str. PUS3.23' : 0.00569 ) : 0.02898 ) : 0.07881 ) : 0.03116 ) : 0.00823 , (' Porphyromonas canoris VPB 4882' : 0.01069 , (' Porphyromonas levii ATCC 29147 (T)' : 0.05097 , ' Porphyromonas cangingivalis VPB 4874 (T)' : 0.01385 ) : 0.04082 ) : 0.01537 ) : 0.00829 , ' Porphyromonas catoniae ATCC 51270 (T)' : 0.05621 ) : 0.02672 , (' Bacteroides forsythus FDC 331' : 0.00061 , ' Bacteroides forsythus FDC 338 (T)' : 0.00069 ) : 0.04016 ) : 0.00915 , ((((' clone UN78' : 0.0609 , ' clone UN71' : 0.03729 ) : 0.03129 , ' Bacteroides distasonis ATCC 8503 (T)' : 0.08551 ) : 0.01191 , ' Bacteroides merdae ATCC 43184 (T)' : 0.0266 ) : 0.0444 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD27' : 0.02709 , (' str. CDC Group DF-3' : 0.0266 , ((' clone UN85' : 0 , ' clone UN77' : 0 ) : 0.02516 , ((' clone UN5' : 0.00202 , ' clone UN27' : 0 ) : 0.01116 , (' clone UN26' : 0 , (' clone UN108' : 0 , ' clone UN19' : 0 ) : 0.00253 ) : 0.00031 ) : 0.03367 ) : 0.06133 ) : 0.00225 ) : 0.03389 ) : 0.0178 )'PPM.MACACAE' : 0.01936 , ((((((((' Bacteroides thetaiotaomicron str. E50 ATCC 29148 (T)' : 0 , ' Bacteroides thetaiotaomicron str. E50 VPI 5482 (T)' : 0.00079 ) : 0.003 , (' Bacteroides ovatus ATCC 8483 (T)' : 0.00028 , ' Bacteroides ovatus NCTC 11153 (T)' : 0.00027 ) : 0.00824 ) : 0.00329 , ' Bacteroides caccae ATCC 43185 (T)' : 0.01843 ) : 0.00556 , (' Bacteroides fragilis ATCC 25285 (T)' : 0.00018 , (' Bacteroides fragilis ATCC 25285 (T)' : 0 , ' Bacteroides fragilis' : 0.00019 ) : 0 ) : 0.02245 ) : 0.00423 , (' Bacteroides uniformis ATCC 8492 (T)' : 0.00574 , (' Bacteroides vulgatus ATCC 8482 (T)' : 0.02001 , (' Prevotella heparinolytica ATCC 35895 (T)' : 0.00817 , ' Prevotella zoogleoformans ATCC 33285 (T)' : 0.01165 ) : 0.03925 ) : 0.00954 ) : 0.01403 ) : 0.00764 , ' Bacteroides eggerthii NCTC 11185 (T)' : 0.01147 ) : 0.00421 , ' Bacteroides stercoris ATCC 43183 (T)' : 0.01811 )'BAC.FRAGILIS' : 0.00936 , ((' str. PUS3.42' : 0.00156 , ' Prevotella tannerae ATCC 51259 (T)' : 0.00302 )'PRV.TANNERAE' : 0.04148 , (' Prevotella bryantii str. B14 DSM 11371 (T)' : 0.04374 , (((((' Prevotella ruminicola str. TC18' : 0 , ' Prevotella ruminicola str. 23' : 0 ) : 0 , ' Prevotella ruminicola subsp. ruminicola ATCC 19189 (T)' : 0 ) : 0.01407 , ' Prevotella ruminicola str. TC2-24' : 0.02212 ) : 0.00813 , (' Prevotella brevis str. GA33 ATCC 19188 (T)' : 0 , ' Prevotella brevis str. GA33 ATCC 19188 (T)' : 0.00172 ) : 0.0224 )'PRV.RUMINICOLA' : 0.01811 , (((((' Prevotella oralis ATCC 33269 (T)' : 0.03036 , ' Prevotella loescheii ATCC 15930 (T)' : 0.04136 ) : 0.00507 , ' Prevotella enoeca ATCC 51261 (T)' : 0.05719 ) : 0.0058 , (' Prevotella dentalis str. ES2645 DSM 3688 (T)' : 0.03924 , (' Prevotella buccae str. 938.11 ATCC 33690' : 0 , ' Prevotella buccae str. VPI D3A-6 ATCC 33574 (T)' : 0 ) : 0.04593 ) : 0.00705 ) : 0.01495 , ' Prevotella buccalis ATCC 35310 (T)' : 0.04695 )'PRV.BUCCAE' : 0.00722 , (' Prevotella bivia ATCC 29303 (T)' : 0.00962 , ((((' Prevotella oris ATCC 33573 (T)' : 0.00099 , ' str. PUS3.3' : 0.00264 ) : 0.01559 , ' Prevotella ruminicola str. 223/M2/7' : 0.04439 ) : 0.01095 , (' Prevotella albensis str. M384 DSM 11370 (T)' : 0 , ' Prevotella albensis str. M384 DSM 11370 (T)' : 0 ) : 0.03732 ) : 0.00195 , (' Prevotella oulora str. WPH 179 ATCC 43324 (T)' : 0.00828 , ((((' Prevotella melaninogenica str. N-58-71A ATCC 43982' : 0.00062 , ' Prevotella melaninogenica str. B282 ATCC 25845 (T)' : 0.00422 ) : 0.00155 , ' Prevotella veroralis ATCC 33779 (T)' : 0.01078 ) : 0.00675 , (' Prevotella denticola ATCC 33185' : 0.00026 , ' Prevotella denticola str. 1210 ATCC 35308 (T)' : 0.00079 ) : 0.03481 ) : 0.00804 , (' Prevotella corporis ATCC 33547 (T)' : 0.0077 , (' Prevotella disiens ATCC 29426 (T)' : 0.01334 , (' Prevotella pallens str. 10371 NCTC 13042 (T)' : 0.02146 , ((' Prevotella intermedia str. B422 (S.Finegold) ATCC 25611 (T)' : 0.00077 , ' Prevotella intermedia str. B422 (S.Finegold) ATCC 25611 (T)' : 0 ) : 0.01827 , ((' Prevotella nigrescens str. Lambe 729-74 ATCC 33563 (T)' : 0.00024 , ' Prevotella nigrescens str. B515 ATCC 25261' : 0.0005 ) : 0.0006 , (' Prevotella melaninogenica' : 0 , ' Prevotella nigrescens str. Lambe 729-74 NCTC 9336' : 0.00704 ) : 0.0011 ) : 0.0226 ) : 0.01376 ) : 0.01381 ) : 0.02628 ) : 0.01165 ) : 0.02559 ) : 0.01276 )'PRV.NIGRESCENS' : 0.03255 ) : 0.00817 ) : 0.02579 ) : 0.01947 ) : 0.10701 ) : 0.0386 ) : 0.04118 ) : 0.09111 ) : 0.03679 ) : 0.03614 ) : 0.07934 ) : 0.01746 ) : 0.0416 )'BACTEROIDES' : 0.01632 ) : 0.01132 , ' marine snow associated clone agg58' : 0.0713 ) : 0.07712 , ' clone A23j' : 0 )'BACTEROIDES_AND_CYTOPHAGA' : 0.02122 , (((' unnamed organism' : 0.02111 , ' str. SBR1097' : 0.08576 ) : 0.01498 , ' Flexibacter canadensis ATCC 29591 (T)' : 0.06744 ) : 0.00226 , ((' Pedobacter heparinus str. HIM 762-3 ATCC 13125 (T)' : 0 , ' clone JAP411' : 0.00176 ) : 0.03531 , ((((' Sphingobacterium spiritivorum JCM 1277 (T)' : 0 , ' Sphingobacterium spiritivorum ATCC 33861 (T)' : 0.00196 ) : 0.00261 , ' Sphingobacterium spiritivorum IFO 14975 (T)' : 0.0015 ) : 0.02151 , (' Flavobacterium mizutaii IFO 14946 (T)' : 0.00022 , ' Flavobacterium mizutaii str. KM 1203 ATCC 33299 (T)' : 0.00174 ) : 0.02966 ) : 0.00768 , ((' Sphingobacterium multivorum IFO 14947 (T)' : 0.00136 , ' Sphingobacterium multivorum' : 0 ) : 0.01015 , (' Sphingobacterium thalpophilum ATCC 43320 (T)' : 0.00033 , (' Sphingobacterium thalpophilum' : 0 , ' Sphingobacterium thalpophilum IFO 14963 (T)' : 0.00073 ) : 0.00034 ) : 0.01541 ) : 0.01537 ) : 0.03857 ) : 0.0419 )'SPHINGOBACTERIUM' : 0.10475 ) : 0.01363 , (' clone 52a' : 0.02307 , ' clone 5511' : 0.00489 )'ENV.5511' : 0.05363 ) : 0.01405 , (' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-14' : 0.16437 , (((((((' Flavobacterium ferrugineum ATCC 13524 (T)' : 0.00725 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD10' : 0.01885 ) : 0.037 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD4' : 0.0504 ) : 0.02325 , ' str. SBR2061' : 0.03924 ) : 0.01872 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD33' : 0.0871 , (' str. R3' : 0.00304 , ' str. NIH' : 0.06422 ) : 0.03198 ) : 0.03439 ) : 0.00517 , (' Cytophaga arvensicola IAM 12650 (T)' : 0.0065 , ((' Flexibacter filiformis str. FX e 1 ATCC 29495 (T)' : 0.00593 , ' Chitinophaga pinensis ACM 2034 (T)' : 0.01929 ) : 0.00928 , (' Flexibacter sancti ATCC 23092 (T)' : 0 , (' str. ML466' : 0.00672 , ' str. MF158' : 0.03721 ) : 0.0157 ) : 0.02834 ) : 0.02663 ) : 0.02006 ) : 0.10656 , ' str. SBR2044' : 0.09878 )'FLX.SANCTI' : 0.02494 , (' Saprospira grandis ATCC 23119 (T)' : 0.01149 , (((' Haliscomenobacter hydrossis ATCC 27775 (T)' : 0.00069 , ' clone SMK206' : 0.00036 ) : 0.03366 , ' str. SBR1082' : 0.23003 ) : 0.00838 , (' str. SBT1019' : 0.0176 , ((((' Lewinella nigricans str. SS-2 ATCC 23147 (T)' : 0.05184 , ' Lewinella cohaerens str. II-2 ATCC 23123 (T)' : 0.06961 ) : 0.03009 , ' Lewinella persica str. T-3 ATCC 23167 (T)' : 0.07431 ) : 0.01061 , ' clone 3311' : 0.07641 ) : 0.01053 , ((' marine snow associated clone agg41' : 0.00042 , ' marine snow associated clone agg32' : 0.00979 ) : 0.03408 , (' clone 7011' : 0.06388 , (' clone 8911' : 0.0164 , ' clone 4611' : 0.01732 ) : 0.12629 ) : 0.03761 ) : 0.03272 ) : 0.11189 ) : 0.02002 ) : 0.11503 )'LEW.NIGRICANS' : 0.03825 ) : 0.13034 )'LEWINELLA' : 0.0626 ) : 0.00585 , (' Flammeovirga aprica ATCC 23126 (T)' : 0.01057 , ((' Persicobacter diffluens str. Lewin LIM-1 ATCC 23140' : 0.00143 , ' Persicobacter diffluens str. B1 NCIMB 1402 (T)' : 0 ) : 0.05257 , (' Flexithrix dorotheae ATCC 23163 (T)' : 0 , (' Microscilla arenaria str. HJ-1 ATCC 23161 (T)' : 0 , ' Flexibacter aggregans str. Lewin NN-3 ATCC 23162 (T)' : 0.00033 ) : 0.00787 ) : 0.31074 ) : 0.15513 )'PERSICOBACTER' : 0.00858 ) : 0.0073 , ((((' Flexibacter tractuosus str. Lewis BA-3 ATCC 23168 (T)' : 0 , ' Microscilla sericea str. SIO-7 ATCC 23182' : 0.0031 ) : 0.03455 , ' Microscilla furvescens str. TV-2 ATCC 23129' : 0.04742 ) : 0.10564 , ' clone PLY51' : 0.01148 ) : 0.01302 , (((' Spirosoma linguale str. Mc1 ATCC 23276' : 0.13734 , ' str. E-35' : 0.01868 ) : 0.01946 , (' str. B273' : 0.03788 , ' Cyclobacterium marinum str. WH-A; Raj ATCC 43824' : 0.06293 ) : 0.04381 ) : 0.01121 , ((((' Flexibacter flexilis str. CR-63 ATCC 23079 (T)' : 0.08302 , ' Flexibacter ruber str. Lewin GEY ATCC 23103 (T)' : 0.08414 ) : 0.01314 , (' Microscilla marina str. SIO-8 ATCC 23134 (T)' : 0.06819 , ' Flexibacter elegans str. NZ-1 ATCC 23112 (T)' : 0.03852 ) : 0.0401 ) : 0.01166 , ' Flectobacillus major ATCC 29496 (T)' : 0.09856 ) : 0.0254 , (' Sporocytophaga myxococcoides ATCC 10010 (T)' : 0.01894 , (' Runella slithyformis ATCC 29530 (T)' : 0.01841 , (' clone 4811' : 0.03149 , ((' Cytophaga hutchinsonii str. D465 (P.H.A. Sneath) ATCC 33406 (T)' : 0.00262 , ' Cytophaga hutchinsonii str. D465 (P.H.A. Sneath) DSM 1761 (T)' : 0 ) : 0.00071 , (' Cytophaga aurantiaca ATCC 12208 (T)' : 0.00346 , ' Cytophaga aurantiaca NCIMB 8628 (T)' : 0.0001 ) : 0.01023 ) : 0.24027 ) : 0.16205 ) : 0.05366 ) : 0.0076 ) : 0.01344 ) : 0.01494 )'CY.AURANTIACA' : 0.01075 ) : 0.01576 , (' Flexibacter polymorphus ATCC 27820 (T)' : 0.02444 , (' Flexibacter litoralis str. Lewin SIO-4 ATCC 23117 (T)' : 0.12269 , ' Flexibacter roseolus str. Lewin CR-155 ATCC 23088 (T)' : 0.07462 ) : 0.0936 )'FLX.LITORALIS' : 0.01602 ) : 0.0332 , ' Thermonema lapsum ATCC 43542 (T)' : 0.08878 ) : 0.02304 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD35' : 0.15476 ) : 0.03301 , ' str. SBR2085' : 0.15761 ) : 0.03257 , (' Rhodothermus obamensis str. OKD7' : 0 , (' Rhodothermus marinus' : 0 , ' Rhodothermus marinus' : 0 ) : 0.0237 )'RHODOTHERMUS' : 0.08621 ) : 0.02067 , (' clone 4511' : 0.02147 , ' clone OPB56' : 0.16624 )'ENV.OPB56' : 0.08427 )'FLEXIBACTER-CYTOPHAGA-BACTEROIDES' : 0.02961 , ((((' clone WCHB1-02' : 0.01182 , ' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A37t' : 0.2048 ) : 0.0187 , ' clone OPS107' : 0.08522 ) : 0.00531 , ' clone WCHB1-03' : 0.02181 )'ENV.WCHB1-02' : 0.11935 , (((' clone OPI-6' : 0.00254 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone OSIII-9' : 0.00745 ) : 0.01536 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type E' : 0.06248 )'ENV.OPI-6' : 0.04164 , (((((' Pelodictyon clathratiforme str. PG' : 0.00218 , ' Pelodictyon phaeoclathratiforme str. BU-1' : 0.00193 ) : 0.00814 , ' Chlorobium phaeobacteroides str. 2430' : 0.01392 ) : 0.00409 , ' Chlorobium phaeovibrioides str. 2631' : 0.00902 ) : 0.00261 , (' Prosthecochloris aestuarii str. SK 413 DSM 271 (T)' : 0.01497 , ' Chlorobium vibrioforme str. 6030 DSM 260 (T)' : 0.0082 ) : 0.02017 ) : 0.00416 , (' Chlorobium limicola str. 8327' : 0.00609 , (((' Chlorobium vibrioforme str. 6132' : 0.00075 , ' Pelodictyon luteolum str. 2530' : 0.00194 ) : 0.01169 , ' "Clathrochloris sulfurica" str. 1' : 0.03035 ) : 0.00221 , (' Chlorobium limicola str. 6230' : 0.00734 , (' Chlorobium limicola DSM 245 (T)' : 0.00179 , ' Chlorobium tepidum str. NZC' : 0.02382 ) : 0.01098 ) : 0.00329 ) : 0.00768 ) : 0.00754 )'CHLOROBIUM' : 0.09827 ) : 0.02459 )'GREEN_SULFUR' : 0.0734 ) : 0.00013 , (' clone G28' : 0.01662 , ' clone G37' : 0.02677 )'ENV.G37' : 0.07326 ) : 0.00032 , ((' clone WCHA1-79' : 0.03888 , ' clone WsCH12' : 0.0391 ) : 0.06493 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD49' : 0.05389 , (' clone RB03' : 0.08079 , (' clone M1' : 0.11541 , (' clone H1.43.f' : 0.02779 , (' clone OPB12' : 0.01571 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD28' : 0.28645 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD21' : 0.05552 , (' str. SBR2037' : 0.07322 , (((((((' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD66' : 0 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD62' : 0.01008 ) : 0.01822 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD46' : 0.00705 ) : 0.01504 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD45' : 0.01556 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD63' : 0.01651 ) : 0.0165 ) : 0.0465 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD29' : 0.01236 ) : 0.01293 , ' clone WCHB1-50' : 0.04954 ) : 0.05429 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD59' : 0.00636 ) : 0.00625 , (' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G31' : 0.00109 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD20' : 0.00136 , ((' str. SBR1029' : 0.00175 , ' str. SBR1064' : 0.00068 ) : 0.00167 , (' clone WCHB1-31' : 0.00166 , ((' clone WCHB1-62' : 0.0172 , ' clone WCHB1-63' : 0.05586 ) : 0 , (' clone G9' : 0.00187 , ((' clone RB41' : 0.01407 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD43' : 0.05797 ) : 0.00454 , (' clone WCHB1-05' : 0.00454 , ' clone WCHB1-43' : 0.00117 ) : 0.01788 ) : 0.03165 ) : 0.00986 ) : 0.01171 ) : 0.00739 ) : 0.02764 ) : 0.03536 ) : 0.00466 ) : 0.00136 ) : 0.00036 ) : 0.00116 ) : 0.00235 ) : 0.00268 ) : 0.00502 ) : 0.002 ) : 0.00123 ) : 0.00286 )'ENV.WCHB31' : 0.00514 ) : 0.03213 , ((((((' clone UN30' : 0 , ' clone UN75' : 0 ) : 0 , ' clone UN64' : 0 ) : 0 , (' clone UN104' : 0 , ' clone UN47' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' clone UN81' : 0.00111 ) : 0.00116 , (' clone UN62' : 0.00065 , ' clone UN79' : 0.0051 ) : 0.01066 )'ENV.UN104' : 0.02415 , ((((((((((((((((' Pirellula sp. str. Schlesner 384' : 0.0113 , ' Pirellula sp. str. Schlesner 140' : 0.00321 ) : 0.01291 , ' Pirellula sp. str. Schlesner 1' : 0.01557 ) : 0.00576 , (' Pirellula sp. str. Schlesner 516' : 0.02333 , ' Pirellula sp. str. Schlesner 158' : 0.02455 ) : 0.02239 ) : 0.00648 , ' Pirellula sp. str. Schlesner 139' : 0.02203 ) : 0.04906 , ' Pirellula sp. str. Schlesner 382' : 0.01035 ) : 0.00799 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD41' : 0.03093 , ' Pirellula sp. str. Schlesner 302' : 0.02317 ) : 0.01562 )'PIR_SCHLESNER' : 0.00632 , ((' Pirellula marina ATCC 49069 (T)' : 0.00443 , ' Pirellula marina DSM 3645' : 0.01968 ) : 0.01454 , (' Pirellula sp. str. Schlesner 678' : 0.02054 , ((' Planctomyces sp. str. Schlesner 670' : 0.05484 , ' str. SBR2065' : 0.02658 ) : 0.02231 , (' Pirellula staleyi DSM 6068 (T)' : 0 , (' Pirellula staleyi DSM 6068 (T)' : 0 , ' Pirellula staleyi ATCC 27377' : 0 ) : 0 ) : 0.02737 ) : 0.07827 ) : 0.03325 )'PIR.STALEYI' : 0.01511 ) : 0.01547 , (' clone 11a' : 0.10844 , ' marine snow associated clone agg8' : 0.10158 )'ENV.AGG8' : 0.00883 ) : 0.00399 , ' str. SBR2006' : 0.04118 )'PIRELLULA' : 0.03865 , (((((' Planctomyces sp. str. Schlesner 638' : 0 , ' Planctomyces sp. str. Schlesner 642' : 0.00095 ) : 0.00358 , (' str. SBR2027' : 0.01508 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 100' : 0.00601 ) : 0.00754 ) : 0.01568 , ' str. SBR2102' : 0.0264 ) : 0.04316 , ' Planctomyces limnophilus ATCC 43296 (T)' : 0.04742 )'PLN.LIMNOPHILUS' : 0.01463 , (((' Planctomyces maris ATCC 29201 (T)' : 0.00662 , ' Planctomyces maris DSM 8797 (T)' : 0.00123 ) : 0.00349 , ' Planctomyces sp. str. Schlesner 130' : 0.01678 ) : 0.01188 , (((' Planctomyces brasiliensis DSM 5305 (T)' : 0 , ' Planctomyces brasiliensis ATCC 49424' : 0.00092 ) : 0 , ' Planctomyces brasiliensis DSM 5305 (T)' : 0.0014 ) : 0.01547 , ((' Planctomyces sp. str. Schlesner 664' : 0.01743 , ' Planctomyces sp. str. Schlesner 668' : 0.0215 ) : 0.01602 , (' Planctomyces sp. str. Schlesner 269' : 0.03457 , (' str. SBR1085' : 0.00658 , ' Planctomyces sp. str. Schlesner 658' : 0.00638 ) : 0.04924 ) : 0.03113 ) : 0.04875 ) : 0.05389 )'PLN.MARIS' : 0.04443 )'PLANCTOMYCES' : 0.04995 ) : 0.02194 , ((((((' Isosphaera pallida str. IS 1B ATCC 43644 (T)' : 0.00363 , ' Isosphaera pallida str. IS 1B ATCC 43644 (T) [gene=rrnA gene]' : 0.00273 ) : 0 , ' Isosphaera pallida DSM 9630 (T)' : 0.00114 ) : 0.02802 , (' str. SBR1038' : 0.01117 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 25' : 0.01763 ) : 0.05331 ) : 0.00853 , (' Isosphaera sp. str. Schlesner 640' : 0.025 , ' Isosphaera sp. str. Schlesner 666' : 0.02414 ) : 0.00873 ) : 0.00733 , ' Isosphaera sp. str. Schlesner 657' : 0.02767 )'ISO.PALLIDA' : 0.03916 , ((((' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 98' : 0.01901 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 1' : 0.03211 ) : 0.01575 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 55' : 0.05081 ) : 0.0081 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 113' : 0.04275 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 11' : 0.03981 ) : 0.00709 )'MOUNT_COOT-THA_I' : 0.03 , (((((' Gemmata obscuriglobus str. UQM 2246 ACM 2224 (T)' : 0.00159 , ' Gemmata obscuriglobus str. UQM 446 (T)' : 0.00264 ) : 0.00114 , ' Gemmata obscuriglobus DSM 5831 (T)' : 0.00414 ) : 0.01499 , ' Gemmata obscuriglobus str. Schlesner 633' : 0.01594 ) : 0.02647 , ' str. SBR2030' : 0.06541 )'GMT.OBSCURIGLOBUS' : 0.02535 , (((' str. SBR2077' : 0.00064 , ' str. SBR1008' : 0.00052 ) : 0 , ' str. SBR1063' : 0.00111 ) : 0.00777 , (' str. SBR1073' : 0 , (' str. SBR1068' : 0.00011 , ' str. SBR2092' : 0.0011 ) : 0.00674 ) : 0.01258 )'STR.SBR1008' : 0.09077 ) : 0.05678 ) : 0.09257 )'ISOSPHAERA' : 0.05525 ) : 0.09678 , ' marine snow associated clone agg27' : 0.16495 ) : 0.01775 , (' clone A20n' : 0.01941 , (' str. s23' : 0.0606 , ' clone A36o' : 0.03772 ) : 0.04057 ) : 0.0773 ) : 0.01146 , ((((' clone WCHB1-58' : 0.06644 , ' clone LGd8' : 0.0307 ) : 0.11029 , ' clone OPd3' : 0.1121 ) : 0.03029 , ' clone A59p' : 0.1588 )'ENV.WCHB58' : 0.11038 , (' clone A55n' : 0.06491 , (((' Simkania negevensis str. Z' : 0.06748 , ' Parachlamydia acanthamoebae' : 0.02503 ) : 0.01787 , ' Waddlia chondrophila str. WSU 86/1044' : 0.05465 )'SMK.NEGEVENSIS' : 0.01107 , ((((((' Chlamydophila pneumoniae str. TW-183' : 0 , ' Chlamydophila pneumoniae' : 0 ) : 0 , ' Chlamydophila pneumoniae' : 0 ) : 0 , ' Chlamydophila pneumoniae' : 0.00154 ) : 0 , ' Chlamydophila pneumoniae str. TW-183' : 0 ) : 0.00134 , ' Chlamydophila pneumoniae str. N16' : 0.00216 ) : 0.00652 , ((((((' Chlamydia trachomatis str. 434' : 0.00034 , ' Chlamydia trachomatis str. A/Har-13' : 0 ) : 0.00025 , ' Chlamydia trachomatis str. HAR-13' : 0.00056 ) : 0.00308 , ' Chlamydia suis str. S45' : 0.00858 ) : 0.00151 , (' Chlamydia muridarum str. MoPn/Wiess-Nigg' : 0.00071 , ' Chlamydia muridarum str. SFPD' : 0.00026 ) : 0.00166 ) : 0.00888 , ' Chlamydophila pecorum str. Bo/E58' : 0.01182 ) : 0.00205 , (' Chlamydophila felis str. Fe/Pn-1 ATCC VR120 (T)' : 0.00132 , (' Chlamydophila psittaci str. 6BC ATCC VR-125 (T)' : 0.00124 , ((' Chlamydophila psittaci str. 6BC ATCC VR-125 (T)' : 0.0005 , ' Chlamydophila psittaci str. 6BC ATCC VR-125 (T)' : 0 ) : 0.0005 , (' Chlamydophila caviae str. Gp/Ic; GPIC ATCC VR813 (T)' : 0 , (' Chlamydophila abortus str. Ov/B577 ATCC VR-656 (T)' : 0 , (' Chlamydophila abortus str. B577 ATCC VR-656 (T)' : 0 , (' Chlamydophila psittaci' : 0 , ' Chlamydophila psittaci' : 0 ) : 0 ) : 0.00064 ) : 0.00299 ) : 0.00096 ) : 0 ) : 0.005 ) : 0.01221 ) : 0.01014 )'CHLAMYDOPHILA' : 0.05797 ) : 0.04885 )'CHLAMYDOPHILA' : 0.16506 )'CHLAMYDOPHILA' : 0.04468 ) : 0.01409 , (' clone TM5' : 0.09845 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 31' : 0.0432 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 17' : 0.01216 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 15' : 0.00469 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 18' : 0.01046 ) : 0.02094 ) : 0.01045 ) : 0.18759 )'MOUNT_COOT-THA_II' : 0.03626 )'PLANCTOMYCES' : 0.01171 , (' clone A32L' : 0.10763 , ((((' clone TM7' : 0.04118 , ' clone SBR2096' : 0.04063 ) : 0.00135 , ' clone M13' : 0.04489 ) : 0.04294 , ' clone JN18e' : 0.07489 )'ENV.TM7' : 0.10496 , (' Gloeobacter violaceus PCC 7421' : 0.012 , (((' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type B' : 0.0115 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type A' : 0.01357 ) : 0.03836 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type J' : 0.05359 )'OCTOPUS_SPRING_CLONES' : 0.0212 , ((((((((((((((((((((' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-33' : 0.00289 , ' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-12' : 0.02393 ) : 0.00644 , ' Pacific Ocean station 29 100m depth bacterioplankton DNA clone NH29-18' : 0.01178 ) : 0.01523 , ' Pacific Ocean station 29 100m depth bacterioplankton DNA clone NH29-14' : 0.0046 ) : 0 , (' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-6' : 0.00625 , ' Pacific Ocean station 29 100m depth bacterioplankton DNA clone NH29-1' : 0.00725 ) : 0.00217 ) : 0 , (' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-15' : 0.02273 , ' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-20' : 0 ) : 0.00196 ) : 0 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 6' : 0.0024 ) : 0.00561 , ' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-8' : 0.00264 ) : 0.0048 , ' Prochlorococcus marinus str. SSW5' : 0.00498 ) : 0.00233 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 12' : 0.00778 ) : 0.001 , ' clone 911' : 0.0052 ) : 0 , (' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 7' : 0.01497 , (' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 100' : 0.00206 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 139' : 0.00194 ) : 0.00798 ) : 0.00986 )'PRC.MARINUS' : 0.01691 , (' Synechococcus sp. PCC 6301' : 0.01822 , (' Microcystis elabens' : 0.07804 , ' Microcystis holsatica' : 0.01636 ) : 0.05334 )'MICROCYSTIS' : 0.05103 ) : 0.01277 , ' Prochlorothrix hollandica' : 0.05553 ) : 0.00818 , (' Phormidium minutum str. D5' : 0.02587 , (' Phormidium "ectocarpi" PCC 7375' : 0.00183 , (' Phormidium "ectocarpi" str. CCAP 1462/5' : 0 , ' Phormidium "ectocarpi" str. N182' : 0.0019 ) : 0.00474 ) : 0.03557 )'PHORMIDIUM' : 0.02502 ) : 0.01111 , (' Thermodesulfobacterium commune' : 0 , ' Synechococcus lividus str. Y-7B7C-S' : 0.00387 )'SYN.LIVIDUS' : 0.06642 ) : 0.00719 , ((' Chamaesiphon subglobosus PCC 7430' : 0.00857 , ' clone JAP606' : 0.13151 ) : 0.01492 , (((' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type I' : 0 , ' clone OPI-8' : 0.05267 ) : 0.03282 , ' Leptolyngbya sp. str. VRUC 135 Albertano 1985/1' : 0.04031 ) : 0.00696 , (' "Oscillatoria amphigranulata" str. CCC NZ-concert-Oa' : 0.04365 , (' Leptolyngbya boryanum PCC 73110' : 0.00037 , (' Leptolyngbya foveolarum str. Komarek 1964/112' : 0.00052 , ' Leptolyngbya boryanum PCC 73110' : 0.00104 ) : 0.00252 ) : 0.05301 ) : 0.01878 ) : 0.02766 )'LEPTOLYNGBYA' : 0.00882 ) : 0.00721 , ((((((' Myxosarcina sp. PCC 7312' : 0.01981 , ' Pleurocapsa sp. PCC 7516' : 0.02266 ) : 0.00296 , ' Pleurocapsa sp. PCC 7321' : 0.03917 ) : 0.00831 , (' Dactylococcopsis sp. PCC 8305' : 0.0106 , ' Cyanothece sp. PCC 7418' : 0.01928 ) : 0.04963 ) : 0.00349 , (' Synechocystis sp. PCC 6308' : 0.06143 , ' Prochloron didemni' : 0.03109 ) : 0.02927 ) : 0.00459 , ' Synechococcus sp. PCC 7003' : 0.04183 ) : 0.00248 , (((' Gloeocapsa sp. PCC 73106' : 0.04821 , ' Dermocarpa sp. PCC 7437' : 0.03288 ) : 0.00556 , (' "Oscillatoria corallinae" str. CJ1 SAG8.92' : 0.04121 , ' Microcoleus sp. PCC 7420' : 0.03848 ) : 0.02346 ) : 0.00456 , (((' Arthrospira sp. PCC 7345' : 0 , ' Spirulina sp. PCC 6313' : 0 ) : 0.00859 , ' Spirulina sp. PCC 6313' : 0.00518 ) : 0.00508 , (((' Gloeothece membranacea PCC 6501' : 0.00968 , ' Gloeothece membranacea' : 0.00099 ) : 0.00526 , ' Cyanothece sp. PCC 7424' : 0.04039 ) : 0.00444 , ((((' Synechocystis sp. PCC 6803' : 0 , ' Synechocystis sp. PCC 6803' : 0 ) : 0 , ' Synechocystis sp. PCC 6803' : 0 ) : 0.00914 , ' Synechocystis sp. PCC 6906' : 0.02293 ) : 0.0152 , ((' Microcystis aeruginosa' : 0.03258 , ' Microcystis sp. str. AWT139' : 0.01746 ) : 0.00112 , ((' Microcystis aeruginosa' : 0.00234 , ' Microcystis wesenbergii' : 0.00608 ) : 0.00017 , (((' Microcystis aeruginosa' : 0.00862 , ' Microcystis aeruginosa' : 0.02002 ) : 0.00108 , ' Microcystis aeruginosa PCC 7806' : 0.00109 ) : 0 , (' Microcystis aeruginosa str. NIES89' : 0.0006 , (' Microcystis wesenbergii' : 0.01071 , ' Microcystis viridis' : 0.01237 ) : 0.00138 ) : 0.00131 ) : 0.00363 ) : 0.0018 ) : 0.03686 ) : 0.02944 ) : 0.03297 ) : 0.00682 ) : 0.01068 )'GLOEOTHECE-GLOEOCAPSA' : 0.00954 ) : 0.00714 , (' Chroococcidiopsis sp. PCC 7203' : 0.0131 , (' "Calothrix desertica" PCC 7102' : 0.00794 , (((' "Chlorogloeopsis fritschii" PCC 6718' : 0.02738 , ' "Chlorogloeopsis" sp. str. HTF PCC 7518' : 0.04702 ) : 0.01124 , (' Fischerella sp. PCC 7414' : 0.03983 , ' Scytonema sp. PCC 7110' : 0.07684 ) : 0.01213 ) : 0.00542 , ((' Nostoc muscorum PCC 7120' : 0.01436 , ' Cylindrospermum sp. PCC 7417' : 0.00756 ) : 0.00703 , ((' Nostoc punctiforme PCC 73102' : 0.00292 , ' Nostoc punctiforme PCC 73102' : 0.00311 ) : 0.01896 , (' Nodularia sp. PCC 73104' : 0.00753 , (' "Anabaena cylindrica" str. NIES19 PCC 7122' : 0.01019 , ' "Anabaena cylindrica" str. NIES19 PCC 7122' : 0.00428 ) : 0.02551 ) : 0.01404 ) : 0.00636 ) : 0.01316 ) : 0.05034 ) : 0.05829 )'NOSTOC' : 0.01418 ) : 0.00198 , (((' "Oscillatoria" sp. PCC 7515' : 0.03308 , ' Trichodesmium sp. NIBB 1067' : 0.01133 ) : 0.02805 , ' "Oscillatoria" sp. PCC 6304' : 0.04183 ) : 0.00311 , (((' Microcoleus sp. str. 10 mfx (Australia)' : 0.00318 , ' "Oscillatoria williamsii" PCC 7105' : 0.00841 ) : 0.06426 , ' "Oscillatoria limnetica" str. Solar-Lake' : 0.05221 ) : 0.00876 , (' "Oscillatoria agardhii" str. CYA 18' : 0.00642 , (' Arthrospira sp. PCC 8005' : 0.02133 , (' Lyngbya confervoides PCC 7419' : 0.01491 , ' Lyngbya confervoides PCC 7419' : 0.00072 ) : 0.02278 ) : 0.06372 ) : 0.02306 ) : 0.01196 )'OSCILLATORIA' : 0.01224 )'CYANOBACTERIA' : 0.01027 , (((' "Pseudanabaena" sp. PCC 6903' : 0.01692 , ' "Pseudanabaena galeata" str. CCC OL-75-PS' : 0.01499 ) : 0.01592 , ' Pseudoanabaena biceps PCC 7367' : 0.04985 )'PSEUDANABAENA' : 0.00339 , (((((' Cyanophora paradoxa (colorless flagellate alga) -- cyanelle' : 0 , ' Cyanophora paradoxa (colorless flagellate alga) -- cyanelle' : 0 ) : 0 , ' Cyanophora paradoxa (colorless flagellate alga) -- cyanelle' : 0 ) : 0.00262 , ' Cyanophora paradoxa str. SAG B 45.85 (colorless flagellate alga) -- cyanelle' : 0.00494 ) : 0.00842 , (' Glaucocystis nostochinearum str. SAG 45.88 (blue green alga) -- cyanelle' : 0.01632 , ' Gloeochaete wittrockiana str. SAG B 46.84 (blue green alga) -- cyanelle' : 0.03186 ) : 0.02577 )'CYANELLE' : 0.01228 , ((((((((((((' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD32' : 0.0177 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD22' : 0.00805 ) : 0.00948 , ' clone OM20' : 0.00997 ) : 0.00415 , (' clone OM19' : 0.00374 , (' clone OM13' : 0.01039 , ' clone OM22' : 0.02049 ) : 0.01129 ) : 0.00736 ) : 0.00515 , ((' marine snow associated clone agg56' : 0.01998 , ' marine snow associated clone agg46' : 0.02047 ) : 0.0024 , (' Skeletonema costatum str. UBS-18 Univ. of British Columbia (centric diatom) -- chloroplast' : 0.00228 , ' Skeletonema pseudocostatum str. CSIRO culture CS-76 (centric diatom) -- chloroplast' : 0.00644 ) : 0.00259 ) : 0.01036 ) : 0.02847 , ' Olisthodiscus luteus (stramenopile) -- chloroplast' : 0.06563 ) : 0.01292 , ' Pylaiella littoralis (brown alga) -- chloroplast' : 0.07994 )'SKELETONEMA' : 0.00732 , (((((' Chlorarachnion reptans CCMP 238 (amoeboflagellate) -- chloroplast' : 0.01657 , ' Chlorarachnion sp. CCMP 242 (amoeboflagellate) -- chloroplast' : 0.01293 ) : 0.01325 , ' Chlorarachnion sp. CCMP 240 (amoeboflagellate) -- chloroplast' : 0.02343 ) : 0.08506 , ' Prototheca zopfii str. SAG 263-1a (green alga) -- chloroplast' : 0.42582 ) : 0.03731 , ' Ochromonas danica str. SAG 933-7 (golden alga) -- chloroplast' : 0.075 ) : 0.10543 , (' Astasia longa str. CCAP 1204-17a (colorless euglenophycean alga) -- chloroplast' : 0.14154 , (' Euglena gracilis (euglenophycean alga) -- chloroplast' : 0.00081 , ((' Euglena gracilis (euglenophycean alga) -- chloroplast' : 0 , ' Euglena gracilis (euglenophycean alga) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , (' Euglena gracilis (euglenophycean alga) -- chloroplast [gene=rrnA gene]' : 0 , (' Euglena gracilis (euglenophycean alga) -- chloroplast [gene=rrnB gene]' : 0 , ' Euglena gracilis (euglenophycean alga) -- chloroplast [gene=rrnC gene]' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00196 ) : 0.06315 ) : 0.02597 )'EUGLENA' : 0.016 ) : 0.019 , (' clone OM21' : 0.01901 , ((' Ochrosphaera sp. str. 181 (haptophyte) -- chloroplast' : 0.00332 , ' Ochrosphaera neapolitana CCMP 593 (haptophyte) -- chloroplast' : 0.0009 ) : 0.00832 , (' Emiliania huxleyi str. Plymouth Marine Laborator PML 92D (flagellate alga; haptophyte) -- chloroplast' : 0.01487 , ' Isochrysis sp. (flagellate alga) -- chloroplast' : 0.01053 ) : 0.01238 ) : 0.01989 )'OCHROSPHAERA' : 0.04219 ) : 0.00794 , (' Pyrenomonas salina (cryptomonad) -- chloroplast' : 0.02446 , ' Cryptomonas phi str. F (2-flagellae cryptomonad) -- chloroplast' : 0.01637 )'PYRENOMONAS' : 0.02091 ) : 0.0101 , (((' Antithamnion sp. (red alga) -- chloroplast' : 0.03324 , ' Chondrus crispus (red alga) -- chloroplast' : 0.02933 ) : 0.03482 , ' Palmaria palmata (edible? red alga) -- chloroplast' : 0.01794 ) : 0.00964 , (' Glaucosphaera vacuolata str. SAG B 13.82 (blue green alga) -- chloroplast' : 0.08096 , (' Porphyra purpurea (alga) -- chloroplast [gene=rrnA gene]' : 0.00508 , ' Porphyra purpurea (alga) -- chloroplast [gene=rrnB gene]' : 0.00111 ) : 0.02822 ) : 0.04785 )'PORPHYRA' : 0.01507 ) : 0.00268 , ' Cyanidium caldarium str. 14-1-1 (red alga) -- chloroplast' : 0.07264 )'OTHER_CHLOROPLASTS' : 0.01941 , (((((((((' Chlorella vulgaris (green alga) -- chloroplast' : 0.00091 , ' Chlorella vulgaris str. 211-11b (green alga) -- chloroplast' : 0.00024 ) : 0.00428 , ' Chlorella sorokiniana str. 211-8k (T) (green alga) -- chloroplast' : 0.00485 ) : 0.06382 , ' Chlorella protothecoides str. 211-7a (T) (green alga) -- chloroplast' : 0.01069 ) : 0.048 , ' Nanochlorum eucaryotum (green coccoidal alga) -- chloroplast' : 0.0047 ) : 0.01057 , (' Chlorella kessleri str. 211-11h (green alga) -- chloroplast' : 0.00147 , ' Chlorella kessleri str. 211-11g (T) (green alga) -- chloroplast' : 0.00027 ) : 0.00503 ) : 0.03922 , (' Chlorella mirabilis str. 748-I (T) (green alga) -- chloroplast' : 0.01681 , (' Chlorella saccharophila subsp. ellipsoidea str. 3.80 (green alga) -- chloroplast' : 0.01037 , ' Chlorella ellipsoidea str. IAM-C87 (green alga) -- chloroplast' : 0.0121 ) : 0.03563 ) : 0.01646 ) : 0.10693 , ' Chlorella saccharophila subsp. saccharophila str. 211-1d (green alga) -- chloroplast' : 0.00545 ) : 0.00841 , (' Pyramimonas parkeae str. NIES 254 (green alga) -- chloroplast' : 0.05907 , (((' Chlamydomonas moewusii str. UTEX 97 (mt+) (green alga) -- chloroplast' : 0 , ' Chlamydomonas eugametos str. UTEX 9 (mt+) (green alga) -- chloroplast' : 0.00061 ) : 0.07772 , ' Chlamydomonas parkeae str. NIES-440 (green alga) -- chloroplast' : 0.03927 ) : 0.01229 , (' Chlamydomonas pallidostigmatica (green alga) -- chloroplast' : 0.02371 , (' Chlamydomonas reinhardii (green alga) -- chloroplast' : 0.00508 , (' Yamagishiella unicocca str. X-441 (green alga) -- chloroplast' : 0.01855 , ' Gonium pectorale str. NIES-468 (green alga) -- chloroplast' : 0.01238 ) : 0.01406 ) : 0.10124 ) : 0.07159 ) : 0.09649 ) : 0.01111 )'GREEN_ALGAE' : 0.00927 , (' Klebsormidium flaccidum (charophyte alga) -- chloroplast' : 0.00697 , (' Chara sp. (stonewort (green alga)) -- chloroplast' : 0.00733 , (' Coleochaete orbicularis (charophyte alga) -- chloroplast' : 0.00514 , ((' Closterium ehrenbergii str. NIES-228 (green alga) -- chloroplast' : 0.05982 , ' Spirogyra maxima (charophyte alga) -- chloroplast' : 0.04053 ) : 0.00776 , (' Selaginella apoda (fern allies) -- chloroplast' : 0.00074 , (' Marchantia polymorpha (liverwort) -- chloroplast' : 0.00084 , ((((' Sphagnum palustre (bryophyte) -- chloroplast' : 0 , ' Sphagnum compactum (bryophyte) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Polytrichum commune (moss) -- chloroplast' : 0.00159 ) : 0 , ' Thuidium delicatulum (mat-forming plant) -- chloroplast' : 0.00529 ) : 0.00127 , (((((' Doodia maxima (leptosporangiate fern) -- chloroplast' : 0.01969 , ' Cibotium glaucum (Hawaiian tree fern) -- chloroplast' : 0.00457 ) : 0.0037 , ' Osmunda cinnamomea str. var. fokiensis (cinnamon fern) -- chloroplast' : 0.00848 ) : 0.0039 , ' Equisetum arvense (fern allies) -- chloroplast' : 0.01551 ) : 0.00077 , (' Angiopteris evecta (eusporangiate fern) -- chloroplast' : 0 , ' Lygodium japonicum (leptosporangiate fern) -- chloroplast' : 0.0248 ) : 0.00234 ) : 0.00112 , (' Lycopodium digitatum (fern allies) -- chloroplast' : 0.00285 , (((' Ophioglossum engelmannii (eusporangiate fern) -- chloroplast' : 0.00583 , ' Botrychium biternatum (eusporangiate fern) -- chloroplast' : 0.0012 ) : 0.01068 , ' Isoetes melanopoda (fern allies) -- chloroplast' : 0.01501 ) : 0.00188 , ((((' Juniperus virginiana (gymnosperm) -- chloroplast' : 0.03164 , ' Ephedra trifurca (gymnosperm) -- chloroplast' : 0.02955 ) : 0.00653 , ' Pinus thunbergiana (Japanese black pine; green pine) -- chloroplast' : 0.00949 ) : 0.00214 , (' Psilotum nudum (fern allies) -- chloroplast' : 0.00411 , ' Tmesipteris oblanceolata (fern allies) -- chloroplast' : 0.0055 ) : 0.0295 ) : 0.0049 , (((((' Zea mays (maize; corn; Indian corn) -- chloroplast' : 0 , ' Zea mays (maize; corn; Indian corn) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Zea mays (maize; corn; Indian corn) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Zea mays (maize; corn; Indian corn) -- chloroplast' : 0 ) : 0.00238 , ' Oryza sativa str. cv. Nipponbare (rice) -- chloroplast' : 0.00286 ) : 0.00379 , ((((' Pisum sativum str. cr. Progress No.9 (pea; garden pea) -- chloroplast' : 0 , ' Pisum sativum (pea; garden pea) -- chloroplast' : 0.00163 ) : 0 , ' Pisum sativum str. Rosakrona (pea; garden pea) -- chloroplast' : 0 ) : 0.00871 , (' Glycine max str. Maple arrow (soy bean) -- chloroplast' : 0 , ' Glycine max (soy bean) -- chloroplast' : 0 ) : 0.0219 ) : 0.00267 , ((' Conopholis americana (flowering plant) -- chloroplast' : 0.01224 , ' Epifagus virginiana (beechdrops) -- chloroplast' : 0.01441 ) : 0.00129 , ((((((((' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0 , ' Daucus carota (carrot) -- chloroplast' : 0.01481 ) : 0 , ' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , ' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , (((' Nicotiana plumbaginifolia str. wild type (curled-leaved tobacco; leadwort-leaved tobacco) -- chloroplast' : 0 , ' Cuscuta reflexa (dodder plant) -- chloroplast' : 0.00319 ) : 0 , ' Nicotiana plumbaginifolia str. wild type (curled-leaved tobacco; leadwort-leaved tobacco) -- chloroplast' : 0 ) : 0 , (' Nicotiana tabacum (common tobacco; tobacco; American tobacco) -- chloroplast' : 0.00091 , (' Alnus incana (hazel alder) -- chloroplast' : 0.00045 , (' Brassica napus (forage rape; kale) -- chloroplast' : 0.00191 , (' Adriana glabrata (euphorbialal dicotyledon plant) -- chloroplast' : 0.0048 , (' Euphorbia pulcherrima (poinsettia) -- chloroplast' : 0.00267 , ' Ricinis communis (castor bean) -- chloroplast' : 0.00054 ) : 0 ) : 0.00332 ) : 0.00279 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.01106 ) : 0.00199 ) : 0.01963 ) : 0.0061 ) : 0.00634 ) : 0.01318 ) : 0.00124 ) : 0.00129 ) : 0.01348 ) : 0.04976 ) : 0.00927 ) : 0.04287 ) : 0.04482 ) : 0.10553 )'CHAROPHYTA-EMBRYOPHYTA' : 0.017 ) : 0.03545 ) : 0.01864 ) : 0.06224 )'CHLOROPLASTS_AND_CYANELLES' : 0.01403 ) : 0.02405 ) : 0.04874 ) : 0.06748 ) : 0.00906 )'CYANOBACTERIA_AND_CHLOROPLASTS' : 0.03556 ) : 0.04309 ) : 0.00795 ) : 0.00198 , ' clone 1611' : 0.14041 ) : 0.21073 , (' Chrysiogenes arsenatis str. BAL-1 (T)' : 0.00535 , (' Geovibrio ferrireducens str. PAL-1' : 0.00162 , (' Deferribacter thermophilus str. BMA' : 0.04697 , ' Flexistipes sinusarabici str. MAS 10 DSM 4947' : 0.06208 ) : 0.09314 ) : 0.34024 )'FLS.SINUSARABICI' : 0 ) : 0.00742 , (((' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD14' : 0.03332 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD8' : 0.05939 ) : 0.00857 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD1' : 0.03908 )'ENV.PAD1' : 0.00875 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD39' : 0.05091 , ((((((((((((((' clone Ep_T1.152' : 0.01324 , ' clone WCHA2-13' : 0.03208 ) : 0.00255 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 13' : 0.01172 ) : 0.00281 , ' clone Ep_T1.154' : 0.02414 ) : 0.00525 , ' clone Ep_T1.153' : 0.017 ) : 0.00253 , ' clone Ep_T1.185' : 0.01811 ) : 0.00346 , ' clone P28' : 0.03092 ) : 0.03113 , (' clone TM1' : 0.06616 , (' clone M26' : 0.00887 , ' clone DA052' : 0.01204 ) : 0.13541 ) : 0.00161 ) : 0.033 , (' Acidobacterium capsulatum str. 161' : 0.00398 , (' clone TM29' : 0.02012 , (' clone TM2' : 0.0092 , ' clone TRB82' : 0.01449 ) : 0.01907 ) : 0.0333 ) : 0.0057 )'ACBT.CAPSULATUM' : 0.00524 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 103' : 0.03434 ) : 0.04097 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 42' : 0 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 22' : 0.00861 )'ENV.MC22' : 0.01123 ) : 0.00233 , (' clone M43' : 0.00339 , (((' clone 32-11' : 0.03115 , ' clone RB41' : 0.01509 ) : 0.01106 , ' clone RB30' : 0.02495 )'ENV.RB_CLONES' : 0.03126 , (' clone OPB3' : 0.03111 , ((' clone C002' : 0.00786 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE20' : 0.02034 ) : 0.00589 , (((' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 9' : 0.01397 , ' clone M10' : 0.02006 ) : 0.00977 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 101' : 0.00827 ) : 0.0256 , ((' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 26' : 0.02578 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 27' : 0.01913 ) : 0.01165 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD16' : 0.00488 , ' clone P15' : 0.02348 ) : 0.01689 ) : 0.013 ) : 0.00847 ) : 0.00746 )'MOUNT_COOT-THA' : 0.10639 ) : 0.11903 ) : 0.0729 )'ACIDOBACTERIUM' : 0.03072 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE3' : 0.1008 ) : 0.01593 , ((((((' clone WCHB1-15' : 0.01719 , ' clone WCHB1-06' : 0.02943 ) : 0.01315 , ' clone WCHB1-01' : 0.02996 ) : 0.14708 , ' clone WCHA2-01' : 0.429 ) : 0.08517 , ' str. SBR1114' : 0.12133 ) : 0.02233 , (' Pacific Ocean station 49 500m depth bacterioplankton DNA clone NH49-10' : 0.04852 , (' clone pB1-121' : 0.03572 , (' clone SAR 406' : 0.01134 , (' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-12' : 0.00287 , ' clone OCS 307' : 0.00462 ) : 0.02065 ) : 0.04476 ) : 0.08648 ) : 0.36332 )'ENV.OCS307' : 0.05903 , ((((' Fibrobacter intestinalis str. C1a' : 0 , ' Fibrobacter intestinalis str. NR9 ATCC 43854 (T)' : 0.00066 ) : 0.00161 , ' Fibrobacter intestinalis str. DR7 ATCC 43855' : 0.02241 ) : 0.00516 , (' Fibrobacter intestinalis str. JG1' : 0 , ' Fibrobacter intestinalis str. LH1' : 0 ) : 0.00438 ) : 0.03048 , (' Fibrobacter succinogenes str. MC1 ATCC 51218' : 0.01395 , (' Fibrobacter sp.' : 0.05622 , ((((' Fibrobacter succinogenes str. A3C ATCC 51219' : 0 , ' Fibrobacter succinogenes str. B1 ATCC 51214' : 0.00236 ) : 0.00112 , ' Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes str. S85 ATCC 19169 (T)' : 0.00205 ) : 0 , ' Fibrobacter succinogenes str. BL2 ATCC 51215' : 0.00188 ) : 0.01316 , (((' Fibrobacter succinogenes str. MM4' : 0 , ' Fibrobacter succinogenes subsp. elongatus str. HM2 ATCC 43856 (T)' : 0 ) : 0 , ' Fibrobacter succinogenes str. MB4' : 0 ) : 0.00468 , (' Fibrobacter sp.' : 0.01509 , (' Fibrobacter succinogenes str. GC5' : 0 , ' Fibrobacter succinogenes str. REH9-1 ATCC 43857' : 0.00283 ) : 0.00915 ) : 0.00717 ) : 0.00322 ) : 0.00502 ) : 0.00796 ) : 0.02189 )'FIBROBACTER' : 0.12815 )'FIBROBACTER' : 0.04509 )'FIBROBACTER_AND_ACIDOBACTERIUM' : 0.01817 , (' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-19' : 0.02053 , ((((((((((((((' Leptospira weilii str. Sarmin, isolate WB46' : 0.00277 , ' Leptospira weilii str. Worsfold, isolate WA 52' : 0 ) : 0 , ' Leptospira weilii str. Celledoni, isolate WA 45 ATCC 43285 (T)' : 0 ) : 0.00044 , ' Leptospira weilii str. Celledoni, isolate WA 45 ATCC 43285 (T)' : 0 ) : 0.00195 , (' Leptospira santarosai str. LT81, isolate SA39' : 0.00113 , ' Leptospira santarosai str. Shermani 1342K ATCC 43286 (T)' : 0.00488 ) : 0.00275 ) : 0.00098 , (' Leptospira borgpetersenii str. Veldrat Bataviae 46 ATCC 43292 (T)' : 0.00019 , (' Leptospira borgpetersenii str. 1627 Burgas, isolate BD30' : 0.00117 , ' Leptospira borgpetersenii str. Hardjo bovis/Sponselee, isolate BD50' : 0.00107 ) : 0.00062 ) : 0.00135 ) : 0.00194 , (' Leptospira noguchii str. Fort Bragg, isolate NB36' : 0.002 , ' Leptospira meyeri str. Ranarum ICF ATCC 43287 (T)' : 0.00212 ) : 0.00265 ) : 0.00106 , (' Leptospira interrogans str. icterohaemorrhagiae RGA' : 0.00129 , (' Leptospira kirschneri str. cynopteri 3522 C' : 0.00046 , ' Leptospira noguchii str. Panama CZ 214 ATCC 43288 (T)' : 0.00783 ) : 0.00187 ) : 0.00187 ) : 0 , ' Leptospira borgpetersenii str. Moulton, serovar canicola' : 0.00104 ) : 0.00049 , ' Leptospira interrogans str. Kennewicki, serovar pomona' : 0.00048 ) : 0.01381 , ' Leptospira inadai str. lyme ATCC 43289 (T)' : 0.01068 )'LPS.INTERROGANS' : 0.02493 , (' Leptospira sp. str. A-183' : 0 , (' Leptospira biflexa str. Porto' : 0.00153 , ((' Leptospira biflexa str. Tororo, parent strain' : 0.00959 , ' Leptospira biflexa str. Tororo ATCC 23583' : 0.00222 ) : 0.00107 , ((' Leptospira biflexa' : 0.00415 , ' Leptospira biflexa' : 0.00334 ) : 0.00258 , (' Leptospira wolbachii str. CDC Biflexa ATCC 43284 (T)' : 0.00206 , ' Leptospira biflexa str. patoc Patoc 1' : 0.0055 ) : 0.00574 ) : 0.00173 ) : 0.0028 ) : 0.00111 )'LPS.BIFLEXA' : 0.07576 )'LEPTOSPIRA' : 0.03119 , (' Leptospira parva str. H' : 0.07355 , (' Leptonema illini str. 3055' : 0.00128 , ' Leptonema illini str. 3055' : 0.00123 ) : 0.10979 )'LEPTONEMA' : 0.058 ) : 0.01449 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone OSV-L-7' : 0.12477 )'LEPTOSPIRA' : 0.0268 , ((((((((((((' Brachyspira innocens str. C 265 (group III)' : 0.00048 , ' Brachyspira hyodysenteriae str. AN 174:92' : 0.00024 ) : 0.00024 , ' Brachyspira hyodysenteriae str. B78 (T)' : 0 ) : 0 , (' Brachyspira innocens str. AN 520:93 (group II)' : 0.00023 , ' Brachyspira innocens str. AN 26:93 (group II)' : 0.00024 ) : 0 ) : 0 , (' Brachyspira hyodysenteriae str. R1' : 0 , (' Brachyspira hyodysenteriae str. NIV-1' : 0 , (' Brachyspira hyodysenteriae str. 2818.5' : 0 , ' Brachyspira hyodysenteriae str. PWS/A' : 0.00084 ) : 0.00046 ) : 0 ) : 0 ) : 0 , (' Brachyspira hyodysenteriae str. B78 (T)' : 0.00029 , (' Brachyspira innocens str. AN 983:90 (group II)' : 0 , ' Brachyspira innocens str. C1' : 0.00431 ) : 0.00048 ) : 0 ) : 0.00029 , ' Brachyspira hyodysenteriae str. B204 ATCC 31212' : 0.00037 ) : 0 , (' Brachyspira hyodysenteriae str. A1' : 0 , (' Brachyspira innocens str. AN 167:90 (group II)' : 0 , ' Brachyspira hyodysenteriae str. B204' : 0 ) : 0.00028 ) : 0 ) : 0.00103 , (' Brachyspira aalborgi NCTC 11492 (T)' : 0.00556 , ((' str. Australia N-Wes B' : 0.00074 , ' str. Italy N-HRM7' : 0 ) : 0 , ((' Brachyspira innocens str. WES-B' : 0.00031 , ' Brachyspira innocens str. HRM-7' : 0.00046 ) : 0 , (' Brachyspira innocens str. P43/6/78' : 0 , (' Brachyspira innocens str. P 43 (group IV)' : 0 , (' Brachyspira innocens str. C 162 (group IV)' : 0.00024 , ' Brachyspira innocens str. AN 916:90 (group IV)' : 0.00024 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00064 ) : 0 ) : 0.02221 ) : 0.00129 ) : 0.00054 , (' Brachyspira innocens str. 155-20' : 0.00022 , ((' Brachyspira innocens str. C 301 (group III)' : 0.00048 , ' Brachyspira innocens str. C 378 (group III)' : 0.00078 ) : 0.00061 , (' Brachyspira innocens str. 4/71' : 0 , (((' Brachyspira innocens str. C 555 (group III)' : 0.00024 , ' Brachyspira innocens str. AN 1023:90 (group III)' : 0.0005 ) : 0.00024 , ' Brachyspira innocens str. AN 3706:90 (group III)' : 0.0005 ) : 0 , ((' Brachyspira innocens str. AN 1004:90 (group III)' : 0 , ' Brachyspira innocens str. C 173 (group III)' : 0 ) : 0 , (' Brachyspira innocens str. C 109 (group III)' : 0.00024 , ' Brachyspira innocens str. C 320 (group III)' : 0.00024 ) : 0 ) : 0.00024 ) : 0.00094 ) : 0.00078 ) : 0.00095 ) : 0.00067 ) : 0 , ' Brachyspira innocens str. B256 (group III)' : 0.0003 ) : 0.0003 , ' Brachyspira innocens str. B256 ATCC 29796 (T)' : 0.00066 )'BRACHYSPIRA' : 0.00982 , (((' Brevinema andersonii str. MV116' : 0 , ' Brevinema andersonii str. FS47' : 0 ) : 0.00194 , ' Brevinema andersonii str. CT 11616 (J.F. Anderson) ATCC 43811 (T)' : 0 )'BRV.ANDERSONII' : 0.05246 , (((((((' Spirochaeta halophila str. RS1 ATCC 29478 (T)' : 0.02554 , ' Spirochaeta alkalica str. Z-7491 DSM 8900 (T)' : 0.01787 ) : 0.01028 , ' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type H' : 0.07278 ) : 0.02134 , (' Spirochaeta litoralis str. R1 ATCC 27000 (T)' : 0.06386 , ' Spirochaeta isovalerica str. MA-2 ATCC 33939 (T)' : 0.03567 ) : 0.0309 ) : 0.00856 , (' Spirochaeta asiatica str. Z-7591 DSM 8901 (T)' : 0.01423 , ' Spirochaeta africana str. Z-7692 DSM 8902 (T)' : 0.0071 ) : 0.04259 ) : 0.00684 , ' Spirochaeta thermophila DSM 6192' : 0.0911 ) : 0.00691 , ((' Spirochaeta bajacaliforniensis str. BA-2 ATCC 35968' : 0.00282 , ' Spirochaeta smaragdinae SEBR 4228 (T)' : 0.00531 ) : 0.04735 , (' str. PL12MY' : 0.01398 , ' Spirochaeta sp. str. Antarctic DSM 6211' : 0.02501 ) : 0.07897 ) : 0.02091 )'SPI.HALOPHILA' : 0.00643 , ((((((((((((' Treponema socranskii subsp. socranskii str. D56BRIII6 ATCC 35536 (T)' : 0.00406 , ' Treponema socranskii subsp. paredis ATCC 35535 (T)' : 0.00384 ) : 0.00315 , ' Treponema socranskii subsp. buccale ATCC 35534 (T)' : 0.00023 ) : 0.07296 , ' Treponema amylovorum' : 0.05114 ) : 0.02308 , ' Treponema maltophilum str. BR' : 0.03043 ) : 0.00219 , (' str. sp40-12' : 0.04184 , (' clone UN10' : 0 , (' clone UN100' : 0 , ' clone UN39' : 0 ) : 0.00396 ) : 0.06549 ) : 0.02521 )'TRP.SOCRANSKII' : 0.01641 , (' Treponema bryantii str. RUS-1 ATCC 33254 (T)' : 0.01351 , ((' Treponema pectinovorum ATCC 33768 (T)' : 0.04216 , ' clone UN2' : 0.06297 ) : 0.01038 , (' Treponema succinifaciens str. 6091 ATCC 33096 (T)' : 0.02177 , (' Treponema saccharophilum str. PB ATCC 43261 (T)' : 0.03298 , ' Treponema sp. str. CA' : 0.07749 ) : 0.09277 ) : 0.02337 ) : 0.05929 )'TRP.BRYANTII' : 0.01672 ) : 0.02058 , (' Spirochaeta zuelzerae ATCC 19044 (T)' : 0.01207 , (' Treponema medium str. G7201' : 0.00829 , (' Treponema denticola str. W ATCC 33520' : 0.02887 , (' Treponema phagedenis str. K5' : 0.01658 , ' Treponema pallidum str. Nichols' : 0.06437 ) : 0.01328 ) : 0.0396 ) : 0.03324 )'TRP.PALLIDUM' : 0.02463 ) : 0.0181 , (' Spirochaeta stenostrepta str. Z1 ATCC 25083 (T)' : 0.02928 , ' Treponema sp. str. H1 Leschine' : 0.01596 )'SPI.STENOSTREPTA' : 0.02027 ) : 0.01094 , (' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A56n' : 0.07645 , (' Spirochaeta sp.' : 0.00665 , ' str. sp5-17' : 0.01286 ) : 0.11678 )'SPI.SPMAST' : 0.05611 ) : 0.00352 , (' clone UN114' : 0.0296 , ((((' clone UN28' : 0.00747 , ' clone UN1' : 0 ) : 0.03158 , (' clone UN21' : 0 , ' clone UN90' : 0 ) : 0.03613 ) : 0.00496 , ' clone UN96' : 0.03623 ) : 0.01458 , (' str. sp40-11' : 0.03537 , (' str. sp40-8' : 0.00388 , (((' str. mpsp15' : 0.03885 , ' str. sp40-2' : 0.03359 ) : 0.01562 , ' str. sp5-18' : 0.04611 ) : 0.00987 , (' str. sp40-7' : 0.00717 , (' str. mpsp2' : 0.01905 , (' str. sp5-9' : 0.00207 , ' str. mpsp16' : 0.00405 ) : 0.0132 ) : 0.02055 ) : 0.0111 ) : 0.04627 ) : 0.01382 ) : 0.01999 ) : 0.04596 )'STR.MPSP16' : 0.01627 ) : 0.00395 , ' Spirochaeta sp. str. NL1' : 0.07145 )'TREPONEMA' : 0.01857 , (' Spirochaeta aurantia subsp. aurantia str. J1 ATCC 25082 (T)' : 0.03474 , (' Cristispira sp. str. 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HT31 JCM 9579 (T)' : 0.00548 ) : 0.00439 , ((((((((' Borrelia burgdorferi str. 934U' : 0.0003 , ' Borrelia afzelii' : 0.00147 ) : 0.0003 , (' Borrelia afzelii str. DK5' : 0.0003 , ' Borrelia afzelii str. DK4' : 0.00045 ) : 0.00045 ) : 0 , (' Borrelia afzelii str. DK3' : 0 , (' Borrelia afzelii str. DK21' : 0 , ' Borrelia afzelii str. DK2' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Borrelia afzelii str. DK1' : 0.0006 ) : 0 , ' Borrelia burgdorferi' : 0.00122 ) : 0 , ' Borrelia burgdorferi str. R-IP3' : 0.00065 ) : 0.00165 , (' Borrelia burgdorferi str. 9MT' : 0 , ' Borrelia burgdorferi' : 0.00029 ) : 0.00178 ) : 0.00039 , (((' Borrelia sp. str. 19941' : 0.00259 , ' Borrelia andersonii' : 0.00097 ) : 0.00038 , ' Borrelia andersonii' : 0.00401 ) : 0.00116 , (((((((' Borrelia garinii str. PBi' : 0.00063 , ' Borrelia burgdorferi str. 935T' : 0.00072 ) : 0.0003 , ' Borrelia garinii str. DK27' : 0.0007 ) : 0 , ' Borrelia garinii str. DK29' : 0 ) : 0.00034 , (' Borrelia garinii str. SL20' : 0.00054 , (' Borrelia burgdorferi str. G2' : 0.00034 , ' Borrelia burgdorferi str. G1' : 0.0007 ) : 0.00122 ) : 0.00041 ) : 0 , ' Borrelia burgdorferi str. R-IP90' : 0 ) : 0.00165 , (' Borrelia burgdorferi str. Rioja (garinii)' : 0.00328 , (' Borrelia burgdorferi str. DN127' : 0.00194 , ((' Borrelia japonica' : 0.0024 , ' Borrelia japonica' : 0.0035 ) : 0.00057 , (' Borrelia japonica str. IKA2' : 0.00163 , ' Borrelia japonica str. HO14' : 0 ) : 0.00099 ) : 0.00354 ) : 0.26807 ) : 0.00196 ) : 0.00041 , (' Borrelia burgdorferi str. VS219' : 0.00034 , (' Borrelia burgdorferi' : 0 , (((((' Borrelia burgdorferi str. B31 ATCC 35210 (T)' : 0.00181 , ' Borrelia burgdorferi str. Sh-2-82' : 0.00035 ) : 0.00125 , ' Borrelia burgdorferi str. Illinois 1' : 0.00122 ) : 0 , (' Borrelia burgdorferi str. 20004' : 0.00031 , ' Borrelia burgdorferi str. 1352' : 0.00105 ) : 0.00046 ) : 0 , ' Borrelia burgdorferi str. CA2-87' : 0 ) : 0 , (((' Borrelia burgdorferi' : 0 , ' Borrelia burgdorferi' : 0 ) : 0.0002 , ' Borrelia burgdorferi str. ESP-1' : 0.0139 ) : 0 , ((' Borrelia burgdorferi str. DK7' : 0.00091 , ' Borrelia burgdorferi str. B31 ATCC 35210 (T)' : 0.00091 ) : 0 , (' Borrelia burgdorferi str. LIPITZ' : 0 , (' Borrelia burgdorferi str. Kipp' : 0.00029 , ((' Borrelia burgdorferi str. DUNKIRK' : 0.0003 , ' Borrelia burgdorferi str. MUL' : 0.0006 ) : 0 , (' Borrelia burgdorferi str. 297' : 0.00104 , ' Borrelia burgdorferi str. 272' : 0.00029 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00065 ) : 0.00041 ) : 0 ) : 0.00066 ) : 0.00065 ) : 0.0019 ) : 0.00052 ) : 0.01522 ) : 0.00059 ) : 0.00202 ) : 0.00266 )'BORRELIA' : 0.21377 ) : 0.08098 ) : 0.03946 ) : 0.02473 )'SPIROCHAETA-TREPONEMA-BORRELIA' : 0.21698 ) : 0.21848 ) : 0.05013 )'SPIROCHETES' : 0.02586 ) : 0.00487 ) : 0.00341 ) : 0.00227 ) : 0.00257 ) : 0.01513 , (' unnamed delta proteobacterium' : 0.00944 , (' gram-negative anaerobic sulfate-reducing bacterium clone A8' : 0.00804 , (((((((((((((((((((((((((((((' Helicobacter pylori str. HP11638' : 0 , ' Helicobacter pylori str. HPF234' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter pylori str. HPF240' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter pylori str. HPC7058' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter pylori str. HPS8' : 0 ) : 0 , (' Helicobacter pylori str. HPF155' : 0.0007 , (' Helicobacter pylori str. HPA5443' : 0 , ' Helicobacter pylori str. HPC5790' : 0.00222 ) : 0.00158 ) : 0 ) : 0 , ' Helicobacter pylori str. SH2' : 0.00047 ) : 0.00068 , ' Helicobacter pylori NCTC 11638' : 0.00171 ) : 0 , ' Helicobacter pylori NCTC 11639' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter pylori str. MC19' : 0 ) : 0 , (' Helicobacter pylori str. L2' : 0 , ((' Helicobacter pylori str. SH3' : 0 , ' Helicobacter pylori str. SH4' : 0 ) : 0.00177 , (' Helicobacter pylori NCTC 11637' : 0 , (' Helicobacter pylori str. L13' : 0 , ' Helicobacter pylori NCTC 11916' : 0 ) : 0 ) : 0.00044 ) : 0.00088 ) : 0.00043 ) : 0.00045 , (' Helicobacter pylori str. MC937' : 0 , (' Helicobacter pylori str. D01' : 0 , (' Helicobacter pylori str. MC903' : 0 , (' Helicobacter pylori str. 5443' : 0.00027 , (' Helicobacter pylori str. MC238' : 0.00026 , (' Helicobacter pylori str. MC123' : 0.0011 , (' Helicobacter pylori ATCC 43504 (T)' : 0 , ' Helicobacter pylori ATCC 43504 (T)' : 0.00033 ) : 0.00053 ) : 0.00077 ) : 0.01579 ) : 0.00038 ) : 0.00019 ) : 0.00042 ) : 0.00111 ) : 0.00051 , (' Helicobacter pylori str. 26695 [gene=rrnA gene]' : 0.00114 , ' Helicobacter pylori str. 26695 [gene=rrnB gene]' : 0.00027 ) : 0.0008 ) : 0.00025 , ' Helicobacter pylori str. 85D08 ATCC 51407' : 0.00038 ) : 0.00083 , ' Helicobacter nemestrinae str. T81213-NTB ATCC 49396 (T)' : 0.02278 ) : 0.00375 , (' Helicobacter acinonychis str. Eaton 90-1908-3 ATCC 51104' : 0 , ' Helicobacter acinonychis str. Eaton 90-119-3 CCUG 29263 (T)' : 0 ) : 0.00896 ) : 0.00937 , (' "Gastrospirillum hominis" str. clone G1A1; isolate 1' : 0.01773 , (' "Gastrospirillum hominis" str. 2' : 0.00106 , (' Helicobacter salomonis str. Inkinen CCUG 37845 (T)' : 0.00134 , (' Helicobacter felis str. CS1 ATCC 49179 (T)' : 0.00051 , (' Helicobacter bizzozeronii CCUG 35045 (T)' : 0.00055 , ' Helicobacter felis str. DS3' : 0.00292 ) : 0.0022 ) : 0.00186 ) : 0.0055 ) : 0.00693 ) : 0.01429 ) : 0.01915 , ' Helicobacter sp. str. CLO 3 CCUG 14564' : 0.01969 ) : 0.0024 , (' Helicobacter sp. str. Seymour B52 (T) CCUG 29561' : 0.00382 , ((' Helicobacter sp. str. Seymour B8 CCUG 29254' : 0 , ' Helicobacter sp. str. Seymour 10B (T) CCUG 29256 (T)' : 0.00027 ) : 0.00318 , (' Helicobacter mustelae str. Fox R85-13-6 NCTC 12198 (T)' : 0 , (' Helicobacter mustelae str. 91-292-E1A Fox' : 0 , (' Helicobacter mustelae str. Fox R85-13-6 NCTC 12198 (T)' : 0.00078 , ' Helicobacter mustelae str. Fox R85-13-6 ATCC 43772 (T)' : 0 ) : 0.00031 ) : 0 ) : 0.00846 ) : 0.00384 ) : 0.01148 ) : 0.00243 , ((' Helicobacter sp. str. 91-269-21 Fox' : 0 , ' Helicobacter sp. str. 91-266-11 Fox' : 0.00066 ) : 0.00223 , (' Helicobacter cholecystus str. Hkb-1 ATCC 700242 (T)' : 0.00353 , (' Helicobacter pametensis str. Seymour B9 (T) CCUG 29255 (T)' : 0 , (' Helicobacter pametensis str. Seymour B7 CCUG 29253' : 0 , (' Helicobacter pametensis str. Seymour B15 CCUG 29259' : 0.00032 , (' Helicobacter pametensis str. Seymour B12 CCUG 29257' : 0.00032 , (' Helicobacter pametensis str. Seymour B13 CCUG 29258' : 0 , ' Helicobacter pametensis str. Seymour M17 CCUG 29260' : 0 ) : 0 ) : 0.00036 ) : 0 ) : 0.00035 ) : 0.00367 ) : 0.00786 ) : 0.00319 ) : 0.00154 , (((((((' Helicobacter pullorum NCTC 12824 (T)' : 0 , ' Helicobacter pullorum NCTC 12825' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter pullorum NCTC 12827' : 0 ) : 0.00344 , (' Helicobacter pullorum NCTC 12826' : 0.00029 , ' Helicobacter pullorum str. UB151' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Helicobacter pullorum str. UB3659' : 0.00045 ) : 0 , ' Helicobacter pullorum str. UB3166' : 0 ) : 0.00108 , ' Helicobacter rodentium str. MIT 95-1707 ATCC 700285 (T)' : 0.01365 ) : 0.00091 , ((((((' Helicobacter hepaticus str. Fox Hh-3 ATCC 51450' : 0.00118 , ' Helicobacter hepaticus str. Fox Hh-2 ATCC 51448 (T)' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter hepaticus str. Fox Hh-1 ATCC 51449' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter hepaticus str. FRED1' : 0 ) : 0.00503 , ' Helicobacter muridarum str. ST1 ATCC 49282 (T)' : 0.00971 ) : 0.00397 , (' Helicobacter trogontum str. LRB 8581' : 0.00659 , (' Helicobacter fennelliae CCUG 18820 (T)' : 0.00799 , ' Helicobacter sp.' : 0.00706 ) : 0.0174 ) : 0.00614 ) : 0.00426 , (((((' Flexispira rappini NCTC 12461' : 0.00054 , ' Helicobacter cinaedi CCUG 18818 (T)' : 0.00487 ) : 0.00247 , ' Flexispira rappini NADC 1937' : 0 ) : 0 , ' Flexispira rappini str. 2011; SDSU 84-3345 NADC 1893 (T)' : 0 ) : 0.00066 , ' Flexispira rappini str. DBS59' : 0.00042 ) : 0.00097 , (((' Helicobacter bilis str. Hb2 ATCC 51631' : 0 , ' Helicobacter bilis str. Hb3 ATCC 51632' : 0 ) : 0 , ' Helicobacter bilis str. Hb1 ATCC 51630 (T)' : 0 ) : 0 , (' Helicobacter canis NCTC 12739 (T)' : 0.00145 , (' Helicobacter sp. CCUG 29176' : 0.04461 , ' Helicobacter canis NCTC 12220' : 0.00095 ) : 0.00185 ) : 0.00169 ) : 0.00596 ) : 0.00588 ) : 0.01374 ) : 0.00435 )'HLB.PYLORI' : 0.01344 , (' Wolinella succinogenes str. 602W (FDC) ATCC 29543 (T)' : 0 , (' Wolinella succinogenes str. 602W (FDC) NCTC 11488' : 0.00113 , ' Wolinella succinogenes str. 602W (FDC) ATCC 29543 (T)' : 0.00174 ) : 0 )'WLN.SUCCINOGENES' : 0.02351 )'HELICOBACTER' : 0.01753 , ((((((((' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_63' : 0.00019 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_32' : 0.0005 ) : 0.00039 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_12' : 0.00126 ) : 0.00055 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_55' : 0.0008 ) : 0.00027 , (' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_10' : 0.00094 , (' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_15' : 0.00021 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_7' : 0 ) : 0.00085 ) : 6e-05 )'PELE.S_VENTS_CLONES' : 0.00621 , ((' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_73' : 0.02991 , ' clone A15jk' : 0.00989 ) : 0.00281 , (' Thiomicrospira denitrificans DSM 1251 (T)' : 0.00238 , (' str. s28' : 0 , ' clone A14jsn' : 0.00641 ) : 0.00729 ) : 0.00378 )'TMS.DENITRIFICANS' : 0.01259 ) : 0.00713 , ((' Thiovulum sp.' : 0 , ' Thiovulum sp.' : 0.00058 ) : 0.07111 , (' clone JN5bf' : 0 , (' str. s26' : 0 , ' clone G15' : 0.0016 ) : 0.00168 ) : 0.10035 )'THVL.SP' : 0.01042 ) : 0.01315 , (' clone A7' : 0.04353 , ((' symbiont of Alvinella pompejana' : 0.03193 , ' symbiont of Alvinella pompejana' : 0.02036 ) : 0.02154 , (' symbiont of Rimicaris exoculata' : 0.02559 , (' symbiont of Alvinella pompejana' : 0.01934 , ' symbiont of Alvinella pompejana' : 0.01685 ) : 0.04348 ) : 0.04556 ) : 0.08235 )'ALVINELLA_SYMBIONTS' : 0.0685 )'THIOVULUM' : 0.01735 , ((((((' Arcobacter cryaerophilus ATCC 49615' : 0 , ' Arcobacter cryaerophilus CCUG 17801 (T)' : 0.00205 ) : 0.00489 , ' Arcobacter skirrowii str. 449/80 CCUG 10374 (T)' : 0.00144 ) : 0.00566 , ' Arcobacter butzleri CCUG 10373' : 0.00789 ) : 0.02456 , ' Arcobacter nitrofigilis CCUG 15893 (T)' : 0.00994 ) : 0.01151 , ' Arcobacter sp. str. Solar Lake' : 0.0237 )'AOB.CRYAEROPHILUS' : 0.02057 , ((((((' Sulfurospirillum deleyianum str. 5175 ATCC 51133 (T)' : 0.00298 , ' Sulfurospirillum arsenophilum str. MIT-13 ATCC 700056' : 0.01188 ) : 0.00172 , ' Sulfurospirillum barnesii str. SES-3' : 0.00541 ) : 0 , ' "Geospirillum barnesii"' : 0.00223 ) : 0.0059 , ' Campylobacter sp. CCUG 13942' : 0.00802 ) : 0.02032 , ' Sulfurospirillum arcachonense str. F1F6 DSMZ 9755 (T)' : 0.02899 )'SFS.BARNESII' : 0.01307 , (' Bacteroides ureolyticus ATCC 33387 (T)' : 0.0098 , (((((((((' Campylobacter jejuni subsp. jejuni str. TGH 9011 ATCC 43431' : 0.00023 , ' Campylobacter coli str. RMIT32A CCUG 33450 (T)' : 0.00045 ) : 0.01033 , ' Campylobacter jejuni str. VC79 NCTC 11392' : 0.00024 ) : 0 , ' Campylobacter jejuni subsp. jejuni CCUG 11284 (T)' : 0.00022 ) : 0 , ' Campylobacter jejuni subsp. doylei CCUG 24567 (T)' : 0.00022 ) : 0 , ' Campylobacter jejuni subsp. jejuni ATCC 33560 (T)' : 0 ) : 0 , (' Campylobacter sp. str. CLO11847' : 0 , (' Campylobacter sp. CCUG 18267' : 0 , (' Campylobacter lari str. VC187; WRI 3034/77 NCTC 11352 (T)' : 0.00451 , ' Campylobacter lari str. VC187; WRI 3034/77 CCUG 23947' : 0 ) : 0.00529 ) : 0.00152 ) : 0.00391 ) : 0.00083 , (' Campylobacter helveticus NCTC 12470 (T)' : 0.00173 , ' Campylobacter upsaliensis CCUG 14913 (T)' : 0.00913 ) : 0.01752 ) : 0.00124 , (' Campylobacter coli str. VC80; 1407 NCTC 11366 (T)' : 0.01094 , (' Campylobacter coli str. 1407 CCUG 11283 (T)' : 0 , ' Campylobacter coli str. VC80; 1407 ATCC 33559 (T)' : 0.00028 ) : 0 ) : 0.00575 ) : 0.0085 , (' Campylobacter sp.' : 0.01253 , ((' Campylobacter hyointestinalis ATCC 35217 (T)' : 0.00028 , ' Campylobacter hyointestinalis NADC 2006' : 0.00066 ) : 0.00451 , (((' Campylobacter fetus subsp. venerealis ATCC 19438 (T)' : 0 , ' Campylobacter fetus subsp. venerealis ATCC 19438 (T)' : 0 ) : 0 , (' Campylobacter fetus ATCC 27374 (T)' : 0 , ' Campylobacter fetus ATCC 27374 (T)' : 0 ) : 0.00045 ) : 0 , (' Campylobacter fetus subsp. fetus str. VC78 CIP 5396 (T)' : 0.00607 , ((' Campylobacter sp. CCUG 20705' : 0.00694 , ' Campylobacter mucosalis CCUG 6822' : 0.00494 ) : 0.00418 , ((' Campylobacter concisus str. Tanner 484 ATCC 33237 (T)' : 0.00053 , ' Campylobacter concisus FDC 288' : 0.00055 ) : 0.00783 , ((' Campylobacter curvus ATCC 35224 (T)' : 0.00653 , ' Campylobacter curvus str. C10 Etoh' : 0.00274 ) : 0.00318 , (((' Campylobacter rectus CCUG 19168' : 0.00119 , ' Campylobacter rectus str. Tanner 371 ATCC 33238 (T)' : 0.00123 ) : 0.00175 , (' Campylobacter showae CCUG 11641' : 0 , ' Campylobacter showae CCUG 3054' : 0.00025 ) : 0.00562 ) : 0.00967 , ((' Campylobacter gracilis str. WAL 6989 ATCC 33236 (T)' : 0 , ' Campylobacter gracilis str. WAL 6989 ATCC 33236 (T)' : 0 ) : 0.02667 , (' Campylobacter sputorum subsp. sputorum str. VC188' : 0.00793 , (' Campylobacter sputorum subsp. sputorum str. S17 ATCC 35980 (T)' : 0 , ' Campylobacter sputorum subsp. bubulus ATCC 33491' : 0.00059 ) : 0 ) : 0.02586 ) : 0.00695 ) : 0.00597 ) : 0.01031 ) : 0.01506 ) : 0.01202 ) : 0.00057 ) : 0.0056 ) : 0.01053 ) : 0.01076 )'CAM.FETUS' : 0.03214 ) : 0.04216 ) : 0.0397 )'CAMPYLOBACTER' : 0.02211 ) : 0.02769 ) : 0.05375 , (' clone A21n' : 0.064 , (' str. s31' : 0.05789 , ' clone G39' : 0.03177 ) : 0.06414 )'ENV.A21N' : 0.05682 )'EPSILON' : 0.00592 , ((((' Bdellovibrio stolpii str. UKi2 ATCC 27052 (T)' : 0.01604 , ' Bdellovibrio stolpii str. UKi2 ATCC 27052 (T)' : 0.00276 ) : 0.52695 , ' Bdellovibrio starrii ATCC 15145 (T)' : 0.06511 ) : 0.0149 , ' Bdellovibrio sp. str. BM-4' : 0.26365 )'BDE.STOLPII' : 0.25705 , (((' clone vadinBA07' : 0.03085 , ' clone TM6' : 0.05247 ) : 0.03658 , (' clone TM10' : 0.00092 , ' clone TM21' : 0.00609 ) : 0.06371 )'ENV.VABA07' : 0.10509 , ((((' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-16' : 2e-05 , ' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-12' : 0.0015 ) : 0.01068 , ' clone pN1-3' : 0.06555 ) : 0.01117 , ' clone WCHA2-26' : 0.55598 )'ENV.WCHA2-26' : 0.00671 , (((' clone WCHA1-16' : 0.08962 , ' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A57n' : 0.12185 ) : 0.10985 , ' clone OPS136' : 0.15187 )'ENV.OPS136' : 0.12841 , (((((' clone WCHB1-11' : 0.01478 , ' clone WCHA1-09' : 0.0179 ) : 0.00986 , ' clone P36' : 0.07584 ) : 0.00859 , ' clone WCHB1-56' : 0.0283 ) : 0.027 , (' clone LGd14' : 0.33283 , ' clone LGd17' : 0.17722 ) : 0.22471 )'ENV.WCHB1-56' : 0.04222 , ((' clone WCHA1-11' : 0.20749 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD31' : 0.51628 )'ENV.WCHA1-11' : 0.03246 , (' clone WCHB1-64' : 0.15791 , ((' clone WCHB1-07' : 0.00927 , ' clone WCHB1-26' : 0.00365 ) : 0.02915 , (' clone WCHA1-24' : 0.03419 , ' clone WCHA1-20' : 0.03521 ) : 0.0537 ) : 0.25744 )'ENV.WCHB1-07' : 0.05737 ) : 0.04258 ) : 0.13654 ) : 0.06152 ) : 0.00767 ) : 0.00421 )'BDE.STOLPII' : 0.05302 ) : 0.01563 , ((((' Desulfohalobium retbaense str. HR100 DSM 5692 (T)' : 0.01695 , ' Desulfohalobium retbaense str. HR100 DSM 5692 (T)' : 0.00023 ) : 0.06425 , ' str. TD3' : 0.07133 ) : 0.0084 , ' Desulfonatronovibrio hydrogenovorans str. Z-7935 DSM 9292 (T)' : 0.00799 )'DHB.RETBAENSE' : 0.00801 , (' Desulfonatronum lacustre str. z-7951' : 0.03498 , (((((((' Desulfomicrobium baculatum DSM 1743' : 0 , ' str. s2' : 0.00101 ) : 0.00052 , ' Desulfomicrobium norvegicum str. Norway 4 NCIMB 8310 (T)' : 0.00134 ) : 0.0007 , ' clone Aspo1' : 0.00163 ) : 0.00084 , (' Desulfomicrobium apsheronum str. 1105 DSM 5918 (T)' : 0.00499 , ' Desulfomicrobium baculatum str. Type strain X VKM B-1378 (T)' : 0.00027 ) : 0.00119 ) : 0.00026 , ' str. SBR1080' : 0.00285 ) : 0.00089 , ' Desulfomicrobium escambiense str. ESC1 ATCC 51164 (T)' : 0.00587 )'DMB.BACULATUM' : 0.028 , ((((((((((' Desulfovibrio sp. str. KRS1' : 0.00124 , ' Desulfovibrio sp. str. KRS2' : 0.00069 ) : 0 , ' Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans ATCC 27774' : 0.00104 ) : 0 , ' Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. Essex 6 (M.E. Adams) DSM 642 (T)' : 0 ) : 0 , ' Desulfovibrio fairfieldensis' : 0.01618 ) : 0.01006 , ((' clone UN6' : 0 , ' clone UN40' : 0.00195 ) : 0 , (' clone UN93' : 0 , (' clone UN59' : 0.00234 , ' clone UN50' : 0 ) : 0 ) : 0.00194 ) : 0.01993 ) : 0.00452 , ' Desulfomonas pigra ATCC 29098 (T)' : 0.01505 )'DSV.DESULFURICANS' : 0.01555 , ((((' Desulfovibrio acrylicus str. W218 DSM 10141 (T)' : 0.03142 , ' Desulfovibrio sp.' : 0.06598 ) : 0.00052 , ' Desulfovibrio sp. str. DMB' : 0.05721 ) : 0.0009 , ' Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough DSM 644 (T)' : 0.00306 ) : 0.01017 , (' Desulfovibrio sp.' : 0 , (' Desulfovibrio longreachensis str. 16910a' : 0.00061 , (' Desulfovibrio sp. str. PT-2' : 0.00157 , (' Desulfovibrio sp. str. KH2' : 0.00081 , ' Desulfovibrio termitidis' : 0.0025 ) : 0.00501 ) : 0.0051 ) : 0.00317 ) : 0.01471 )'DSV.LONGREACHENSIS' : 0.02534 ) : 0.00621 , (' Bilophila wadsworthia' : 0.02181 , ((' symbiont of Sus scrofa' : 0 , ' Desulfovibrio sp. str. MIT 87-599' : 0.00052 ) : 0 , (' Lawsonia intracellularis str. 1482/89 NCTC 12656 (T)' : 0.00046 , (' Desulfovibrio sp.' : 0 , ' symbiont of intracellular ileal symbiont of Mesocricetus auratus' : 0 ) : 0.00305 ) : 0 ) : 0.05528 )'LW.INTRACELLULARIS' : 0.01571 ) : 0.02009 , (' Desulfovibrio litoralis str. STL6 DSM 11393 (T)' : 0.03223 , ' Desulfovibrio cuneatus str. STL1 DSM 11391 (T)' : 0.02986 )'DSV.CUNEATUS' : 0.01907 ) : 0.00614 , ((' Desulfovibrio gabonensis SEBR 2840 (T)' : 0.0384 , ' Desulfovibrio gigas ATCC 19364 (T)' : 0.03911 )'DSV.GABONENSIS' : 0.00884 , (((((' str. RS-1' : 0.01556 , ' Desulfovibrio burkinensis str. HDv DSM 6830 (T)' : 0.00677 ) : 0.00489 , (' Desulfovibrio fructosovorans str. JJ DSM 3604 (T)' : 0.00916 , ' Desulfovibrio alcoholovorans str. SPSN DSM 5433 (T)' : 0.01155 ) : 0.00581 ) : 0.01258 , ' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G20' : 0.02174 ) : 0.00436 , (' Desulfovibrio africanus DSM 2603 (T)' : 0.01058 , ' Desulfovibrio africanus' : 0.00089 ) : 0.05788 )'DSV.AFRICANUS' : 0.00445 , (' Desulfovibrio aminophilus str. ALA-3' : 0.00624 , (' Desulfovibrio longus str. SEBR 2582' : 0.011 , ((' Desulfovibrio desulfuricans str. E1 Agheila Z NCIMB 8380' : 0.03945 , ' Desulfovibrio senezii str. CVL DSM 8436 (T)' : 0.0302 )'DSV.SENEZII' : 0.01465 , ((((' clone Aspo3' : 0 , ' str. s8' : 0 ) : 0.00786 , ' Desulfovibrio sp.' : 0.00891 ) : 0.00422 , (' Desulfovibrio zosterae str. lac' : 0.00703 , ' Desulfovibrio salexigens ATCC 14822 (T)' : 0.01183 ) : 0.01494 )'DSV.ZOSTERAE' : 0.00931 , ((((' Desulfovibrio halophilus DSM 5663 (T)' : 0 , ' Desulfovibrio halophilus DSM 5663 (T)' : 0.00126 ) : 0 , ' Desulfovibrio sp. str. Solar Lake' : 0.00538 ) : 0.00182 , ' Desulfovibrio sp. str. PIB' : 0.00194 ) : 0.01594 , (' Desulfovibrio profundus str. 500-1 DSM 11384 (T)' : 0.0055 , (((' Desulfovibrio aespoeensis' : 0.00086 , ' str. s21' : 0.00382 ) : 0.00383 , ' str. s5' : 0.0018 ) : 0.00457 , (' Desulfovibrio sp.' : 0.00428 , (' clone A10h' : 0 , (' clone A7hq' : 0 , (' clone A9h' : 0 , (' clone A6hq' : 0.00155 , ' clone A8h' : 0 ) : 0.00162 ) : 0.00157 ) : 0.03672 ) : 0.01131 ) : 0.00522 ) : 0.02071 ) : 0.03128 )'DSV.HALOPHILUS' : 0.01594 ) : 0.01078 ) : 0.04886 ) : 0.03436 ) : 0.0142 ) : 0.01874 ) : 0.02531 )'DESULFOVIBRIO' : 0.033 ) : 0.00908 ) : 0.01305 )'DESULFOVIBRIO' : 0.02276 ) : 0.00302 , (' Desulfurella acetivorans DSM 5264' : 0 , (' Desulfurella multipotens str. RH-8 DSM 8415 (T)' : 0 , (' Desulfurella kamchatkensis str. K-119 DSM 10409 (T)' : 0.00201 , ' Desulfurella propionica str. U-8 DSM 10410 (T)' : 0.00156 ) : 0.00049 ) : 0.00315 )'DSR.ACETIVORANS' : 0.15824 ) : 0.00669 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE17' : 0.14033 ) : 0.00183 , ((((' clone A36' : 0.00243 , ' clone A30' : 0.00973 ) : 0.00046 , ' clone A33' : 0.01054 ) : 0.03319 , ' clone A1' : 0.02535 )'ENV.A33' : 0.02957 , ((((((((' Melittangium lichenicola ATCC 25946' : 0.00023 , ' Myxococcus coralloides str. M2 ATCC 25202 (T)' : 0.00028 ) : 0.00694 , ' Myxococcus xanthus str. DK1622' : 0.00987 ) : 0.00288 , (' Cystobacter fuscus ATCC 25194 (T)' : 0.00272 , (' Archangium gephyra ATCC 25201 (T)' : 0.0023 , ' Angiococcus disciformis ATCC 33172 (T)' : 0.00271 ) : 0.00737 ) : 0.00381 ) : 0.00548 , ' Stigmatella aurantiaca ATCC 25190 (T)' : 0.01016 ) : 0.0822 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD3' : 0.04686 )'MYX.XANTHUS' : 0.03241 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD34' : 0.09011 ) : 0 , (' Nannocystis exedens str. Na e1 ATCC 25963 (T)' : 0.01428 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD12' : 0.00398 , ((' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_46' : 0.10122 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE4' : 0.07278 ) : 0.01839 , ((' Chondromyces crocatus str. Cm c6' : 0.00525 , ' Chondromyces apiculatus str. Cm a2' : 0.01368 ) : 0.00427 , (' Polyangium sp. str. Pl 4943' : 0.01279 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 114' : 0.00112 , ' Polyangium cellulosum subsp. ferrugineum str. SMP 456 ATCC 25531' : 0.0352 ) : 0.01817 ) : 0.00608 ) : 0.02829 ) : 0.03561 ) : 0.12987 )'POL.CELLULOSUM' : 0.02512 )'MYXOBACTERIA' : 0.01045 , (((((((' Pelobacter acetylenicus str. WoAcyl DSM 2348' : 0.00628 , ' Pelobacter venetianus DSM 2394 (T)' : 0.00431 ) : 0.00293 , (' Desulfuromonas acetexigens DSM 1397 (T)' : 0.01712 , ' Desulfuromonas palmitatis str. SDBY1 ATCC 51701' : 0.01669 ) : 0.00593 ) : 0.01056 , (' Pelobacter carbinolicus str. GraBd1 DSM 2380 (T)' : 0 , ' Pelobacter carbinolicus str. GraBd1 DSM 2380 (T)' : 0.00082 ) : 0.00325 ) : 0.02413 , ((' Pelobacter acidigallici str. MaGa12 DSM 2377 (T)' : 0.0145 , ' Malonomonas rubra str. GraMal1 DSM 5091 (T)' : 0.01156 ) : 0.00694 , (' Desulfuromusa kysingii str. Kysw2 DSM 7343 (T)' : 0.00169 , (' Desulfuromusa succinoxidans str. Gylac DSM 8270 (T)' : 0.00561 , ' Desulfuromusa bakii str. Gyprop DSM 7345 (T)' : 0.00204 ) : 0.00114 ) : 0.01217 ) : 0.003 )'PEB.ACETYLENICUS' : 0.0116 , (' Desulfuromonas thiophila str. NZ27 DSMZ 8987 (T)' : 0.0177 , ' Desulfuromonas acetoxidans str. 11070 DSM 684 (T)' : 0.00963 )'DSM.ACETOXIDANS' : 0.00722 ) : 0.00527 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD48' : 0.01792 , (((' Geobacter "hydrogenophilus"' : 0.00361 , ' Geobacter metallireducens str. GS-15 ATCC 53774 (T)' : 0.00134 ) : 0.01119 , ' Geobacter sulfurreducens str. PCA ATCC 51573 (T)' : 0.01544 ) : 0.00822 , (' Desulfuromonas sp.' : 0.0163 , (' Geobacter "chapelleii" str. 172' : 0.00881 , ' Pelobacter propionicus str. OttBd1 DSM 2379 (T)' : 0.00672 ) : 0.00713 ) : 0.01008 )'GBC.METALLIREDUCENS' : 0.0044 ) : 0.0061 )'DESULFUROMONAS' : 0.00404 , (((((((((' Bdellovibrio bacteriovorus str. 109J' : 0.0022 , ' Bdellovibrio bacteriovorus str. 109D' : 0.00179 ) : 0.00252 , ' Bdellovibrio sp. str. W ATCC 27047' : 0.04595 ) : 0.00272 , ' Bdellovibrio bacteriovorus str. 109 ATCC 15143' : 0.02741 ) : 0 , ' Bdellovibrio bacteriovorus str. 114 ATCC 15632' : 0.00991 ) : 0.0018 , (' Bdellovibrio bacteriovorus str. 6-5-S' : 0.00123 , (' Bdellovibrio bacteriovorus str. H-I 0x9-2 ATCC 25630' : 0.00162 , ' Bdellovibrio bacteriovorus str. H-I 0x9-3 ATCC 25631' : 0.00173 ) : 0.00515 ) : 0.00294 ) : 0 , ' Bdellovibrio bacteriovorus str. HD 100 ATCC 15356 (T)' : 0.00764 ) : 0 , ' Bdellovibrio bacteriovorus str. 109J ATCC 43826' : 0.0058 ) : 0.07406 , ' str. SBR1113' : 0.06227 )'BDE.BACTERIOVORUS' : 0.07155 , ((' clone A48u' : 0.01012 , ' clone A38t' : 0.23866 )'ENV.A38T' : 0.01708 , (((((((((((' Syntrophobacter wolinii' : 0 , ' Syntrophobacter wolinii' : 0.00135 ) : 0.00224 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD11' : 0.02872 ) : 0.01035 , ' Syntrophobacter fumaroxidans str. MPOB DSM 10017 (T)' : 0.01805 ) : 0.00217 , ' Syntrophobacter pfennigii str. KOPROP1 DSM 10092 (T)' : 0.01162 ) : 0.00289 , ' Desulforhabdus amnigenus str. ASRB1' : 0.02957 ) : 0.01802 , (' Desulfacinum infernum str. BalphaG1 ACM 3991 (T)' : 0.02933 , ' Thermodesulforhabdus norvegicus str. A8444' : 0.0717 ) : 0.02126 ) : 0.03839 , ' Desulfovibrio baarsii str. 2st14, Konstanz DSM 2075 (T)' : 0.07363 ) : 0.00505 , (' clone A52p' : 0.05623 , ' Desulfobacca acetoxidans str. ASRB2' : 0.05191 ) : 0.0259 ) : 0.01228 , (' clone G27' : 0.00708 , ' Desulfomonile tiedjei str. DCB-1 ATCC 49306 (T)' : 0.0043 ) : 0.04355 ) : 0.00129 , ' unnamed organism' : 0.06413 )'DESULFOBULBUS' : 0.00136 , (((((((((' Desulfobulbus propionicus str. 1 pr 3, Lindhorst ATCC 33891 (T)' : 0 , ' Desulfobulbus elongatus str. FP DSM 2908 (T)' : 0.01385 ) : 0 , ' Desulfobulbus rhabdoformis str. M16 DSM 8777 (T)' : 0.0193 ) : 0 , ' Desulfobulbus sp. str. 3pr10 DSM 2058' : 0.07891 ) : 0 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD60' : 0.05135 ) : 0.02939 , ' clone A16jk' : 0.09361 ) : 0.0029 , (' Desulfocapsa thiozymogenes str. Bra2 DSM 7269 (T)' : 0.00522 , ((' Desulforhopalus vacuolatus str. ltk10' : 0.00623 , ' Desulfobulbus sp.' : 0.0091 ) : 0.01362 , (' Desulfobulbus sp.' : 0.02693 , ' Desulfofustis glycolicus str. PerGlyS' : 0.00419 ) : 0.0346 ) : 0.03211 ) : 0.01416 ) : 0.01139 , ' clone A35' : 0.13014 ) : 0.00896 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD15' : 0.02675 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD9' : 0.00929 ) : 0.05732 )'DBB.PROPIONICUS' : 0.00667 , ((((' Smithella propionica str. LYP' : 0.02409 , ' clone A17o' : 0.18387 ) : 0 , (' Syntrophus buswellii str. DM-3 DSM 02612 (T)' : 0.0103 , ' Syntrophus gentianae str. HQGoe1 DSM 8423 (T)' : 0.00631 ) : 0.01528 ) : 0.00395 , ' clone G30' : 0.00968 )'SYNTROPHUS' : 0.02048 , (((((((((' Desulfococcus multivorans str. 1 be 1, Goettingen ATCC 33890 (T)' : 0.00655 , ' clone JAP552' : 0.11543 ) : 0.0128 , ' Desulfonema limicola str. Jadebusen DSM 2076 (T)' : 0.03485 ) : 0.0072 , ' Desulfovibrio sapovorans str. 1pa3, Lindhorst ATCC 33892 (T)' : 0.07673 ) : 0.00631 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD42' : 0.01687 , ' Desulfonema magnum str. Montpellier DSM 2077 (T)' : 0.05424 ) : 0.0084 ) : 0.00576 , ((' iron sulfide containing magnetotactic bacterium clone MMP1991' : 0 , ' iron sulfide containing magnetotactic bacterium clone MMP1990' : 0.00128 ) : 0.02586 , (' clone A34' : 0.0108 , ' clone A52' : 0.01058 ) : 0.02897 ) : 0.01747 )'DSF.LIMICOLA' : 0.00305 , (' Desulfosarcina variabilis str. 3 be 13, Montpellier DSM 2060 (T)' : 0.00012 , ' Desulfosarcina variabilis str. 3 be 13, Montpellier DSM 2060 (T)' : 0.00147 )'DSS.VARIABILIS' : 0.10375 ) : 0.02914 , ' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G24' : 0.02185 ) : 0.10795 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD25' : 0.06512 ) : 0.00502 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD40' : 0.00842 , (((' Desulfobacterium vacuolatum DSM 3385' : 0.00755 , ' Desulfobacterium niacini DSM 2650' : 0.00983 ) : 0.01307 , ' Desulfobacterium autotrophicum DSM 3382 (T)' : 0.02758 )'DBM.VACUOLATUM' : 0.0178 , (((' Desulfospira joergensenii str. B331 DSM 10085 (T)' : 0.01255 , ' str. s4' : 0.00806 ) : 0.00369 , ' Desulfobacula toluolica str. Tol2 DSM 7467' : 0.02189 ) : 0.00392 , (' Desulfobacter sp.' : 0.03273 , (' Desulfobacter postgatei str. 2 ac 9 DSM 2034 (T)' : 0.003 , (' Desulfobacter curvatus str. AcRM3 DSM 3379 (T)' : 0.01606 , (' Desulfobacter sp. str. 3ac10 DSM 2035' : 0.00616 , ((' Desulfobacter sp. str. 4ac11 DSM 2057' : 0.00552 , ' Desulfobacter latus str. AcRS2 DSM 3381 (T)' : 0.00355 ) : 0.00265 , (' Desulfobacter vibrioformis str. B54 DSMZ 8776 (T)' : 0.0071 , ' Desulfobacter hydrogenophilus str. AcRS1 DSM 3380 (T)' : 0.00674 ) : 0.00289 ) : 0.00383 ) : 0.00322 ) : 0.0052 ) : 0.01302 ) : 0.00854 )'DSB.POSTGATEI' : 0.03244 ) : 0.18644 ) : 0.06519 )'DESULFOBACTER' : 0.02948 ) : 0.01851 ) : 0.02677 ) : 0 ) : 0.01691 ) : 0.02164 ) : 0.02649 ) : 0.01291 ) : 0.00311 )'DELTA_AND_EPSILON' : 0.00546 , (((((((((' uncultured magnetotactic bacterium clone Cs310' : 0.00848 , ' clone CS981' : 0.01042 ) : 0.03265 , ' clone CS93' : 0.05419 ) : 0.00994 , (' uncultured magnetotactic bacterium clone Cs103' : 0.02482 , ' clone TB12' : 0.00966 ) : 0.01843 ) : 0.0074 , ((' clone TB24' : 0.01277 , ' clone MP17' : 0.00899 ) : 0.0018 , (' clone CS106' : 0.00721 , ' uncultured magnetotactic bacterium clone Cs308' : 0.00173 ) : 0.00538 ) : 0.01858 ) : 0.00469 , (' clone CS408' : 0.00394 , ' clone CS105' : 0.00969 ) : 0.01551 ) : 0.00897 , ' str. magnetotactic isolate MC-1 (DeLong)' : 0.0636 ) : 0.01515 , ' clone PLY16' : 0.11302 ) : 0.01764 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_13' : 0.17215 )'UNCULTURED_MAGNETOTACTIC_CLONES' : 0.01917 , ((((((((((((((((((((((((((((((((((((' Rhizobium gallicum str. R602sp' : 0.00081 , ' Rhizobium gallicum str. R602sp' : 0.00388 ) : 0.00043 , ' Rhizobium sp. str. Sh19351.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0.00027 , ' Rhizobium sp. str. NM095.Rhizobium isolate' : 0 ) : 5e-05 , ' Rhizobium etli str. CFN-244' : 0.00319 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum str. FL 27' : 5e-05 ) : 2e-05 , (' Rhizobium sp. str. R602' : 0.00187 , ' Rhizobium mongolense USDA 1844 (T)' : 0.00263 ) : 0.00187 ) : 0.00588 , ' Rhizobium sp. str. OK-50' : 0.01005 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum IAM 12609 (T)' : 0.00615 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum IAM 12609 (T)' : 0.00065 ) : 0 , (' Rhizobium sp. str. 2223,Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium leguminosarum str. Olivia 4' : 0 , ' Rhizobium leguminosarum str. 162Y13' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00058 , ((' Rhizobium etli str. TAL 182 USDA 9041' : 0.00025 , ' Rhizobium etli str. CFN-265' : 0.00321 ) : 0.00025 , (' Rhizobium etli CFN 42 (T)' : 0 , (' Rhizobium leguminosarum' : 0 , (' Rhizobium etli str. CLI-80' : 0 , ' Rhizobium leguminosarum str. Or191' : 0 ) : 0.0017 ) : 0.00661 ) : 0.00356 ) : 0 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum str. type 1 LMG 8819' : 0.00277 ) : 0.00822 , ' str. SBR1005' : 0 )'RHB.LEGU11' : 0.0078 , ((((' str. L-85' : 0 , ' str. E-43' : 0.01521 ) : 0.00257 , ' str. EE-34' : 0.01476 ) : 0 , ' Rhizobium sp. str. RCR 3618D USDA 2947' : 0.09029 )'RHB.SP3618' : 0.00085 , (((((((' Rhizobium leguminosarum str. RCR 3644 USDA 2671' : 0.00102 , ' Rhizobium leguminosarum USDA 2370 (T)' : 0.00153 ) : 0.00541 , ' Rhizobium leguminosarum' : 0.00717 ) : 9e-05 , ' Rhizobium sp. str. ciam1125.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum str. 162K10' : 2e-05 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum' : 0.00105 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum LMG 8820 (alpha purple bacterium)' : 0.00421 ) : 0 , (((' Rhizobium leguminosarum str. 162K13' : 0 , ' Rhizobium leguminosarum ATCC 8002' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum str. 162Y10' : 0 ) : 0 , (' Rhizobium sp. str. 2370.Rhizobium isolate' : 0 , ((' Rhizobium sp. str. 2235.Rhizobium isolate' : 0 , ' Rhizobium sp. str. 2m16+4.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0 , (' Rhizobium sp. str. 2163.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 2061.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. ciam1146.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 2386.Rhizobium isolate' : 0 , ' Rhizobium sp. str. 7104.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 )'RHB.LEGU13' : 0.0108 ) : 0 )'RHB.LEGUMINOSARUM' : 0.0077 , ((' Agrobacterium rhizogenes IAM 13570' : 0 , ' Agrobacterium rhizogenes LMG 152' : 0 ) : 0 , ((' Agrobacterium rhizogenes IFO 13257 (T)' : 0 , ' Agrobacterium tumefaciens str. Ch-Ag-4' : 0.00034 ) : 0.00026 , (' Rhizobium sp. str. (Leucaena) TAL 1145' : 0.00347 , (' Rhizobium sp. str. BR 8802 LMG 10020' : 0.0004 , ((((((' Rhizobium tropici str. IIA USDA 9039' : 0 , ' Rhizobium tropici str. IIA USDA 2840' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium leguminosarum' : 0.00271 ) : 0 , ' Rhizobium tropici LMG 10336' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium tropici str. IIA LMG 9517' : 0 ) : 0.00026 , ' Rhizobium sp. LMG 9509' : 0.00466 ) : 0.00046 , (((' Rhizobium tropici CIAT 899 (T)' : 0.00698 , ' Rhizobium tropici CIAT 899 (T)' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium tropici' : 0 ) : 0 , ((' Agrobacterium tumefaciens str. K-Ag-3' : 0.00047 , ' Rhizobium tropici IFO 15247 (T)' : 0.00151 ) : 0 , (' Rhizobium tropici LMG 9503 (T)' : 0 , (' Rhizobium tropici IAM 14206' : 0 , ' Rhizobium leguminosarum str. C-O5 LMG 9518' : 0 ) : 0 ) : 0.00098 ) : 0.00131 ) : 0.00312 ) : 0.0026 ) : 0 ) : 0.00067 ) : 0.00032 )'RHB.TROPICI' : 0.00384 ) : 0.00037 , ' Rhizobium hainanense str. I66 CCBAU 57015 (T)' : 0.02119 ) : 0 , ' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1492' : 0.00083 ) : 2e-05 , (((' Devosia riboflavina str. Foster 4R3337 IFO 13584 (T)' : 0.02799 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE11' : 0.21322 ) : 0.00798 , ' clone pCON19' : 0.03427 )'DV.RIBOFLAVINA' : 0.00619 , ((' Liberobacter sp. str. Poona' : 0.00212 , ' Liberobacter sp. str. Nelspruit' : 0.01073 )'LIB.SP' : 0.00819 , ((((((' Azospirillum sp. str. A1-3 DSM 1726' : 0 , ' Agrobacterium tumefaciens NCPPB 2437 (T)' : 0.00055 ) : 0 , ' Agrobacterium tumefaciens IAM 13129' : 0 ) : 0 , (' Agrobacterium tumefaciens str. C-58' : 0 , ' Rhizobium sp. str. JL103.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0 ) : 0.00184 , (' Agrobacterium tumefaciens ATCC 4720 (alpha purple bacterium)' : 0 , (' Agrobacterium tumefaciens str. ICPB TT111 LMG 196' : 0 , ' Agrobacterium tumefaciens IAM 14141' : 0 ) : 0.00045 ) : 0.00239 ) : 0.00034 , ((' Agrobacterium rubi IAM 13569 (T)' : 0 , ' Agrobacterium rubi LMG 156 (T)' : 0 ) : 1e-05 , (' Agrobacterium rubi IFO 13261 (T)' : 0 , (' Agrobacterium sp. str. AF3.10' : 0 , (' Agrobacterium tumefaciens str. IAM 13558' : 0 , ' Agrobacterium tumefaciens NCPPB 1650' : 0 ) : 0.01395 ) : 0.0023 ) : 0.02352 ) : 0.00651 )'AG.TUMEFACIENS' : 0.01049 , (((((((' Agrobacterium vitis LMG 8750 (T)' : 0.00094 , ' Agrobacterium vitis str. K309 NCPPB 3554 (T)' : 0 ) : 0 , ' Agrobacterium vitis str. S4' : 0.00044 ) : 0 , ' Agrobacterium vitis IAM 14140 (T)' : 0 ) : 0.00038 , ' Agrobacterium vitis str. K309 NCPPB 3554 (T)' : 0.00156 ) : 0.0064 , ' str. B279' : 0.02376 ) : 0.0054 , ' Allorhizobium undicola LMG 11875 (T)' : 0.03494 ) : 0.00369 , (' Rhizobium sp. str. ciam540.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium galegae str. gal 1261 HAMBI 540 (T)' : 0 , ((' Rhizobium galegae IAM 13631' : 0 , ' Rhizobium galegae str. gal 1261 LMG 6214 (T)' : 0.00049 ) : 0.0006 , (' Rhizobium galegae str. gal 1261 ATCC 43677 (T)' : 0.0005 , (' Rhizobium huautlense str. S02' : 0 , ((' Rhizobium sp. str. 113' : 0.01012 , ' Rhizobium sp. str. ciam1141.Rhizobium isolate' : 0.00689 ) : 0.00217 , (' Rhizobium sp. str. ciam4540.Rhizobium isolate' : 0.00073 , (' Rhizobium sp. str. SIN1' : 9e-05 , (' Rhizobium sp. str. ciam490.Rhizobium isolate' : 0.00065 , (' Rhizobium sp. str. 3394.Rhizobium isolate' : 0.00202 , ' Rhizobium sp. str. OK-55' : 0 ) : 0 ) : 0.00221 ) : 0.00223 ) : 0.00355 ) : 0.00058 ) : 0.00136 ) : 0.00252 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00913 )'AG.VITIS' : 0.01237 ) : 0.08904 ) : 0.00652 )'AGROBACTERIUM' : 0.00683 ) : 0.00266 , (((' Rhizobium giardinii str. H152' : 0 , ' Rhizobium sp. str. H152' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium sp. str. H152' : 0.0031 ) : 0 , (' clone JN15d' : 0.0138 , (' Blastobacter capsulatus ATCC 43294 (T)' : 0 , (' str. B0710' : 0 , ' Blastobacter aggregatus ATCC 43293 (T)' : 0.00644 ) : 0.02751 ) : 0.01698 ) : 0.0146 )'BLB.CAPSULATUS' : 0.00285 ) : 0.01216 , ((((' Sinorhizobium terangae LMG 7834 (T)' : 0 , ' Sinorhizobium teranga LMG 6463' : 0 ) : 0.00173 , ' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1392' : 0 ) : 0 , ' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1698' : 0.00173 ) : 0 , (' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1395' : 0 , (' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1551' : 0 , (' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1393' : 0 , (((' Sinorhizobium saheli LMG 8310' : 0 , ' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1496' : 0 ) : 0.00064 , ' Sinorhizobium saheli LMG 7837 (T)' : 0.00079 ) : 0.00124 , (' Sinorhizobium fredii LMG 6217 (T)' : 0 , ((((' Sinorhizobium xinjiangensis IAM 14142' : 0 , ' Sinorhizobium fredii ATCC 35423 (T)' : 0 ) : 0 , ' Sinorhizobium fredii ATCC 35423 (T)' : 0 ) : 0 , ' Sinorhizobium fredii IAM 13625' : 0.02392 ) : 0 , (' Sinorhizobium meliloti IAM 12611' : 0.00041 , (' Sinorhizobium meliloti str. 3DOa2 ATCC 9930 (T)' : 0 , (' Sinorhizobium meliloti LMG 6133 (T)' : 0 , (' Sinorhizobium meliloti CC 2013' : 0 , (' Rhizobium sp. str. cc2155b.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 1115.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 1177.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 1970.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 1088.Rhizobium isolate' : 0 , (' Sinorhizobium meliloti str. 3DOa2 ATCC 9930 (T)' : 0 , (' Sinorhizobium meliloti NZP 4017' : 0 , (' Sinorhizobium fredii USDA 205 (T)' : 0 , (' Rhizobium tropici str. BR-816' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 1968.Rhizobium isolate' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 1079.Rhizobium isolate' : 0 , (((' Rhizobium sp. str. JL084.Rhizobium isolate' : 0 , ' Sinorhizobium meliloti CC 169' : 0 ) : 0 , ' Sinorhizobium sp. str. HAMBI 1624' : 0.00478 ) : 2e-05 , (' Rhizobium sp. str. 1079.Rhizobium isolate' : 0 , (' Sinorhizobium meliloti IAM 12611' : 0.0002 , (' Rhizobium sp. str. cc2160.Rhizobium isolate' : 0.00629 , (' Rhizobium sp. str. 1114.Rhizobium isolate' : 0.00632 , ' Rhizobium sp. str. 1083.Rhizobium isolate' : 0.00298 ) : 0.00892 ) : 0.00307 ) : 0.00015 ) : 0.0033 ) : 0.01031 ) : 0 ) : 0.01186 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.01365 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00106 ) : 0.00125 ) : 0.00602 ) : 0 ) : 0.0036 ) : 0.00018 ) : 0.0005 ) : 0.00038 ) : 0.00076 )'SRH.FREDII' : 0.00103 ) : 0.00583 , (((' Bartonella bacilliformis ATCC 35685' : 0.00193 , ' Bartonella bacilliformis ATCC 35685' : 0.00097 ) : 0.00098 , ' Bartonella bacilliformis NCTC 12138 (T)' : 0.00443 ) : 0.00387 , ((' Bartonella elizabethae str. F9251; B91-002005 ATCC 49927 (T)' : 0.00064 , ' Bartonella tribocorum str. IBS 506 CIP 105476 (T)' : 0.00319 ) : 0.00134 , (((' Bartonella quintana str. Fuller ATCC VR-358 (T)' : 0.00087 , ' Bartonella quintana' : 0 ) : 0 , ' Bartonella quintana str. Fuller ATCC VR-358 (T)' : 0 ) : 0.00445 , ((((' Bartonella clarridgeiae str. Houston-2 cat ATCC 51734 (T)' : 0.0017 , ' Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii' : 0 ) : 0.0053 , ' Bartonella alsatica str. 382 CIP 105477 (T)' : 0.00698 ) : 0.00033 , (' Bartonella bacilliformis ATCC 35685' : 0.00289 , ' Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii str. 93-C01 ATCC 51672 (T)' : 0 ) : 0.00545 ) : 0.00096 , (' Bartonella taylorii str. M6 NCTC 12861 (T)' : 0.00043 , (' Bartonella grahamii str. V2 NCTC 12860 (T)' : 0.00113 , (' Bartonella vinsonii subsp. vinsonii str. Baker ATCC VR-152 (T)' : 0 , (' Bartonella vinsonii subsp. vinsonii str. Baker ATCC VR-152 (T)' : 0 , (' Bartonella vinsonii subsp. vinsonii str. Baker ATCC VR-152 (T)' : 0.00049 , (' Bartonella doshiae str. R18 NCTC 12862 (T)' : 0.00049 , (' Wolbachia melophagi str. MO6' : 0.00173 , (' Bartonella henselae str. Houston-1' : 0 , (' Bartonella henselae str. BA-TF' : 0 , ' Bartonella henselae str. BA-TF' : 0 ) : 0 ) : 0.01168 ) : 0.00149 ) : 0.00175 ) : 0.00117 ) : 0 ) : 0.00121 ) : 0.00236 ) : 0.00329 ) : 0.00498 ) : 0.00554 ) : 0.00495 )'BARTONELLA' : 0.01878 ) : 0.33335 , (' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-2A' : 3e-05 , (' Duganella zoogloeoides ATCC 19623' : 0 , (' str. SBR2101' : 0 , ' Duganella zoogloeoides IAM 12669' : 0 ) : 0 ) : 0.39279 )'DG.ZOOGLOEOIDES_I' : 0 ) : 0.00295 , (' Mycoplana dimorpha IAM 13154' : 0.00571 , (' Mycoplana ramosa str. IAM 13949' : 0.00377 , ((((' Ochrobactrum anthropi IFO 13694' : 0 , ' Ochrobactrum sp. IFO 12950' : 0.01323 ) : 0 , ' Solomonas fluorantheni' : 0.01211 ) : 0.00052 , (' clone SMK6' : 0.00077 , ' Ochrobactrum anthropi IAM 14119' : 0.24658 ) : 0.00077 ) : 0.00306 , (' Ochrobactrum intermedium str. CNS 2-75 LMG 3301 (T)' : 0.00461 , (' clone pCON47' : 0 , (' Brucella melitensis str. 11/19' : 0 , ((' Brucella melitensis ATCC 23444 (T)' : 0 , ' Brucella melitensis ATCC 23459 (T)' : 0.00159 ) : 0 , (' Brucella melitensis ATCC 25840 (T)' : 0.00052 , (' Brucella melitensis ATCC 23456 (T)' : 0 , ' Brucella melitensis' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00579 ) : 0.01438 ) : 0.00762 ) : 0.00667 ) : 0.00733 ) : 0.00729 )'BRUCELLA_ASSEMBLAGE' : 0.00085 ) : 0.01225 , ' Mesorhizobium tianshanense str. A-1BS DSM 11417 (T)' : 0.00362 ) : 0.0083 , (((((((((((' Rhizobium sp. str. 3353.Rhizobium isolate' : 0 , ' Rhizobium sp. str. 3143.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium sp. str. 3357.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0 , ' Mesorhizobium huakuii CCBAU 2609 (T)' : 0 ) : 0 , ' str. SBR2108' : 0 ) : 0 , (' Mesorhizobium plurifarium LMG 7836' : 0 , ' Rhizobium sp. LMG 7854' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Mesorhizobium plurifarium str. ORS 1032 LMG 11892 (T)' : 0.00249 ) : 0.00226 , ' Mesorhizobium amorphae ACCC 19665 (T)' : 0.00303 ) : 0.00042 , (' Mesorhizobium huakuii IFO 15243' : 0.00177 , (' Mesorhizobium loti IAM 13588' : 0 , ' Mesorhizobium huakuii IAM 14158 (T)' : 0.00142 ) : 0 ) : 0.00045 ) : 0 , ' str. E-42' : 0 ) : 0 , ' Rhizobium sp. str. ciam2209.Rhizobium isolate' : 0.00046 )'MSU.HUAKUII_SUBGROUP' : 0.00022 , (' Mesorhizobium tianshanense str. A-1BS CCBAU 3306 (T)' : 0 , (' Rhizobium sp. str. 3620.Rhizobium isolate' : 0 , (' Mesorhizobium mediterraneum str. UPM-Ca36' : 0.00058 , (' Mesorhizobium tianshanense str. A-1BS USDA 3592' : 0.00308 , (' Rhizobium sp. str. ciam0218.Rhizobium isolate' : 0.00313 , (' Mesorhizobium loti NZP 2213 (T)' : 0 , (((((' Rhizobium sp. str. TAL1148' : 0.00479 , ' Mesorhizobium loti ATCC 33669 (T)' : 0.00147 ) : 0.00097 , ' Mesorhizobium loti LMG 6125 (T)' : 0 ) : 0.00031 , ' Rhizobium sp. str. 3854.Rhizobium isolate' : 0 ) : 0.00024 , (' Mesorhizobium loti str. 3F6g2 LMG 4284' : 0.00104 , ' Mesorhizobium ciceri str. UPM-Ca7 ATCC 51585 (T)' : 0.00032 ) : 0.00031 ) : 0.00022 , ((' Rhizobium sp. str. ciam1416.Rhizobium isolate' : 0 , ' Rhizobium sp. str. 2026.Rhizobium isolate' : 0.01275 ) : 0 , ((((' Aminobacter aganoensis str. TH-3 DSM 7051 (T)' : 0 , ' Aminobacter niigataensis str. DM-81 DSM 7050 (T)' : 0 ) : 0.00054 , ' Aminobacter aminovorans str. TK3001 DSM 7048 (T)' : 0.0009 ) : 0.00185 , ' str. ER2' : 0.0127 ) : 0.00339 , ((' Pseudaminobacter defluvii str. THI051' : 0.00415 , ' Pseudaminobacter salicylatoxidans str. BN12' : 0.01677 ) : 0.00289 , (' clone pCON7' : 0.00414 , ((' Ahrensia kielensis IAM 12618 (T)' : 0 , ' clone SMK271' : 0.19333 ) : 0.0052 , (' Phyllobacterium myrsinacearum IAM 13584' : 0.00094 , ' Phyllobacterium rubiacearum IAM 13587' : 0 ) : 0.0694 ) : 0.08688 ) : 0.00983 ) : 0.00828 ) : 0.00155 ) : 0.00502 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00492 ) : 0.00235 ) : 0 ) : 0 )'MSO.LOTI_SUBGROUP' : 0.00219 ) : 0.0014 ) : 0.02023 , (' Caulobacter vibrioides str. CB13' : 0 , ' Caulobacter vibrioides str. CB15' : 0 )'CAU.VIBRIOIDES_I' : 0.00195 ) : 0.01451 , (((' Rhodopseudomonas sp. str. CP-B-3' : 0 , ' Rhodopseudomonas sp. str. CP-B-2' : 0 ) : 0.07549 , ' Rhodobium orientis str. MB312 JCM 9337 (T)' : 0.00045 ) : 0.01929 , (' clone JAP553' : 0.14429 , (' Rhodopseudomonas marina subsp. agilis str. GN-14' : 0.00023 , (' Rhodobium marinum NCIMB 2201 (T)' : 0 , (' Rhodopseudomonas sp. str. H. Gest HG/JF ATCC 35601' : 0 , ' Rhodobium marinum DSM 2698 (T)' : 0 ) : 0.00056 ) : 0.00925 ) : 0.03887 ) : 0.06781 )'RDB.MARINUM' : 0.00245 ) : 0.00411 , (' Stappia stellulata IAM 12621 (T)' : 0.06184 , ((((((((((' Hyphomicrobium facile subsp. tolerans IFAM I-551 (T)' : 0 , ' Hyphomicrobium facile subsp. ureaphilum IFAM CO-582 (T)' : 0 ) : 0.00039 , ' Hyphomicrobium facile subsp. facile IFAM H-526 (T)' : 0.00063 ) : 0 , ' clone 4911' : 1.79694 ) : 0.00356 , (' str. SBR1100' : 0.00534 , ' Hyphomicrobium methylovorum str. KM-146 DSM 5458 (T)' : 0.02352 ) : 0.0008 ) : 0.00613 , ' Hyphomicrobium denitrificans str. X DSM 1869 (T)' : 0.00466 ) : 0.00748 , (' Pedomicrobium manganicum ACM 3038 (T)' : 0.01015 , (' Pedomicrobium ferrugineum ACM 3037 (T)' : 0.0026 , (' Pedomicrobium australicum IFAM ST-1306 (T)' : 0.0029 , ' Pedomicrobium americanum ACM 3090 (T)' : 0.00051 ) : 0.00351 ) : 0.01612 ) : 0.04621 )'HYP.DENITRIFICANS' : 0.00688 , (' Hyphomicrobium hollandicum IFAM KB-677 (T)' : 0.00822 , (' Hyphomicrobium vulgare str. MC-750 ATCC 27500' : 0.00521 , (' Hyphomicrobium zavarzinii IFAM ZV-622 (T)' : 0.00503 , ' str. US-353' : 0.00032 ) : 0.01943 ) : 0.00529 )'HYP.ZAVARZINII' : 0.01297 ) : 0.00633 , (' str. SBR1098' : 0.00215 , ' str. SBR2054' : 0.00746 ) : 0.07001 ) : 0.00736 , ' str. EE-12' : 0.02358 ) : 0.00218 , (' Rhodomicrobium vannielii str. EY33 ATCC 51194' : 0.05736 , (' Methylopila capsulata str. IM1 VKM B-1606 (T)' : 0.0581 , (((((((((((((((' Azorhizobium caulinodans str. MAR 1568 ORS 571 (T)' : 0.0014 , ' Azorhizobium caulinodans str. MAR 1568 ORS 571 (T)' : 0 ) : 0 , ' Azorhizobium caulinodans str. MAR 1568 ORS 571 (T)' : 0 ) : 0 , ' Azorhizobium caulinodans str. MAR 1568 LMG 6465 (T)' : 0.00055 ) : 0 , ' Azorhizobium caulinodans' : 0 ) : 0 , ' Azorhizobium caulinodans str. MAR 1568 ORS 571 (T)' : 0 ) : 0.00458 , ' Xanthobacter flavus str. 301' : 0.00665 ) : 0.00276 , ' Xanthobacter agilis str. SA35' : 0.00933 ) : 0.00245 , (' Xanthobacter tagetidis str. TagT2C' : 0.00228 , (' Aquabacter spiritensis str. SPL-1 ATCC 43981 (T)' : 0.00578 , ' Xanthobacter autotrophicus str. 7c (T)' : 0.01297 ) : 0.00992 ) : 0.00425 ) : 0.01632 , (' Ancylobacter aquaticus ATCC 25396 (T)' : 0.00125 , (' Methylorhabdus multivorans str. DM13 VKM B-2030 (T)' : 0.00252 , ' Thiobacillus novellus IAM 12100' : 0.02645 ) : 0.01568 ) : 0.03534 ) : 0.0098 , ((' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 24' : 0.06444 , ' str. SBR1099' : 0.07213 ) : 0.00732 , (' Blastochloris sulfoviridis DSM 729 (T)' : 0.00337 , (' Blastochloris viridis str. F' : 0.00112 , (' Blastochloris viridis ATCC 19567 (T)' : 0 , ' Blastochloris viridis ATCC 19567 (T)' : 0 ) : 0.00259 ) : 0.00545 ) : 0.01267 ) : 0.01119 ) : 0.00104 , ((' clone MC 5' : 0 , ' clone MC 12' : 0 ) : 0.00705 , (' clone MC 34' : 0.0414 , ' str. SBR2082' : 0.00723 ) : 0.025 ) : 0.00601 ) : 0.00027 , (' str. SBR2035' : 0.03597 , ((((' str. SBR2094' : 0.00275 , ' str. SBR2093' : 0.00571 ) : 0.0012 , ' Rhodopseudomonas sp. str. ANT-P-1' : 0.57069 ) : 0 , ' Rhodopseudomonas sp. str. IL-245' : 0.00058 ) : 0.00606 , (' Rhodoplanes elegans str. AS130' : 0.00551 , ((' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD54' : 0.00374 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD53' : 0.00348 ) : 0.00876 , (' Rhodoplanes roseus str. 941' : 0 , ' Rhodoplanes roseus str. 941 DSM 5909 (T)' : 0.00306 ) : 0.03003 ) : 0.01727 ) : 0.00944 ) : 0.33049 ) : 0.11314 )'BL.VIRIDIS' : 0.0133 , ((((' Methylosporovibrio methanica str. 81Z' : 0.038 , ' Methylosinus trichosporium str. OB3b' : 0.04458 ) : 0.07489 , ' Methylocystis parvus str. OBBP' : 0.00519 ) : 0.04973 , ' Methylosinus sp. str. B' : 0.00634 ) : 0.00176 , (' Methylosinus sp. str. LAC' : 0.01421 , (' str. B-3060' : 0.00577 , (' Methylosinus sporium str. provided by Y.Trotsenko' : 0.01408 , (' Methylocystis echinoides str. 2' : 0.0055 , (' Methylocystis pyriformis str. 14' : 0.00717 , ' Methylocystis minimus str. 42' : 0.03935 ) : 0.02582 ) : 0.0116 ) : 0.01811 ) : 0.0022 ) : 0.00799 )'MSI.TRICHOSPORIUM' : 0.0185 ) : 0.004 , (' Rhodopseudomonas acidophila str. 7050 ATCC 25092 (T)' : 0.02997 , (' Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 (T)' : 0.00488 , (' str. S18' : 0 , (' str. 1' : 0.0283 , ' Azorhizobium caulinodans str. MAR 1568 ORS 571 (T)' : 0.05816 ) : 0.01104 ) : 0.01942 ) : 0.01181 )'BEI.INDICA' : 0.01382 ) : 0.00517 , ((((((((((((((((' Methylobacterium rhodinum JCM 2811 (T)' : 0.00617 , ' Methylobacterium rhodinum NCIMB 9421 (T)' : 0 ) : 0.01197 , ' Methylobacterium zatmanii str. Ps.135 NCIMB 12243 (T)' : 0.00014 ) : 0.00404 , (' Methylobacterium rhodesianum str. Ps.1 NCIMB 12249 (T)' : 0.00103 , ' Methylobacterium sp. str. GK118' : 0.00344 ) : 0.00183 ) : 0.0015 , ' Methylobacterium extorquens NCIMB 9399 (T)' : 0 ) : 0.0011 , (' Methylobacterium sp. str. M27 NCIMB 9686' : 0.00831 , (' Methylobacterium sp. str. PK-1 (S.Hirano)' : 0.00109 , ' Methylobacterium sp. str. PR-6 (S.Hirano)' : 0.0016 ) : 0.00341 ) : 0.00055 ) : 0.0057 , ' Methylobacterium extorquens NCIMB 9399 (T)' : 0 ) : 0 , ' Methylobacterium extorquens ATCC 43645 (T)' : 0.00099 ) : 0.001 , ' Methylobacterium sp. str. GK101' : 0 ) : 0.00117 , (' Methylobacterium zatmanii str. MA1/5 JCM 2819' : 0 , (' unnamed organism' : 0.02809 , (' Methylobacterium rhodesianum JCM 2810' : 0.00277 , ' Methylobacterium extorquens JCM 2802 (T)' : 0.00093 ) : 0.00261 ) : 0.00443 ) : 0 ) : 0 , ' Methylobacterium sp. str. DM4' : 0.03142 ) : 0.09854 , ' Methylobacterium extorquens str. AM1' : 0.00355 ) : 0.02075 , ' clone K19' : 0.00359 )'MLB.EXTORQUENS' : 0.00698 , (' Blastobacter sp. str. BF10' : 0.01164 , (((' Methylobacterium sp. str. F48' : 0.01311 , ' Blastobacter sp. str. PC30.44' : 0.02227 ) : 0.0109 , ' Methylobacterium sp. str. F37' : 0.0022 ) : 0.00542 , (' Methylobacterium sp. str. F42' : 0.00273 , ((' Methylobacterium mesophilicum JCM 2829 (T)' : 0.00225 , ' Methylobacterium sp. str. F18' : 0.00268 ) : 0.00612 , ((' Methylobacterium sp. str. F05' : 0.00099 , ' Methylobacterium sp. str. F15' : 0.00121 ) : 0.00195 , (' Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 (T)' : 0.00287 , (' Methylobacterium sp. str. F73' : 0.00162 , (' Blastobacter sp. str. PC30.39' : 0.01068 , ' Blastobacter sp. str. BF15' : 0.00262 ) : 0 ) : 0.00182 ) : 0 ) : 0.00365 ) : 0.01735 ) : 0.00546 ) : 0.00949 )'MLB.RADIOTOLERANS' : 0.01068 ) : 0.0035 , (' Methylobacterium organophilum str. XX JCM 2833 (T)' : 0 , ' Methylobacterium organophilum str. XX (T)' : 0.03106 )'MLB.ORGANOPHILUM' : 0.00797 ) : 0.00642 , (' clone G23' : 0.04765 , ' Bosea thiooxidans str. BI-42 DSM 9653 (T)' : 0.03368 )'BOSEA' : 0.01007 )'METHYLOBACTERIA' : 0.01021 , (' Afipia felis' : 0.00233 , (' Afipia clevelandensis' : 0.0018 , (' clone SMK196' : 0.00406 , (((((((((' Nitrobacter sp. ATCC 25384' : 0.00142 , ' Nitrobacter sp. ATCC 25383' : 0.00056 ) : 0.00147 , ' clone MC 2' : 0.05535 ) : 0 , ' Nitrobacter winogradskyi ATCC 25381 (T)' : 0 ) : 0 , ' Nitrobacter winogradskyi ATCC 14123' : 0.00017 ) : 0.00012 , (' Nitrobacter sp. str. R6' : 0 , ' Nitrobacter winogradskyi str. W' : 0 ) : 0.00073 ) : 0.00117 , (' Nitrobacter sp. str. LL' : 0 , (' Nitrobacter hamburgensis str. X14' : 0 , (' Rhodopseudomonas sp. str. WCU-G13' : 0.00155 , ' Nitrobacter hamburgensis str. Nb14? or X14 (T)' : 0.00319 ) : 0.00155 ) : 0.00628 ) : 0.001 ) : 0 , (' clone MC 7' : 0 , ' Nitrobacter sp. ATCC 25385' : 0.01556 ) : 0.0013 ) : 0.00119 , ' clone pCON11' : 0.00716 )'NTB.WINOGRADSKYI' : 0.00125 , ((((((((((' clone PLY10' : 0.0011 , ' clone JAP702' : 0.00507 ) : 0.00107 , ' clone POR47' : 0.01274 ) : 1e-05 , ' clone JAP601' : 0.01089 ) : 0.00916 , ' clone POR22' : 0.02833 ) : 0.00447 , ' clone POR14' : 0.00488 ) : 0.00125 , ' clone PLY14' : 0.06415 ) : 0.08705 , (' clone POR18' : 0.00622 , ' clone JAP603' : 0.03552 ) : 0.14004 ) : 0.01958 , ' clone JAP850' : 0.28995 )'ENV.JAP850' : 0.01305 , (' Rhodopseudomonas palustris str. ATH 2.1.6 ATCC 17001 (T)' : 0.00682 , (' Rhodopseudomonas palustris str. ATH 2.1.6 ATCC 17001 (T)' : 0 , ((' Rhodopseudomonas palustris str. ATH 2.1.6 ATCC 17001 (T)' : 0 , ' Rhodopseudomonas palustris' : 0 ) : 0 , ((' Rhodopseudomonas palustris' : 0.00078 , ' Rhodopseudomonas palustris' : 0.00092 ) : 0.00023 , (' Rhodopseudomonas palustris str. GH' : 0 , (' Rhodopseudomonas palustris str. 2.1.6' : 0 , ' Rhodopseudomonas palustris str. R-1' : 0 ) : 0 ) : 0.00088 ) : 0.00023 ) : 0.00048 ) : 0.01312 )'RPS.PALUSTRE' : 0.15072 ) : 0.00195 , (' clone MC 6' : 0 , (((((((((((((((((((((' Bradyrhizobium lupini' : 0.00023 , ' str. SBR2007' : 0.00849 ) : 0.00018 , ' Bradyrhizobium sp. str. T-1' : 0 ) : 1e-05 , ' Bradyrhizobium sp. IRBG 309' : 0.009 ) : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum str. 3I1b6, SEMIA 5052, RCR 3425 ATCC 10324 (T)' : 1e-05 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1445; TAL 1775; NC 92' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1574; TAL 1276' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1586' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1605; Z 105' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. NC6' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1555; TAL 11' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. NC6' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1600; Z 55' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 253; Madison 625' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1589; NC 83.2; IC 7015' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum USDA 59' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1587' : 0 ) : 0 , ' clone MC 23' : 0 ) : 0 , (' Bradyrhizobium japonicum LMG 6138 (T)' : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum LMG 6138 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum IAM 12608' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum str. 3I1b6, SEMIA 5052, RCR 3425 USDA 6' : 0.00023 )'BDR.LUPINI' : 0.00023 , (((' Bradyrhizobium japonicum IAM 12608' : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum str. MAR 1491 USDA 110' : 0.0025 ) : 0.00126 , (' Bradyrhizobium sp. str. 129' : 0.00362 , ' Bradyrhizobium sp. str. 55S' : 0.00145 ) : 0.00214 )'BDR.JAPONICUS' : 0.00029 , (((((((' Bradyrhizobium elkanii' : 0.00186 , ' Bradyrhizobium japonicum USDA 31' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum USDA 76 (T)' : 0 ) : 0 , (' Bradyrhizobium sp. LMG 9520' : 0 , ' Bradyrhizobium sp. LMG 10689' : 0.00158 ) : 0 ) : 0.0006 , (' Bradyrhizobium sp. LMG 9980' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. LMG 9514' : 0.00023 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD51' : 0.00023 , ' Bradyrhizobium sp. LMG 9966' : 0.12455 ) : 0.06595 ) : 0 ) : 0.00159 ) : 0.00428 , ' Bradyrhizobium japonicum USDA 94' : 0.00645 ) : 0.00164 , ' Afipia broomeae str. F186' : 0.01822 )'BDR.ELKANII' : 0.00071 , (' Bradyrhizobium japonicum' : 0 , (((((' Bradyrhizobium japonicum' : 0.00049 , ' Bradyrhizobium japonicum str. MAR 1491 USDA 110' : 0 ) : 6e-05 , ' Bradyrhizobium liaoningensis str. ESG 2062' : 0.00903 ) : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum RCR 3407' : 0.00041 ) : 0 , (' Bradyrhizobium japonicum USDA 136' : 0 , ' Bradyrhizobium japonicum str. MAR 1491 USDA 110' : 0 ) : 0.00013 )'BDR.LIAONINGENSIS' : 0.00096 , ((((((((' Bradyrhizobium sp. str. IRBG 2' : 0 , ' Bradyrhizobium sp. IRBG 230' : 0 ) : 0 , ' Bradyrhizobium sp. ORS 322' : 0 ) : 0 , ' Photorhizobium sp. str. MKAa 3' : 0 ) : 0 , ' Photorhizobium sp. str. MKAa 2' : 0 ) : 0 , (' Photorhizobium sp. str. IRBG2' : 0 , ' Bradyrhizobium sp. LMG 8295' : 0.01312 ) : 0.01331 ) : 0.00124 , ' Photorhizobium sp. str. IRBG 230' : 0.00191 ) : 0.00132 , (' Bradyrhizobium sp. str. NZP 2257 (Lotus)' : 0.00381 , ' str. H58' : 0 ) : 0.00604 )'PHR.SP230' : 0.00134 , (' Bradyrhizobium sp. str. BTAi1' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. 32H1' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1510; TAL 309; CB 756' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1505; TAL 169' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. MAR 1576; TAL 1380 (32H1)' : 0 , (' Bradyrhizobium japonicum str. MAR 1491 USDA 110' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. MAR 967' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. BTAi-1' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. MAR 471' : 0 , (' Bradyrhizobium japonicum str. MAR 1526 USDA 123' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. MAR 411; IC 7011; 3G4b20' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. MA1977-1' : 0 , (' Photorhizobium thompsonianum str. BTAi' : 0 , (' Bradyrhizobium sp. str. NC123' : 0 , ((' Blastobacter denitrificans LMG 8443 (T)' : 2e-05 , ' Blastobacter denitrificans LMG 8443 (T)' : 0 ) : 0 , (' Bradyrhizobium sp. IRBG 231' : 0 , ' Agromonas oligotrophica JCM 1494 (T)' : 0 ) : 0.00644 ) : 0.0069 ) : 0 ) : 0.00911 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 )'BLB.DENITRIFICANS' : 0.00562 ) : 0.00574 ) : 0.00055 ) : 0.01227 ) : 0.00514 ) : 0.00083 ) : 0 ) : 0.00233 ) : 0.00197 ) : 0.00169 ) : 0.00745 ) : 0.00567 )'BRADYRHIZOBIUM' : 0.0318 ) : 0.01965 ) : 0.01218 ) : 0.0098 ) : 0.00369 ) : 0.00796 ) : 0.00702 )'RHIZOBIUM-AGROBACTERIUM' : 0.01515 , (' clone SMK410' : 0.03314 , (((' Phenylobacterium immobile str. E DSM 1986 (T)' : 0.00537 , ' clone SAR 121' : 0.3705 ) : 0.01003 , ' clone SMK141' : 0.02211 )'PB.IMMOBILE' : 0.01076 , (((((((((((' Caulobacter henricii ATCC 15253 (T)' : 0.00104 , ' Caulobacter henricii ATCC 15253 (T)' : 0 ) : 0 , ' Caulobacter henricii ATCC 15253 (T)' : 0 ) : 0 , (' Caulobacter sp. str. MR1' : 0 , ' Caulobacter sp. str. FWC2' : 0.00464 ) : 0.0104 ) : 0 , ' Caulobacter sp. str. FWC18' : 0.00765 ) : 0.00232 , ' Caulobacter sp. str. FWC17' : 0.00276 ) : 0 , ' Caulobacter sp. str. CDF20a' : 0.00236 ) : 0.00162 , ' Caulobacter sp. str. FWC26' : 0.002 ) : 0 , (' Mycoplana segnis IFO 13240 (T)' : 0.00123 , ((' Caulobacter vibrioides str. CB13' : 0 , ' Caulobacter vibrioides' : 0.01196 ) : 0 , (' Caulobacter vibrioides str. CB2A' : 0 , (' Caulobacter vibrioides str. CB2' : 0 , ' Caulobacter vibrioides str. CB15A' : 0.0042 ) : 0 ) : 0.02099 ) : 0.02225 ) : 0.00027 ) : 0.01131 , (' Caulobacter fusiformis ATCC 15257 (T)' : 0 , (' Caulobacter fusiformis ATCC 15257 (T)' : 0.00016 , (' Caulobacter fusiformis ATCC 15257 (T)' : 0.00066 , ' Caulobacter bacteroides str. CB7' : 0.0003 ) : 0.00524 ) : 0 ) : 0.0153 ) : 0.0041 , ' Caulobacter sp. str. FWC38' : 0.00854 )'CAU.VIBRIOIDES_II' : 0.01264 , (((((' Asticcacaulis excentricus ATCC 15261 (T)' : 0 , ' Asticcacaulis excentricus ATCC 15261 (T)' : 0.00471 ) : 0.01708 , ' Asticcacaulis biprosthecium str. MBIC3411 ATCC 27554 (T)' : 0.02516 ) : 0.02654 , ' clone SMK142' : 0 ) : 0.00299 , ' clone SMK1' : 0 )'ASC.EXCENTRICUS' : 0.00202 , ((((((' Brevundimonas vesicularis LMG 2350 (T)' : 0 , ' Brevundimonas vesicularis ACM 2862 (T)' : 0.0006 ) : 0.00319 , ' Brevundimonas vesicularis IAM 12105 (T)' : 0 ) : 0 , ' Caulobacter intermedius str. CB63 ATCC 15262 (T)' : 0.00135 ) : 0.00374 , ' Caulobacter intermedius str. CB63 ACM 2608 (T)' : 0 ) : 0.0032 , ' Caulobacter sp. str. FWC14' : 0.00466 ) : 0.00361 , ((((' Caulobacter sp. str. MCS17' : 0 , ' Caulobacter sp. str. CDF35' : 0.01439 ) : 0 , ' Caulobacter sp. str. MCS24' : 0.00104 ) : 0.00704 , (' Caulobacter bacteroides ATCC 15254 (T)' : 0.00887 , ' Caulobacter variabilis str. CB17 ATCC 15255 (T)' : 0.00785 ) : 0.00937 ) : 0.0044 , ((((' clone L' : 0 , ' clone pCON26' : 0.00887 ) : 0 , ' clone pCON12' : 0 ) : 0.00084 , (' Brevundimonas diminuta' : 0 , ' Brevundimonas diminuta ATCC 11568 (T)' : 0 ) : 0.00718 ) : 0.00727 , (' Mycoplana bullata IAM 13153 (T)' : 0.00248 , (' Caulobacter sp. str. TS1' : 0.00839 , (' Caulobacter sp. str. CDFo' : 0.00439 , (' Caulobacter subvibrioides ATCC 15264 (T)' : 0.0141 , ' Caulobacter subvibrioides ACM 2483 (T)' : 0 ) : 0.00252 ) : 0.00987 ) : 0.00416 ) : 0.00832 ) : 0.00624 ) : 0.00495 )'CAU.SUBVIBRIOIDES' : 0.00348 ) : 0.00372 ) : 0.01965 ) : 0.00479 )'CAULOBACTER' : 0.07734 ) : 0.00553 , ((((((((((((((((((((((' Sphingomonas sp. str. Q1' : 0.0011 , ' Sphingomonas yanoikuyae' : 0 ) : 0.00035 , ' Sphingomonas sp. str. SS3 DSM 6432' : 0.00073 ) : 0 , (' Sphingomonas yanoikuyae str. B1' : 0 , ' Sphingomonas yanoikuyae' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Sphingomonas yanoikuyae IFO 15163' : 0.00099 ) : 0 , ' Sphingomonas yanoikuyae str. B1' : 0 ) : 0 , (' Sphingomonas yanoikuyae IFO 15102 (T)' : 0 , (' Sphingomonas yanoikuyae LMG 11252 (T)' : 0.0063 , ' Sphingomonas yanoikuyae JCM 7371 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00109 ) : 0.00077 , ' Sphingomonas yanoikuyae GIFU 9882 (T)' : 0.00085 ) : 0.00389 , (' Sphingomonas sp. str. CF06' : 0.00779 , (((' Sphingomonas chlorophenolica ATCC 33790 (T)' : 0 , ' Sphingomonas chlorophenolica str. SR3' : 0 ) : 0 , ' Sphingomonas chlorophenolica ATCC 33790 (T)' : 0.00518 ) : 0.00264 , (' Sphingomonas sp. str. SS86' : 0.00417 , (((' Sphingomonas flava ATCC 29723' : 0 , ' Sphingomonas flava str. RA2 DSM 8671' : 0 ) : 0.00566 , ' Sphingomonas sp. str. DhA-33' : 0.00396 ) : 0.00468 , (' Rhizomonas sp. str. WI4' : 0.00862 , (' Sphingomonas paucimobilis str. EPA 505' : 0.00091 , ' Sphingomonas paucimobilis' : 0 ) : 0.00238 ) : 0.00553 ) : 0.00438 ) : 0.00273 ) : 0.01015 ) : 0.00623 )'SPG.YANOIKUYAE' : 0.00656 , (' Sphingomonas sp. str. UN1F1' : 0.00721 , (' Sphingomonas sp. str. HH69 DSM 7135' : 0.00373 , (' Sphingomonas sp. str. UN1F2' : 0.00211 , (' str. C7' : 0.00226 , ' Sphingomonas sp. str. BN6' : 0.00142 ) : 0.00333 ) : 0.02138 ) : 0.00981 )'SPG.UN1F1' : 0.00678 ) : 0.00236 , ' Sphingomonas sp. str. SYK6' : 0.01421 ) : 0.0102 , ((' Sphingomonas sp. str. RW1' : 0.01054 , ' Sphingomonas sp. str. A175' : 0.00876 ) : 0.00688 , (' str. SBR2050' : 0.06922 , (' Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 (T)' : 0.00381 , ' Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 (T)' : 0.00348 ) : 0.17189 ) : 0.0754 )'ZYM.MOBILIS' : 0.01385 ) : 0.00986 , ((((((' Caulobacter subvibrioides str. CB81' : 0 , ' Asticcacaulis excentricus ACM 1263 (T)' : 0.00138 ) : 0 , ' Asticcacaulis biprosthecium str. MBIC3411 ACM 2498 (T)' : 0.00138 ) : 0 , (' Caulobacter leidyi ATCC 15260 (T)' : 0 , (' Caulobacter leidyi ATCC 15260 (T)' : 0 , ' Caulobacter leidyi ATCC 15260 (T)' : 0.0005 ) : 0 ) : 0.00529 ) : 0.00992 , ' Sphingomonas trueperi LMG 2142 (T)' : 0.02087 ) : 0.00182 , (' Sphingomonas pruni str. Y-250 IFO 15498 (T)' : 0.00091 , (' Sphingomonas mali str. Y-347 IFO 15500 (T)' : 0.00017 , (' Sphingomonas mali str. Y-347 IFO 15500 (T)' : 0 , (' Sphingomonas asaccharolytica str. Y-345 IFO 15499 (T)' : 0.00145 , ' Sphingomonas pruni str. Y-250 IFO 15498 (T)' : 0.00913 ) : 0.0015 ) : 0.00813 ) : 0.00027 ) : 0.0052 )'SPG.PRUNI' : 0.00739 , (((' Pseudomonas echinoides DSM 1805 (T)' : 0 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD26' : 0 ) : 0.00053 , ' Blastobacter sp. str. BF14 ?' : 0.01482 ) : 0.002 , ((' Sphingomonas adhaesiva JCM 7370 (T)' : 0.00405 , ' Sphingomonas adhaesiva GIFU 11458 (T)' : 0.00439 ) : 0.00241 , (' Sphingomonas sanguinis IFO 13937 (T)' : 0.00245 , ((' Sphingomonas parapaucimobilis IFO 15100 (T)' : 0.00494 , ' Sphingomonas parapaucimobilis JCM 7510 (T)' : 0.00334 ) : 0.00465 , (' Sphingomonas paucimobilis ATCC 29837 (T)' : 0 , ((' Sphingomonas paucimobilis ATCC 29837 (T)' : 0.00131 , ' Sphingomonas paucimobilis ATCC 10829' : 0.00135 ) : 0 , (' Sphingomonas paucimobilis IFO 13935 (T)' : 0 , (' Sphingomonas paucimobilis ATCC 29837 (T)' : 0.0003 , (' Sphingomonas paucimobilis LMG 1227 (T)' : 0.0023 , ' Sphingomonas paucimobilis GIFU 2395 (T)' : 0.00402 ) : 0.0023 ) : 0.00807 ) : 0.00121 ) : 0.00647 ) : 0.00543 ) : 0.00321 ) : 0.01281 ) : 0.02238 )'SPG.PAUCIMOBILIS' : 0.00098 ) : 0.01079 ) : 0.00438 , (' Rhizomonas suberifaciens str. CA1T' : 0 , ' Rhizomonas suberifaciens IFO 15211 (T)' : 0.002 )'RHZ.SUBERIFACIENS' : 0.02069 ) : 0.00077 , ' clone SMK270' : 0.02513 ) : 0.00126 , (' str. SBR2032' : 0.02208 , (' Blastomonas natatoria DSM 3183 (T)' : 0.00055 , (' Blastomonas natatoria ATCC 35951 (T)' : 0.0005 , (' Sphingomonas sp. str. B477' : 0 , ' Erythromonas ursincola str. KR-99 DSM 9006 (T)' : 0.00097 ) : 0.01584 ) : 0.0015 ) : 0.02576 )'BLA.NATATO' : 0.00734 ) : 0.00105 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD23' : 0.02328 ) : 0.00114 , (' str. B274' : 0.03861 , ((((' Sphingomonas subarctica str. KF1 (T)' : 0 , ' Sphingomonas subarctica str. NKF1' : 0 ) : 0 , ' Sphingomonas subarctica str. KF3' : 0 ) : 0.00042 , ' Sphingomonas sp. str. UN1P1' : 0.00185 ) : 0.00321 , (' Sphingomonas rosa IFO 15208 (T)' : 0.01072 , (((' Sphingomonas sp. str. B695' : 0.00158 , ' Sphingomonas sp. str. B522' : 0 ) : 0 , ' Sphingomonas sp. str. F199' : 0.00314 ) : 0.00123 , (' Sphingomonas sp. str. B478' : 0.00762 , (' Sphingomonas capsulata GIFU 11526' : 0 , (' Sphingomonas capsulata LMG 2830 (T)' : 0.00319 , ' Sphingomonas capsulata ATCC 14666 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.01142 ) : 0.00308 ) : 0.01167 ) : 0.01409 ) : 0.02138 ) : 0.01465 ) : 0.00475 , ((((((' str. L-86' : 0 , ' str. L-87' : 0 ) : 0 , ' Sphingomonas adhaesiva IFO 15099 (T)' : 0.10856 ) : 0.00473 , ' Sphingomonas terrae str. E-1-A IFO 15098 (T)' : 0.01349 ) : 0.00587 , ' str. s24' : 0.04407 ) : 0 , (' Sphingomonas macrogoltabidus str. 203 IFO 15033 (T)' : 0.00691 , ((' str. SBR2017' : 0.00352 , ' str. SBR1109' : 0.00646 ) : 0.00467 , (' clone JN9c' : 0 , ' str. RB2256' : 0.01401 ) : 0.01471 ) : 0.00753 ) : 0.00552 ) : 0.00955 , (((' str. B712' : 0.00927 , ' str. B707' : 0.0154 ) : 0 , (' str. B713' : 0.05178 , ' str. B615' : 0 ) : 0.01454 ) : 0.00054 , ((' str. SBR1110' : 0.15833 , ' str. SBR1103' : 0 ) : 0.00198 , ((' str. SBR2056' : 0 , ' str. SBR1106' : 0.00177 ) : 0 , (' str. SBR1045' : 0 , (' str. SBR1018' : 0.00349 , ' str. SBR2021' : 0.00362 ) : 0.0018 ) : 0 ) : 0.002 ) : 0.0141 ) : 0.00925 )'SPG.MACROGOLTABIDUS' : 0.00616 ) : 0.00408 , ((((' Porphyrobacter neustonensis ACM 2844 (T)' : 0 , ' Porphyrobacter neustonensis ACM 2844 (T)' : 0 ) : 0.00883 , ' Porphyrobacter tepidarius str. OT3' : 0.00955 ) : 0 , (' Erythromicrobium ramosum str. E5 Yurkov strain Drews DSM 8510 (T)' : 0.00642 , (' str. SBR2075' : 0 , ' Porphyrobacter sp. ACM 2721' : 0.09105 ) : 0.00971 ) : 0.00218 ) : 0.0056 , (' clone 6811' : 0.00255 , ((' Erythrobacter litoralis str. T4(31-1187) DSM 8509 (T)' : 0.00271 , ' Erythrobacter litoralis str. T4(31-1187) DSM 8509 (T)' : 0.0006 ) : 0.00496 , ((' Erythrobacter longus str. OCh 101' : 0 , ' Erythrobacter longus str. OCh 101' : 0 ) : 0 , (' Erythrobacter longus str. OCh 101 ATCC 33941 (T)' : 0 , (' Erythrobacter longus str. OCh 101 ATCC 33941 (T)' : 0.00227 , ' Erythrobacter longus JCM 6170 (T)' : 0.00409 ) : 0 ) : 0.00415 ) : 0.01572 ) : 0.06239 ) : 0.00672 )'ERB.LONGUS' : 0.01816 ) : 0.00935 , ' Sandaracinobacter sibiricus str. RB16-17 (T)' : 0.03436 )'SPHINGOMONAS' : 0.0428 , (' Rhodothalassium salexigens ATCC 35888 (T)' : 0 , (' clone 4a' : 0.18558 , ' Rhodothalassium salexigens ATCC 35888 (T)' : 0.39289 ) : 0.1019 )'R.SALEXIGENS' : 0.0345 ) : 0.01546 , (((((((((((((((' Amaricoccus veronensis str. Ben102 ACM 5098 (T)' : 0.00767 , ' Amaricoccus macauensis str. Ben104 ACM 5096 (T)' : 0.00958 ) : 0.00963 , ' Amaricoccus tamworthensis str. Ben103 ACM 5097 (T)' : 0.01598 ) : 0.00421 , ' Amaricoccus kaplicensis str. Ben101 ACM 5099 (T)' : 0.02434 ) : 0.01434 , (' Rhodobacter blasticus ATCC 33485 (T)' : 0.00691 , ' Rhodobacter blasticus NCIMB 11576 (T)' : 0.00252 ) : 0.03424 )'AMR.MACAUENSIS' : 0.00663 , (' Rhodobacter capsulatus str. C5' : 0 , ((' Rhodobacter capsulatus str. ATH 2.3.1 ATCC 11166 (T)' : 0 , ' Rhodobacter capsulatus str. ATH 2.3.1 ATCC 11166 (T)' : 0.00081 ) : 0.00057 , (' Rhodobacter capsulatus str. B10 ATCC 33303' : 0 , ' Rhodobacter capsulatus str. B10 ATCC 33303' : 0 ) : 0 ) : 0.0054 )'RB.CAPSULATUS' : 0.01453 ) : 0 , ' clone JN8c' : 0.00495 ) : 0.02096 , (((' Rhodobacter azotoformans str. KA25' : 0 , ' Rhodobacter azotoformans str. SA16' : 0 ) : 0 , (' clone SMK2352' : 0 , ' clone SMK1973' : 0.00376 ) : 0.03684 ) : 0.00462 , (' Rhodobacter sphaeroides str. IL106' : 0.00034 , (' Rhodobacter sphaeroides IFO 12203' : 0 , (' Rhodobacter sphaeroides str. ATH 2.4.1 ATCC 17023 (T) [gene=rrnC]' : 0 , (' Rhodobacter sphaeroides str. ATH 2.4.1 ATCC 17023 (T) [gene=rrnA]' : 0 , ' Rhodobacter sphaeroides str. ATH 2.4.1 ATCC 17023 (T) [gene=rrnB]' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.0005 ) : 0.00927 )'RB.SPHAEROIDES' : 0 ) : 0.00388 , (' str. SBR2045' : 0.00542 , (' str. SBR2070' : 0.01821 , ' str. SW2' : 0.01439 ) : 0.03929 )'STR.SW2' : 0.00374 ) : 0.00606 , (' Rhodobacter veldkampii ATCC 35703 (T)' : 0.00839 , ' Rhodobacter veldkampii ATCC 35703 (T)' : 0.00098 )'RB.VELDKAMPII' : 0.01865 ) : 0.00814 , (((' Paracoccus solventivorans str. L1 DSM 6637 (T)' : 0.00137 , ' Paracoccus alkenifer str. A901/1 DSM 11593 (T)' : 0.01001 ) : 0.01087 , ' Paracoccus kocurii str. B JCM 7684 (T)' : 0.01397 )'PAR.ALKENIFER' : 0.00622 , ((((((' Paracoccus alcaliphilus str. TK 1015 JCM 7364 (T)' : 0.0242 , ' clone SMK735' : 0.01552 ) : 0 , (' clone GAC-5' : 0.00524 , ' clone GAI-36' : 0.00568 ) : 0.0288 ) : 0.01113 , ' Paracoccus aminovorans str. DM-82 JCM 7685 (T)' : 0.02247 ) : 0.00947 , ' Paracoccus thiocyanatus str. THI 011; 1-8A IAM 12816 (T)' : 0.00409 ) : 0.00557 , (' clone K5' : 0.00412 , ' Paracoccus aminophilus str. DM-15 JCM 7686 (T)' : 0.00386 ) : 0.00226 )'PAR.AMINOPHILUS' : 0.00369 , ((' Paracoccus denitrificans LMD 22.1 (T)' : 0 , ' Paracoccus denitrificans ATCC 17741 (T)' : 0 ) : 0.00532 , (((' Paracoccus denitrificans IAM 12479 (T)' : 0.00285 , ' Paracoccus denitrificans LMG 4218 (T)' : 0 ) : 0 , (' Paracoccus denitrificans DSM 65' : 0 , ' Paracoccus pantotrophus ATCC 35512 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.0036 , (' Paracoccus versutus ATCC 25364 (T)' : 0 , (' Paracoccus versutus IAM 12814 (T)' : 0.00054 , (' Paracoccus versutus IAM 12815' : 0 , ' Paracoccus versutus ATCC 25364 (T)' : 0.0125 ) : 0.00115 ) : 0 ) : 0.00061 ) : 0.0016 )'PAR.DENITRIFICANS' : 0.00691 ) : 0.00776 ) : 0.02013 )'PARACOCCUS' : 0.0059 , (' clone SAR 122' : 0.00239 , (' clone GAI-15' : 0.00247 , (' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 83' : 0.00813 , (((((((((' clone 8a' : 0.01925 , ' clone 6511' : 0.01474 ) : 0.0034 , ' clone 5211' : 0.01184 ) : 0 , ' clone 10a' : 0 ) : 0.01089 , ' Ruegeria atlantica str. 1480 IAM 14463 (T)' : 0.00534 ) : 0.00905 , ' clone 47a' : 0.00496 ) : 0.00854 , ' Ruegeria gelatinovorans str. B6 IAM 12617 (T)' : 0.00974 ) : 0.03398 , ' clone 3011' : 0.0022 ) : 0.00126 , (' clone GAI-33' : 0.00163 , (' clone GAI-3b' : 0.00597 , (' Octadecabacter arcticus str. 238' : 0.00141 , ' Octadecabacter antarcticus str. 307' : 0.00348 ) : 0.01601 ) : 0.00577 ) : 0.00378 )'OCT.ANTARCTICUS' : 0.00244 , ((' str. NF18' : 0.02573 , ' str. AG33' : 0.01392 )'STR.NF18' : 0.00592 , ((((((' clone 37SW-2' : 0.00403 , ' clone 37SW-1' : 0.01348 ) : 0.00575 , ' Sagittula stellata str. E-37' : 0.01361 ) : 0.00198 , ' str. 36 (Nielsen)' : 0.00111 ) : 0.0224 , ' Antarctobacter heliothermus str. EL-219 DSM 11440 (T)' : 0.01891 ) : 0.00396 , (' clone GAI-26' : 0.00521 , (' clone GAI-37' : 0.00621 , ' str. LFR' : 0.0024 ) : 0.00713 ) : 0.01348 )'ANB.HELIOTHERMUS' : 0.00233 , ((((((' Roseobacter gallaeciensis str. BS107 CIP 105210 (T)' : 0.00367 , ' clone GAI-5' : 0.01032 ) : 0.0018 , ' clone GAC-2' : 0.0217 ) : 0.00018 , ' clone GAC-3' : 0.00535 ) : 0.00504 , (' Ruegeria algicola str. ML4 ATCC 51441' : 0 , (' Ruegeria algicola str. FF2 ATCC 51442' : 0 , ' Ruegeria algicola str. T-FF3 ATCC 51440 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00924 ) : 0.00461 , (' Roseovarius tolerans str. EL-172 DSM 11457 (T)' : 0.00733 , (' clone GAC-8' : 0.00243 , ' clone GAC-1' : 0 ) : 0.02122 ) : 0.00786 )'RG.ALGICOLA' : 0.00925 , (' symbiont of Prionitis lanceolata gall' : 0.01493 , ((((' Roseobacter denitrificans str. OCh 114 (T)' : 0 , ' Roseobacter denitrificans str. OCh 114 (T)' : 0 ) : 0 , ' Roseobacter denitrificans str. OCh 114 (T)' : 0.00292 ) : 0.00691 , ' Roseobacter litoralis ATCC 49566 (T)' : 0.00659 ) : 0.0046 , (' Sulfitobacter mediterraneus str. CH-B427' : 0.00398 , (' clone GAI-21' : 0 , (' str. EE-36' : 0 , (' str. EE-36' : 0 , ' Sulfitobacter pontiacus str. ChLG 10 DSM 10014 (T)' : 0.00522 ) : 0.00098 ) : 0.00118 ) : 0.00575 ) : 0.01259 ) : 0.01948 )'ROS.DENITRIFICANS' : 0.01132 ) : 0.00975 ) : 0.01208 ) : 0.00448 ) : 0.04838 ) : 0.01889 ) : 0.02879 )'ROS.LITORALIS' : 0.01176 )'RHODOBACTER' : 0.00716 , ((((' Rhodovulum adriaticum ATCC 35885 (T)' : 0.00243 , ' Rhodovulum sp. str. MB253' : 0 ) : 0.00204 , ' Rhodovulum adriaticum DSM 2781' : 0.00171 ) : 0.00516 , ' Rhodovulum robiginosum str. N2' : 0.01903 )'RHV.ADRIATICUM' : 0.00768 , ((((' Rhodovulum euryhalinum str. KA-65 DSM 4868 (T)' : 0.00138 , ' Rhodovulum euryhalinum str. KA-65 DSM 4868 (T)' : 0.0006 ) : 0.00553 , ' Rhodovulum strictum str. MB-G2' : 0.02222 ) : 0.00278 , ' Rhodovulum iodosum str. N1' : 0.01723 ) : 0.00151 , (((' Rhodovulum sulfidophilum str. W4 DSM 1374 (T)' : 0 , ' Rhodovulum sulfidophilum str. TW13' : 0 ) : 0 , ' clone R2102' : 0.00916 ) : 0 , (' Rhodovulum sulfidophilum str. TW13' : 0 , (' Rhodovulum sulfidophilum str. W12 DSM 2351' : 0.00102 , (' Rhodovulum sulfidophilum str. W-4 (T)' : 0.00134 , (' Rhodovulum sp. str. MB260' : 0.00072 , ' Rhodovulum sp. str. MB263' : 0.00392 ) : 0.0013 ) : 0.00129 ) : 0.00059 ) : 0.00056 ) : 0.01877 )'RHV.SULFIDOPHILUS' : 0.0219 )'RHODOVULUM' : 0.01724 ) : 0.01481 , ((((' str. SBR2040' : 0 , ' str. SBR1094' : 0.00286 ) : 0 , ' str. SBR1010' : 0 ) : 0 , ' str. SBR1111' : 0.00142 )'ENVIRONMENTAL_SBR_CLONES' : 0.01029 , ((((' Caulobacter maris ATCC 15268 (T)' : 0.0025 , ' Caulobacter halobacteroides ATCC 15269 (T)' : 0 ) : 0.00279 , ' Caulobacter sp. str. MCS10' : 0.00603 ) : 0.01044 , (' Caulobacter sp. str. MCS18' : 0 , ' Caulobacter sp. str. MCS6' : 0.00098 ) : 0.01297 )'CAU.HALOBACTEROIDES' : 0.01568 , (' Hirschia baltica IFAM 1418 (T)' : 0.01202 , (((' Hyphomonas jannaschiana str. VP-1 ATCC 33882' : 0 , ' Hyphomonas jannaschiana str. VP-2 DSM 5153 (T)' : 0 ) : 0 , ' Hyphomonas sp. str. MHS3' : 0.00302 ) : 0.00601 , (' Hyphomonas oceanitis str. SCH89 IFAM 1325 (T)' : 0.01296 , (' Hyphomonas neptunium str. LE670 IFAM LE670 (T)' : 0.00398 , ' Hyphomonas hirschiana str. VP-5 DSM 5152 (T)' : 0.00045 ) : 0.01102 ) : 0.01759 ) : 0.05292 )'HYM.JANNASCHIANA' : 0.03421 ) : 0.05413 )'HYPHOMONAS' : 0.01905 ) : 0.00379 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 102' : 0.06107 ) : 0.00525 , (((((((' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 11' : 0 , ' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-1' : 0 ) : 0.00172 , ' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-4' : 0.00547 ) : 0.00706 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 1' : 0.01033 ) : 0.00439 , ((' clone PLY43' : 0.00671 , ' clone FL1' : 0.04436 ) : 0 , (' clone 17a' : 0.0056 , ' clone FL11' : 0.01466 ) : 0.00187 ) : 0.00881 ) : 0.00062 , (' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-1' : 1e-05 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 95' : 0 ) : 0.00677 )'ENVIRONMENTAL_CLONE_PLY43' : 0.01254 , (' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-7' : 0.31391 , (' Zea mays -- mitochondrion' : 0.00036 , (' Triticum aestivum (bread wheat) -- mitochondrion' : 0 , (' Secale cereale (rye) -- mitochondrion' : 0 , ' Triticum aestivum (bread wheat) -- mitochondrion' : 0 ) : 1e-05 ) : 0.00168 )'MITOCHONDRIA' : 0.10824 ) : 0.15494 ) : 0.00761 , ((' Caedibacter caryophila str. 221 (T)' : 0.05796 , ' Holospora obtusa' : 0.10752 )'HOLOSPORA' : 0.02545 , ((((((((((((((((((' Rickettsia conorii str. Moroccan' : 0 , ' Rickettsia conorii str. Indian Tick Typhus rickettsia' : 0 ) : 0 , ' Rickettsia conorii str. IIT-586' : 0 ) : 0.00029 , ' Rickettsia sp. str. A-167' : 0 ) : 0 , ' Rickettsia sp. str. ISTT CDC1' : 0.00061 ) : 0.00029 , (' Rickettsia parkeri str. Maculatum 20 (T)' : 0 , ' Rickettsia parkeri str. Maculatum 20 (T)' : 0.00063 ) : 0.00063 ) : 0 , (' Rickettsia sibirica str. 246' : 0.0003 , (' Rickettsia sibirica ATCC VR151 (T)' : 0 , (' Rickettsia sibirica str. 246' : 0 , ' Rickettsia sp. str. HA-91' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.0003 ) : 0.00014 , (' Rickettsia africae str. ESF-5; Z9-Hu (T)' : 0.00293 , ' Rickettsia sp. str. S' : 0.00014 ) : 0 ) : 0.00029 , ' Rickettsia slovaca str. 13-B' : 0.0003 ) : 0 , ((' Rickettsia sp. str. TT-118' : 0.0003 , ' Rickettsia honei str. JC' : 0.00061 ) : 0.00031 , (' Rickettsia peacockii str. Skalkaho (T)' : 0.00039 , (' Rickettsia rickettsii str. R (Bitterroot)' : 0.0009 , (' Rickettsia rickettsii str. Sawtooth' : 0 , ' Rickettsia rickettsii str. R ATCC VR-891 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00075 ) : 0.00033 ) : 0 ) : 0 , (' Rickettsia japonica str. YM' : 0.00172 , (' Rickettsia montana str. Ohio 83-441' : 0 , ' Rickettsia montana ATCC VR-611 (T)' : 0.0009 ) : 0.0009 ) : 0.00036 ) : 0 , (((' Rickettsia massiliae str. Mtu1 (T)' : 0 , ' Rickettsia massiliae str. GS' : 0 ) : 0 , ' Rickettsia sp. str. Bar 29' : 0.0003 ) : 0.0003 , (' Rickettsia aeschlimanni str. Mc16 (T)' : 0.00032 , (' Rickettsia rhipicephali' : 0.00029 , ' Rickettsia rhipicephali str. 3-7-6' : 0.00065 ) : 0.0017 ) : 0.00033 ) : 0.00038 ) : 0 , ' Rickettsia amblyommii str. MO 85-1084' : 0.00239 ) : 0.00032 , (' Rickettsia helvetica str. C9P9' : 0.00261 , (' Rickettsia sp. str. ELB agent' : 0.00105 , ((' Rickettsia akari str. MK (Kaplan)' : 0 , ' Rickettsia akari str. Hartford' : 0.00065 ) : 0.00667 , (' Rickettsia australis str. RHS' : 0.00137 , (' Rickettsia australis str. Phillips' : 0 , ' Rickettsia australis str. Phillips' : 0.00081 ) : 0.0004 ) : 0.00103 ) : 0.00032 ) : 0.00066 ) : 0.00039 ) : 0.00042 , (((' Rickettsia canadensis str. McKeil' : 0 , ' Rickettsia canadensis str. 2678' : 0 ) : 0.00547 , ' Rickettsia sp.' : 0.00497 ) : 0.00042 , (' Rickettsia bellii str. strains 369-C and G2D42' : 0 , (' Rickettsia sp. str. PAR' : 0 , ' Rickettsia bellii str. 369L42-1' : 0.00168 ) : 0 ) : 0.00117 ) : 0.00192 ) : 0 , (' Rickettsia prowazekii str. Breinl ATCC VR-142 (T) (alpha purple bacterium)' : 0.00095 , (' Rickettsia typhi str. Wilmington' : 0 , (' Rickettsia typhi str. Wilmington' : 0 , ' Rickettsia typhi str. Wilmington' : 0 ) : 0 ) : 0.00212 ) : 0.00553 )'RICKETTSIA' : 0.02926 , (' Orientia tsutsugamushi str. Kawasaki' : 0.00042 , (' Orientia tsutsugamushi str. Shimokoshi' : 0.00146 , ((' Orientia tsutsugamushi str. Kato' : 0.00027 , ' Orientia tsutsugamushi str. Kato' : 0 ) : 0.00057 , ((' Orientia tsutsugamushi str. Karp' : 0 , ' Orientia tsutsugamushi str. Karp' : 0 ) : 0 , (' Orientia tsutsugamushi str. Kuroki' : 0.00114 , (' Orientia tsutsugamushi str. Gilliam' : 0 , (' Orientia tsutsugamushi str. Gilliam' : 0 , ' Orientia tsutsugamushi str. Gilliam' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00028 ) : 0.00059 ) : 0.00596 ) : 0 )'ORIENTIA' : 0.05474 ) : 0.00739 , (((' Pacific Ocean station 49 500m depth bacterioplankton DNA clone NH49-1' : 0.02582 , ' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-27' : 0.00288 ) : 0.01176 , ' Pacific Ocean station 29 100m depth bacterioplankton DNA clone NH29-3' : 0.018 ) : 0.00152 , (' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-17' : 0.01544 , (' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-15' : 0.00205 , (' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-25' : 0 , (' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-11' : 0 , ' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-20' : 0 ) : 0.0155 ) : 0 ) : 0.01782 ) : 0.01569 )'OCEANIC_ENVIRONMENTAL_CLONES' : 0.2388 ) : 0 , (((((' Ehrlichia sp.' : 0.00336 , ' Ehrlichia risticii str. Ohio isolate 081' : 0.00091 ) : 0.00068 , (' Ehrlichia risticii str. Kentucky isolate' : 0.00104 , ' Ehrlichia risticii str. Illinois ATCC VR-986 (T) (alpha purple bacterium)' : 0.00101 ) : 0.00101 ) : 0.00128 , (' Ehrlichia sennetsu str. 11908' : 0 , ' Ehrlichia sennetsu str. Miyayama' : 0 ) : 0.00318 ) : 0.01507 , ' Neorickettsia helminthoeca' : 0.01626 )'EHR.RISTICII' : 0.01735 , ((((((' Ehrlichia canis str. Oklahoma' : 0 , ' Ehrlichia canis str. Florida' : 0.00029 ) : 0.00027 , ' Ehrlichia canis str. 611' : 0.00139 ) : 0.00164 , (' Ehrlichia muris str. AS145 (T) ATCC VR-1411' : 0.00714 , (' Ehrlichia chaffeensis str. 91HE17' : 0 , ' Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas (T)' : 0.00031 ) : 0.00127 ) : 0.00717 ) : 0.00301 , (' Ehrlichia ewingii str. Stillwater (T)' : 0.00827 , (' Cowdria ruminantium str. Mara 87/7' : 0.00084 , (' Cowdria ruminantium str. Crystal Springs (Zimbabwe) isolate' : 0 , (' Cowdria ruminantium str. Ball3' : 0 , (' Cowdria ruminantium str. Omatjenne' : 0.00029 , ' Cowdria ruminantium str. d from Senegal stock' : 0.001 ) : 0.00033 ) : 0.00346 ) : 0 ) : 0.01012 ) : 0.00408 )'EHR.CANIS' : 0.02895 , (' Anaplasma marginale' : 0.00688 , (' Ehrlichia bovis' : 0.00471 , (' Ehrlichia platys' : 0.00621 , (' Ehrlichia sp.' : 0.0001 , (' Ehrlichia sp. str. rosa' : 0 , (' Ehrlichia phagocytophila str. OS (Old Sourhope)' : 0 , (' Ehrlichia equi' : 0 , ' Ehrlichia phagocytophila str. FG (feral goat)' : 0.0092 ) : 0 ) : 0.0001 ) : 0.00013 ) : 0.00578 ) : 0.01818 ) : 0.01294 )'EHR.PHAGOCYTOPHILA' : 0.02499 )'EHRLICHIA' : 0.03625 , ((' endosymbiont of Sitophilus oryzae' : 0.00325 , ' Pacific Ocean station 25 100m depth bacterioplankton DNA clone NH25-10' : 0.42319 ) : 0.00037 , ((' endosymbiont of Rhinocyllus conicus' : 0.00837 , ' symbiont of Dirofilaria immitis' : 0.01961 ) : 0.00187 , (' Wolbachia pipientis' : 0.003 , (((' symbiont of incompatibility symbiont of Nasonia longicornis' : 0.00105 , ' symbiont of incompatibility symbiont of Nasonia giraulti' : 0.00122 ) : 0.00034 , ' symbiont of incompatibility symbiont of Nasonia vitripennis' : 0.00071 ) : 0.00085 , (((((((((((' Wolbachia sp.' : 0 , ' Wolbachia pipientis' : 0 ) : 0 , ' Wolbachia sp.' : 0 ) : 0.00026 , ' Wolbachia sp.' : 0 ) : 0.0001 , (' Wolbachia pipientis' : 0.0006 , ' Wolbachia sp.' : 0 ) : 0.00013 ) : 0 , (' Wolbachia pipientis' : 0.00218 , ' symbiont of Muscifidurax uniraptor' : 0 ) : 0.00047 ) : 0 , ' Wolbachia sp.' : 0 ) : 0 , ' Wolbachia sp.' : 0.00046 ) : 0 , ' Wolbachia sp. str. 81' : 0.00056 ) : 0 , ' Wolbachia sp.' : 0.00043 ) : 0 , ' Wolbachia sp.' : 0 ) : 0.00088 , (' symbiont of incompatibility symbiont of Nasonia vitripennis' : 0.00188 , (' symbiont of incompatibility symbiont of Nasonia giraulti' : 0.0021 , ((' Wolbachia sp.' : 0.00115 , ' Wolbachia sp.' : 0.00368 ) : 0.00046 , (' symbiont of incompatibility symbiont of Nasonia longicornis' : 0.00102 , (' Wolbachia sp.' : 0 , (' Wolbachia pipientis' : 0 , ((' endosymbiont of Bangasternus orientalis' : 0.00289 , ' symbiont of incompatibility symbiont of Nasonia vitripennis' : 0 ) : 0 , (' Wolbachia pipientis' : 0.00327 , (((' Wolbachia sp. str. 89' : 0.0006 , ' Wolbachia sp. str. 85' : 0 ) : 0.00129 , ' Wolbachia sp.' : 0 ) : 0 , ((' Wolbachia sp.' : 0 , ' Wolbachia sp.' : 0.00086 ) : 0 , (((' Wolbachia pipientis' : 0 , ' Wolbachia pipientis' : 0 ) : 0 , ' Wolbachia pipientis' : 0 ) : 0.00038 , (' Wolbachia sp.' : 0.00186 , (' Wolbachia sp.' : 0 , ((' symbiont of Trichogramma deion' : 0.00538 , ' symbiont of Trichogramma deion' : 0.00136 ) : 0 , (' symbiont of Trichogramma deion' : 0.00127 , (' symbiont of Trichogramma cordubensis' : 0.00041 , (' symbiont of Trichogramma deion' : 0 , ' symbiont of Trichogramma pretiosum' : 0.00035 ) : 0.00294 ) : 0.00083 ) : 0.00194 ) : 0 ) : 0.00211 ) : 0.00221 ) : 0.00042 ) : 0.00063 ) : 0.00136 ) : 0.00135 ) : 0.00092 ) : 0.00092 ) : 0.00231 ) : 0.00693 ) : 0.00453 ) : 0.00216 ) : 0.00719 ) : 0.00186 ) : 0.0018 ) : 0.00389 ) : 0.28976 )'WOLBACHIA' : 0.03889 ) : 0.07999 ) : 0.11895 ) : 0.03929 ) : 0.0094 )'RICKETTSIA' : 0.03332 )'RHODOBACTER-RICKETTSIA' : 0.00656 ) : 0.00617 ) : 0.02433 , (' str. MV1' : 0.04375 , (' Oceanospirillum pusillum IFO 13613 (T)' : 0 , ' Oceanospirillum pusillum ATCC 33338 (T)' : 0 ) : 0.0786 )'OSP.PUSILLUM' : 0.01933 ) : 0.01343 , ((((((' Rhodospirillum rubrum str. ATH 1.1.1; S.1 ATCC 11170 (T)' : 0.00088 , ' Rhodospirillum rubrum str. ATH 1.1.1; S.1 ATCC 11170 (T)' : 0.00053 ) : 7e-05 , ' Rhodospirillum rubrum str. ATH 1.1.1; S.1 ATCC 11170 (T)' : 0.00247 ) : 7e-05 , ' Rhodospirillum rubrum' : 0.00014 ) : 0.00949 , (' Rhodospirillum sp. str. E-12' : 0.00171 , ' Rhodospirillum photometricum str. E-11' : 0.0036 ) : 0.01878 ) : 0.0255 , ' Aquaspirillum itersonii NCIMB 9070' : 0.48792 )'R.RUBRUM' : 0.01303 , (((((' Magnetospirillum sp. str. AMB-1' : 0 , ' Magnetospirillum sp. str. MGT-1' : 0.00361 ) : 0.00385 , (' Magnetospirillum magnetotacticum DSM 3856 (T)' : 0 , ' Magnetospirillum magnetotacticum' : 0.00315 ) : 0 ) : 0.01159 , (' str. SBR2042' : 0.00761 , ' Magnetospirillum gryphiswaldense str. MSR-1 DSM 6361 (T)' : 0.16361 ) : 0.01413 ) : 0.00855 , (' Phaeospirillum molischianum ATCC 14031 (T)' : 0.00079 , (' Phaeospirillum fulvum str. 1360 NCIMB 11762 (T)' : 0.00254 , ' Phaeospirillum fulvum str. 1360 ATCC 15798' : 0.00034 ) : 0.00253 ) : 0.01954 )'MAG.GRYPHISWALDENSE' : 0.01155 , (' clone SAR 116' : 0.16019 , (((((((' Azospirillum irakense str. KBC1' : 0 , ' Azospirillum irakense str. KA3' : 0.00306 ) : 0.00443 , ' Azospirillum irakense str. 103312' : 0.0057 ) : 0.00352 , (' Azospirillum sp. str. 5 AZ DSM 4835' : 0.00556 , ' Azospirillum sp. str. 4 AZ DSM 4834' : 0.00628 ) : 0.00466 ) : 0.00438 , ((' Rhodocista sp.' : 0 , ' Rhodocista sp.' : 0 ) : 0.00063 , (' Rhodocista centenaria IAM 14193 (T)' : 0 , ' Rhodocista centenaria' : 0 ) : 0.00767 ) : 0.01698 ) : 0.01343 , (' Azospirillum amazonense str. Y-1 DSM 2787 (T)' : 0.00104 , (' Azospirillum amazonense str. Y2' : 0.00183 , ' Azospirillum amazonense str. Y-1 DSM 2787 (T)' : 0.0098 ) : 0.00201 ) : 0.09375 ) : 0.00821 , (' clone PLY35' : 0.06413 , ' Skermanella parooensis ACM 2042 (T)' : 0.09478 ) : 0.02095 ) : 0.00559 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 77' : 0.0836 , ((' Azospirillum halopraeferens str. Au4' : 0.00998 , ' Azospirillum halopraeferens str. AU4 DSM 3675 (T)' : 0.00071 ) : 0.00416 , (((((((' Azospirillum brasilense str. Sp 7 DSM 1690 (T)' : 0 , ' Azospirillum brasilense str. Cdr' : 0 ) : 0 , ' Azospirillum brasilense str. SpF94' : 0 ) : 0.01155 , ' Azospirillum brasilense str. Sp 7 NCIMB 11860 (T)' : 0 ) : 0.00382 , ' Azospirillum brasilense str. Sp 7 ATCC 29145 (T)' : 0 ) : 0.0029 , (' Azospirillum brasilense str. Sp T60 DSM 2298' : 0.00611 , (' Azospirillum sp. str. 129/2' : 0 , ' Azospirillum sp. str. 129/1' : 0 ) : 0.00777 ) : 0.00166 ) : 0.00716 , ' Azospirillum brasilense str. Sp 81 DSM 1859' : 0.00177 ) : 0.00407 , (((' Azospirillum lipoferum str. F' : 0.02581 , ' Azospirillum sp. str. 137/5' : 0.00218 ) : 0.00671 , ' Azospirillum lipoferum str. PA1' : 0.00148 ) : 0.00226 , (' Azospirillum largomobile ACM 2041 (T)' : 0.00064 , ((' Azospirillum lipoferum str. VIP Sp RG 20a ATCC 29708' : 0.00531 , ' Azospirillum lipoferum str. BR17' : 0.00282 ) : 0 , (' Azospirillum lipoferum str. VPI Sp RG6xx ATCC 29731' : 0.00592 , (' Azospirillum lipoferum str. W03' : 0.0171 , (' Azospirillum lipoferum str. VPI Sp 59b ATCC 29707 (T)' : 0.00402 , ' Azospirillum lipoferum str. VPI Sp 59b NCIMB 11861 (T)' : 0 ) : 0.00396 ) : 0.00141 ) : 0.00115 ) : 0.03542 ) : 0.00594 ) : 0.00525 ) : 0.02182 ) : 0.03252 ) : 0.0174 )'AZS.LIPOFERUM' : 0.07592 ) : 0.12529 ) : 0.01542 )'AZOSPIRILLUM' : 0.01533 ) : 0.04356 , ' str. SBR1030' : 0.00748 ) : 0.02474 , (' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type O' : 0.06799 , (' Roseococcus thiosulfatophilus str. RB-3 DSM 8511 (T)' : 0.01245 , ((((' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD52' : 0.00244 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD47' : 0.0021 ) : 0.01346 , ' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 74' : 0.02226 ) : 0.00993 , (' Mount Coot-tha region (Brisbane, Australia) 5-10cm depth soil DNA clone MC 106' : 0.01435 , (' Rhodopila globiformis str. 7950 DSM 161' : 0.00093 , ' Rhodopila globiformis str. 7950 DSM 161' : 0 ) : 0.01796 ) : 0.01714 )'RPL.GLOBIFORMIS' : 0.00798 , ((((((' Acetobacter pasteurianus str. LMD 22.1 LMG 1262 (T)' : 0.00166 , ' Acetobacter pomorum str. LTH 2458 DSM 11825 (T)' : 0.00061 ) : 0.00619 , (' Acetobacter aceti NCIMB 8621 (T)' : 0.00053 , ' Acetobacter aceti JCM 7641 (T)' : 0 ) : 0.01551 ) : 0.00284 , (' Gluconobacter oxydans subsp. oxydans DSM 3503 (T)' : 0.00487 , (' Gluconobacter frateurii IFO 3264 (T)' : 0.00324 , (' Gluconobacter cerinus IFO 3267 (T)' : 0.0087 , ' Gluconobacter asaii IFO 3276 (T)' : 0.00203 ) : 0.00325 ) : 0.00941 ) : 0.01962 ) : 0.00821 , (' Acidomonas methanolica str. MB 58 IMET 10945 (T)' : 0.00285 , ' Acidomonas methanolica str. MB 58 IMET 10945 (T)' : 0.00178 ) : 0.01487 ) : 0.00308 , ((' Gluconacetobacter liquefaciens IFO 12388 (T)' : 0.00397 , ' Gluconacetobacter diazotrophicus ATCC 49037 (T)' : 0.00702 ) : 0.00868 , (' Gluconacetobacter hansenii NCIMB 8746 (T)' : 0.00838 , ((' Gluconacetobacter xylinus subsp. xylinus NCIMB 11664 (T)' : 0.00085 , ' Gluconacetobacter xylinus subsp. sucrofermentans str. BPR2001 JCM 9730 (T)' : 0.00117 ) : 0.00029 , (' Gluconacetobacter europaeus str. DES11 DSM 6160 (T)' : 1e-05 , (' Acetobacter intermedius str. TF2 DSM 11804 (T)' : 0.00115 , ' Acetobacter oboediens str. LTH 2460 DSM 11826 (T)' : 0.00056 ) : 0.00348 ) : 0.00274 ) : 0.00201 ) : 0.00212 ) : 0.00398 )'ABA.ACETI' : 0.01765 , ((((' Acidocella facilis str. PW2 ATCC 35904 (T)' : 0.00091 , ' Acidocella facilis str. PW2 ATCC 35904 (T)' : 0.00608 ) : 0.00663 , ' Acidocella aminolytica str. 101 (T) JCM 8796' : 0.00713 ) : 0.01538 , ' str. SBR2078' : 0.12375 ) : 0.00867 , (((((((' Acidiphilium angustum ATCC 35903 (T)' : 0 , ' Acidiphilium rubrum ATCC 35905 (T)' : 0 ) : 0.00074 , (' Acidiphilium sp. str. QBP' : 0.02554 , ' Acidiphilium angustum ATCC 35903 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Acidiphilium rubrum ATCC 35905 (T)' : 0.00109 ) : 0.00225 , ' Acidiphilium acidophilum ATCC 27807 (T)' : 0.00474 ) : 0.00619 , ' Acidiphilium acidophilum ATCC 27807 (T)' : 0 ) : 0.01242 , ' Acidiphilium sp. str. C-1' : 0.00961 ) : 0.00865 , (' clone SMK2321' : 0.00371 , ((' Acidiphilium multivorum AIU 301 (T)' : 0.00031 , ' Acidiphilium acidophilum' : 0.00968 ) : 0 , ((' Acidiphilium organovorum ATCC 43141 (T)' : 0 , ' Acidiphilium cryptum ATCC 33463 (T)' : 0.00151 ) : 0 , (' Acidiphilium cryptum ATCC 33463 (T)' : 0.00054 , (' clone cOS6' : 0.00053 , ' Acidiphilium cryptum str. B-Het4' : 0.00046 ) : 0.00307 ) : 0 ) : 0.00031 ) : 0.0687 ) : 0.01105 ) : 0.0138 )'ACDP.CRYPTUM' : 0.01839 ) : 0.01322 ) : 0.05828 ) : 0.04581 )'RHODOPILA' : 0.00427 ) : 0.01009 , (' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A22L' : 0.02191 , (' Rhodospirillum sodomense str. DS1 ATCC 51195 (T)' : 0.00215 , (' Rhodovibrio salinarum ATCC 35394 (T)' : 0.00216 , ' Rhodovibrio salinarum NCIMB 2243 (T)' : 0.00231 ) : 0.0059 ) : 0.18446 )'RDV.SALINARUM' : 0.00501 )'ALPHA_PROTEOBACTERIA' : 0.06343 , ((((' Halorhodospira halophila str. SL 1 DSM 244 (T)' : 0.00101 , ' Halorhodospira halophila str. BN 9624; 51/1' : 0.00748 ) : 0.00244 , ' Halorhodospira halophila str. BN 9630; 51/3' : 0.0205 ) : 0.0053 , (' Halorhodospira abdelmalekii str. BN 9840; 51/20 DSM 2110 (T)' : 0 , (' Halorhodospira halochloris str. A ATCC 35916 (T)' : 0 , ' Halorhodospira halochloris str. BN 9851; 51/12' : 0 ) : 0.00934 ) : 0.0244 )'HALORHODOSPIRA' : 0.01495 , ((' Nitrococcus mobilis ATCC 25380 (T)' : 0.02093 , ' Arhodomonas aquaeolei str. HA-1 ATCC 49307 (T)' : 0.02152 )'ARHODOMONAS_AND_NITROCOCCUS' : 0.01357 , (((((((' Ectothiorhodospira haloalkaliphila str. BN 9903; 51/7' : 0 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 18' : 0.23222 ) : 0.00374 , ' Ectothiorhodospira haloalkaliphila str. BN 9902; C' : 0.00552 ) : 0.00151 , ' Ectothiorhodospira marina str. BN 9914; Matheron BA 1010 DSM 241 (T)' : 0.00911 ) : 0.0023 , ' Ectothiorhodospira marismortui str. BN 9410; Oren EG-1 DSM 4180 (T)' : 0.01588 ) : 0.00181 , ' Ectothiorhodospira mobilis str. BN 9911; Truper 8112 DSM 237 (T)' : 0.0192 ) : 0.00427 , (' Ectothiorhodospira vacuolata str. BN 9512; beta1 DSM 2111 (T)' : 0.00208 , (' Ectothiorhodospira shaposhnikovii DSM 243 (T)' : 0 , ' Ectothiorhodospira shaposhnikovii str. BN 9912; Truper 8115 DSM 239' : 0.00301 ) : 0.006 ) : 0.00507 )'ECTOTHIORHODOSPIRA' : 0.00811 , ((((((((((' Thiorhodovibrio winogradskyi str. MBIC2776T' : 0 , ' Thiorhodovibrio winogradskyi str. SSP1 DSM 6702 (T)' : 0.00128 ) : 0.00357 , ' Rhabdochromatium marinum str. 8315-5 DSM 5261 (T)' : 0.01688 ) : 0.00713 , ' Thiohalocapsa halophila str. SG3202 DSM 6210 (T)' : 0.01219 ) : 0.0015 , (' Marichromatium purpuratum str. BN 5500 DSM 1591 (T)' : 0.00168 , (' Marichromatium purpuratum str. BN 5500 DSM 1591 (T)' : 0.01241 , ' Marichromatium gracile str. BN 5210 DSM 203 (T)' : 0.026 ) : 0.00608 ) : 0.01087 ) : 0.00258 , (' Halochromatium salexigens str. 6310 DSM 4395 (T)' : 0.01221 , ' Halochromatium glycolicum str. BN 3201' : 0.01854 ) : 0.0111 ) : 0.00063 , ((' Allochromatium warmingii DSM 173 (T)' : 0.02663 , ' Thiorhodospira sibirica str. A12' : 0.03476 ) : 0.0043 , (' symbiont of Laxus sp. found in Belize' : 0.00794 , ' endosymbiont of Inanidrilus leukodermatus, S-oxidizing' : 0.00736 ) : 0.00586 ) : 0.02258 ) : 0.00654 , (' str. Thd2' : 0.01292 , (' Lamprocystis roseopersicina DSM 229 (T)' : 0.00099 , (' Amoebobacter purpureus str. ThSchl2 DSM 4197 (T)' : 0 , ' Amoebobacter purpureus str. ThSchl2 DSM 4197 (T)' : 0.01516 ) : 0.00284 ) : 0.01707 ) : 0.00876 )'MCH.PURPURATUM' : 0.00209 , (((((' Thiocapsa rosea str. 6611 DSM 235 (T)' : 0 , ' Thiocapsa rosea str. 6611 DSM 235 (T)' : 0.01536 ) : 0.00437 , (' clone T5811' : 0.00881 , ' Thiocapsa pendens str. 1314 DSM 236 (T)' : 0.02647 ) : 0.00565 ) : 0.00668 , ' Thiolamprovum pedioforme str. Taichung DSM 3802 (T)' : 0.03262 ) : 0.01123 , ' Thiorhodococcus minor str. HA2P ATCC 700259 (T)' : 0.01226 )'TCP.ROSEA' : 0.00087 , (' Isochromatium buderi DSM 176 (T)' : 0.00123 , (((' Thermochromatium tepidum str. MC ATCC 43061 (T)' : 0.03076 , ' Thiococcus pfennigii str. RG3 DSM 226' : 0.02671 ) : 0.01093 , (' Allochromatium minutissimum str. glubokoe DSM 1376 (T)' : 0.00057 , ' Allochromatium vinosum ATCC 17899 (T)' : 0.00514 ) : 0.01249 ) : 0.00194 , (' Thiocystis violacea str. 2711 (N. Pfennig) DSM 207 (T)' : 0.00491 , (' Chromatium okenii DSM 169 (T)' : 0.00533 , (' Thiocystis minor DSM 178 (T)' : 0.00113 , (' Thiocystis violascens DSM 198 (T)' : 0.00416 , ' Thiocystis gelatinosa str. 2611 DSMZ 215 (T)' : 0.00776 ) : 0.01394 ) : 0.0162 ) : 0.01383 ) : 0.00369 ) : 0.04664 )'THC.GELATI' : 0.0061 ) : 0.01701 ) : 0.005 , ((((' Thioploca araucae' : 0.00776 , ' Thioploca chileae' : 0.01864 ) : 0.00806 , ' Thioploca ingrica' : 0.01912 ) : 0.01109 , (' Beggiatoa alba str. B15LD DSM 1416' : 0.02926 , ' Beggiatoa sp. str. 1401-13' : 0.05732 ) : 0.01632 )'BEG.ALBA' : 0.00747 , ((' Nitrosococcus oceani str. C-107 (T)' : 0.00474 , ' Nitrosococcus oceani str. C-27' : 0.00279 )'NSC.OCEANI' : 0.03842 , (' Thiobacillus tepidarius DSM 3134 (T)' : 0.02309 , ((((' Thiobacillus thiooxidans' : 0 , ' Thiobacillus caldus str. KU DSM 8584 (T)' : 0.00126 ) : 0.02924 , (' Thiobacillus ferrooxidans IFO 14245' : 0.05456 , ' Thiobacillus ferrooxidans str. LM2' : 0.00118 ) : 0 ) : 0.01761 , ' Thiobacillus thiooxidans DSM 612' : 0.01617 ) : 0.00481 , ((' Thiobacillus thiooxidans str. 3/TA ATCC 19377 (T)' : 0.0075 , ' Thiobacillus thiooxidans str. B-53' : 0.00156 ) : 0.00264 , (((' Thiobacillus ferrooxidans str. N-Fe2' : 0 , ' clone cOS1' : 0 ) : 0.00084 , (' Thiobacillus ferrooxidans IFO 14262' : 0.01522 , ' Thiobacillus ferrooxidans str. N-Fe4' : 0 ) : 0.00522 ) : 0.00097 , (' Thiobacillus ferrooxidans str. F221' : 0.00247 , (' Thiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 (T)' : 0.00294 , (' Thiobacillus ferrooxidans str. N-Fe3' : 0.00465 , ' Thiobacillus ferrooxidans ATCC 19859' : 0.00077 ) : 0.00029 ) : 0.00095 ) : 0.00139 ) : 0.0083 ) : 0.00711 ) : 0.06563 )'THB.FERROOXIDANS' : 0.04872 ) : 0.01827 ) : 0.01119 )'THIOBACILLUS' : 0.0145 , ((((((((((((((' clone A11jk' : 0.0065 , ' clone A12s' : 0.0039 ) : 1e-05 , ' symbiont of Lucina pectinata gill' : 0.11201 ) : 0.02205 , ' symbiont of Thyasira flexuosa gill' : 0.1287 ) : 0.00535 , ' symbiont of Anodontia phillipiana (bivalve mollusc) gill' : 0.01615 ) : 0.00223 , ' clone A13k' : 0.10548 ) : 0.00304 , (' symbiont of Lucinoma aequizonata gill' : 0.00625 , (' symbiont of Lucinoma annulata' : 0.0058 , (' symbiont of Lucina floridana gill' : 0.00094 , ' symbiont of Codakia costata gill' : 0.00067 ) : 0.01133 ) : 0.00822 ) : 0.0112 ) : 0.00246 , (' symbiont of Lucina nassula' : 0.0044 , (' symbiont of Codakia orbicularis gill' : 0.00718 , ' symbiont of Codakia orbicularis gill' : 0.00036 ) : 0.00204 ) : 0.00901 ) : 0.003 , ' symbiont of Riftia pachyptila trophosome' : 0.11105 ) : 0.00571 , ((' Achromatium oxaliferum' : 0.0032 , ' Achromatium oxaliferum' : 0.0103 ) : 0.00523 , (' Achromatium oxaliferum' : 0.02127 , (' Achromatium oxaliferum' : 0 , (' Achromatium oxaliferum' : 0 , (' Achromatium oxaliferum' : 0.00042 , ' Achromatium oxaliferum' : 0 ) : 0.0009 ) : 0.00353 ) : 0.02616 ) : 0.03577 ) : 0.04319 ) : 0.0039 , ' symbiont of Solemya velum' : 0.04794 ) : 0.00438 , (' symbiont of Solemya reidi gill' : 0 , ' symbiont of Solemya reidi' : 0.00345 ) : 0.05301 ) : 0.00187 , ' marine snow associated clone agg47' : 0.08224 ) : 0.00481 , ' Thiobacillus ferrooxidans str. m-1 DSM 2392' : 0.06081 )'ACHROMATIUM' : 0.00533 , ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((' str. SBR2053' : 0.0012 , ' str. SBR1036' : 0.00271 ) : 0 , ' str. SBR1105' : 0.00171 ) : 0.0021 , (' str. T36' : 0.00384 , ' Aquaspirillum psychrophilum str. CA 1 LMG 5408 (T)' : 0.00459 ) : 0.0085 ) : 0.00757 , ' Aquaspirillum metamorphum LMG 4339 (T)' : 0.00191 ) : 0.00218 , ' str. SBR2089' : 0.00637 ) : 0 , ' str. SBR1084' : 0.00275 ) : 0 , ' str. SBR2041' : 0.00083 ) : 0 , ' str. T33' : 0 ) : 0.00189 , (' str. T69' : 0.00309 , ' str. T59' : 0 ) : 0.00251 ) : 0.03461 , ' clone JN6b' : 0.00202 ) : 0.00545 , (' clone G14' : 0 , (' clone G2' : 0.0061 , ' Aquaspirillum sinuosum LMG 4393 (T)' : 0 ) : 0.03172 ) : 0.00054 )'AQSP.PSYCHROPHILUM' : 0.00502 , (((' Acidovorax avenae subsp. cattleyae NCPPB 961 (T)' : 0.00155 , ' Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 (T)' : 0.0009 ) : 3e-05 , (' Acidovorax konjaci str. K2 ATCC 33996 (T)' : 0.00064 , ' Acidovorax avenae subsp. citrulli ATCC 29625 (T)' : 0.01303 ) : 0.00037 ) : 0.00696 , (((' Acidovorax delafieldii ATCC 17505 (T)' : 0.00156 , ' Rhodoferax limosa str. 7087' : 0 ) : 0.00266 , ' unnamed organism' : 0.00786 ) : 0.0033 , (((' str. SBR2010' : 0.0028 , ' str. SBR1091' : 0.00278 ) : 0 , (' str. SBR2048' : 0 , ' str. SBR2067' : 0.00175 ) : 0.00086 ) : 0.00013 , (' str. SBR1026' : 0.00013 , (' Acidovorax temperans CCUG 11779 (T)' : 0.00119 , (' str. T20' : 0 , ' Acidovorax facilis CCUG 2113 (T)' : 0 ) : 0.00432 ) : 0.00081 ) : 0 ) : 0.0003 ) : 0.00499 )'AV.AVENAE' : 0.00358 ) : 0.00315 , ' Xylophilus ampelinus ATCC 33914 (T)' : 0.00483 ) : 0.0226 , ' unnamed organism' : 0.00471 ) : 0.00111 , (' clone JAP301' : 0.0002 , ' Variovorax paradoxus IAM 12373 (T)' : 0.0039 )'VRV.PARADOXUS' : 0.00487 ) : 0.0087 , (' str. T65' : 0 , (' str. SBR2005' : 0 , ((((' str. SBR1112' : 0.00186 , ' str. SBR1079' : 0.00084 ) : 0 , ' str. SBR1072' : 0 ) : 0 , ' unnamed organism' : 0.00081 ) : 0 , (((' str. SBR2020' : 0.00295 , ' str. SBR1027' : 0.00083 ) : 0 , ' str. SBR2098' : 0.00091 ) : 0 , (' str. SBR1070' : 0 , (' str. SBR2012' : 0 , ' str. SBR2071' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.0009 ) : 0.00949 ) : 0.00111 )'STR.SBR2098' : 0.00588 ) : 0.00124 , ((' Aquaspirillum delicatum str. 146 LMG 4328 (T)' : 0 , ' Comamonas baltica' : 0.01024 ) : 0.00049 , (' Polaromonas vacuolata str. 34-P' : 0.00246 , ((((' Rhodoferax fermentans str. FR2' : 0 , ' Rhodoferax fermentans str. FR3' : 0 ) : 0.00623 , ' str. T14' : 0.00507 ) : 0.0014 , ' clone A45L' : 0.00219 ) : 0.00075 , ((' str. T67' : 0.00112 , ' str. T73' : 0.00213 ) : 0.00101 , (' clone A62L' : 0.00317 , ' str. T3' : 0 ) : 0.00417 ) : 0.00451 ) : 0.02757 ) : 0.00484 )'RHF.FERMENTANS' : 0.00582 ) : 0.01774 , ' str. SBR2018' : 0.00378 ) : 0.00924 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD44' : 0 , (' clone G1' : 0 , ' unnamed organism' : 0 ) : 0.0097 )'STR.BERLIN7' : 0.00519 ) : 0.01827 , ' Aquaspirillum gracile str. D4 ATCC 19624 (T)' : 0.00514 ) : 0.00652 , ((' str. T25' : 0.00317 , ' clone JN1af' : 0.01036 ) : 0.00322 , (' str. T19' : 0.01092 , ' str. T41' : 0.00718 ) : 0.00426 )'STR.T41' : 0.00736 ) : 0.00306 , (' Hydrogenophaga palleronii str. S1 DSM 63 (T)' : 0.00043 , (' Hydrogenophaga palleronii str. Stanier 362t1 CCUG 20334 (T)' : 0.00155 , (' clone JN11de' : 0.00708 , ' Hydrogenophaga taeniospiralis ATCC 49743 (T)' : 0.0052 ) : 0.00334 ) : 0.00117 )'HGP.PALLERONII' : 0.00319 ) : 0.0035 , (' Hydrogenophaga flava CCUG 1658 (T)' : 0.00399 , ' Hydrogenophaga pseudoflava str. GA3 ATCC 33668 (T)' : 0.00325 )'HGP.FLAVA' : 0.00287 ) : 0.00749 , (' str. T60' : 0.00478 , (' Brachymonas denitrificans str. AS-P1 JCM 9216 (T)' : 0.0063 , ((' Comamonas testosteroni str. RH 1104 ATCC 11996 (T)' : 0.01238 , ' Comamonas terrigena str. IMI 359870' : 0.02113 ) : 0.01096 , (' clone SMK198' : 0.00267 , (' clone A44t' : 0.00308 , (' Delftia acidovorans str. Stanier 14 ACM 489 (T)' : 0.00394 , ' clone JAP403' : 0.00168 ) : 0.00494 ) : 0.02582 ) : 0.00665 ) : 0.01316 ) : 0.03104 )'COM.TERRIGENA' : 0.00248 )'ACIDOVORAX' : 0.03147 , ((((((((' Rubrivivax gelatinosus str. ATH 2.2.1 ATCC 17011 (T)' : 0 , ' Rubrivivax gelatinosus str. ATH 2.2.1 ATCC 17011 (T)' : 0.00219 ) : 0.00049 , ' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE1' : 0.02559 ) : 0.00211 , ' Rubrivivax gelatinosus str. A3' : 0.00028 ) : 0.01486 , ' Alcaligenes latus IAM 12599 (T)' : 0.00357 ) : 0.00359 , (' str. SBR2063' : 0.0048 , (' str. SBR2087' : 0.00107 , ' str. SBR2034' : 0.00093 ) : 0.00835 ) : 0.00349 ) : 0.00149 , ' Ideonella dechloratans CCUG 30898 (T)' : 0.00165 )'RUB.GELATINOSUS' : 0.00113 , ' Leptothrix mobilis str. Feox-1 DSM 10617 (T)' : 0.00816 ) : 0.00179 , ((((((' Sphaerotilus natans str. 565' : 0 , ' Sphaerotilus natans ATCC 29329' : 0 ) : 0.00097 , ' clone SMK200' : 0.01799 ) : 0.00089 , ' Sphaerotilus natans ATCC 29330' : 0.0037 ) : 0.00305 , (' Sphaerotilus natans ATCC 15291' : 0 , ' Sphaerotilus natans ATCC 13338 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.03993 , ' str. SBR2088' : 0.00256 )'SPT.NATANS' : 0.00841 , ((((' str. SBR1061' : 0.0012 , ' str. SBR1060' : 0.00487 ) : 0 , ' str. SBR1077' : 0.00224 ) : 0.00781 , ' Leptothrix discophora str. SS-1 ATCC 43182 (T)' : 0.00095 ) : 0.00041 , ((' Roseateles depolymerans str. 61A DSM 11813 (T)' : 0 , ' Roseateles depolymerans str. 61B2' : 0.00031 ) : 0 , (((' Leptothrix discophora str. SP-6 ATCC 51168' : 0 , ' Leptothrix discophora str. SS-1 ATCC 43182 (T)' : 0 ) : 0 , (' Leptothrix cholodnii str. Mulder 5 LMG 7171' : 0.00253 , ' Leptothrix sp. str. NC-1' : 0 ) : 0 ) : 0 , ((' Aquabacterium parvum str. B6' : 0.00688 , ' clone G4' : 0 ) : 0.00261 , (' Aquabacterium commune str. B8' : 0.0011 , (' str. SBR2002' : 0.00335 , ' Aquabacterium citratiphilum str. B4' : 0.02559 ) : 0.00395 ) : 0.00454 ) : 0.00875 ) : 0.01187 ) : 0 )'LPTX.DISCOPHORA' : 0.00607 ) : 0.00657 )'LEPTOTHRIX' : 0.00367 ) : 0.03526 , ' clone SMK480' : 0.01345 ) : 0.00677 , ((' str. SBR1033' : 0.00947 , ' str. SBR1020' : 0.06155 ) : 0.02054 , (' str. SBR2025' : 0.00404 , (' str. SBR2038' : 0.00437 , (' str. SBR1002' : 0.00187 , ' str. SBR1074' : 0.00065 ) : 0.0055 ) : 0.02005 ) : 0.02437 )'STR.SBR1074' : 0.02303 ) : 0.00284 , (' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type N' : 0.02166 , (' Thiomonas thermosulfata ATCC 51520 (T)' : 0.02796 , ' Thiomonas perometabolis ATCC 23370 (T)' : 0.02645 ) : 0.00811 )'THB.THERMOSULFATUS' : 0 ) : 0.07206 , ' str. SBR1023' : 0.00663 )'ACIDOVORAX' : 0.00092 , ((((((((((((((((' Burkholderia cepacia str. G4' : 0.0013 , ' Thiomonas cuprina str. Hö5 DSM 5495 (T)' : 0.1154 ) : 0.00091 , ' Burkholderia vietnamiensis str. TVV70' : 0.0016 ) : 0.0002 , ' Burkholderia vietnamiensis str. TVV75' : 0.00373 ) : 0 , ' Burkholderia sp.' : 0 ) : 0 , (' Burkholderia sp.' : 0.00143 , (' Burkholderia cepacia str. Ballard 717; Starr PC 25 ATCC 25416 (T)' : 0 , ' Burkholderia cepacia str. Ballard 717; Starr PC 25 ATCC 25416 (T)' : 0 ) : 0.01156 ) : 0.00205 ) : 0.00059 , ' Burkholderia cepacia str. Ballard 717; Starr PC 25 ATCC 25416 (T)' : 0.00091 ) : 0.00132 , (' Burkholderia gladioli NCIMB 12451' : 0.00406 , ' Burkholderia cepacia' : 0.00712 ) : 0.00046 ) : 0 , ' Burkholderia cepacia' : 0.00195 ) : 0.00319 , ' Burkholderia pyrrocinia str. 2327 LMG 14191 (T)' : 0.00254 ) : 0.0017 , (' Burkholderia glumae LMG 2196 (T)' : 0.00081 , ((' Burkholderia plantarii LMG 16020 (T)' : 0.0039 , ' Burkholderia plantarii str. AZ 8201 LMG 9035 (T)' : 0.00085 ) : 0.00125 , (' Burkholderia gladioli ATCC 10248 (T)' : 0 , (' Burkholderia gladioli LMG 11626 (T)' : 0.00464 , ' Burkholderia gladioli EY 3258' : 0.00129 ) : 0.00048 ) : 0.00179 ) : 0.00129 ) : 0.00184 )'BUR.CEPACIA' : 0.00327 , (' Burkholderia thailandensis str. E264 ATCC 700388 (T)' : 0.00049 , ((' Burkholderia pseudomallei' : 0 , ' Burkholderia pseudomallei' : 0 ) : 0 , ((' Burkholderia pseudomallei ATCC 23343' : 0 , ' Burkholderia mallei str. China 7 ATCC 23344' : 0 ) : 0 , (' Burkholderia pseudomallei' : 0 , ' Burkholderia pseudomallei' : 0 ) : 0.00069 ) : 0 ) : 0.00328 )'BUR.THAILANDENSIS' : 0.00504 ) : 0.00132 , ((' Burkholderia glathei str. N 15 LMG 14190 (T)' : 0 , ' Burkholderia glathei str. N 15 LMG 14190 (T)' : 0.00176 ) : 0.00138 , (' Burkholderia caryophylli ATCC 25418' : 0.00337 , (' Burkholderia phenazinium str. 1A LMG 2247 (T)' : 0.00271 , ((' Burkholderia graminis str. C4D1M ATCC 700544 (T)' : 0.01031 , ' Burkholderia caribensis str. MWAP64' : 0.01341 ) : 0.00645 , (' Burkholderia sp.' : 0.00249 , (' Burkholderia sp.' : 0.01674 , (' Burkholderia sp.' : 0.01717 , (' str. MF657' : 0.07449 , ' str. MA674' : 0 ) : 0.0427 ) : 0.2707 ) : 0.00631 ) : 0.00416 ) : 0.00252 ) : 0.01573 ) : 0.01197 )'BUR.GLATHEI' : 0.00784 ) : 0.00896 , ' Burkholderia andropogonis ATCC 23061 (T)' : 0.01352 ) : 0.00363 , (' endosymbiont of mealybug (Pseudococcus maritimus)' : 0.00658 , (' endosymbiont of mealybug (Pseudococcus longispinus)' : 0.0051 , ' endosymbiont of mealybug (Dysmicoccus neobrivipes)' : 0.00495 ) : 0.03054 )'MEALYBUG_SYMBIONTS' : 0.13087 ) : 0.0314 , ' Burkholderia norimbergensis str. R2 DSM 11628 (T)' : 0.01653 )'BURKHOLDERIA' : 0.00714 , (((((((((((((((' Janthinobacterium lividum str. H-24 DSM 1522 (T)' : 5e-05 , ' clone JAP405' : 0.0083 ) : 5e-05 , ' str. PUS10.40' : 0.00432 ) : 0 , ' clone K11' : 0 ) : 0 , ' clone G22' : 0 ) : 0 , ' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G41' : 0.04043 ) : 0.003 , (' unnamed organism' : 0.01588 , (' Duganella zoogloeoides IAM 12670 (T)' : 0.00137 , ' Duganella zoogloeoides ATCC 25935' : 0.01183 ) : 0.00629 ) : 0.01603 ) : 0.02707 , (' Telluria mixta ACM 1762 (T)' : 0.0156 , ' Telluria chitinolytica str. 20M ACM 3522 (T)' : 0.0093 ) : 0.0034 ) : 0.02908 , ' clone A40t' : 0.00338 ) : 0.01083 , ' str. B0265' : 0.00952 ) : 0.00624 , (' clone G11' : 0.00275 , ' Pseudomonas lemoignei' : 0.01532 ) : 0.04808 ) : 0.03542 , ' str. Kw55' : 0 ) : 0.00646 , ' Herbaspirillum seropedicae str. Z67 DSM 6445 (T)' : 0.01367 ) : 0.0181 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD58' : 0.02321 ) : 0.00544 , (' str. SBR1014' : 0.00824 , (' Oxalobacter formigenes str. OxB ATCC 35274 (T)' : 0.00026 , ' Oxalobacter formigenes str. OxB ATCC 35274 (T)' : 0.00476 ) : 0.06039 ) : 0 )'OXALOBACTER' : 0.0094 , ((' Polynucleobacter necessarius' : 0.00534 , ' clone A43L' : 0.0036 )'PNB.NECESSARIUS' : 0.00461 , ((((' Ralstonia eutropha str. 3CB-1' : 0.00095 , ' Ralstonia eutropha str. 335 (R.Y. Stanier) ATCC 17697 (T)' : 0.00228 ) : 0 , (' Ralstonia eutropha str. B30P4' : 0.02542 , ' Alcaligenes sp. str. M91-3' : 0.00896 ) : 0.0145 ) : 0.00323 , ' Ralstonia gilardii LMG 5886 (T)' : 0.00358 )'RAL.EUTROPHA' : 0.00815 , (((((((((((((' Ralstonia solanacearum ATCC 11696 (T)' : 0 , ' Ralstonia solanacearum str. PDDCC1727; K60 ATCC 1696 (T)' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum ATCC 11696 (T)' : 0.00038 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum' : 0.00196 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum str. R207' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum CIP 210' : 0 ) : 0.00032 , ((' Ralstonia solanacearum str. R633' : 0 , ' Ralstonia solanacearum str. R639' : 0 ) : 0 , (' Ralstonia solanacearum str. R634' : 0 , ' Ralstonia solanacearum str. R483' : 0 ) : 0 ) : 0.00032 ) : 0 , (' Ralstonia solanacearum str. Br150' : 0 , ' Ralstonia solanacearum CIP 238' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum CIP 10' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum ACH 0158' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum ACH 0158' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum' : 0 )'RAL.SOLANA' : 0.00032 , ((((((((' Ralstonia solanacearum str. R288' : 0 , ' Ralstonia solanacearum str. R791' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum ACH 0171' : 0 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum CIP 365' : 0 ) : 0 , (' Ralstonia solanacearum ACH 092' : 0 , ' Ralstonia solanacearum ACH 092' : 0 ) : 0.00032 ) : 0 , ' Ralstonia solanacearum ACH 0171' : 0 ) : 0 , (' str. B704' : 0.01825 , ' Ralstonia solanacearum str. H1' : 0 ) : 0 ) : 0.00025 , ' Ralstonia solanacearum ACH 0732' : 0.00065 )'RAL.SOLAN4' : 0.00036 , (((((((' Ralstonia pickettii str. K 550 ATCC 27512' : 0 , ' Ralstonia pickettii str. K-288 NCTC 11149 (T)' : 0 ) : 0 , ' str. B0711' : 0.00044 ) : 0.00058 , (' Ralstonia pickettii str. E1625' : 0.00028 , ' Ralstonia pickettii str. PKO1' : 0 ) : 0.00108 ) : 0 , ' clone G42' : 0.01177 ) : 0.00031 , ' str. B708' : 0.01997 ) : 0.00015 , ' Ralstonia pickettii str. K-288 ATCC 27511' : 0.00031 )'RAL.PICKETTII' : 0.00415 , (' Ralstonia solanacearum' : 0 , (((' str. R223' : 0 , ' str. R506' : 0.00031 ) : 0 , ' str. R233' : 0 ) : 0 , ((' Ralstonia solanacearum str. R780' : 0 , ' Ralstonia solanacearum str. R142' : 0 ) : 0 , (' Pseudomonas syzygii' : 0 , (' Pseudomonas syzygii str. R001 (T)' : 0 , ' Pseudomonas syzygii str. R058' : 0 ) : 0 ) : 0.00031 ) : 0.00073 ) : 1e-05 )'PS.SYZYGII' : 0.00795 ) : 0.00118 ) : 0.00074 )'RAL.SOLANACEARUM' : 0.0112 ) : 0.03988 ) : 0.01837 ) : 0.01716 ) : 0.01194 ) : 0.00637 , (' Lautropia mirabilis str. AB2188 NCTC 12852 (T)' : 0.00553 , ((' Sutterella wadsworthensis str. WAL 7877' : 0.0003 , ' Sutterella wadsworthensis str. WAL 9054' : 0 )'SUT.WADSWORTHENSIS' : 0.05677 , (((' Taylorella equigenitalis NCTC 11184 (T)' : 0.01703 , ' Pelistega europaea str. N57 LMG 10982 (T)' : 0.01493 ) : 0.0066 , (' str. S14' : 0.00526 , ' str. S2' : 0.00429 ) : 0.00973 )'PLS.EUROPAEA' : 0.0024 , ((' Alcaligenes faecalis subsp. faecalis ATCC 8750 (T)' : 0.00693 , ' Alcaligenes defragrans str. 54Pin DSM 12141 (T)' : 0.01163 ) : 0.00112 , (' Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans ATCC 15173 (T)' : 0.00219 , ((' str. B0272' : 0 , ' clone pM10' : 0.00156 ) : 0 , (' clone K6' : 0.00786 , ((' symbiont of Crithidia sp.' : 0.00836 , ' endosymbiont of Blastocrithidia culicis' : 0.01338 ) : 0.00207 , (' Bordetella avium ATCC 35086 (T)' : 0.00497 , (' Bordetella bronchiseptica str. S-1' : 0 , (' Bordetella bronchiseptica str. Dog 71 ATCC 19395 (T)' : 0 , (' Bordetella parapertussis ATCC 15311 (T)' : 0.00107 , (' Bordetella holmesii CDC F5101 (T)' : 0.00298 , ' Bordetella pertussis ATCC 9797 (T)' : 0.00036 ) : 0 ) : 0 ) : 0.0003 ) : 0.00229 ) : 0.01783 ) : 0.00327 ) : 1e-05 ) : 0.00743 ) : 0.02354 )'BRD.BRONCHISEPTICA' : 0.0062 ) : 0.05697 ) : 0.02927 )'BORDETELLA' : 0.00731 ) : 0.00508 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD37' : 0.04444 ) : 0.00538 , (((' Thiobacillus thioparus ATCC 8158 (T)' : 0.00413 , ' unnamed organism' : 0.00429 ) : 0.04711 , ' Spirillum volutans ATCC 19554 (T)' : 0.03512 ) : 0.00639 , (' str. SBR1090' : 0.00719 , (' str. SBR1021' : 0.01151 , (' str. SBR1001' : 0 , ' str. SBR2080' : 0.00278 ) : 0.02064 ) : 0.01249 ) : 0.01347 )'SPR.VOLUTANS' : 0.01311 ) : 0.00462 , (' Azoarcus sp. str. 6a3' : 0.02495 , ((((((((((' clone JN7b' : 0 , ' clone G10' : 0.0136 ) : 0.00191 , ' clone G13' : 0.01216 ) : 0.00101 , ' clone G16' : 0.00899 ) : 0.00539 , ' clone G19' : 0.03052 ) : 0.01768 , ' unnamed organism' : 0.02222 ) : 0.00273 , (((' str. SBR2058' : 0.01508 , ' str. SBR1025' : 0.01374 ) : 0.00435 , ' Dechlorimonas agitatus str. CKB (T)' : 0.00543 ) : 0.00133 , (' clone G3' : 0.00821 , (' clone G5' : 0 , ' unnamed organism' : 0 ) : 0.00816 ) : 0.01645 ) : 0.00962 )'DCL.AGITATUS' : 0.01222 , ' clone G6' : 0.01802 ) : 0 , (' str. SBR1119' : 0.01968 , (' Rhodocyclus purpureus str. 6770 DSM 168 (T)' : 0.01375 , ((' Rhodocyclus tenuis str. 2761 DSM 109 (T)' : 0 , ' Rhodocyclus tenuis str. SW18' : 0 ) : 0.0091 , (' Rhodocyclus tenuis str. 3760 DSM 110' : 0.0029 , (' str. SBR2090' : 0.00555 , (' str. SBR1058' : 0.00691 , ' clone SMK107' : 0.03925 ) : 0 ) : 0.00209 ) : 0.00781 ) : 0.00498 ) : 0.00539 )'RCY.TENUIS' : 0.00505 ) : 0.00104 , (' Azoarcus sp. str. S5b2' : 0.03421 , (' Octopus Spring microbial mat DNA from Yellowstone NP clone Type G' : 0.02211 , (' clone JA22hi' : 0 , ' Hydrogenophilus thermoluteolus str. TH-1' : 0 ) : 0.02556 ) : 0.05391 )'HGH.THLUTE' : 0.00279 ) : 0.00513 , (((((((((' clone G8' : 0 , ' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A46L' : 0 ) : 0.00385 , ' Duganella zoogloeoides IAM 12136' : 0.00745 ) : 0.00087 , ' Duganella zoogloeoides str. 235 (N.C. Dondero) ATCC 19324' : 0.00385 ) : 0.00088 , ' Duganella zoogloeoides ATCC 19544' : 0.00046 ) : 0.00092 , ' str. SBR1037' : 0.00244 ) : 0.0093 , ' Zoogloea sp. str. DhA-35' : 0.01225 ) : 0.00339 , ' clone G12' : 0.0175 ) : 0.0006 , (' str. SBR1009' : 0.00345 , ' str. SBR1056' : 0.00651 ) : 0.00866 )'DG.ZOOGLOEOIDES_II' : 0.00571 , ((((((' str. SBR1011' : 0.00601 , ' str. SBR1022' : 0 ) : 0.00184 , (' clone AX39' : 0 , ' Thauera selenatis str. Ax ATCC 55363 (T)' : 0.00045 ) : 0.00341 ) : 0.00276 , ' Thauera aromatica str. K172, clone K1 DSM 6984 (T)' : 0.00976 ) : 0.00297 , ' Thauera linaloolentis str. 47Lol DSM 12138 (T)' : 0.01294 ) : 0.00387 , ' Thauera terpenica str. 58Eu DSM 12139 (T)' : 0.0109 )'THA.AROMATICA' : 0.00581 , (((' Azoarcus indigens str. VB32 (T)' : 0 , ' Azoarcus indigens str. VB32 LMG 9092 (T)' : 0 ) : 0.00508 , ' Azoarcus sp.' : 0.01855 ) : 0.00308 , (' Azoarcus sp. str. BH72' : 0.02233 , (((' Azoarcus communis str. KGP1' : 0 , ' Azoarcus communis str. SWub3 (T)' : 0.00841 ) : 0.00135 , ' Azoarcus communis str. SWub3 DSM 12120 (T)' : 0.00271 ) : 0.01166 , (' Azoarcus anaerobius str. LuFRes1 DSM 12081 (T)' : 0.01363 , (((' Azoarcus denitrificians str. Td-2' : 0.00148 , ' Azoarcus tolulyticus str. Tol-4' : 0.00038 ) : 0 , ' Azoarcus denitrificians str. Td-1' : 0.00035 ) : 0.00251 , ((' Azoarcus denitrificians str. Td-15' : 0.00042 , ' Azoarcus denitrificians str. Td-17' : 0.00269 ) : 0.00092 , (' Azoarcus denitrificians str. Td-21' : 0.00025 , ((' Azoarcus sp. str. pF6' : 0 , ' Azoarcus evansii str. KB740 DSM 6898 (T)' : 0 ) : 0 , (' Azoarcus denitrificians str. Td-3' : 0.00312 , ' Azoarcus denitrificians str. Td-19' : 0.00201 ) : 0.00099 ) : 0.00298 ) : 0.00126 ) : 0.00322 ) : 0.00477 ) : 0.00814 ) : 0.00299 ) : 0.00347 )'AZC.INDIGENS' : 0.01039 ) : 0.06367 ) : 0.08587 ) : 0 )'AZOARCUS' : 0.00804 ) : 0.00274 , (((((((' clone G17' : 0.00242 , ' clone A4o' : 0.00509 ) : 0.00459 , ' clone A2g' : 0.00683 ) : 0.00236 , (' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A3g' : 0.00528 , ' clone A42L' : 0.00186 ) : 0.00377 ) : 0.00409 , ' Gallionella ferruginea str. (stock Johan)' : 0.01476 ) : 0.00311 , ' clone UN45' : 0.03576 ) : 0.00305 , ' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD17' : 0.01908 )'GALLIONELLA' : 0.00139 , (' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G34' : 0.04726 , (((((((((' Nitrosospira sp. str. AF' : 0.00183 , ' Nitrosospira sp. str. L115' : 0 ) : 0.0009 , ' Nitrosospira tenuis str. Nv1' : 0.00144 ) : 0.0011 , ' Nitrosospira tenuis str. C-141' : 0.00133 ) : 0.00079 , (' Nitrosospira tenuis str. Nv12' : 0.00149 , (' Nitrosospira briensis str. C-128' : 0.00323 , ' Nitrosospira briensis str. C-128' : 0.00206 ) : 0.00443 ) : 0.00266 ) : 0 , (' Nitrosospira multiformis ATCC 25198' : 0.00149 , (' Nitrosospira multiformis str. C-71 ATCC 25196 (T)' : 0 , (' Nitrosospira multiformis' : 0 , ' Nitrosospira multiformis str. C-71 ATCC 25196 (T)' : 0 ) : 0.00162 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00123 , (' Nitrosospira multiformis str. C-71 ATCC 25196 (T)' : 0.00042 , (' Nitrosospira sp. str. T7' : 0 , ' Nitrosospira sp. str. B6' : 0 ) : 0.00116 ) : 0.00208 ) : 0.00128 , (' Nitrosospira sp. str. D11' : 0.0005 , (' Nitrosospira sp. str. GM4' : 0.00061 , ' Nitrosospira sp. str. 40KI' : 0 ) : 0.00277 ) : 0.00207 ) : 0.00612 , ' clone AEM3' : 0.02418 )'NSS.MULTIFORMIS_SUBGROUP' : 0.00374 , (((((' Nitrosomonas communis str. Nm2' : 0 , ' Nitrosomonas sp. str. Nm58' : 0.01514 ) : 0 , ' Nitrosomonas sp. str. Nm33' : 0.00021 ) : 0 , ' Nitrosomonas sp. str. Nm41' : 0 ) : 0 , ' Nitrosomonas nitrosa str. Nm90' : 0.0029 )'NMN.COMMUNIS' : 0.00214 , (((' clone AEM6' : 0 , ' clone AEM5' : 0 ) : 0 , ' clone AEM4' : 0.0035 )'ENV.AEM5' : 0.0081 , ((((((' Nitrosomonas europaea' : 0.0017 , ' Nitrosomonas europaea str. C-31 (T); Nm50' : 0.00137 ) : 0.00302 , (' Nitrosomonas eutropha' : 0 , ' Nitrosomonas eutropha str. C-91; Nm57' : 0 ) : 0.00794 ) : 0 , ' Nitrosomonas europaea ATCC 25978 (T)' : 0.0008 ) : 0.00364 , (' Nitrosomonas halophila str. Nm1' : 0 , ' Nitrosomonas halophila str. Nm1' : 0 ) : 0.00812 ) : 0.01101 , ' Nitrosococcus mobilis str. Nc2' : 0.01379 )'NMN.EUROPAEA' : 0.00286 , (((' Nitrosomonas marina str. C-56; Nm63' : 0.00897 , ' Nitrosomonas marina str. Nm22' : 0 ) : 0.00277 , (' Nitrosomonas aestuarii str. Nm36' : 0 , ' Nitrosomonas marina str. Nm22' : 0.00353 ) : 0.00963 ) : 0.00204 , ((' clone AEM2' : 0 , ' clone AEM1' : 0 ) : 0.0132 , (' Nitrosomonas cryotolerans str. Nm55' : 0.00584 , (' Nitrosomonas sp. str. Nm84' : 0 , ((' Nitrosomonas ureae str. Nm10' : 0.00433 , ' Nitrosomonas ureae str. Nm10' : 0.00114 ) : 0 , (' Nitrosomonas sp. str. Nm86' : 0.02228 , ' Nitrosomonas oligotropha' : 0.01284 ) : 0.00807 ) : 0.00629 ) : 0.0066 ) : 0.01898 ) : 0.01384 )'NMN.MARINA' : 0.00812 ) : 0.00811 ) : 0.02482 ) : 0.00679 ) : 0.04885 ) : 0.03046 )'NITROSOMONAS' : 0.02374 ) : 0.00947 , ((((' Methylobacillus glycogenes str. T-11 ATCC 29475 (T)' : 0.00293 , ' Methylobacillus "methylovora" str. M12-4 ATCC 21852 (T)' : 0.00305 ) : 0.00661 , ' Methylobacillus "methylovora" str. M12-4 ATCC 21852 (T)' : 0.00674 ) : 0.00172 , ' Methylobacillus flagellatum str. KT1' : 0.0165 ) : 0.00429 , (' clone G7' : 0.01524 , (' Methylophilus methylotrophus str. AS1 ATCC 53528 (T)' : 0.00273 , (' str. s12' : 1e-05 , ' Methylophilus methylotrophus str. AS1 ATCC 53528 (T)' : 0 ) : 0.02712 ) : 0.01207 ) : 0.00537 )'METHYLOPHILUS' : 0.02749 ) : 0.00944 , (' str. SBR2062' : 0.07264 , ' str. SBR1096' : 0.03933 )'STR.SBR2062' : 0.01896 ) : 0 , (' Iodobacter fluviatile ATCC 33051 (T)' : 0.00326 , (' Microvirgula aerodenitrificans str. SGLY2 (T)' : 0.04345 , (' Vogesella indigofera ATCC 19706 (T)' : 0.02719 , (' Chromobacterium violaceum ATCC 12472 (T)' : 0.02859 , ((' Vitreoscilla stercoraria str. VT1' : 0 , ' Vitreoscilla stercoraria ATCC 15218 (T)' : 0.00038 )'VIT.STERCO' : 0.01281 , ((' Neisseria canis str. H6 ATCC 14687 (T)' : 0.00128 , ' str. SBR1041' : 0.01379 )'NIS.CANIS' : 0.00387 , (' Kingella oralis str. UB-38 CCUG 30450 (T)' : 0.00325 , ((' Kingella kingae NCTC 10529 (T)' : 0 , ' Kingella kingae ATCC 23330 (T)' : 0 ) : 0.00463 , (((((((((' Eikenella corrodens ATCC 23834 (T)' : 0.00094 , ' Eikenella corrodens FDC 1073' : 0 ) : 0 , ' Eikenella corrodens FDC 558' : 0 ) : 0 , ' Eikenella corrodens FDC 373' : 0 ) : 0.00617 , ' Eikenella sp. str. UB-204 CCUG 28283' : 0.01378 ) : 0.00594 , (' Simonsiella muelleri ATCC 29453 (T)' : 0.00465 , (' Neisseria denitrificans str. M37 ATCC 14686 (T)' : 0 , ' Neisseria denitrificans str. M37 ATCC 14686 (T)' : 0 ) : 0.02196 ) : 0.00218 ) : 0.008 , (' Kingella denitrificans str. UB-294 CCUG 28284' : 0 , ' Kingella denitrificans ATCC 33394 (T)' : 0.00091 ) : 0.00238 ) : 0.00758 , (' Neisseria elongata ATCC 25295 (T)' : 0 , ' Neisseria elongata' : 0.00068 ) : 0.00439 ) : 0.00461 , ' Neisseria animalis str. NA1 ATCC 19573' : 0.00425 ) : 0.00333 , (' Neisseria weaveri CDC 8142' : 0.00498 , (' Neisseria flavescens str. N155 ATCC 13120 (T)' : 0.00244 , ((((((' Neisseria gonorrhoeae subsp. kochii NRL 32895' : 0.00188 , ' Neisseria meningitidis str. serotype A ATCC 13077 (T)' : 0 ) : 0.00128 , ' Neisseria sicca' : 0.00199 ) : 0 , ' Neisseria macacae str. M-740 ATCC 33926 (T)' : 0.00286 ) : 0.00071 , ' Neisseria pharyngis NCTC 4590' : 0.00092 ) : 0.00508 , ' Neisseria lactamica NCTC 10617 (T)' : 0.02513 ) : 0.00268 , ((' Neisseria meningitidis str. serotype A NCTC 10025 (T)' : 0 , ' Neisseria meningitidis str. 418' : 0 ) : 0.00092 , ((' Neisseria gonorrhoeae str. 2013' : 0.00063 , ' Neisseria gonorrhoeae str. B 5025 NCTC 8375 (T)' : 0 ) : 0.00094 , (' Neisseria polysaccharea ATCC 43768 (T)' : 1e-05 , (' Neisseria cinerea CDC 10050' : 0 , ' Neisseria polysaccharea ATCC 43768 (T)' : 0.00595 ) : 0.0036 ) : 0.00829 ) : 0.00285 ) : 0.00543 ) : 0.00294 ) : 0.00723 ) : 0.006 )'NIS.GONORRHOEAE' : 0.01699 ) : 0.01072 ) : 0.00613 ) : 0.01907 ) : 0.03005 ) : 0.01819 ) : 0.03013 ) : 0.0314 )'NEISSERIA' : 0.00982 )'BETA_PROTEOBACTERIA' : 0.01431 , ((' Nevskia ramosa str. Soe1 DSM 11499 (T)' : 0.04781 , ' clone A35o' : 0.37001 ) : 0.0286 , ((' Rhodanobacter lindaniclasticus str. RP5557 LMG 18385 (T)' : 0.0258 , ' Frateuria aurantia IFO 3245 (T)' : 0.01734 )'RHN.LINDANICLASTICUS' : 0.03403 , (' unidentified soil bacterium from paddy field clone PAD61' : 0.03648 , ((((' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_25' : 0.00142 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_3, PVB_5' : 0 ) : 0.00055 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_47' : 0.00057 ) : 0.00781 , ' Lysobacter antibioticus str. Ly a2 DSM 2044 (T)' : 0.00345 )'LYB.ANTBIO' : 0.01014 , ((((((' Stenotrophomonas maltophilia LMG 958 (T)' : 0 , ' Stenotrophomonas maltophilia ATCC 13637 (T)' : 0.00352 ) : 0.00075 , ' Stenotrophomonas africae str. MGB' : 0.00473 ) : 0 , ' Stenotrophomonas maltophilia ATCC 13637 (T)' : 0.0009 ) : 0.00178 , ' clone K13' : 0.00222 ) : 0.00067 , ' str. SBR2112' : 0.01456 )'STE.MALTOP' : 0.00097 , ((((((' str. SBR2015' : 0.00097 , ' str. SBR1055' : 0 ) : 0 , ' str. SBR1034' : 0 ) : 0 , ' str. SBR2059' : 0.00091 ) : 0.01532 , ' str. SBR1104' : 0 ) : 0.01499 , ' Xylella fastidiosa str. PWT-100 ATCC 35880' : 0.02437 )'XYL.FASTIDIOSA' : 0.00886 , (((((' Xanthomonas melonis LMG 8670 (T)' : 0 , ' Xanthomonas translucens LMG 876 (T)' : 0.00053 ) : 0 , ' Xanthomonas hyacinthi LMG 739 (T)' : 0.0008 ) : 0.00055 , ' Xanthomonas albilineans LMG 494 (T)' : 0.00087 ) : 0.00793 , (' str. SBR2076' : 1e-05 , ' Xanthomonas sacchari LMG 471 (T)' : 0.22993 ) : 0.00136 ) : 0.00484 , ((((' Xanthomonas campestris str. X56' : 0 , ' Xanthomonas campestris str. X56' : 0 ) : 0.01145 , (' Xanthomonas campestris str. XC53' : 0 , ' Xanthomonas campestris str. XC53' : 0 ) : 0.00168 ) : 0.00294 , (' Xanthomonas campestris str. XC41' : 0 , ' Xanthomonas campestris str. XC41' : 0 ) : 0.0056 ) : 0.00023 , (' Xanthomonas populi LMG 5743 (T)' : 0.00023 , (' Xanthomonas cucurbitae str. LMG (T)' : 0 , (' Xanthomonas theicola LMG 8684 (T)' : 0 , ((' Xanthomonas vesicatoria LMG 911 (T)' : 0 , ' Xanthomonas campestris LMG 568 (T)' : 0 ) : 0 , (' Xanthomonas campestris ATCC 33913 (T)' : 0 , (((' Xanthomonas pisi LMG 847 (T)' : 0 , ' Xanthomonas cassavae LMG 673 (T)' : 0 ) : 0 , ' Xanthomonas bromi LMG 947 (T)' : 0 ) : 0 , ((((' Xanthomonas vasicola LMG 736 (T)' : 0 , ' Xanthomonas phaseoli ATCC 49119 (T)' : 0 ) : 0 , ' Xanthomonas codiaei LMG 8678 (T)' : 0.00074 ) : 0.00026 , (' Xanthomonas oryzae LMG 5047 (T)' : 0 , ' Xanthomonas oryzae LMG 5047 (T)' : 0 ) : 0.00026 ) : 0 , ((' Xanthomonas fragariae LMG 708 (T)' : 0 , ' Xanthomonas fragariae ATCC 33239 (T)' : 0.00102 ) : 0.00024 , (' Xanthomonas axonopodis LMG 538 (T)' : 0 , (' Xanthomonas arboricola LMG 747 (T)' : 0 , ' Xanthomonas hortorum LMG 733 (T)' : 0 ) : 0.00275 ) : 0.00025 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00026 ) : 0 ) : 0.00024 ) : 0 ) : 0.00049 ) : 0.00142 ) : 0.00498 )'XAN.CAMPESTRIS' : 0.00992 ) : 0.00494 ) : 0.00624 ) : 0.06887 ) : 0.03365 ) : 0.08464 )'XANTHOMONAS' : 0.04326 ) : 0.01486 , ((' Thiobacillus neapolitanus str. X' : 0.05053 , ' Thiobacillus hydrothermalis str. R3 DSM 7121 (T)' : 0.02901 ) : 0.03518 , (' Cardiobacterium hominis ATCC 15826 (T)' : 0.02045 , (' Suttonella indologenes ATCC 25869 (T)' : 0.03763 , (' Dichelobacter nodosus' : 0.00481 , ' Dichelobacter nodosus str. 198A ATCC 27521' : 0 ) : 0.01771 ) : 0.02471 ) : 0.03075 )'DICHELOBACTER' : 0.00895 ) : 0.01559 , (((((((((((' symbiont of Calyptogena sp.' : 0.00093 , ' symbiont of Calyptogena sp.' : 0.00057 ) : 0.00049 , ' symbiont of Calyptogena sp. gill' : 0.00492 ) : 0 , ' symbiont of Calyptogena soyoae' : 0.00404 ) : 0 , ' symbiont of Calyptogena sp.' : 0.00119 ) : 0 , ' symbiont of Calyptogena sp.' : 0.00073 ) : 0.00308 , ' symbiont of Calyptogena elongata gill' : 0.0051 ) : 0.00444 , ' symbiont of Calyptogena magnifica' : 0.00996 ) : 0.00122 , ' symbiont of Vesicomya chordata gill' : 0.00484 ) : 0.01389 , (' symbiont of Bathymodiolus thermophilus gill' : 0.00673 , ' symbiont of mussel thioautotrophic gill' : 0.00757 ) : 0.0216 )'SYM.CLYPEL' : 0.01035 , (' Leucothrix mucor' : 0.06026 , ((' Thiothrix ramosa' : 0.03265 , ' str. SBR2039' : 0.02615 ) : 0.00644 , (' Thiothrix nivea str. JP2 DSM 5205 (T)' : 0 , ' Thiothrix nivea str. JP2 ATCC 35100' : 0 ) : 0.01053 ) : 0.06128 )'THTX.NIVEA' : 0.05153 ) : 0.01135 , (((((((((' Thiomicrospira sp. str. L12' : 0.00218 , ' Thiomicrospira sp. str. L12' : 0.00173 ) : 0.00188 , ' Thiomicrospira sp.' : 0 ) : 0 , ' Thiomicrospira crunogena ATCC 35932 (T)' : 0.00368 ) : 0.00618 , ' Thiomicrospira sp. str. MA2-6' : 0.00768 ) : 0.00407 , (' Hydrogenovibrio marinus str. MH-110 JCM 7688 (T)' : 0.00893 , ' Thiomicrospira kuenenii str. JB-A1' : 0.00696 ) : 0.00939 ) : 0.00396 , (' Thiomicrospira frisia str. JB-A2' : 0.01113 , ' Thiomicrospira chilensis str. Ch-1' : 0.01944 ) : 0.00906 )'TMS.FRISIA' : 0.01257 , (' clone 3611' : 0.06564 , (' Thiomicrospira thyasirae str. TG-2 DSM 5322 (T)' : 0.00558 , (' Thiomicrospira pelophila DSM 1534 (T)' : 0.0007 , ' Thiomicrospira thyasirae str. TG-2 DSM 5322 (T)' : 0.00362 ) : 0 ) : 0.23752 )'TMS.THYASI' : 0.30613 ) : 0.01857 , ((' Cycloclasticus pugetii str. PS-1 (T) ATCC 51542 (T)' : 0 , ' Cycloclasticus pugetii str. PS-1 (T) ATCC 51542 (T)' : 0 ) : 0.02515 , (' clone FL5' : 0.03032 , (' Methylophaga marina ATCC 35842 (T)' : 0.00661 , (' Methylophaga marina' : 0.00482 , (' Methylophaga sulfidovorans str. RB-1; 94-792 LMD 95.210 (T)' : 0.0056 , (' Methylophaga thalassica' : 0.00023 , ' Methylophaga thalassica ATCC 33146 (T)' : 0.00974 ) : 0.00297 ) : 0.00897 ) : 0.00303 ) : 0.04142 ) : 0.03587 )'MP.MARINA' : 0.06042 ) : 0.00492 , ((' Piscirickettsia salmonis' : 0.00202 , ' Piscirickettsia salmonis str. LF-89' : 0.00048 ) : 0.07119 , (' Wolbachia persica ATCC VR-331 (T)' : 0.00156 , (' Francisella tularensis str. Fx1' : 0 , (' Francisella novicida str. Utah 11 ATCC 15482 (T)' : 0.00021 , (((((' Francisella tularensis FSC 044' : 0 , ' Francisella tularensis SBL R45' : 0 ) : 0 , (' Francisella tularensis FSC 151' : 0 , ' Francisella tularensis FSC 026' : 0 ) : 0 ) : 0 , ' Francisella tularensis CCUG 17299' : 0.00092 ) : 0 , ' Francisella tularensis' : 0 ) : 0.00034 , ((' Francisella tularensis str. SCHU FSC 043' : 0 , ' Francisella tularensis subsp. tularensis str. lvs ATCC 6223 (T)' : 0.00034 ) : 0 , ((((' Francisella philomiragia ATCC 25017' : 0 , ' Francisella philomiragia CDC E6588' : 0 ) : 0.0004 , ' Francisella philomiragia ATCC 25015 (T)' : 0.00245 ) : 0.00043 , ' Francisella philomiragia ATCC 25015 (T)' : 0.00125 ) : 0 , (' Francisella tularensis FSC 046' : 0 , (' Francisella tularensis FSC 147' : 0 , (' Francisella novicida str. Utah 11 ATCC 15482 (T)' : 0 , ((' Francisella tularensis FSC 033' : 0 , ' Francisella tularensis FSC 041' : 0 ) : 0 , (' Francisella tularensis str. Fx2' : 0 , (' Francisella tularensis FSC 054' : 0 , (' Francisella tularensis FSC 022' : 0 , (' Francisella tularensis FSC 042' : 0 , (' Francisella tularensis FSC 090' : 0 , ' Francisella tularensis subsp. tularensis str. lvs ATCC 6223 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00081 ) : 0 ) : 0.00294 ) : 0 ) : 0.00134 ) : 0.00044 ) : 0.00068 ) : 0.00804 ) : 0.09851 )'FNC.TULAR' : 0.01222 ) : 0.01468 )'FRANCISELLA' : 0.01207 ) : 0.00197 , (((((((((((((((((((((' Fluoribacter dumoffii str. NY-23' : 0.00173 , ' Fluoribacter bozemanae str. WIGA NCTC 11368' : 0.03319 ) : 0.00769 , ' Fluoribacter dumoffii str. Tex-KL ATCC 33343' : 0 ) : 0.01643 , ' Fluoribacter gormanii str. LS-13 ATCC 33342 (T)' : 0.00174 ) : 0.00112 , ' Fluoribacter dumoffii NCTC 11370' : 0.00412 ) : 0.00119 , ' Fluoribacter dumoffii str. NY-23 ATCC 33279 (T)' : 0.00333 )'FLU.DUMOFFII' : 0.00171 , (' Fluoribacter gormanii NCTC 11401' : 0.00122 , ((' Legionella wadsworthii NCTC 11532' : 0.00154 , ' Legionella wadsworthii ATCC 33877 (T)' : 0.00633 ) : 0.0019 , (' Legionella cherrii' : 0 , ' Legionella cherrii ATCC 35252 (T)' : 0.01049 ) : 0.00302 ) : 0.00334 )'LEG.WADSWORTHII' : 0.00239 ) : 0.00091 , ' Legionella parisiensis NCTC 11983' : 0.00301 ) : 0.00087 , (' Legionella anisa ATCC 35292 (T)' : 0.0005 , ' Legionella anisa NCTC 11974' : 0.00145 )'LEG.ANISA' : 0.00154 ) : 0.00056 , (' Fluoribacter bozemanae str. MI-15' : 1e-05 , (' Fluoribacter bozemanae str. WIGA NCTC 11368' : 0.00146 , (' Fluoribacter bozemanae str. Mi-15 sgp1 NCTC 11369' : 0.0024 , ' Fluoribacter bozemanae str. spg2 NCTC 11975' : 0.00113 ) : 0.00755 ) : 0.01188 )'FLU.BOZEMANAE' : 0.01782 ) : 0.00054 , (' Legionella gratiana NCTC 12788' : 0.00397 , (' Legionella longbeachae str. Long-Beach-4 NCTC 11477' : 0.00021 , (' Legionella sainthelensi ATCC 35248 (T)' : 0.00165 , (' Legionella sainthelensi NCTC 11988' : 0.00215 , (' Legionella cincinnatiensis NCTC 12438' : 0.00145 , (' Legionella cincinnatiensis ATCC 43753 (T)' : 0.00038 , ' Legionella santicrucis NCTC 11999' : 0.00896 ) : 0.00382 ) : 0.00331 ) : 0.00343 ) : 0.00434 ) : 0.00945 )'LEG.CINCINNATIENSIS' : 0.00222 ) : 0.00077 , ((' Legionella steigerwaltii ATCC 35302 (T)' : 0 , ' Legionella steigerwaltii NCTC 11991' : 0.00273 ) : 0.00192 , (' Legionella tucsonensis NCTC 124439' : 0.00491 , ((' Legionella lytica str. LLAP-3 PCM 2298 (T)' : 0 , ' Legionella sp. str. LLAP-3' : 0 ) : 0.0002 , (' Legionella lytica str. LLAP-3 PCM 2298 (T)' : 0.00087 , ' Legionella lytica str. LLAP-3 PCM 2298 (T)' : 0.0006 ) : 0.00206 ) : 0.0155 ) : 0.00261 )'LEG.LYTICA' : 0.00212 ) : 0.00333 , (' Legionella worsleiensis NCTC 13277' : 0.00248 , (' Legionella quateirensis NCTC 12370' : 0.00055 , (' Legionella shakespearei NCTC 12829' : 0.01837 , ' Legionella moravica NCTC 12239' : 0.00436 ) : 0.00984 ) : 0.00497 )'LEG.SHAKESPEAREI' : 0.00864 ) : 0.00142 , ((' Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Chicago 2 ATCC 33215' : 0 , ' Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 ATCC 33152 (T)' : 0 ) : 0.0006 , (' Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Chicago 2 ATCC 33215' : 0.00768 , ((' Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 ATCC 33152 (T)' : 0.00907 , ' Legionella pneumophila subsp. fraseri str. Dallas-1E'' ATCC 33216' : 0.01614 ) : 1e-05 , (' Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Knoxville-1 NCTC 11286' : 0 , (' Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 NCTC 11192 (T)' : 0.00448 , (' Legionella pneumophila subsp. fraseri str. Dallas-1E NCTC 11405' : 0.00057 , ' Legionella pneumophila subsp. fraseri str. Los Angeles 1 NCTC 11233' : 0.00099 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00596 ) : 1e-05 ) : 0.01502 )'LEG.PNEUMOPHILA' : 0.00415 ) : 0.00991 , ' Legionella londiniensis NCTC 12374' : 0.01392 ) : 0.00071 , ((((((' Tatlockia micdadei str. TATLOCK ATCC 33218 (T)' : 0 , ' Tatlockia micdadei str. PPA-JC' : 0.00941 ) : 0.00196 , ' Tatlockia micdadei str. VAMC-Pgh-12 ATCC 33346' : 0.00855 ) : 0 , ' Tatlockia micdadei str. TATLOCK NCTC 11371 (T)' : 0.00285 ) : 0 , (' Tatlockia maceachernii str. PX-1-G2-E2 ATCC 35300 (T)' : 0.00751 , (' Tatlockia maceachernii str. PX-1-G2-E2 NCTC 11982 (T)' : 0 , ' Tatlockia maceachernii str. PX-1-G2-E2 NCTC 11982 (T)' : 0 ) : 0.01145 ) : 0.01214 ) : 0.00649 , (' Legionella feeleii str. 691-WI-H NCTC 11978' : 0.00169 , (' Legionella donaldsonii' : 0.00014 , (' Legionella feeleii str. WO-44C ATCC 35072 (T)' : 0 , ' Legionella feeleii str. 691-WI-H ATCC 35849' : 0.00035 ) : 0.00337 ) : 0.01214 ) : 0.01129 )'TAT.MICDADEI' : 0.00148 , ((' str. SBR1117' : 0.00201 , ' unnamed organism' : 0.00094 )'STR.SBR1117' : 0.00167 , ((' Legionella fairfieldensis NCTC 12488' : 0.01485 , ' Legionella lansingensis NCTC 12830' : 0.03881 ) : 0.00068 , (((' Legionella birminghamensis NCTC 12437' : 0.00369 , ' Legionella quinlivanii NCTC 12433' : 0.01776 ) : 0.00206 , (' Legionella adelaidensis NCTC 12735' : 0.01533 , ' Legionella geestiana NCTC 12373' : 0.04242 ) : 0.00283 ) : 0.0024 , ((' Legionella oakridgensis ATCC 33761 (T)' : 0.0014 , ' Legionella oakridgensis NCTC 11531' : 0.00226 ) : 0.00428 , (' Legionella nautarum NCTC 12375' : 0.00602 , (' Legionella israelensis NCTC 12010' : 0 , ' Legionella israelensis ATCC 43119' : 0 ) : 0.02839 ) : 0.02016 ) : 0.00763 ) : 0.00478 )'LEG.ISRAELENSIS' : 0.01286 ) : 0.0025 ) : 0.00449 ) : 0.00302 , (' Legionella spiritensis str. Mt St Helens-9 NCTC 11990' : 0.00969 , ((' Legionella erythra str. SE-32A-C8 NCTC 11977' : 0.00257 , ' Legionella erythra str. SE-32A-C8 ATCC 35303 (T)' : 0.00164 ) : 0.00061 , (' Legionella taurinensis str. Turin I no. 1 ATCC 700508 (T)' : 0.00317 , (' Legionella rubrilucens ATCC 35304 (T)' : 0.00026 , ' Legionella rubrilucens NCTC 11987' : 0 ) : 0.00219 ) : 0.00441 ) : 0.01286 )'LEG.ERYTHRA' : 0.00307 ) : 0.00456 , (' Legionella brunensis' : 0 , ' Legionella brunensis NCTC 12240' : 0.00053 )'LEG.BRUNENSIS' : 0.00558 ) : 0.00363 , (' Legionella hackeliae str. Lansing-2 NCTC 11979' : 0.00591 , (' Legionella jamestowniensis ATCC 35298 (T)' : 0.00202 , ' Legionella jamestowniensis NCTC 11981' : 0.01456 ) : 0.01163 )'LEG.JAMESTOWNIENSIS' : 0.00441 ) : 0.00574 , (' Legionella jordanis NCTC 11533' : 0.00314 , ' Legionella jordanis ATCC 33623 (T)' : 0.0008 )'LEG.JORDANIS' : 0.00759 )'LEGIONELLA' : 0.02295 , (' Rickettsiella grylli' : 0.09792 , (' Coxiella burnetii str. Q177' : 0.02328 , ' clone SAR 145' : 0.12983 ) : 0.01418 )'COX.BURNETII' : 0.03713 )'LEGIONELLA' : 0.00451 , (((((((((' Methylomicrobium agile str. A30 ACM 3308 (T)' : 0.00181 , ' Methylomicrobium album str. BG8' : 0.02695 ) : 0.00092 , ' Methylomicrobium album str. VKM-BG8 ACM 3314 (T)' : 0.00635 ) : 0.00202 , (' Methylobacter luteus ACM 3304' : 0.00224 , ' Methylobacter whittenburyi ACM 3309 (T)' : 0.00502 ) : 0.00522 ) : 0.00368 , (' Methylomicrobium pelagicum ACM 3505' : 0.00365 , (' Methylomicrobium pelagicum' : 0 , ' Methylomicrobium pelagicum' : 0 ) : 0.01935 ) : 0.01492 ) : 0.00655 , (' Methylomonas rubra str. VKM-15m NCIMB 11913' : 0.01903 , ((' Methylomonas fodinarum str. JB13 (phenon2) ACM 3268 (T)' : 0.00147 , ' Methylomonas aurantiaca str. JB103 (phenon3) ACM 3406 (T)' : 0.00077 ) : 0.02127 , (' Methylomonas sp. str. 761 NCIMB 11931' : 0.06391 , (' Methylomonas methanica' : 0.00715 , ' Methylomonas methanica str. S1 ATCC 35067 (T)' : 0 ) : 0.00215 ) : 0.00259 ) : 0.00631 ) : 0.01512 )'MLM.METHANICA' : 0.00227 , (((' symbiont of methanotrophic symbiont of Louisiana Slope mussel gill' : 0.00629 , ' symbiont of unidentified mussel methanotrophic gill' : 0.01373 ) : 0.00095 , ' Methylosphaera hansonii str. AM6 ACAM 549 (T)' : 0.0301 ) : 0.00095 , (' Methylomonas sp. str. A4 (M.Lidstrom)' : 0 , (' Methylobacter luteus NCIMB 11914 (T)' : 0.01149 , (' Methylobacter whittenburyi NCIMB 11128' : 0.00962 , (' Methylobacter whittenburyi str. 87' : 0.01431 , ' Methylobacter luteus str. 89' : 0.01235 ) : 0.00469 ) : 0.01822 ) : 0.02999 ) : 0.02782 )'MBC.LUTEUS' : 0.00861 ) : 0.00357 , (((' unnamed gamma proteobacterium' : 0.01392 , ' str. KI89C' : 0.0081 ) : 0.00267 , ' str. KI89B' : 0.00885 )'STR.KI89C' : 0.06628 , (' Methylomonas methanica str. 81Z' : 0.10705 , (((' Methylococcus sp. str. JB140' : 0.00096 , ' Methylococcus thermophilus str. IMV-B-3037' : 0.01856 ) : 0.00129 , (' Methylococcus capsulatus str. Bath ACM 3302' : 0.0033 , ' Methylococcus capsulatus str. Texas ACM 1292' : 0.0006 ) : 0.01271 ) : 0.00871 , ((' Methylococcus capsulatus str. Bath ATCC 33009' : 0.00417 , ' Methylococcus capsulatus str. BATH' : 0.05862 ) : 0.00831 , ((' clone G44' : 0.02195 , ' str. s30' : 0.0038 ) : 0.02866 , (' Methylocaldum szegediense str. OR2 (T)' : 0.00182 , (' Methylocaldum tepidum str. LK6 (T)' : 0.00782 , ' Methylocaldum gracile str. VKM-14L' : 0.00691 ) : 0.00908 ) : 0.03621 ) : 0.03758 ) : 0.01136 ) : 0.02587 )'MLC.CAPSULATUS' : 0.01892 ) : 0.01225 ) : 0.11076 , ' endosymbiont of Heliothis virescens testis' : 0.00959 )'METHYLOMONAS' : 0.01309 , ((((((((((((((((' Halomonas elongata ATCC 33173 (T)' : 0 , ' Halomonas elongata ATCC 33173 (T)' : 0.00342 ) : 0.00181 , ' Halomonas eurihalina str. F9-6 ATCC 49336 (T)' : 0.00032 ) : 0.00042 , ' Halomonas eurihalina str. F9-6 ACAM 353 (T)' : 0.00182 ) : 0.00406 , ' Halomonas halmophila ATCC 19717 (T)' : 0.00974 ) : 0.00408 , (' Halomonas halophila str. F5-7 DSM 4770 (T)' : 0.00353 , ' Halomonas salina ATCC 49509 (T)' : 0.00074 ) : 0.01015 ) : 0.00332 , (' Halomonas pacifica ACAM 345 (T)' : 0.00302 , (' Halomonas halodenitrificans ATCC 13511 (T)' : 0.00164 , (' Halomonas salina ATCC 49509 (T)' : 0.00568 , ' Halomonas cupida ACAM 343 (T)' : 0.01625 ) : 0.02816 ) : 0.00689 ) : 0.00657 )'HLM.ELONGATA' : 0.00418 , ((' Halomonas desiderata str. FB2 DSM 9502 (T)' : 0.00724 , ' Halomonas pantelleriensis str. AAP DSM 9661 (T)' : 0.0158 )'HLM.DESIDERATA' : 0.0059 , (((' Halomonas halodurans DSM 5160 (T)' : 0.00135 , ' Halomonas subglaciescola ACAM 21' : 0 ) : 0.00527 , ' Halomonas subglaciescola ACAM 12 (T)' : 0.00605 ) : 0.00828 , (' Halomonas venusta ACAM 346 (T)' : 0.0048 , (' Halomonas variabilis DSM 3051 (T)' : 0.00787 , (' Halomonas meridiana ACAM 246 (T)' : 0 , ' Halomonas aquamarina DSM 30161 (T)' : 0 ) : 0.01666 ) : 0.00617 ) : 0.01545 )'HLM.SUBGLACIESCOLA' : 0.00851 ) : 0.00591 ) : 0.01432 , (' Chromohalobacter marismortui ATCC 17056 (T)' : 0.00379 , (' Chromohalobacter marismortui str. A-100' : 0.0003 , (' Chromohalobacter marismortui str. A-492' : 0 , ' Chromohalobacter marismortui str. A-65' : 0.00031 ) : 0.00528 ) : 0.01375 )'CH.MARISMORTUI' : 0.00834 ) : 0.02193 , (' Halomonas marina IAM 12928' : 0 , ' Halomonas marina str. 219 DSM 4741 (T)' : 0.00448 )'HLM.MARINA' : 0.01242 ) : 0.01344 , (' Zymobacter palmae str. T109 IAM 14233 (T)' : 0.02105 , (' symbiont of Trialeurodes vaporariorum (greenhouse whitefly)' : 0.00498 , (' symbiont of Bemisia tabaci (sweetpotato whitefly)' : 0.03609 , ' symbiont of Siphoninus phillyreae (ash whitefly)' : 0.01183 ) : 0.00374 ) : 0.08575 )'ZYB.PALMAE' : 0.01065 ) : 0.01223 , (' str. s3' : 0.03091 , (' Marinospirillum minutulum ATCC 19193 (T)' : 0.00268 , ' Marinospirillum minutulum ATCC 19193 (T)' : 0.00238 ) : 0.08384 )'MRS.MINUTULUM' : 0.01416 ) : 0.06341 , ' Oceanospirillum japonicum ATCC 19191 (T)' : 0.01159 )'HALOMONAS' : 0.00803 , ((' Balneatrix alpica str. 4-87 CIP 103589 (T)' : 0.03106 , ' clone SAR 135' : 0.05673 ) : 0.00974 , ((' Oceanospirillum multiglobuliferum ATCC 33336 (T)' : 0.00203 , ' Oceanospirillum multiglobuliferum IFO 13614 (T)' : 0.00293 ) : 0.007 , ((' Oceanospirillum beijerinckii subsp. beijerinckii ATCC 12754 (T)' : 0.00291 , ' Oceanospirillum beijerinckii subsp. pelagicum str. SWC UF1 IFO 13612 (T)' : 0.00024 ) : 0.00566 , (' Oceanospirillum linum ATCC 11336 (T)' : 0.00514 , (' Oceanospirillum maris subsp. maris ATCC 27649' : 0 , (' Oceanospirillum maris subsp. maris str. Jannasch 10 ATCC 27509 (T)' : 0 , ' Oceanospirillum maris subsp. williamsae str. 2b IFO 15468 (T)' : 0.00026 ) : 0.00078 ) : 0.01354 ) : 0.00736 ) : 0.01456 ) : 0.06001 )'OSP.MARIS' : 0.02028 ) : 0.00432 , (((' Neptunomonas naphthovorans str. NAG-2N-126' : 0.03047 , ' str. SBR2068' : 0.04264 ) : 0.00126 , ' Marinobacterium georgiense str. KW-40' : 0.00294 ) : 0.00047 , ((((' Marinomonas vaga ATCC 27119 (T)' : 0.00451 , ' Marinomonas vaga IAM 12923' : 0.0065 ) : 0 , ' Marinomonas vaga ATCC 27119 (T)' : 0.00494 ) : 0.0042 , (' Marinomonas communis IAM 12914' : 0 , ' Marinomonas communis ATCC 27118 (T)' : 0.01125 ) : 0.00952 ) : 0.01254 , ((' Oceanospirillum jannaschii ATCC 27135 (T)' : 0.00085 , ' Oceanospirillum jannaschii IFO 15466 (T)' : 0.00229 ) : 0.02017 , (' str. s14' : 0.00775 , (' Oceanospirillum kriegii IFO 15467 (T)' : 8e-05 , ' Oceanospirillum kriegii ATCC 27133 (T)' : 0.00342 ) : 0.00583 ) : 0.04523 ) : 0.04243 ) : 0.04128 )'MARINOMONAS' : 0.00629 ) : 0.00559 , ((' clone SAR 156' : 0.02694 , ' Pacific Ocean station 16 100m depth bacterioplankton DNA clone NH16-18' : 0.00235 ) : 0.04444 , (' clone SAR 89' : 0.0231 , ((' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-10' : 0 , ' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-11' : 0.00238 ) : 0.04032 , (' clone SAR 86' : 0.07277 , ((' Sargasso Sea 10m depth bacterioplankton DNA clone BDA1-8' : 0 , ' Pacific Ocean station 29 100m depth bacterioplankton DNA clone NH29-6' : 0.00457 ) : 0.00749 , (' Pacific Ocean station 29 100m depth bacterioplankton DNA clone NH29-17' : 0 , ' Pacific Ocean station 49 500m depth bacterioplankton DNA clone NH49-13' : 0 ) : 0.01459 ) : 0.04552 ) : 0.05148 ) : 0.08248 ) : 0.097 )'ENV.SAR86' : 0.05763 )'OCEANOSPIRILLUM' : 0.00374 , ((' Fundibacter jadensis str. T9' : 0.00519 , ' Alcanivorax borkumensis str. SK2 DSM 11573 (T)' : 0.01007 )'ALCANIVORAX/FUNDIBACTER' : 0.05551 , (((((((((((((((((((((((((((((((((((((' Pseudomonas sp. str. S3.8' : 0 , ' Pseudomonas sp. str. S3.1' : 0 ) : 0 , ' Pseudomonas sp. str. S3.29' : 0 ) : 0 , ' Pseudomonas sp. str. S1.1' : 0 ) : 0 , ' Pseudomonas sp. str. S3.3' : 0.00156 ) : 0 , ' Pseudomonas amygdali LMG 2123 (T)' : 0 ) : 0.01305 , ' Pseudomonas viridiflava LMG 2352 (T)' : 0.00316 ) : 0 , (' clone A26ou' : 0 , ' Pseudomonas syringae subsp. syringae str. (pathovar reference strain) LMG 1247 (T)' : 0.00768 ) : 0.0054 ) : 0.00629 , ' Pseudomonas amygdali str. L7 LMG 5694 (T)' : 0.00049 ) : 0.00058 , (' Pseudomonas chlororaphis LMG 5004 (T)' : 0.00047 , (' clone A28t' : 0 , ' Pseudomonas cichorii str. PC 1 LMG 2162 (T)' : 0.00194 ) : 0.01449 ) : 0.0003 ) : 0.00252 , (' Pseudomonas amygdali ATCC 33614 (T)' : 0.00089 , (' clone JAP415' : 0 , (' Pseudomonas syringae subsp. syringae str. (pathovar reference strain) ATCC 19310 (T)' : 0 , ' Pseudomonas caricapapayae ATCC 33615 (T)' : 0.00164 ) : 0.03033 ) : 0.00311 ) : 0.00114 ) : 0.00154 , (' str. B0623' : 0.00063 , ' Pseudomonas corrugata ATCC 29736 (T)' : 0.00203 ) : 0.02259 )'PS.AMYGDALI' : 0.00088 , (' Pseudomonas veronii str. CFML 92-134 CIP 104663 (T)' : 0.0003 , (((' Pseudomonas rhodesiae str. CFML 92-111 CIP 104664 (T)' : 0.00112 , ' Pseudomonas marginalis str. (pathovar reference strain) LMG 2210 (T)' : 0.00528 ) : 0.00111 , ' clone JAP501' : 0 ) : 0.00014 , ((((((' Pseudomonas fluorescens IAM 12022 (T)' : 0.00206 , ' clone A29mn' : 0 ) : 0 , ' clone K3' : 0 ) : 0 , ' clone G18' : 0 ) : 0 , ' Pseudomonas fluorescens DSM 50090 (T)' : 0.00591 ) : 0.00104 , ' clone JAP412' : 0 ) : 0 , (' clone A30P' : 0 , (' Azospirillum sp. str. AM-53 DSM 1727' : 0.00044 , (' Pseudomonas tolaasii LMG 2342 (T)' : 0 , ((' clone G26' : 0 , ' str. s27' : 0 ) : 0 , (' clone K2' : 0.00231 , ' Pseudomonas tolaasii ATCC 33618 (T)' : 0.00173 ) : 0 ) : 0.00771 ) : 0.00178 ) : 0.05334 ) : 0.00142 ) : 0 ) : 0.00104 )'PS.TOLAASII' : 0.00691 ) : 0.00233 , (' clone G33' : 0 , (' clone G36' : 0 , (' Pseudomonas chlororaphis IFO 3904 (T)' : 0.00109 , (' Pseudomonas chlororaphis IAM 12354 (T)' : 0.00388 , ' Pseudomonas chlororaphis IAM 12353 (T)' : 0.00378 ) : 0.00075 ) : 0.00442 ) : 0.13219 )'PS.CHLORORAPHIS' : 0.00024 ) : 0.01753 , ' Pseudomonas sp.' : 0.00016 ) : 0.00132 , ((' Pseudomonas syringae str. 31R-1' : 0 , ' Pseudomonas syringae str. 31R-1' : 0 ) : 0.00101 , (' unidentified soil bacterium from soybean field clone FIE8' : 0 , (' Pseudomonas fluorescens str. MS1650' : 0 , ' Pseudomonas fluorescens str. MS1650' : 0 ) : 0.0067 ) : 0.01024 )'PS.SYRINGAE' : 0.0001 ) : 0.01318 , ' Pseudomonas fluorescens IAM 12022 (T)' : 0.00104 ) : 0.00576 , (' Pseudomonas sp. str. S1.26' : 0.0018 , ' Pseudomonas taetrolens IAM 1653 (T)' : 0.00329 )'PS.TAETROLENS' : 0.00048 ) : 0 , (' Pseudomonas sp. str. S3.9' : 0 , (' Pseudomonas sp. str. S1.51' : 0 , (' Pseudomonas sp. str. S1.6' : 0 , ' Pseudomonas sp. str. S2.5' : 0 ) : 0.00156 ) : 0.00587 ) : 0.00037 ) : 0.00136 , ((((' Pseudomonas azotoformans IAM 1603 (T)' : 0.00039 , ' clone A31m' : 0 ) : 0.00076 , ' Pseudomonas mucidolens IAM 12406 (T)' : 0.00091 ) : 0.00021 , ' Pseudomonas synxantha IAM 12356' : 0.0015 ) : 0.00148 , (' Pseudomonas sp. str. S3.6' : 0.00044 , (' Bangombe boreholes at depth of 5-105m DNA clone G35' : 0.00063 , (' Pseudomonas fluorescens ATCC 13525 (T)' : 0 , ' Pseudomonas fluorescens ATCC 13525 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00189 )'PS.AZOTOFORMANS' : 0.00053 ) : 0.003 , (' Pseudomonas syringae str. A501' : 0 , ' Pseudomonas syringae str. A501' : 0 ) : 0.00297 ) : 0.00555 , ' Pseudomonas sp. str. S2.1' : 0.00206 ) : 0.00784 , ' clone A27u' : 0.00162 )'PSEUDOMONAS_I' : 0.00073 , (' Pseudomonas graminis str. P 294/08 DSM 11363 (T)' : 0.00523 , (' Pseudomonas agarici LMG 2112 (T)' : 0.00103 , ' Pseudomonas agarici ATCC 25941 (T)' : 0.00175 ) : 0.00689 )'PS.AGARICI' : 0.00078 ) : 0.00368 , ((((' Pseudomonas putida IAM 1236 (T)' : 0.00396 , ' Flavimonas oryzihabitans str. L-1 IAM 1568 (T)' : 0.0022 ) : 0.00031 , (' Pseudomonas asplenii LMG 2137 (T)' : 0.00095 , ' Pseudomonas putida DSM 291 (T)' : 0.00484 ) : 0.00121 ) : 0.00142 , ' Pseudomonas fulva IAM 1529 (T)' : 0.00599 ) : 0 , (' Pseudomonas monteilii str. CFML 90-60 CIP 104883 (T)' : 0.00213 , (' Pseudomonas putida str. mt-2' : 0.00025 , ((' Pseudomonas putida IFO 14164 (T)' : 0.00456 , ' Pseudomonas putida str. PB4' : 0 ) : 0 , (' Pseudomonas putida str. mt-2 JCM 6156' : 0 , (' Pseudomonas putida str. F1' : 0.0006 , ' Pseudomonas putida str. R1' : 0.0008 ) : 0.00036 ) : 0.00031 ) : 0.00043 ) : 0 ) : 0.00109 )'PS.PUTIDA' : 5e-05 ) : 0.00254 , (' Pseudomonas sp. str. BB61' : 0.00069 , (' Pseudomonas sp. str. S1.3' : 0.01478 , ' Pseudomonas luteola IAM 13000 (T)' : 0 ) : 0.01516 )'PS.LUTEOLA' : 0.00149 ) : 0.00795 , (' Pseudomonas flavescens str. B62 NCPPB 3063 (T)' : 0.0035 , ' Pseudomonas straminea IAM 1598 (T)' : 0.00668 )'PS.STRAMINEA' : 0.00162 ) : 0.00556 , ((' Pseudomonas alcaligenes IAM 12411 (T)' : 0.00499 , ' Pseudomonas alcaligenes LMG 1224 (T)' : 0.00252 ) : 0.00404 , (' clone JA21gh' : 0 , (' str. s19' : 0 , (' str. s25' : 0.00458 , ' str. s17' : 0 ) : 0.00643 ) : 0 ) : 0.00967 )'PS.ALCALIGENES' : 0.00043 ) : 0.00261 , (' str. B0267' : 0.00172 , ' str. B0251' : 0.00283 )'STR.B0251' : 0.00129 ) : 0.00171 , (' Pseudomonas mendocina NCIMB 10541 (T)' : 0.07654 , (' clone JAP417' : 0 , (((' Pseudomonas oleovorans DSM 1045 (T)' : 0.00654 , ' Pseudomonas sp. str. BB49' : 0.00307 ) : 0 , ' Pseudomonas pseudoalcaligenes subsp. pseudoalcaligenes LMG 1225 (T)' : 0 ) : 0 , (' Pseudomonas mendocina LMG 1223 (T)' : 0 , (' Pseudomonas mendocina ATCC 25411 (T)' : 0 , (' str. SBR2073' : 0.07848 , ' str. SBR2111' : 0.02999 ) : 0.00809 ) : 0.0031 ) : 0.0007 ) : 0.02053 ) : 0 )'PS.MENDOCINA' : 0.00108 ) : 0.0061 , (' str. NF13' : 0 , ((((((' Pseudomonas stutzeri str. Zobell ATCC 14405' : 0.00032 , ' Pseudomonas stutzeri str. Stanier 220 ATCC 17587' : 0 ) : 0 , ' Pseudomonas stutzeri str. Stanier 224 ATCC 17591' : 0.00031 ) : 0.00069 , (' Pseudomonas stutzeri str. ST27MN3' : 0 , ' Pseudomonas stutzeri str. 19SMN4 DSM 6084' : 0 ) : 0.00105 ) : 0.00027 , ' str. SBR2051' : 0.00604 ) : 0.00072 , (' Pseudomonas stutzeri str. AN11' : 0 , (' Pseudomonas stutzeri DSM 50227' : 1e-05 , ' Pseudomonas stutzeri str. AN10' : 0.00032 ) : 0.00064 ) : 0.00361 ) : 0 , (((' Pseudomonas balearica str. SP1402 DSM 6083 (T)' : 0 , ' Pseudomonas stutzeri str. LS401' : 0.00033 ) : 0.01755 , ' Pseudomonas mendocina str. KR' : 0.00525 ) : 0 , (' Pseudomonas stutzeri str. Stanier 419 DSM 50238' : 0 , (' str. B0253' : 0 , (' Pseudomonas stutzeri str. DNSP21 DSM 6082' : 0 , ((' Flavobacterium "lutescens" ATCC 27951' : 0 , ' Pseudomonas stutzeri IAM 12668' : 0.00419 ) : 0 , (' Pseudomonas stutzeri str. Stanier 222 ATCC 17589' : 0 , (' Pseudomonas stutzeri str. Stanier 221 CCUG 11256 (T)' : 0 , ' Pseudomonas fragi IAM 12402' : 0.00181 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00287 ) : 0.00406 ) : 0.01102 ) : 0.00147 ) : 0.01896 )'PS.STUTZERI' : 0.00363 ) : 0.02654 , ' Azotobacter vinelandii str. AMOP' : 0.00099 ) : 0.00259 , ((((' Pseudomonas nitroreducens IAM 1439 (T)' : 0.00303 , ' Pseudomonas sp. str. B13' : 0 ) : 0.00159 , ' Pseudomonas sp. str. CRE 12' : 0.00262 ) : 0.00136 , ' Pseudomonas citronellolis DSM 50332 (T)' : 0.00555 ) : 0.0046 , ((' Pseudomonas resinovorans LMG 2274 (T)' : 0.01411 , ' Pseudomonas anguilliseptica NCIMB 1949 (T)' : 0.0105 ) : 0.00271 , (' Pseudomonas aeruginosa LMG 1242 (T)' : 0.00028 , ((' Pseudomonas aeruginosa DSM 50071 (T)' : 0.00483 , ' Pseudomonas aeruginosa IAM 1514 (T)' : 0.00353 ) : 0.00302 , (' Pseudomonas sp. str. CRE 11' : 0 , (' Pseudomonas aeruginosa str. NIH 18 ATCC 25330' : 0.00298 , ' Pseudomonas aeruginosa' : 0 ) : 0.00155 ) : 0.00506 ) : 0 ) : 0.00474 ) : 0.00579 )'PS.AERUGINOSA' : 0.00121 ) : 0.00773 , ' Pseudomonas oleovorans IAM 1508 (T)' : 0.00714 ) : 0.05379 , ' clone SMK199' : 0.00571 ) : 0.01508 , (' Microbulbifer hydrolyticus str. IRE-31' : 0.01489 , (' str. SCB11' : 0.02672 , ' Teredinibacter turnerae str. T7902 ATCC 39867' : 0.04337 ) : 0.07286 )'TEREDINIBACTER' : 0.00386 ) : 0.03997 , (((((((((((' Psychrobacter urativorans str. B-57 ATCC 15174 (T)' : 0.0111 , ' Psychrobacter frigidicola ACAM 304 (T)' : 0.0157 ) : 0.00325 , ' Psychrobacter glacincola ACAM 483 (T)' : 0.0119 ) : 0 , ' Moraxella sp. str. S2.18' : 0.00743 ) : 0.00077 , ' clone AW5' : 0.01695 ) : 0 , ' Psychrobacter immobilis' : 0.01409 ) : 0.00902 , (' Psychrobacter phenylpyruvicus ATCC 23333 (T)' : 0.0094 , ' Psychrobacter phenylpyruvicus NCTC 10526 (T)' : 0.00432 ) : 0.01154 ) : 0.0199 , ' Moraxella osloensis NCTC 10465 (T)' : 0.02634 ) : 0.01021 , (' Moraxella lacunata str. A182 NCTC 11011 (T)' : 0.00115 , ' Moraxella lacunata str. A182 ATCC 17967 (T)' : 0.00063 ) : 0.02648 ) : 0.00576 , (' Moraxella catarrhalis' : 1e-05 , (' Moraxella catarrhalis NCTC 11020 (T)' : 0.00041 , ' Moraxella catarrhalis ATCC 25238 (T)' : 0 ) : 0.00971 ) : 0.02336 ) : 0.00211 , ((' Moraxella (branhamella) ovis str. 199/55 NCTC 11227 (T)' : 0.00325 , ' Moraxella bovis ATCC 10900 (T)' : 0.0048 ) : 0 , (' Moraxella cuniculi' : 0.00438 , (' Moraxella caviae str. GP 11 CCUG 355 (T)' : 0 , ' Moraxella caviae' : 0 ) : 0.00638 ) : 0.00754 ) : 0.00457 )'MRX.CATARRHALIS' : 0.01841 , (' clone JN3c' : 0.01107 , (' clone A25t' : 0.01732 , (' clone A24otp' : 0.00369 , ((' Acinetobacter calcoaceticus ATCC 33604' : 0.00172 , ' Acinetobacter calcoaceticus str. DNA group one ATCC 23055 (T)' : 0.0047 ) : 0.00139 , ((((((((' Acinetobacter junii DSM 1532' : 0 , ' Acinetobacter junii str. 2723/59 DSM 6964 (T)' : 0 ) : 0 , ' clone G21' : 0 ) : 0 , ' clone K9' : 0 ) : 0 , ' clone JN2c' : 0 ) : 0 , ' str. s6' : 0 ) : 0.00351 , ' clone JN17e' : 0 ) : 0.00247 , ((' Acinetobacter baumannii str. 2208 DSM 30007 (T)' : 0 , ' Acinetobacter baumannii str. IGSchaub Biol 1 DSM 30008' : 0 ) : 0 , (' Acinetobacter baumannii str. IGSchaub Biol 1 ATCC 15308' : 0 , ' Acinetobacter calcoaceticus NCTC 10292' : 0.00588 ) : 0.00022 ) : 0.00881 )'ACN.BAUMANNII' : 0.00448 , ((((' unnamed organism' : 0.00616 , ' clone JAP752' : 0.00074 ) : 0 , ' Acinetobacter sp. DSM 590' : 0 ) : 0.00077 , (' str. SBR1017' : 0.00121 , ' str. SBR1118' : 0.00452 ) : 0.02505 ) : 0.00106 , (' clone K4' : 0.0101 , (' Acinetobacter lwoffii ATCC 17925' : 0.00418 , (((' Acinetobacter lwoffii NCTC 5866 (T)' : 0.00174 , ' clone JN16e' : 0.00156 ) : 0 , ' Acinetobacter lwoffii DSM 2403 (T)' : 0 ) : 0.00309 , (((' Acinetobacter calcoaceticus DSM 30009' : 0.00639 , ' Acinetobacter lwoffii' : 0.00855 ) : 0.00844 , ' Acinetobacter radioresistens str. FO-1 DSM 6976 (T)' : 0.02957 ) : 0.00248 , ((((' str. s15' : 0 , ' str. s20' : 0.00287 ) : 0 , ' Acinetobacter haemolyticus DSM 6962 (T)' : 0 ) : 0.00151 , ' Acinetobacter johnsonii DSM 6963 (T)' : 0.00545 ) : 0.00078 , (' Acinetobacter anitratus' : 0.00993 , (' str. B0258' : 0 , (' Acinetobacter calcoaceticus str. DNA group one DSM 30006 (T)' : 0 , (' Acinetobacter sp. str. UN1P2' : 0.00013 , (' clone JA23h' : 0.00103 , ' Acinetobacter calcoaceticus DSM 1139' : 0.0014 ) : 0.00103 ) : 0.00027 ) : 0 ) : 0.00256 ) : 0.00075 ) : 0.0072 ) : 0.00357 ) : 0.00533 ) : 0.00937 ) : 0.00568 )'ACN.LWOFFII' : 0.00557 ) : 0.01498 ) : 0.00194 ) : 0.00214 ) : 0.02157 ) : 0.03433 )'ACINETOBACTER' : 0.01281 )'PSEUDOMONAS' : 0.00776 , (' unnamed organism' : 0.08979 , (((' clone SAR 125' : 0.00765 , ' clone 7911' : 0.16226 ) : 0.00527 , ' Sargasso Sea bacterioplankton DNA clone SAR 92' : 0.03316 )'ENV.SAR92' : 0.00183 , ((((' Marinobacter aquaeolei str. VT8' : 0 , ' Marinobacter hydrocarbonoclasticus str. 179 ATCC 27132' : 0.00057 ) : 0.00084 , (' Marinobacter hydrocarbonoclasticus IAM 12929' : 0 , ' Marinobacter hydrocarbonoclasticus str. SP.17 ATCC 49840 (T)' : 0.0016 ) : 0.00208 ) : 0.00702 , ' Flectobacillus sp. str. S36-W(gv)1' : 0.02259 )'MRB.HYDROCARBONOCLASTICUS' : 0.01725 , (' Thiocapsa roseopersicina str. 4210' : 0.09175 , (((((((' Colwellia psychroerythrea' : 0.01395 , ' Colwellia psychroerythrea ATCC 27364 (T)' : 0.00058 ) : 0.00411 , ' Colwellia psychroerythrea ATCC 27364 (T)' : 0.00573 ) : 0.00536 , ' marine snow associated clone agg53' : 0.00567 ) : 0.00468 , (' Colwellia maris str. ABE-1 JCM 10085 (T)' : 0.00204 , (' Colwellia psychrotropica ACAM 179 (T)' : 0.00544 , ' Colwellia rossensis str. S51-W(gv)1' : 0.00778 ) : 0.00302 ) : 0.00557 ) : 0.01208 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_54' : 0.02516 ) : 0.00927 , ' clone K18' : 0.03159 )'COLWELLIA' : 0.01144 , (((' Alteromonas macleodii' : 8e-05 , ' Alteromonas macleodii IAM 12920 (T)' : 0.00119 ) : 0.00092 , ' str. E-32' : 0.00837 )'ALTM.MACLEODII' : 0.0106 , ((((((((((((((' Shewanella hanedai CIP 103207 (T)' : 0 , ' Shewanella hanedai ATCC 33224 (T)' : 0.00459 ) : 0.0001 , ' Shewanella woodyi str. MS32 DSM 12036 (T)' : 0.00535 ) : 0.00032 , ' Shewanella gelidimarina str. ICP6 ACAM 456 (T)' : 0.01539 ) : 0.00018 , ' Shewanella violacea str. DSS12 (T)' : 0.01839 ) : 0.00197 , (' barophile WHB 46 clone 2' : 0 , ' barophile WHB 46 clone 1' : 0.05811 ) : 0.02248 ) : 0.00088 , (' Vibrio sp. str. DB172F' : 0.00068 , ' Vibrio sp. str. DB172R' : 0.00049 ) : 0.00101 ) : 0.00034 , ' Shewanella benthica ATCC 43992 (T)' : 0.00048 ) : 0.00059 , ' Vibrio sp. str. DB6906' : 0.01006 ) : 0.0062 , (' Vibrio sp. str. DB6101' : 0.02561 , ' Vibrio sp. str. DB5501' : 0.00696 ) : 0.0083 ) : 0.01182 , ' Vibrio sp. str. DB6705' : 0.01195 ) : 0.013 , ((' Moritella marina str. MP-1 ATCC 15381 (T)' : 0.00118 , ' Moritella marina str. MP-1 ATCC 15381 (T)' : 0.00233 ) : 0.00033 , (' Moritella marina str. MP-1 NCIMB 1144 (T)' : 0 , (' Moritella marina str. MP-1 ATCC 15381 (T)' : 0.01695 , ' Moritella japonica str. DSK1' : 0 ) : 0 ) : 0.0024 ) : 0.03332 )'MRT.MARINA' : 0.01385 , ((((' Shewanella algae str. FeRed' : 0 , ' Shewanella algae ATCC 51192 (T)' : 0.00174 ) : 0.00052 , ' Shewanella algae str. OK-1 IAM 14159 (T)' : 0.00411 ) : 0.01272 , ' Shewanella amazonensis str. SB2B' : 0.01808 ) : 0.0023 , (' str. s29' : 0.00165 , ((((' Shewanella sp. ACAM 122' : 0.01425 , ' Shewanella frigidimarina str. ICP1 ACAM 591 (T)' : 0.00367 ) : 0.01121 , ' Shewanella oneidensis str. MR-1' : 0.01073 ) : 0.00208 , (' str. s10' : 0 , ' Shewanella baltica NCTC 10735 (T)' : 0.00156 ) : 0.00731 ) : 0.00258 , (' Shewanella algae str. BrY' : 0.00028 , (' Shewanella putrefaciens LMG 2268 (T)' : 9e-05 , (' str. s9' : 0.00019 , (' Shewanella putrefaciens str. B.W. Hammer 95 IAM 12079 (T)' : 0.00029 , (' Shewanella putrefaciens str. B.W. Hammer 95 ATCC 8071 (T)' : 0.00254 , ' clone Aspo5' : 0.00073 ) : 0.01667 ) : 0 ) : 0.00235 ) : 0 ) : 0.00347 ) : 0.0116 ) : 0 )'SHE.PUTREFACIENS' : 0.00479 ) : 0.00228 , (' Pseudoalteromonas bacteriolytica str. E8R IAM 14595 (T)' : 0.00225 , (((((((' Pseudoalteromonas piscicida str. C201 CERBOM' : 0.0001 , ' Pseudoalteromonas piscicida ATCC 15057 (T)' : 0.00036 ) : 0.00096 , ' Pseudoalteromonas rubra ATCC 29570 (T)' : 0.00502 ) : 0.00205 , ' Pseudoalteromonas luteoviolacea NCIMB 1893 (T)' : 0.00496 ) : 0.00435 , (' Pseudoalteromonas denitrificans ATCC 43337 (T)' : 0.02456 , ' Pseudoalteromonas tunicata' : 0.0185 ) : 0.00864 ) : 0.00313 , (' Pseudoalteromonas aurantia ATCC 33046 (T)' : 0.00088 , ' Pseudoalteromonas citrea NCIMB 1889 (T)' : 0 ) : 0.00508 ) : 0.00602 , (' clone 11w103' : 0.00319 , ' Pele's Vents Bacterium DNA clone PVB_18' : 0.01121 ) : 0.00576 )'PAL.AURANTIA' : 0.00529 , (((((' Pseudoalteromonas haloplanktis subsp. haloplanktis ATCC 14393 (T)' : 0.00068 , ' Pseudoalteromonas nigrifaciens NCIMB 8614 (T)' : 0 ) : 0 , ' Pseudoalteromonas nigrifaciens IAM 13010' : 0.00083 ) : 0 , (' Alteromonas fuliginea KMM 216 (T)' : 0.00067 , ' Pseudoalteromonas antarctica str. NF3 CECT 4664' : 0.00061 ) : 0.00029 ) : 0 , ' Pseudoalteromonas undina NCIMB 2128 (T)' : 0.00142 ) : 0.00045 , ((' Alteromonas distincta KMM 638 (T)' : 0 , ' Alteromonas elyakovii str. 40MC KMM 162 (T)' : 0 ) : 0 , ((' clone SAR 166' : 0.00329 , ' Pseudoalteromonas haloplanktis subsp. haloplanktis ATCC 14393 (T)' : 0.00161 ) : 0 , (' Pseudoalteromonas haloplanktis subsp. tetraodonis str. GFC IAM 14160 (T)' : 0 , (' Moritella marina str. MP-1 ATCC 15381 (T)' : 0.00015 , ((' clone SAR 160' : 0.00058 , ' Pseudoalteromonas carrageenovora IAM 12662 (T)' : 0.00152 ) : 0 , (' Pseudoalteromonas atlantica IAM 12927 (T)' : 0 , (' Pseudoalteromonas espejiana IAM 12640 (T)' : 0 , ' Pseudoalteromonas espejiana NCIMB 2127 (T)' : 0.00165 ) : 0 ) : 0.00052 ) : 0.00209 ) : 0.00354 ) : 0 ) : 0.00099 ) : 0.00128 )'PAL.HALOPLANKTIS' : 0.00819 ) : 0.07161 ) : 0.02176 )'PSEUDOALTEROMONAS' : 0.00334 , (' str. 90-P(gv)1' : 0.00192 , (' Ferrimonas balearica str. PAT DSM 9799 (T)' : 0.0071 , ((((((((((((((((((((' Listonella anguillarum HI 11341' : 0 , ' Listonella anguillarum HI 11345' : 0 ) : 0 , (' Listonella anguillarum str. 775' : 0.00036 , ' Listonella anguillarum NCIMB 2129' : 0 ) : 0 ) : 0.00059 , ' Listonella anguillarum HI 11421' : 0 ) : 0 , ' Listonella anguillarum HI 11331' : 0.00088 ) : 0 , ((' Listonella anguillarum NCIMB 2130' : 0 , ' Listonella anguillarum HI 7400' : 0 ) : 0 , (' Listonella anguillarum HI 11340' : 0 , (' Listonella anguillarum HI 11423' : 0 , ' Listonella anguillarum HI 11351' : 0 ) : 0 ) : 0.00045 ) : 0.00023 ) : 0.00058 , (' Listonella anguillarum HI 11336' : 0 , (' Listonella anguillarum HI 4791' : 0 , (' Listonella anguillarum HI 11349' : 0 , (' Listonella anguillarum HI 10424' : 0 , ' Listonella anguillarum HI 11343' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00077 ) : 0.00072 , (' Listonella anguillarum IFO 13266' : 0.00971 , ' Listonella anguillarum str. 1247/1 ATCC 43313' : 0.00755 ) : 0.00127 ) : 0 , (' Vibrio ordalii str. DF3K CIP 103205 (T)' : 0 , (' Vibrio ordalii str. DF3K ATCC 33509 (T)' : 0.00057 , (' Vibrio ordalii str. DF3K NCIMB 2167' : 1e-05 , (' Photobacterium damsela subsp. damsela NCIMB 2184' : 0.00218 , ' Listonella anguillarum str. C510 ATCC 19264 (T)' : 0.00087 ) : 0.00038 ) : 0.00218 ) : 0.0009 ) : 0.0014 )'LSN.ANGUILLARUM' : 0.00206 , (((' Vibrio diazotrophicus str. NS CIP 103191 (T)' : 0 , ' Vibrio diazotrophicus str. NS ATCC 33466 (T)' : 0.00357 ) : 7e-05 , ' Vibrio diazotrophicus str. NS ATCC 33466 (T)' : 0.01103 ) : 0.00486 , ((' Vibrio metschnikovii str. MV 2484 NCTC 11170' : 0 , ' Vibrio metschnikovii str. M 34 NCTC 8443 (T)' : 0.00074 ) : 0.00161 , (' Vibrio metschnikovii CIP 69.14 (T)' : 0 , (' Vibrio cincinnatiensis ATCC 35912 (T)' : 0.01158 , (' Vibrio gazogenes str. PB 1 ATCC 29988 (T)' : 0.00147 , ' Vibrio gazogenes str. PB 1 CIP 103173 (T)' : 0.00209 ) : 0.02287 ) : 0.00596 ) : 0.00325 ) : 0.01095 )'V.DIAZOTROPHICUS' : 0.00653 ) : 0.00246 , (((((' Vibrio vulnificus CIP 75.04 (T)' : 0 , ' Vibrio vulnificus ATCC 27562 (T)' : 0.00357 ) : 0 , ' Vibrio vulnificus ATCC 27562 (T)' : 0 ) : 0 , ' Vibrio vulnificus ATCC 27562 (T)' : 0 ) : 0.0006 , (' Vibrio vulnificus str. C7184' : 0 , ' Vibrio vulnificus ATCC 29307' : 0 ) : 0.00542 ) : 0.00052 , (' Vibrio navarrensis CIP 103381 (T)' : 0.00171 , (' Vibrio mimicus CIP 101888 (T)' : 0 , (((' Vibrio cholerae ATCC 35971' : 0.00517 , ' Vibrio cholerae' : 0.00392 ) : 0.0009 , ' Vibrio cholerae CECT 514 (T)' : 0.00236 ) : 0 , (' Vibrio cholerae str. 1062 INSERM U303' : 0 , (' Vibrio cholerae str. 726' : 0 , (' Vibrio cholerae str. 1094 CIP 62.13 (T)' : 0 , (' Vibrio cholerae str. non O_1 Nanking 32/123 CIP 63.40' : 0 , (' Vibrio cholerae str. non O_1 El Tor 34-D23 CIP 63.41' : 0 , (' Vibrio cholerae str. 1094 ATCC 14035 (T)' : 0 , (' Vibrio cholerae str. IID936' : 0.00072 , (' Vibrio mimicus ATCC 33655 (T)' : 0 , (' Vibrio cholerae str. IID467' : 0 , (' Vibrio cholerae str. IID934' : 0 , (' Vibrio cholerae str. IID935' : 0 , ' Vibrio cholerae str. IID1655' : 0 ) : 0.00405 ) : 0 ) : 0.00235 ) : 0.00148 ) : 0.00037 ) : 0.00037 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00077 ) : 0 ) : 0.00025 ) : 0.00051 ) : 0.0346 ) : 0.0026 )'V.CHOLERAE' : 0.00485 ) : 0.00561 , (' Vibrio aestuarianus str. OY-0-002 CIP 102971 (T)' : 0 , (' Vibrio aestuarianus str. OY-0-002 ATCC 35048 (T)' : 0.00061 , ' Vibrio aestuarianus str. OY-0-002 ATCC 35048 (T)' : 0.00072 ) : 0.00061 )'V.AESTUARIANUS' : 0.00645 ) : 0.00154 , (' Vibrio natriegens str. 111 CCM 2575' : 0.00448 , ' Vibrio scophthalmi str. A089 CECT 4638 (T)' : 0.00375 )'V.SCOPHTHA' : 0.00551 ) : 0.00304 , (' Vibrio ordalii ATCC 35509 (T)' : 0.00717 , ' Vibrio pectenicida str. A365 CIP 105190 (T)' : 0.00167 )'V.PECTENICIDA' : 0.00805 ) : 0.00208 , (' Vibrio tapetis str. B1090 CECT 4600 (T)' : 0.00381 , (' Listonella anguillarum HI 11431' : 0.00094 , ((' Vibrio splendidus CIP 102893 (T)' : 0.00044 , ' Vibrio splendidus str. SCB8' : 0.00986 ) : 0 , (' Listonella anguillarum HI 11342' : 0.00796 , ' Listonella anguillarum HI 11446' : 0 ) : 0.00121 ) : 0.00287 ) : 0.00788 )'V.SPLENDIDUS' : 0.00345 ) : 0.0023 , (' Vibrio mediterranei CIP 103203 (T)' : 0.02539 , (' symbiont of Kryptophanaron alfredi' : 0.02805 , (' symbiont of Anomalops katoptron' : 0.01496 , (' symbiont of Photoblepharon palpebratus' : 0.0021 , (' symbiont of Photoblepharon steinetzi' : 0.00218 , ' symbiont of Photoblepharon palpebratus' : 0.00085 ) : 0.00366 ) : 0.02954 ) : 0.00841 ) : 0.00494 )'V.MEDITERRANEI' : 0.00533 ) : 0.00218 , ((((' Vibrio furnissii ATCC 35016 (T)' : 0 , ' Vibrio furnissii CIP 102972 (T)' : 0 ) : 0.00034 , ' Listonella pelagia ATCC 25916 (T)' : 0.01279 ) : 0.00049 , (' Vibrio fluvialis str. VL 5125 NCTC 11327 (T)' : 0.00587 , ' Vibrio fluvialis str. VL 5125 NCIMB 2249' : 0 ) : 0.00125 )'V.FURNISSII' : 0.00189 , ((' Vibrio nereis CIP 103194 (T)' : 0.00173 , ' Vibrio tubiashii CIP 102760 (T)' : 0.00422 )'V.NEREIS' : 0.00116 , ((((((((' Vibrio salmonicida HI 11366-2' : 0 , ' Vibrio salmonicida HI 11391' : 0.00162 ) : 0 , ' Vibrio salmonicida NCIMB 2262 (T)' : 0.00046 ) : 0.00171 , (' Vibrio salmonicida str. PT2' : 0 , ' Vibrio salmonicida str. halibut' : 0.00093 ) : 0.00209 ) : 0 , (' Vibrio logei str. PS207 (R.R. Colwell) ATCC 15382' : 0.00075 , ' Vibrio logei str. PS207 (R.R. Colwell) CIP 103204 (T)' : 0.00411 ) : 0.00073 ) : 0.0007 , ' Vibrio fischeri NCIMB 1274' : 0.00131 )'V.SALMONICIDA' : 0.00748 , (' Vibrio fischeri NCIMB 1281 (T)' : 0 , (' Vibrio fischeri NCIMB 1281 (T)' : 0 , (' Vibrio fischeri ATCC 7744 (T)' : 0.00645 , ' Photobacterium fischeri str. MJ-1' : 0.00344 ) : 0 ) : 0.00058 )'V.FISCHERI' : 0.01341 ) : 0.00043 , (' Vibrio proteolyticus str. 262 CIP 102892 (T)' : 0.0009 , (' Vibrio proteolyticus str. 262 NCIMB 1326 (T)' : 0.00075 , (' Vibrio nigripulchritudo ATCC 27043 (T)' : 0 , ' Vibrio nigripulchritudo CIP 103195 (T)' : 0.00347 ) : 0.00613 ) : 0.00057 )'V.PROTEOLYTICUS' : 0.02016 ) : 0.002 , ((' Vibrio proteolyticus str. 262 ATCC 15338 (T)' : 0.00495 , ' Vibrio parahaemolyticus str. 113 ATCC 17802 (T)' : 0.00911 ) : 0 , (' Vibrio campbellii str. 40 CIP 75.01 (T)' : 0.00092 , ((' Vibrio parahaemolyticus str. 113 ATCC 17802 (T)' : 0.0011 , ' Vibrio diabolicus str. HE800 CNCM I-1629 (T)' : 0.00255 ) : 0.0021 , ((' Vibrio parahaemolyticus CIP 73.30' : 0 , ' Vibrio parahaemolyticus str. 113 CIP 75.02' : 0 ) : 0 , (((((' Vibrio nereis ATCC 25917 (T)' : 0.00074 , ' Vibrio parahaemolyticus str. 113 ATCC 17802 (T)' : 0 ) : 0 , (' Vibrio alginolyticus str. XII-53 NCIMB 1903 (T)' : 0.00267 , ' Listonella pelagia CIP 102762 (T)' : 0.0043 ) : 0.00265 ) : 0 , ' Vibrio natriegens str. 111 CIP 103193 (T)' : 2e-05 ) : 0.00061 , (' Listonella pelagia NCIMB 1900 (T)' : 0.00135 , ' Vibrio natriegens str. 111 ATCC 14048 (T)' : 0.00088 ) : 0.00062 ) : 0.00038 , (' Vibrio alginolyticus CIP 70.65' : 0 , (' Vibrio alginolyticus str. XII-53 CIP 75.03' : 0 , (((((' Vibrio harveyi' : 0 , ' Vibrio harveyi ATCC 35084 (T)' : 0.00264 ) : 0 , ' Vibrio fluvialis str. VL 5125 NCTC 11328' : 0 ) : 0 , ' Vibrio harveyi ATCC 14126 (T)' : 0.00234 ) : 0 , ' Vibrio harveyi ATCC 35084 (T)' : 0.00207 ) : 0.00392 , (' Vibrio campbellii str. 40 ATCC 25920 (T)' : 6e-05 , ((' Vibrio alginolyticus str. XII-53 ATCC 17749 (T)' : 0 , ' Vibrio campbellii str. 40 ATCC 25920 (T)' : 0.00629 ) : 0 , (' Vibrio harveyi ATCC 14126 (T)' : 0 , (' Vibrio harveyi ATCC 14126 (T)' : 0 , ' Vibrio harveyi CIP 103192 (T)' : 0.00109 ) : 0 ) : 0.00794 ) : 0.0012 ) : 0.00532 ) : 0.00067 ) : 0 ) : 0.00117 ) : 0.00035 ) : 0.00219 ) : 0.00144 ) : 0.00387 )'V.HARVEYI' : 0.00286 ) : 0.00503 ) : 0.00872 )'VIBRIO' : 0.00503 ) : 0.00149 , (' Vibrio orientalis str. 717 CIP 102891 (T)' : 0 , (' Vibrio orientalis str. 717 ATCC 33934 (T)' : 0.00203 , ' Vibrio orientalis str. 716 ATCC 33933' : 0.00145 ) : 0 )'V.ORIENTALIS' : 0.00326 ) : 0.01087 , ((((' Vibrio hollisae CIP 101886 (T)' : 0 , ' Vibrio hollisae JCM 1283 (T)' : 0.00254 ) : 0.006 , ' Vibrio hollisae ATCC 33564 (T)' : 0.00673 ) : 0.01383 , (' symbiont of Melanocetus johnsoni' : 0.02234 , ' symbiont of Cryptosaras couesi' : 0.04164 ) : 0.01786 )'V.HOLLISAE' : 0.00263 , (((((' Vibrio aspartigenicus str. GSP-1 ATCC 49962' : 0 , ' Vibrio aspartigenicus str. GSP-1 ATCC 49962' : 0 ) : 0 , ' Salinivibrio costicola NCIMB 701 (T)' : 0 ) : 0 , ' Salinivibrio costicola NCIMB 701 (T)' : 0.00352 ) : 0 , ' Salinivibrio costicola NCIMB 701 (T)' : 0.0044 )'SAV.COSTICOLA' : 0.00797 , (((((' Photobacterium damsela subsp. damsela CIP 102761' : 0.00011 , ' Photobacterium damsela subsp. damsela ATCC 33539 (T)' : 0.0026 ) : 0.00014 , ' Vibrio ordalii str. MSC 2-75' : 0.00181 ) : 0 , (' Photobacterium damsela subsp. piscicida NCIMB 2058 (T)' : 0 , ' Photobacterium damsela str. wild isolate' : 0 ) : 0.00011 ) : 0.00013 , ' Photobacterium histaminum str. C-8' : 0.00477 )'PHB.DAMSELA' : 0.00253 , ((((' Photobacterium leiognathi str. L1 CIP 66.5' : 0 , ' Photobacterium leiognathi str. PL721' : 0.00625 ) : 0 , ' Photobacterium leiognathi str. L1 ATCC 25521 (T)' : 0.00356 ) : 0.00041 , ' Photobacterium leiognathi str. L1 ATCC 25521 (T)' : 0.00217 ) : 4e-05 , ((((' Photobacterium angustum ATCC 25915 (T)' : 0.00344 , ' Photobacterium angustum' : 0.00627 ) : 0.00066 , ' Photobacterium angustum CIP 75.10 (T)' : 0.00078 ) : 0.00245 , ' clone SAR 134' : 0.00271 )'PHB.ANGUSTUM' : 0.00064 , (' Photobacterium profundum str. DSJ4' : 0.00524 , (((' Photobacterium phosphoreum ATCC 11040 (T)' : 0.00313 , ' Photobacterium phosphoreum str. Og61' : 0.00453 ) : 0.00019 , ' Photobacterium iliopiscarium str. PS1 ATCC 51760 (T)' : 0.00137 ) : 2e-05 , (' Photobacterium iliopiscarium str. PS1 (T)' : 0.00959 , (' Photobacterium phosphoreum ATCC 11040 (T)' : 2e-05 , ' Photobacterium phosphoreum ATCC 11040 (T)' : 0.00255 ) : 0.0034 ) : 0.00019 )'PHB.PHOSPHOREUM' : 0.01955 ) : 0.00421 ) : 0.01463 ) : 0.01452 ) : 0.0488 ) : 0.00666 )'PHOTOBACTERIUM' : 0.01288 )'VIBRIO' : 0.01123 , ((((' Ruminobacter amylophilus ATCC 29744 (T)' : 0 , ' Ruminobacter amylophilus DSM 1361 (T)' : 0 ) : 0.03077 , ' Anaerobiospirillum succiniciproducens str. S411 ATCC 29305 (T)' : 0.06343 ) : 0.01769 , ' Tolumonas auensis str. TA 4 DSM 9187 (T)' : 0.03087 )'RUM.AMYLOPHILUS' : 0.0099 , (' Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida NCIMB 1102 (T)' : 0.00012 , (' Aeromonas sp. str. BB16' : 0 , (' Aeromonas salmonicida IFO 13784' : 0.00073 , (((((' Aeromonas sp. CDC 9533-76' : 0 , ' Aeromonas salmonicida subsp. smithia CCM 4103 (T)' : 0.00362 ) : 0 , ' Aeromonas salmonicida subsp. masoucida str. 1-1-1 CIP 103210 (T)' : 0 ) : 0 , ' Aeromonas salmonicida subsp. achromogenes NCIMB 1110 (T)' : 0 ) : 0 , ' Aeromonas sp. str. 93/1060-1' : 0 ) : 0.00018 , (((' Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida CIP 103209 (T)' : 0 , ' Aeromonas sp. CDC 9701-84' : 0 ) : 0 , (' Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida NCIMB 1102 (T)' : 0 , ' Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida NCIMB 1102 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 , (' Aeromonas sp. ATCC 35941' : 0.00059 , (' Aeromonas sobria CIP 74.33 (T)' : 0.00022 , (' Aeromonas sobria NCIMB 12065 (T)' : 0.00017 , (((' Aeromonas eucrenophila CIP 76.17 (T)' : 0 , ' Aeromonas eucrenophila NCIMB 74 (T)' : 0 ) : 0.00026 , ' Aeromonas popoffii LMG 17541 (T)' : 0.0015 ) : 0.0002 , (((((((' Aeromonas veronii ATCC 35624 (T)' : 0.00298 , ' Aeromonas sp. str. BB6' : 0 ) : 0 , ' Aeromonas sp. str. BB7' : 0 ) : 0 , ' Aeromonas sp. str. BB8' : 0 ) : 0 , (' Aeromonas veronii ATCC 35624 (T)' : 0 , (' Aeromonas veronii NCIMB 13015' : 0 , ' Aeromonas ichthiosmia DSM 6393 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 ) : 0.00021 , ((' Aeromonas schubertii DSM 4882 (T)' : 0 , ' Aeromonas schubertii ATCC 43700 (T)' : 0 ) : 0.00167 , (' Aeromonas jandaei CDC 787-80 (T)' : 0.00059 , (' Aeromonas jandaei ATCC 49568 (T)' : 0 , ' Aeromonas jandaei ATCC 49568 (T)' : 0 ) : 0.00045 ) : 0.00317 ) : 0.00022 ) : 0.00164 , ' Aeromonas allosaccharophila CECT 4199 (T)' : 0.00195 ) : 0 , (((((' Aeromonas media ATCC 33907 (T)' : 0 , ' Aeromonas media ATCC 33907 (T)' : 0 ) : 0 , (' Aeromonas sp. str. BB3' : 0.00136 , ' Aeromonas media JCM 2385 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0 , (' Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 (T)' : 0 , (' Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila CIP 76.14 (T)' : 0 , ' Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 (T)' : 0 ) : 0 ) : 0.00076 ) : 0 , ' Aeromonas hydrophila ATCC 35654' : 0.0005 ) : 0.00172 , (' Aeromonas caviae ATCC 15467' : 0 , (' Aeromonas caviae CIP 76.16 (T)' : 0 , (' clone G40' : 0.00022 , ((((' Aeromonas caviae JCM 1060 (T)' : 0.00347 , ' clone K8' : 0.00185 ) : 0 , ' Aeromonas caviae IFO 13282' : 0.00132 ) : 0 , ' str. SBR2011' : 0.00026 ) : 0.00026 , (' Aeromonas hydrophila' : 0 , (' Aeromonas caviae NCIMB 13016' : 0 , (' Aeromonas trota ATCC 49657 (T)' : 0 , (' Aeromonas enteropelogenes DSM 6394 (T)' : 0 , ' Aeromonas trota ATCC 49657 (T)' : 0.00025 ) : 0.00076 ) : 0.00025 ) : 0.00022 ) : 0.00054 ) : 0 ) : 3e-05 ) : 0.00075 ) : 0.00192 ) : 0.00174 ) : 0.00234 ) : 0.00123 ) : 0.0018 ) : 0.00112 ) : 0.00154 ) : 0.00032 ) : 7e-05 ) : 0.00483 ) : 0.00694 )'ARM.HYDROPHILA' : 0.01627 )'AEROMONAS' : 0.01229 ) : 0.0046 , (' AEspoe hard rock 10-626m below ground surface DNA clone A47t' : 0.12955 , ((((((((((((((((((((((((((((' Haemophilus actinomycetemcomitans str. FDC Y4' : 0 , ' Haemophilus actinomycetemcomitans ATCC 29522' : 0 ) : 0.00103 , ' Haemophilus actinomycetemcomitans ATCC 29524' : 0.00035 ) : 0.001 , ' Haemophilus actinomycetemcomitans ATCC 2952